MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Turneriella parva DSM 21527 plasmid pTURPA.01

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018021	ACAG	2	8	644	651	50 %	0 %	25 %	25 %	392405698
2	NC_018021	CCTG	2	8	1458	1465	0 %	25 %	25 %	50 %	392405699
3	NC_018021	GCAC	2	8	1821	1828	25 %	0 %	25 %	50 %	392405699
4	NC_018021	CGCT	2	8	3787	3794	0 %	25 %	25 %	50 %	392405701
5	NC_018021	CTGC	2	8	4391	4398	0 %	25 %	25 %	50 %	392405702
6	NC_018021	AGCC	2	8	4632	4639	25 %	0 %	25 %	50 %	392405702
7	NC_018021	CCGC	2	8	5340	5347	0 %	0 %	25 %	75 %	392405703
8	NC_018021	GCGA	2	8	6773	6780	25 %	0 %	50 %	25 %	392405704
9	NC_018021	CCAA	2	8	7561	7568	50 %	0 %	0 %	50 %	392405705
10	NC_018021	CTCG	2	8	7619	7626	0 %	25 %	25 %	50 %	392405705
11	NC_018021	GCCC	2	8	7909	7916	0 %	0 %	25 %	75 %	392405705
12	NC_018021	TTCA	2	8	8812	8819	25 %	50 %	0 %	25 %	392405706
13	NC_018021	CAAA	2	8	8921	8928	75 %	0 %	0 %	25 %	392405706
14	NC_018021	CGAG	2	8	8987	8994	25 %	0 %	50 %	25 %	392405706
15	NC_018021	TGAA	2	8	9872	9879	50 %	25 %	25 %	0 %	392405707
16	NC_018021	GCTC	2	8	9950	9957	0 %	25 %	25 %	50 %	392405707
17	NC_018021	TTCA	2	8	10086	10093	25 %	50 %	0 %	25 %	392405707
18	NC_018021	GCTG	2	8	10594	10601	0 %	25 %	50 %	25 %	392405708
19	NC_018021	ATCT	2	8	10725	10732	25 %	50 %	0 %	25 %	392405708
20	NC_018021	TTTC	2	8	11241	11248	0 %	75 %	0 %	25 %	392405709
21	NC_018021	TGCA	2	8	11357	11364	25 %	25 %	25 %	25 %	392405709
22	NC_018021	CTGC	2	8	11681	11688	0 %	25 %	25 %	50 %	392405709
23	NC_018021	GCGA	2	8	11863	11870	25 %	0 %	50 %	25 %	392405709
24	NC_018021	GCAG	2	8	12123	12130	25 %	0 %	50 %	25 %	392405709
25	NC_018021	GCAG	2	8	12378	12385	25 %	0 %	50 %	25 %	392405709
26	NC_018021	CGCC	2	8	13436	13443	0 %	0 %	25 %	75 %	392405710
27	NC_018021	AAAT	2	8	14037	14044	75 %	25 %	0 %	0 %	392405710
28	NC_018021	TCGA	2	8	14223	14230	25 %	25 %	25 %	25 %	392405711
29	NC_018021	TCGT	2	8	14634	14641	0 %	50 %	25 %	25 %	392405712
30	NC_018021	GCAT	2	8	14674	14681	25 %	25 %	25 %	25 %	392405712
31	NC_018021	GGCT	2	8	15179	15186	0 %	25 %	50 %	25 %	392405712
32	NC_018021	TTCT	2	8	15279	15286	0 %	75 %	0 %	25 %	392405712
33	NC_018021	CGAT	2	8	15371	15378	25 %	25 %	25 %	25 %	392405713
34	NC_018021	AAGA	2	8	15679	15686	75 %	0 %	25 %	0 %	392405713
35	NC_018021	GCAT	2	8	17406	17413	25 %	25 %	25 %	25 %	392405715
36	NC_018021	GCAA	2	8	17493	17500	50 %	0 %	25 %	25 %	392405715
37	NC_018021	TCAA	2	8	18414	18421	50 %	25 %	0 %	25 %	392405716
38	NC_018021	GCTC	2	8	18508	18515	0 %	25 %	25 %	50 %	392405716
39	NC_018021	TTAC	2	8	18733	18740	25 %	50 %	0 %	25 %	392405716
40	NC_018021	AAGA	2	8	18984	18991	75 %	0 %	25 %	0 %	392405716
41	NC_018021	GACA	2	8	19172	19179	50 %	0 %	25 %	25 %	392405716
42	NC_018021	TCAC	2	8	20100	20107	25 %	25 %	0 %	50 %	392405718
43	NC_018021	TGCG	2	8	20365	20372	0 %	25 %	50 %	25 %	392405718
44	NC_018021	AGCG	2	8	20446	20453	25 %	0 %	50 %	25 %	392405718
45	NC_018021	CGCA	2	8	20714	20721	25 %	0 %	25 %	50 %	392405719
46	NC_018021	CTCG	2	8	20969	20976	0 %	25 %	25 %	50 %	392405720
47	NC_018021	CGAG	2	8	21523	21530	25 %	0 %	50 %	25 %	392405720
48	NC_018021	TTTC	2	8	21769	21776	0 %	75 %	0 %	25 %	392405721
49	NC_018021	TGCG	2	8	21949	21956	0 %	25 %	50 %	25 %	392405721
50	NC_018021	ATTC	2	8	22676	22683	25 %	50 %	0 %	25 %	392405722
51	NC_018021	ATGC	2	8	22801	22808	25 %	25 %	25 %	25 %	392405722
52	NC_018021	TCGA	2	8	23388	23395	25 %	25 %	25 %	25 %	392405723
53	NC_018021	GCGA	2	8	23749	23756	25 %	0 %	50 %	25 %	392405724
54	NC_018021	GCCT	2	8	24179	24186	0 %	25 %	25 %	50 %	392405724
55	NC_018021	CGGC	2	8	24507	24514	0 %	0 %	50 %	50 %	392405725
56	NC_018021	GTCT	2	8	24548	24555	0 %	50 %	25 %	25 %	392405725
57	NC_018021	GGCC	2	8	24711	24718	0 %	0 %	50 %	50 %	392405725
58	NC_018021	ATCG	2	8	25032	25039	25 %	25 %	25 %	25 %	392405726

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.