MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.01

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018022	TGGGCG	2	12	5159	5170	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018022	GTCACC	2	12	7330	7341	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018022	ACGGCT	3	18	38049	38066	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018022	TGTCGG	2	12	39740	39751	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018022	CGGCTG	2	12	40025	40036	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018022	CGACCC	2	12	54161	54172	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_018022	TGGCGG	2	12	90481	90492	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018022	CGATCG	2	12	90714	90725	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018022	GGCGCC	2	12	110147	110158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018022	GCTCGG	2	12	113415	113426	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018022	GGGCGT	2	12	123262	123273	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018022	CGGCAC	2	12	123573	123584	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018022	TTGACA	2	12	167864	167875	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018022	CATCGA	2	12	174757	174768	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018022	TCGATC	2	12	175499	175510	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018022	GCAGGC	2	12	247478	247489	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018022	ACCGCG	2	12	250660	250671	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018022	GCCGGC	2	12	269583	269594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018022	AGCCGA	2	12	278782	278793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018022	CGATGG	2	12	285694	285705	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018022	TCCAGC	2	12	289287	289298	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018022	TCGATG	2	12	292383	292394	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018022	GCCGCG	2	12	300982	300993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018022	GTCGGT	2	12	303961	303972	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018022	ACCGGC	2	12	304052	304063	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018022	CGAAGC	2	12	304830	304841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018022	TGGTGA	2	12	306649	306660	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018022	CCAACA	2	12	356561	356572	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018022	CGTGAT	2	12	369864	369875	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018022	GTCGAG	2	12	399250	399261	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018022	GACGTC	2	12	409331	409342	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018022	GCGATC	2	12	410410	410421	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018022	GAACAG	2	12	410430	410441	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018022	AGAAGG	2	12	410444	410455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018022	CTGGTC	2	12	425366	425377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018022	GTCGAT	2	12	426413	426424	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018022	GCGTGC	2	12	432435	432446	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018022	CAGATG	2	12	433452	433463	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018022	CCGCTA	2	12	433766	433777	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018022	CCGCCT	2	12	439546	439557	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018022	CCCCGT	2	12	454961	454972	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018022	CTCGGC	2	12	457411	457422	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018022	CGTCGG	2	12	459699	459710	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018022	CGCCCG	2	12	462238	462249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_018022	GTGTAG	2	12	470523	470534	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018022	AGCCGA	2	12	503380	503391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018022	GCCGGC	2	12	505021	505032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018022	GTCACC	2	12	527764	527775	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018022	GTCGAG	2	12	534770	534781	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018022	GTCGAA	2	12	553366	553377	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018022	TGACGT	2	12	567453	567464	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018022	CGTCAT	2	12	568434	568445	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018022	GGGCGG	2	12	596964	596975	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018022	GGTGCG	2	12	599601	599612	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.