MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.01

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018022	TCTGG	2	10	251	260	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018022	GGCCG	2	10	1521	1530	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_018022	GGGTG	2	10	8142	8151	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018022	CACCC	2	10	10926	10935	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5	NC_018022	ACCAG	2	10	11044	11053	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_018022	TGCGG	2	10	11203	11212	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018022	GCAAC	2	10	11965	11974	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_018022	TGCGG	2	10	23740	23749	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018022	GTCGC	2	10	24142	24151	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_018022	TCCAG	2	10	37336	37345	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_018022	CCCAC	2	10	38996	39005	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
12	NC_018022	GATCG	2	10	48519	48528	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018022	ATGCA	2	10	52738	52747	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018022	GCCGC	2	10	67142	67151	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_018022	ACGCG	2	10	67301	67310	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_018022	ACGTA	3	15	74035	74049	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018022	CTCCC	2	10	74327	74336	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
18	NC_018022	TGCAT	2	10	80725	80734	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018022	CAGGC	2	10	113611	113620	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_018022	CTTGG	2	10	123230	123239	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018022	GCAGC	2	10	123497	123506	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_018022	CGAGG	2	10	125426	125435	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018022	GCGCC	2	10	134773	134782	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_018022	GCGCT	2	10	145645	145654	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_018022	TTTCC	2	10	147222	147231	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_018022	TCGTT	2	10	162863	162872	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018022	TCATG	2	10	165631	165640	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018022	CCTTG	2	10	165730	165739	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_018022	GACTG	2	10	165851	165860	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018022	TTCCC	2	10	172086	172095	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_018022	TTTCG	2	10	174741	174750	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018022	TCCAC	2	10	186236	186245	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_018022	GGCTC	2	10	189750	189759	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_018022	GCGCG	2	10	190593	190602	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_018022	CTCAG	2	10	202030	202039	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_018022	ACCGT	2	10	223865	223874	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_018022	AGGAG	2	10	233254	233263	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018022	TCCCC	2	10	234983	234992	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
39	NC_018022	GTCGT	2	10	237519	237528	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018022	CGAGT	2	10	239152	239161	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018022	CAGCG	2	10	241411	241420	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_018022	CGAGC	2	10	242130	242139	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_018022	CGAGC	2	10	243308	243317	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_018022	GCCAC	2	10	249613	249622	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_018022	CAGCG	2	10	263738	263747	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_018022	TTCGA	2	10	265580	265589	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018022	CACTC	2	10	266014	266023	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
48	NC_018022	TCACC	2	10	266040	266049	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
49	NC_018022	ACCGC	2	10	269181	269190	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
50	NC_018022	ACTGG	2	10	269299	269308	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018022	TCGGC	2	10	274698	274707	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_018022	CGGCG	2	10	280823	280832	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_018022	CGATC	2	10	282403	282412	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_018022	GGTCG	2	10	283346	283355	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018022	CCCAG	2	10	283640	283649	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_018022	GCCGC	2	10	284093	284102	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_018022	GCCGA	2	10	287390	287399	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_018022	ACCGA	2	10	289238	289247	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_018022	ATCTG	2	10	292099	292108	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018022	CGAAA	2	10	292401	292410	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018022	CTGAC	2	10	295648	295657	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_018022	TTCGA	2	10	298681	298690	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018022	CACTC	2	10	299115	299124	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_018022	TCACC	2	10	299141	299150	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
65	NC_018022	GGGAT	2	10	300408	300417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018022	TCACC	2	10	303256	303265	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_018022	TCAAC	2	10	305068	305077	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_018022	TGAGG	2	10	305391	305400	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018022	GGGTG	2	10	305410	305419	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018022	TAGCG	2	10	309605	309614	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018022	CCTCA	2	10	330004	330013	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
72	NC_018022	AGTGC	2	10	330319	330328	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018022	GTCGG	2	10	331211	331220	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018022	GAAGT	2	10	333380	333389	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018022	CTCGG	2	10	347058	347067	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_018022	CTTCG	2	10	369475	369484	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_018022	CCGGC	2	10	375665	375674	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
78	NC_018022	TTCGG	2	10	379942	379951	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018022	CGCGA	2	10	380239	380248	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_018022	CGCGA	2	10	381490	381499	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_018022	TTGCA	2	10	390101	390110	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018022	CCGGA	2	10	394424	394433	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_018022	CCCGT	2	10	396435	396444	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_018022	TGCGC	2	10	402926	402935	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_018022	ACATC	2	10	422242	422251	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_018022	CACGA	2	10	426789	426798	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_018022	CACGA	2	10	427082	427091	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_018022	GGCGG	2	10	427349	427358	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018022	CCGTG	2	10	427608	427617	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_018022	CGGCG	2	10	427959	427968	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_018022	CGGGT	2	10	432409	432418	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018022	CGGCC	2	10	433679	433688	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
93	NC_018022	GTCGG	2	10	434432	434441	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018022	GCCGG	2	10	438420	438429	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
95	NC_018022	CGGCG	2	10	460064	460073	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_018022	GCTAA	2	10	460929	460938	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018022	CGCGG	2	10	479147	479156	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
98	NC_018022	GCGAC	2	10	504622	504631	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_018022	CGCTG	2	10	504733	504742	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_018022	CCGAC	2	10	507297	507306	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_018022	ACAGC	2	10	508018	508027	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_018022	CTTCA	2	10	534833	534842	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_018022	GCGCC	2	10	558041	558050	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
104	NC_018022	ATTTG	2	10	563514	563523	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018022	TTCGT	2	10	577277	577286	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018022	ACGCA	2	10	577494	577503	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_018022	ACACG	2	10	577830	577839	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_018022	ATTGC	2	10	585909	585918	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018022	CCGAC	2	10	587444	587453	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_018022	GCCGC	2	10	587734	587743	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
111	NC_018022	TCGGC	2	10	598098	598107	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_018022	CGGGT	2	10	599077	599086	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018022	CGACG	2	10	606368	606377	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.