MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.01

Total Repeats: 403

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018022	CTAC	2	8	2707	2714	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018022	GCAA	2	8	3266	3273	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018022	AGCG	2	8	5198	5205	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018022	ACGG	2	8	5605	5612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018022	CGCT	2	8	7150	7157	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018022	GCTG	2	8	7194	7201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018022	GGCC	2	8	7496	7503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018022	GTGC	2	8	7702	7709	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018022	GGTC	2	8	8231	8238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018022	TGGA	2	8	11472	11479	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018022	CCGA	2	8	11482	11489	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018022	CTGC	2	8	11778	11785	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018022	GCTG	2	8	14168	14175	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018022	GACC	2	8	21333	21340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018022	CATA	2	8	21361	21368	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018022	GCCG	2	8	22161	22168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018022	GCCT	2	8	22429	22436	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018022	CCCT	2	8	23271	23278	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_018022	CCAA	2	8	23981	23988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018022	AGTG	2	8	24008	24015	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018022	ACCC	2	8	24050	24057	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_018022	CCGA	2	8	26169	26176	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018022	GCCA	2	8	29341	29348	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018022	AATC	2	8	32920	32927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018022	TGCC	2	8	32933	32940	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018022	TCGA	2	8	38821	38828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018022	CACG	2	8	39812	39819	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018022	GCGG	2	8	40051	40058	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018022	GAAC	2	8	49571	49578	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018022	TGCA	2	8	54247	54254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018022	ACCC	2	8	56084	56091	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_018022	GGCG	2	8	57285	57292	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018022	GATT	2	8	61395	61402	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018022	CGGC	2	8	63481	63488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018022	CTTG	2	8	63504	63511	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018022	CGGT	2	8	66382	66389	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018022	GTGC	2	8	66610	66617	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018022	TTCG	2	8	67092	67099	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018022	CGGC	2	8	67446	67453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018022	GCGG	2	8	67690	67697	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018022	GCCC	2	8	73976	73983	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_018022	ACCG	2	8	74254	74261	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018022	AACG	2	8	74344	74351	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018022	GCCT	2	8	77597	77604	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018022	TCGC	2	8	78326	78333	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018022	CGAC	2	8	78395	78402	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018022	CAGC	2	8	78420	78427	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018022	GGCC	2	8	78548	78555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018022	TCGT	2	8	78754	78761	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018022	TGGC	2	8	78958	78965	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018022	ACGC	2	8	79019	79026	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018022	ACAA	2	8	80144	80151	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018022	ACCT	2	8	83869	83876	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018022	CGAG	2	8	91854	91861	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018022	GTGA	2	8	91947	91954	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018022	ACCA	2	8	93484	93491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018022	CTCA	2	8	93541	93548	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018022	CGCT	2	8	93597	93604	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018022	GGGC	2	8	93660	93667	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018022	CAGC	2	8	98775	98782	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018022	CTGG	2	8	101187	101194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018022	CGGT	2	8	102373	102380	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018022	ACCA	2	8	102401	102408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018022	CCGT	2	8	102440	102447	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018022	TGCT	2	8	106445	106452	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018022	GGTC	2	8	109562	109569	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018022	CCCA	2	8	109718	109725	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_018022	GCAG	2	8	109746	109753	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018022	CGGG	2	8	109762	109769	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018022	TCCT	2	8	109840	109847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018022	AGGA	2	8	109942	109949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018022	GTAC	2	8	110168	110175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018022	GCCC	2	8	113129	113136	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_018022	CGTG	2	8	113625	113632	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018022	GGTG	2	8	115825	115832	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018022	CTGG	2	8	122949	122956	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018022	CAGG	2	8	123478	123485	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018022	CCTT	2	8	125273	125280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018022	ACCA	2	8	133398	133405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018022	CGAT	2	8	134321	134328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018022	CGGA	2	8	134391	134398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018022	GCTG	2	8	134717	134724	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018022	ATCG	2	8	134912	134919	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018022	GGTG	2	8	140789	140796	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018022	GCCC	2	8	142902	142909	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_018022	GTCG	2	8	142926	142933	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018022	TTCT	2	8	143364	143371	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018022	GGCC	2	8	143393	143400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018022	TGGT	2	8	144824	144831	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018022	ACCT	2	8	148564	148571	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018022	GGGC	2	8	148585	148592	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018022	CTGG	2	8	149925	149932	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_018022	CCGA	2	8	150717	150724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018022	GGCA	2	8	151012	151019	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018022	CATT	2	8	162846	162853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018022	AGGA	2	8	162935	162942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018022	CGAG	2	8	164521	164528	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018022	CCAT	2	8	165077	165084	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018022	TACC	2	8	165166	165173	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018022	GCCC	2	8	165255	165262	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_018022	CGCC	2	8	165308	165315	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_018022	CGCA	2	8	165752	165759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018022	CTCG	2	8	166012	166019	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018022	ACCG	2	8	166218	166225	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018022	AGGT	2	8	174814	174821	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018022	ACCA	2	8	175446	175453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018022	GGCC	2	8	185648	185655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018022	CACC	2	8	185736	185743	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_018022	CGCC	3	12	186105	186116	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_018022	CGCC	2	8	186351	186358	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_018022	GGCG	2	8	187847	187854	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018022	CCCT	2	8	188110	188117	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_018022	TCAC	2	8	188185	188192	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018022	ATCT	2	8	188309	188316	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018022	CCAC	2	8	191715	191722	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_018022	CGCC	2	8	192242	192249	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_018022	GCCC	2	8	192321	192328	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
118	NC_018022	GAGG	2	8	192699	192706	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018022	GGCG	2	8	193076	193083	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018022	GTTG	2	8	201950	201957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018022	TGGA	2	8	202356	202363	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018022	GCCG	2	8	207595	207602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018022	TGGC	2	8	213395	213402	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018022	TGCG	2	8	213533	213540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018022	CCGG	2	8	213555	213562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018022	ACCA	2	8	214228	214235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018022	CTTC	2	8	215871	215878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018022	TCAG	2	8	215886	215893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018022	GGTA	2	8	217637	217644	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018022	TTGC	2	8	223909	223916	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018022	CTCA	2	8	228061	228068	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018022	CAGC	2	8	232931	232938	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018022	GCAG	2	8	232980	232987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018022	ACGT	2	8	233743	233750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018022	AACG	2	8	233856	233863	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018022	TCAC	2	8	234114	234121	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018022	CGAG	2	8	234506	234513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018022	TGAA	2	8	234667	234674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018022	GCTG	2	8	243682	243689	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018022	ACCT	2	8	247363	247370	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018022	GGCT	2	8	249685	249692	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018022	ATCG	2	8	257989	257996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018022	GGCG	2	8	258021	258028	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018022	CTAC	2	8	258324	258331	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_018022	AGGT	3	12	261215	261226	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018022	CTTC	2	8	263408	263415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018022	CGGC	2	8	263446	263453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018022	TGGA	2	8	263461	263468	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018022	GCCA	2	8	263671	263678	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_018022	GGCG	2	8	263768	263775	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_018022	CCGG	2	8	264982	264989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_018022	GTCG	2	8	265614	265621	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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155	NC_018022	GCGG	2	8	269242	269249	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
156	NC_018022	CCGC	2	8	269521	269528	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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158	NC_018022	AGGA	2	8	270721	270728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_018022	GCCG	2	8	274063	274070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_018022	GCCG	2	8	274093	274100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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170	NC_018022	GTCG	2	8	278578	278585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_018022	GTCA	2	8	288982	288989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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193	NC_018022	GGGC	2	8	291173	291180	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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232	NC_018022	GCCA	2	8	325861	325868	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
233	NC_018022	GCCC	2	8	327202	327209	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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242	NC_018022	TGCA	2	8	332002	332009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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244	NC_018022	GACC	2	8	332163	332170	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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260	NC_018022	CGAA	2	8	374874	374881	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
261	NC_018022	GTGA	2	8	375719	375726	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
262	NC_018022	GCCG	2	8	375823	375830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
263	NC_018022	TCGA	2	8	375962	375969	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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274	NC_018022	ACCG	2	8	402192	402199	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
275	NC_018022	CGAT	2	8	402808	402815	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
276	NC_018022	GTAC	2	8	404683	404690	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
277	NC_018022	CGAG	2	8	409516	409523	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
278	NC_018022	CACC	2	8	409708	409715	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
279	NC_018022	GGGC	2	8	409920	409927	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
280	NC_018022	CCGA	2	8	409978	409985	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
281	NC_018022	CGAC	2	8	410144	410151	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
282	NC_018022	GGTC	2	8	411000	411007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
283	NC_018022	GGTG	2	8	411288	411295	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
284	NC_018022	GCCG	2	8	411351	411358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
285	NC_018022	TCGA	2	8	411364	411371	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
286	NC_018022	CGGG	2	8	411901	411908	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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289	NC_018022	TGCT	2	8	422435	422442	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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291	NC_018022	CGAG	2	8	422829	422836	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
292	NC_018022	TGAC	2	8	424384	424391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
293	NC_018022	GCCC	2	8	426248	426255	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
294	NC_018022	CTGC	2	8	426338	426345	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
295	NC_018022	CGTC	2	8	426432	426439	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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297	NC_018022	GGCC	2	8	427793	427800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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305	NC_018022	CCGC	2	8	433153	433160	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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327	NC_018022	CGGG	2	8	459817	459824	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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332	NC_018022	TCCT	2	8	478182	478189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
333	NC_018022	CCCG	2	8	495641	495648	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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336	NC_018022	GTGC	2	8	503248	503255	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
337	NC_018022	CGCC	2	8	504705	504712	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
338	NC_018022	CTGG	2	8	504801	504808	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
339	NC_018022	GCGG	2	8	504902	504909	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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341	NC_018022	GGAA	2	8	505064	505071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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343	NC_018022	CTCC	2	8	507958	507965	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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346	NC_018022	GGGC	2	8	508895	508902	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
347	NC_018022	CTGG	2	8	510235	510242	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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382	NC_018022	GCGA	2	8	575424	575431	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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390	NC_018022	CGGT	2	8	587744	587751	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
391	NC_018022	CCCG	2	8	587835	587842	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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397	NC_018022	TCCG	2	8	598721	598728	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
398	NC_018022	GACG	2	8	598836	598843	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
399	NC_018022	AGGT	2	8	599007	599014	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
400	NC_018022	GAAC	3	12	599647	599658	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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402	NC_018022	ATGA	2	8	600000	600007	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
403	NC_018022	GTGG	2	8	600577	600584	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.