MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.02

Total Repeats: 293

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018023	CG	3	6	121	126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018023	CA	3	6	971	976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018023	CG	3	6	1352	1357	0 %	0 %	50 %	50 %	392406270
4	NC_018023	TC	3	6	1526	1531	0 %	50 %	0 %	50 %	392406270
5	NC_018023	CG	3	6	2241	2246	0 %	0 %	50 %	50 %	392406270
6	NC_018023	CG	3	6	2743	2748	0 %	0 %	50 %	50 %	392406271
7	NC_018023	CG	3	6	3428	3433	0 %	0 %	50 %	50 %	392406271
8	NC_018023	CG	3	6	4593	4598	0 %	0 %	50 %	50 %	392406272
9	NC_018023	CA	3	6	6388	6393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018023	AC	3	6	7031	7036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018023	AG	3	6	8079	8084	50 %	0 %	50 %	0 %	392406276
12	NC_018023	CA	3	6	8387	8392	50 %	0 %	0 %	50 %	392406276
13	NC_018023	GC	4	8	8930	8937	0 %	0 %	50 %	50 %	392406277
14	NC_018023	TC	3	6	9261	9266	0 %	50 %	0 %	50 %	392406277
15	NC_018023	CG	4	8	9319	9326	0 %	0 %	50 %	50 %	392406277
16	NC_018023	AC	3	6	9585	9590	50 %	0 %	0 %	50 %	392406277
17	NC_018023	GC	3	6	11286	11291	0 %	0 %	50 %	50 %	392406278
18	NC_018023	AC	3	6	11588	11593	50 %	0 %	0 %	50 %	392406279
19	NC_018023	GC	3	6	11812	11817	0 %	0 %	50 %	50 %	392406279
20	NC_018023	AC	3	6	11963	11968	50 %	0 %	0 %	50 %	392406279
21	NC_018023	GC	3	6	12241	12246	0 %	0 %	50 %	50 %	392406280
22	NC_018023	AT	3	6	12660	12665	50 %	50 %	0 %	0 %	392406280
23	NC_018023	AT	3	6	13588	13593	50 %	50 %	0 %	0 %	392406281
24	NC_018023	GC	3	6	14068	14073	0 %	0 %	50 %	50 %	392406281
25	NC_018023	AC	3	6	15675	15680	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018023	CG	3	6	16262	16267	0 %	0 %	50 %	50 %	392406282
27	NC_018023	CG	3	6	16394	16399	0 %	0 %	50 %	50 %	392406282
28	NC_018023	GT	3	6	16707	16712	0 %	50 %	50 %	0 %	392406282
29	NC_018023	GC	3	6	17730	17735	0 %	0 %	50 %	50 %	392406283
30	NC_018023	GC	3	6	18264	18269	0 %	0 %	50 %	50 %	392406283
31	NC_018023	CG	3	6	19068	19073	0 %	0 %	50 %	50 %	392406284
32	NC_018023	GC	3	6	19077	19082	0 %	0 %	50 %	50 %	392406284
33	NC_018023	CG	3	6	19420	19425	0 %	0 %	50 %	50 %	392406284
34	NC_018023	GC	3	6	22516	22521	0 %	0 %	50 %	50 %	392406287
35	NC_018023	CG	3	6	22651	22656	0 %	0 %	50 %	50 %	392406287
36	NC_018023	GC	3	6	23342	23347	0 %	0 %	50 %	50 %	392406288
37	NC_018023	GC	4	8	23546	23553	0 %	0 %	50 %	50 %	392406288
38	NC_018023	GC	3	6	23765	23770	0 %	0 %	50 %	50 %	392406289
39	NC_018023	AG	3	6	24133	24138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018023	CA	3	6	24580	24585	50 %	0 %	0 %	50 %	392406290
41	NC_018023	GC	3	6	24615	24620	0 %	0 %	50 %	50 %	392406290
42	NC_018023	AC	3	6	25060	25065	50 %	0 %	0 %	50 %	392406290
43	NC_018023	TA	3	6	25311	25316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018023	GT	3	6	26261	26266	0 %	50 %	50 %	0 %	392406292
45	NC_018023	CG	3	6	26396	26401	0 %	0 %	50 %	50 %	392406292
46	NC_018023	GC	4	8	26952	26959	0 %	0 %	50 %	50 %	392406292
47	NC_018023	CA	3	6	27987	27992	50 %	0 %	0 %	50 %	392406293
48	NC_018023	AG	3	6	28042	28047	50 %	0 %	50 %	0 %	392406293
49	NC_018023	GC	3	6	28159	28164	0 %	0 %	50 %	50 %	392406293
50	NC_018023	GC	3	6	28506	28511	0 %	0 %	50 %	50 %	392406293
51	NC_018023	CG	3	6	28854	28859	0 %	0 %	50 %	50 %	392406294
52	NC_018023	TC	3	6	29409	29414	0 %	50 %	0 %	50 %	392406294
53	NC_018023	CA	3	6	30300	30305	50 %	0 %	0 %	50 %	392406295
54	NC_018023	GC	3	6	30870	30875	0 %	0 %	50 %	50 %	392406295
55	NC_018023	CG	4	8	31373	31380	0 %	0 %	50 %	50 %	392406295
56	NC_018023	GC	3	6	32031	32036	0 %	0 %	50 %	50 %	392406296
57	NC_018023	GC	3	6	34597	34602	0 %	0 %	50 %	50 %	392406299
58	NC_018023	GA	3	6	36207	36212	50 %	0 %	50 %	0 %	392406300
59	NC_018023	GC	4	8	36894	36901	0 %	0 %	50 %	50 %	392406300
60	NC_018023	TG	3	6	37080	37085	0 %	50 %	50 %	0 %	392406300
61	NC_018023	TC	3	6	37346	37351	0 %	50 %	0 %	50 %	392406301
62	NC_018023	CG	3	6	37452	37457	0 %	0 %	50 %	50 %	392406301
63	NC_018023	CG	3	6	37729	37734	0 %	0 %	50 %	50 %	392406301
64	NC_018023	GT	4	8	37857	37864	0 %	50 %	50 %	0 %	392406301
65	NC_018023	GA	3	6	38216	38221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018023	GC	3	6	38535	38540	0 %	0 %	50 %	50 %	392406302
67	NC_018023	CG	3	6	38568	38573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018023	CG	3	6	38893	38898	0 %	0 %	50 %	50 %	392406303
69	NC_018023	CG	3	6	39087	39092	0 %	0 %	50 %	50 %	392406303
70	NC_018023	GT	3	6	39968	39973	0 %	50 %	50 %	0 %	392406303
71	NC_018023	CG	3	6	40383	40388	0 %	0 %	50 %	50 %	392406303
72	NC_018023	TC	3	6	40731	40736	0 %	50 %	0 %	50 %	392406303
73	NC_018023	GC	3	6	40845	40850	0 %	0 %	50 %	50 %	392406303
74	NC_018023	GC	3	6	42213	42218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018023	CA	3	6	42383	42388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018023	GC	3	6	42740	42745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018023	GC	4	8	43010	43017	0 %	0 %	50 %	50 %	392406304
78	NC_018023	GC	3	6	43095	43100	0 %	0 %	50 %	50 %	392406304
79	NC_018023	CG	3	6	43881	43886	0 %	0 %	50 %	50 %	392406304
80	NC_018023	AG	3	6	44133	44138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018023	TC	3	6	44386	44391	0 %	50 %	0 %	50 %	392406305
82	NC_018023	TG	3	6	45354	45359	0 %	50 %	50 %	0 %	392406305
83	NC_018023	GT	3	6	45387	45392	0 %	50 %	50 %	0 %	392406305
84	NC_018023	GT	3	6	46168	46173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018023	AT	3	6	47307	47312	50 %	50 %	0 %	0 %	392406306
86	NC_018023	GA	4	8	47516	47523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018023	GC	3	6	47828	47833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018023	GC	3	6	48261	48266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018023	GT	3	6	48975	48980	0 %	50 %	50 %	0 %	392406307
90	NC_018023	AG	4	8	49718	49725	50 %	0 %	50 %	0 %	392406308
91	NC_018023	AG	3	6	50197	50202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018023	AC	3	6	50609	50614	50 %	0 %	0 %	50 %	392406309
93	NC_018023	CT	3	6	50713	50718	0 %	50 %	0 %	50 %	392406309
94	NC_018023	CA	3	6	51075	51080	50 %	0 %	0 %	50 %	392406309
95	NC_018023	GC	3	6	51440	51445	0 %	0 %	50 %	50 %	392406310
96	NC_018023	CG	3	6	52247	52252	0 %	0 %	50 %	50 %	392406310
97	NC_018023	TG	3	6	54036	54041	0 %	50 %	50 %	0 %	392406312
98	NC_018023	GC	3	6	54387	54392	0 %	0 %	50 %	50 %	392406313
99	NC_018023	GC	3	6	54398	54403	0 %	0 %	50 %	50 %	392406313
100	NC_018023	GC	3	6	54905	54910	0 %	0 %	50 %	50 %	392406313
101	NC_018023	TC	3	6	55391	55396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018023	GT	3	6	55397	55402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018023	CG	4	8	56304	56311	0 %	0 %	50 %	50 %	392406317
104	NC_018023	GC	3	6	56361	56366	0 %	0 %	50 %	50 %	392406317
105	NC_018023	GC	3	6	56795	56800	0 %	0 %	50 %	50 %	392406317
106	NC_018023	CG	5	10	56838	56847	0 %	0 %	50 %	50 %	392406318
107	NC_018023	CG	3	6	57418	57423	0 %	0 %	50 %	50 %	392406318
108	NC_018023	CA	3	6	58140	58145	50 %	0 %	0 %	50 %	392406318
109	NC_018023	CG	4	8	58150	58157	0 %	0 %	50 %	50 %	392406318
110	NC_018023	AC	3	6	58219	58224	50 %	0 %	0 %	50 %	392406318
111	NC_018023	CA	3	6	58564	58569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018023	GT	3	6	59383	59388	0 %	50 %	50 %	0 %	392406320
113	NC_018023	CG	3	6	60617	60622	0 %	0 %	50 %	50 %	392406321
114	NC_018023	GC	3	6	61682	61687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018023	GC	3	6	62457	62462	0 %	0 %	50 %	50 %	392406322
116	NC_018023	CG	3	6	62736	62741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018023	AC	3	6	62912	62917	50 %	0 %	0 %	50 %	392406323
118	NC_018023	CG	3	6	63135	63140	0 %	0 %	50 %	50 %	392406324
119	NC_018023	GT	3	6	63546	63551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018023	GC	3	6	64067	64072	0 %	0 %	50 %	50 %	392406325
121	NC_018023	GC	3	6	64350	64355	0 %	0 %	50 %	50 %	392406325
122	NC_018023	CA	3	6	64530	64535	50 %	0 %	0 %	50 %	392406325
123	NC_018023	TG	3	6	64542	64547	0 %	50 %	50 %	0 %	392406325
124	NC_018023	GC	3	6	64857	64862	0 %	0 %	50 %	50 %	392406325
125	NC_018023	TC	3	6	65367	65372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018023	CA	3	6	66189	66194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018023	CG	3	6	66219	66224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018023	GC	3	6	66426	66431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018023	CA	3	6	66938	66943	50 %	0 %	0 %	50 %	392406327
130	NC_018023	CA	3	6	67211	67216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018023	CG	3	6	67600	67605	0 %	0 %	50 %	50 %	392406328
132	NC_018023	GC	3	6	67623	67628	0 %	0 %	50 %	50 %	392406328
133	NC_018023	AC	3	6	67879	67884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018023	CA	3	6	67885	67890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_018023	CT	3	6	68272	68277	0 %	50 %	0 %	50 %	392406329
136	NC_018023	CG	3	6	68405	68410	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
137	NC_018023	CG	3	6	68487	68492	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
138	NC_018023	CG	3	6	68836	68841	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
139	NC_018023	CG	3	6	69400	69405	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
140	NC_018023	GC	3	6	69464	69469	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
141	NC_018023	CG	3	6	69485	69490	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
142	NC_018023	GC	3	6	69504	69509	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
143	NC_018023	CG	3	6	70891	70896	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
144	NC_018023	CG	3	6	71260	71265	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
145	NC_018023	GC	3	6	72560	72565	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
146	NC_018023	CG	3	6	72701	72706	0 %	0 %	50 %	50 %	392406329
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.