MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Turneriella parva DSM 21527 chromosome

Total Repeats: 2754

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018020	AACTG	2	10	5020	5029	40 %	20 %	20 %	20 %	392401591
2	NC_018020	CCTGA	2	10	5777	5786	20 %	20 %	20 %	40 %	392401591
3	NC_018020	CCATC	2	10	5910	5919	20 %	20 %	0 %	60 %	392401591
4	NC_018020	TTTCG	2	10	12343	12352	0 %	60 %	20 %	20 %	392401601
5	NC_018020	GTGTT	2	10	15328	15337	0 %	60 %	40 %	0 %	392401604
6	NC_018020	GAATA	2	10	16531	16540	60 %	20 %	20 %	0 %	392401605
7	NC_018020	GCCTT	2	10	20609	20618	0 %	40 %	20 %	40 %	392401608
8	NC_018020	AATGG	2	10	23216	23225	40 %	20 %	40 %	0 %	392401610
9	NC_018020	CATGC	2	10	24405	24414	20 %	20 %	20 %	40 %	392401610
10	NC_018020	TCTGG	2	10	28585	28594	0 %	40 %	40 %	20 %	392401615
11	NC_018020	AAGAA	2	10	28767	28776	80 %	0 %	20 %	0 %	392401615
12	NC_018020	TCGTA	2	10	35077	35086	20 %	40 %	20 %	20 %	392401622
13	NC_018020	CATTT	2	10	37629	37638	20 %	60 %	0 %	20 %	392401624
14	NC_018020	GGTCA	2	10	50929	50938	20 %	20 %	40 %	20 %	392401640
15	NC_018020	GCTGC	2	10	51506	51515	0 %	20 %	40 %	40 %	392401641
16	NC_018020	GCGCC	2	10	52427	52436	0 %	0 %	40 %	60 %	392401643
17	NC_018020	TTTTC	2	10	52516	52525	0 %	80 %	0 %	20 %	392401643
18	NC_018020	ATCTT	2	10	53047	53056	20 %	60 %	0 %	20 %	392401643
19	NC_018020	ACTTC	2	10	57955	57964	20 %	40 %	0 %	40 %	392401646
20	NC_018020	CTGCC	2	10	59387	59396	0 %	20 %	20 %	60 %	392401648
21	NC_018020	GAAAC	2	10	62272	62281	60 %	0 %	20 %	20 %	392401651
22	NC_018020	AGGCG	2	10	62500	62509	20 %	0 %	60 %	20 %	392401651
23	NC_018020	CGTCA	2	10	65653	65662	20 %	20 %	20 %	40 %	392401654
24	NC_018020	CCGAC	2	10	68304	68313	20 %	0 %	20 %	60 %	392401656
25	NC_018020	AGAGC	2	10	68569	68578	40 %	0 %	40 %	20 %	392401656
26	NC_018020	GCTGC	2	10	68667	68676	0 %	20 %	40 %	40 %	392401657
27	NC_018020	TTGCC	2	10	70781	70790	0 %	40 %	20 %	40 %	392401659
28	NC_018020	ACACG	2	10	75889	75898	40 %	0 %	20 %	40 %	392401663
29	NC_018020	AGGCG	2	10	77130	77139	20 %	0 %	60 %	20 %	392401664
30	NC_018020	GCAAC	2	10	78101	78110	40 %	0 %	20 %	40 %	392401665
31	NC_018020	GGCAA	2	10	78951	78960	40 %	0 %	40 %	20 %	392401666
32	NC_018020	ATGGC	2	10	81557	81566	20 %	20 %	40 %	20 %	392401670
33	NC_018020	GCGTC	2	10	82033	82042	0 %	20 %	40 %	40 %	392401671
34	NC_018020	CGCGC	2	10	82122	82131	0 %	0 %	40 %	60 %	392401671
35	NC_018020	GCGCG	2	10	82278	82287	0 %	0 %	60 %	40 %	392401671
36	NC_018020	CAGAG	2	10	85924	85933	40 %	0 %	40 %	20 %	392401676
37	NC_018020	GCTGC	2	10	86907	86916	0 %	20 %	40 %	40 %	392401676
38	NC_018020	CTGAA	2	10	93179	93188	40 %	20 %	20 %	20 %	392401680
39	NC_018020	GCGCA	2	10	93873	93882	20 %	0 %	40 %	40 %	392401681
40	NC_018020	CGCGC	2	10	95836	95845	0 %	0 %	40 %	60 %	392401684
41	NC_018020	AAGCG	2	10	99228	99237	40 %	0 %	40 %	20 %	392401687
42	NC_018020	ACCGA	2	10	99559	99568	40 %	0 %	20 %	40 %	392401688
43	NC_018020	ATTTC	2	10	101012	101021	20 %	60 %	0 %	20 %	392401689
44	NC_018020	CGACG	2	10	101769	101778	20 %	0 %	40 %	40 %	392401689
45	NC_018020	AAAAG	2	10	103087	103096	80 %	0 %	20 %	0 %	392401691
46	NC_018020	TTCTT	2	10	105940	105949	0 %	80 %	0 %	20 %	392401696
47	NC_018020	GCGAC	2	10	108193	108202	20 %	0 %	40 %	40 %	392401699
48	NC_018020	TCAGA	2	10	108737	108746	40 %	20 %	20 %	20 %	392401699
49	NC_018020	TGCCC	2	10	108951	108960	0 %	20 %	20 %	60 %	392401699
50	NC_018020	CGTGT	2	10	110391	110400	0 %	40 %	40 %	20 %	392401701
51	NC_018020	TGAGC	2	10	117676	117685	20 %	20 %	40 %	20 %	392401709
52	NC_018020	GCATC	2	10	122798	122807	20 %	20 %	20 %	40 %	392401714
53	NC_018020	ATTTT	2	10	124264	124273	20 %	80 %	0 %	0 %	392401715
54	NC_018020	ACCGC	2	10	125315	125324	20 %	0 %	20 %	60 %	392401717
55	NC_018020	CGAAT	2	10	127682	127691	40 %	20 %	20 %	20 %	392401717
56	NC_018020	TTCGG	2	10	128665	128674	0 %	40 %	40 %	20 %	392401718
57	NC_018020	AGTTC	2	10	131088	131097	20 %	40 %	20 %	20 %	392401718
58	NC_018020	GCAGC	2	10	131377	131386	20 %	0 %	40 %	40 %	392401719
59	NC_018020	GTGCA	2	10	138168	138177	20 %	20 %	40 %	20 %	392401727
60	NC_018020	AGCGA	2	10	139036	139045	40 %	0 %	40 %	20 %	392401727
61	NC_018020	TTTGT	2	10	142475	142484	0 %	80 %	20 %	0 %	392401732
62	NC_018020	GCGAT	2	10	144426	144435	20 %	20 %	40 %	20 %	392401734
63	NC_018020	CGGCG	2	10	145073	145082	0 %	0 %	60 %	40 %	392401735
64	NC_018020	GGTTT	2	10	145956	145965	0 %	60 %	40 %	0 %	392401736
65	NC_018020	TCGCA	2	10	146329	146338	20 %	20 %	20 %	40 %	392401736
66	NC_018020	CGAAT	2	10	147233	147242	40 %	20 %	20 %	20 %	392401737
67	NC_018020	GCGCC	2	10	149961	149970	0 %	0 %	40 %	60 %	392401738
68	NC_018020	AGCGA	2	10	151794	151803	40 %	0 %	40 %	20 %	392401740
69	NC_018020	CAAAC	2	10	155741	155750	60 %	0 %	0 %	40 %	392401742
70	NC_018020	CAAGA	2	10	155791	155800	60 %	0 %	20 %	20 %	392401742
71	NC_018020	ATGAC	2	10	157096	157105	40 %	20 %	20 %	20 %	392401743
72	NC_018020	CAGAC	2	10	168208	168217	40 %	0 %	20 %	40 %	392401754
73	NC_018020	CAGTT	2	10	168943	168952	20 %	40 %	20 %	20 %	392401755
74	NC_018020	TCGGT	2	10	169757	169766	0 %	40 %	40 %	20 %	392401755
75	NC_018020	TGCAT	2	10	171976	171985	20 %	40 %	20 %	20 %	392401757
76	NC_018020	AAGGC	2	10	172738	172747	40 %	0 %	40 %	20 %	392401758
77	NC_018020	GCCGC	2	10	175035	175044	0 %	0 %	40 %	60 %	392401759
78	NC_018020	AACTG	2	10	178013	178022	40 %	20 %	20 %	20 %	392401761
79	NC_018020	ATTCG	2	10	179542	179551	20 %	40 %	20 %	20 %	392401763
80	NC_018020	ATCAC	2	10	184532	184541	40 %	20 %	0 %	40 %	392401766
81	NC_018020	CTCAT	2	10	184817	184826	20 %	40 %	0 %	40 %	392401766
82	NC_018020	CTGAA	2	10	185003	185012	40 %	20 %	20 %	20 %	392401766
83	NC_018020	ATATG	2	10	185254	185263	40 %	40 %	20 %	0 %	392401766
84	NC_018020	ACCTC	2	10	186757	186766	20 %	20 %	0 %	60 %	392401767
85	NC_018020	GGCGA	2	10	187985	187994	20 %	0 %	60 %	20 %	392401767
86	NC_018020	TGATT	2	10	188658	188667	20 %	60 %	20 %	0 %	392401768
87	NC_018020	CCTGC	2	10	189099	189108	0 %	20 %	20 %	60 %	392401768
88	NC_018020	TGGTG	2	10	189888	189897	0 %	40 %	60 %	0 %	392401769
89	NC_018020	AGACG	2	10	191876	191885	40 %	0 %	40 %	20 %	392401770
90	NC_018020	GCCCT	2	10	192226	192235	0 %	20 %	20 %	60 %	392401771
91	NC_018020	GTTCT	2	10	192947	192956	0 %	60 %	20 %	20 %	392401771
92	NC_018020	TGGCG	2	10	194407	194416	0 %	20 %	60 %	20 %	392401772
93	NC_018020	AGACA	2	10	195421	195430	60 %	0 %	20 %	20 %	392401774
94	NC_018020	CGGCC	2	10	195706	195715	0 %	0 %	40 %	60 %	392401774
95	NC_018020	GGCAA	2	10	195716	195725	40 %	0 %	40 %	20 %	392401774
96	NC_018020	GGCGA	2	10	196116	196125	20 %	0 %	60 %	20 %	392401775
97	NC_018020	CGAAG	2	10	202214	202223	40 %	0 %	40 %	20 %	392401779
98	NC_018020	AAAAT	2	10	202970	202979	80 %	20 %	0 %	0 %	392401779
99	NC_018020	ACCCA	2	10	203244	203253	40 %	0 %	0 %	60 %	392401780
100	NC_018020	AAGCA	2	10	204824	204833	60 %	0 %	20 %	20 %	392401782
101	NC_018020	GGCGA	2	10	206582	206591	20 %	0 %	60 %	20 %	392401784
102	NC_018020	CGCGC	2	10	207713	207722	0 %	0 %	40 %	60 %	392401785
103	NC_018020	CCCCA	2	10	208230	208239	20 %	0 %	0 %	80 %	392401786
104	NC_018020	ATTCG	2	10	211642	211651	20 %	40 %	20 %	20 %	392401788
105	NC_018020	ATGGC	2	10	213398	213407	20 %	20 %	40 %	20 %	392401790
106	NC_018020	ATACC	2	10	214503	214512	40 %	20 %	0 %	40 %	392401791
107	NC_018020	GCAGC	2	10	214635	214644	20 %	0 %	40 %	40 %	392401791
108	NC_018020	GGGGC	2	10	215191	215200	0 %	0 %	80 %	20 %	392401792
109	NC_018020	CTGAA	2	10	215534	215543	40 %	20 %	20 %	20 %	392401792
110	NC_018020	GTCGA	2	10	217276	217285	20 %	20 %	40 %	20 %	392401792
111	NC_018020	CGAAG	2	10	219314	219323	40 %	0 %	40 %	20 %	392401796
112	NC_018020	CACGC	2	10	220474	220483	20 %	0 %	20 %	60 %	392401796
113	NC_018020	TCAGC	2	10	221140	221149	20 %	20 %	20 %	40 %	392401797
114	NC_018020	TCGCT	2	10	221187	221196	0 %	40 %	20 %	40 %	392401797
115	NC_018020	GTATT	2	10	226243	226252	20 %	60 %	20 %	0 %	392401799
116	NC_018020	TGCAC	2	10	231487	231496	20 %	20 %	20 %	40 %	392401804
117	NC_018020	CGCGC	2	10	232557	232566	0 %	0 %	40 %	60 %	392401806
118	NC_018020	TTGAG	2	10	233237	233246	20 %	40 %	40 %	0 %	392401807
119	NC_018020	TGCCC	2	10	234854	234863	0 %	20 %	20 %	60 %	392401810
120	NC_018020	CTTTT	2	10	236239	236248	0 %	80 %	0 %	20 %	392401811
121	NC_018020	GCCGG	2	10	237320	237329	0 %	0 %	60 %	40 %	392401811
122	NC_018020	GCGAA	2	10	237339	237348	40 %	0 %	40 %	20 %	392401811
123	NC_018020	CGCGT	2	10	238740	238749	0 %	20 %	40 %	40 %	392401812
124	NC_018020	CGGCG	2	10	241020	241029	0 %	0 %	60 %	40 %	392401814
125	NC_018020	CGCGC	2	10	242379	242388	0 %	0 %	40 %	60 %	392401815
126	NC_018020	GCCCT	2	10	245072	245081	0 %	20 %	20 %	60 %	392401817
127	NC_018020	CGAAC	2	10	247878	247887	40 %	0 %	20 %	40 %	392401820
128	NC_018020	CGAAC	2	10	247996	248005	40 %	0 %	20 %	40 %	392401820
129	NC_018020	AATCG	2	10	249450	249459	40 %	20 %	20 %	20 %	392401821
130	NC_018020	AGCGA	2	10	249487	249496	40 %	0 %	40 %	20 %	392401821
131	NC_018020	GGCCT	2	10	250224	250233	0 %	20 %	40 %	40 %	392401821
132	NC_018020	TACAA	2	10	250617	250626	60 %	20 %	0 %	20 %	392401822
133	NC_018020	AACGC	2	10	251287	251296	40 %	0 %	20 %	40 %	392401822
134	NC_018020	AAAAG	2	10	251946	251955	80 %	0 %	20 %	0 %	392401823
135	NC_018020	CGCAG	2	10	252925	252934	20 %	0 %	40 %	40 %	392401824
136	NC_018020	GCGTC	2	10	253235	253244	0 %	20 %	40 %	40 %	392401824
137	NC_018020	GCAAG	2	10	254584	254593	40 %	0 %	40 %	20 %	392401825
138	NC_018020	CGCGC	2	10	256442	256451	0 %	0 %	40 %	60 %	392401828
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142	NC_018020	GCCGA	2	10	264076	264085	20 %	0 %	40 %	40 %	392401833
143	NC_018020	GATCA	2	10	265440	265449	40 %	20 %	20 %	20 %	392401834
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147	NC_018020	GAAGA	2	10	277354	277363	60 %	0 %	40 %	0 %	392401849
148	NC_018020	CCGCG	2	10	279683	279692	0 %	0 %	40 %	60 %	392401851
149	NC_018020	CAGGC	2	10	280083	280092	20 %	0 %	40 %	40 %	392401851
150	NC_018020	GGCAT	2	10	281101	281110	20 %	20 %	40 %	20 %	392401852
151	NC_018020	AAGGC	2	10	284415	284424	40 %	0 %	40 %	20 %	392401854
152	NC_018020	GCCGC	2	10	284702	284711	0 %	0 %	40 %	60 %	392401854
153	NC_018020	GGTCA	2	10	285436	285445	20 %	20 %	40 %	20 %	392401855
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159	NC_018020	TACCT	2	10	293970	293979	20 %	40 %	0 %	40 %	392401863
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163	NC_018020	CCCGA	2	10	301205	301214	20 %	0 %	20 %	60 %	392401870
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165	NC_018020	GACTT	2	10	304591	304600	20 %	40 %	20 %	20 %	392401872
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177	NC_018020	GGTCA	2	10	325083	325092	20 %	20 %	40 %	20 %	392401892
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180	NC_018020	ACCAG	2	10	328122	328131	40 %	0 %	20 %	40 %	392401894
181	NC_018020	TTGCA	2	10	330040	330049	20 %	40 %	20 %	20 %	392401897
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234	NC_018020	CCCGG	2	10	400905	400914	0 %	0 %	40 %	60 %	392401953
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244	NC_018020	CCGCA	2	10	419228	419237	20 %	0 %	20 %	60 %	392401966
245	NC_018020	GCTGC	2	10	424254	424263	0 %	20 %	40 %	40 %	392401971
246	NC_018020	GCACC	2	10	425478	425487	20 %	0 %	20 %	60 %	392401972
247	NC_018020	CATCG	2	10	426742	426751	20 %	20 %	20 %	40 %	392401972
248	NC_018020	AAAAC	2	10	427774	427783	80 %	0 %	0 %	20 %	392401973
249	NC_018020	TTTCG	2	10	429126	429135	0 %	60 %	20 %	20 %	392401974
250	NC_018020	CGACA	2	10	429775	429784	40 %	0 %	20 %	40 %	392401975
251	NC_018020	GCCGA	2	10	430676	430685	20 %	0 %	40 %	40 %	392401977
252	NC_018020	AAGCG	2	10	432945	432954	40 %	0 %	40 %	20 %	392401978
253	NC_018020	TTCGC	2	10	433808	433817	0 %	40 %	20 %	40 %	392401979
254	NC_018020	AATTT	2	10	434565	434574	40 %	60 %	0 %	0 %	392401980
255	NC_018020	TGCGC	2	10	437958	437967	0 %	20 %	40 %	40 %	392401984
256	NC_018020	CATCG	2	10	438690	438699	20 %	20 %	20 %	40 %	392401985
257	NC_018020	GAATG	2	10	439260	439269	40 %	20 %	40 %	0 %	392401985
258	NC_018020	CTACC	2	10	442776	442785	20 %	20 %	0 %	60 %	392401989
259	NC_018020	AAGGT	2	10	443117	443126	40 %	20 %	40 %	0 %	392401989
260	NC_018020	CGGCC	2	10	443602	443611	0 %	0 %	40 %	60 %	392401991
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262	NC_018020	GCTTT	2	10	447539	447548	0 %	60 %	20 %	20 %	392401994
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380	NC_018020	CAACC	2	10	642489	642498	40 %	0 %	0 %	60 %	392402182
381	NC_018020	CGCAT	2	10	643400	643409	20 %	20 %	20 %	40 %	392402182
382	NC_018020	CGGCG	2	10	645815	645824	0 %	0 %	60 %	40 %	392402183
383	NC_018020	TGGTA	2	10	647637	647646	20 %	40 %	40 %	0 %	392402186
384	NC_018020	CCTGA	2	10	647749	647758	20 %	20 %	20 %	40 %	392402186
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386	NC_018020	TTCAT	2	10	656649	656658	20 %	60 %	0 %	20 %	392402192
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389	NC_018020	CCGAA	2	10	663447	663456	40 %	0 %	20 %	40 %	392402200
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499	NC_018020	TGCGC	2	10	811624	811633	0 %	20 %	40 %	40 %	392402339
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