MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 1306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018019	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	392399584
2	NC_018019	CACGC	2	10	5736	5745	20 %	0 %	20 %	60 %	392399588
3	NC_018019	TTATC	2	10	14083	14092	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018019	ACGTA	2	10	14246	14255	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018019	CAGTA	2	10	14629	14638	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018019	CAGTG	2	10	15500	15509	20 %	20 %	40 %	20 %	392399597
7	NC_018019	AAAAT	2	10	16760	16769	80 %	20 %	0 %	0 %	392399598
8	NC_018019	TAGCG	2	10	18328	18337	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018019	CTTTT	2	10	19235	19244	0 %	80 %	0 %	20 %	392399602
10	NC_018019	CACAC	2	10	21467	21476	40 %	0 %	0 %	60 %	392399607
11	NC_018019	TGGAT	2	10	22060	22069	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018019	TGCGT	2	10	25054	25063	0 %	40 %	40 %	20 %	392399610
13	NC_018019	CTGAT	2	10	29085	29094	20 %	40 %	20 %	20 %	392399614
14	NC_018019	GGAGC	2	10	30037	30046	20 %	0 %	60 %	20 %	392399615
15	NC_018019	TTGCT	2	10	31125	31134	0 %	60 %	20 %	20 %	392399616
16	NC_018019	TGAGG	2	10	37958	37967	20 %	20 %	60 %	0 %	392399620
17	NC_018019	CACAT	2	10	40142	40151	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_018019	TGCGG	2	10	41070	41079	0 %	20 %	60 %	20 %	392399624
19	NC_018019	GAAGG	2	10	45725	45734	40 %	0 %	60 %	0 %	392399629
20	NC_018019	CAGTG	2	10	47655	47664	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018019	TGAGA	2	10	47997	48006	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018019	AGTGA	2	10	48047	48056	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018019	TTGAT	2	10	51112	51121	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018019	TGCAC	2	10	51206	51215	20 %	20 %	20 %	40 %	392399636
25	NC_018019	CTGGC	2	10	51465	51474	0 %	20 %	40 %	40 %	392399637
26	NC_018019	GCAGC	2	10	51964	51973	20 %	0 %	40 %	40 %	392399637
27	NC_018019	GACTG	2	10	51980	51989	20 %	20 %	40 %	20 %	392399637
28	NC_018019	AAGGC	2	10	54223	54232	40 %	0 %	40 %	20 %	392399639
29	NC_018019	ATGTG	2	10	61913	61922	20 %	40 %	40 %	0 %	392399647
30	NC_018019	GCTGG	2	10	64073	64082	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018019	AGGGA	2	10	66683	66692	40 %	0 %	60 %	0 %	392399651
32	NC_018019	AAGAT	2	10	68490	68499	60 %	20 %	20 %	0 %	392399652
33	NC_018019	GGAGC	2	10	68597	68606	20 %	0 %	60 %	20 %	392399652
34	NC_018019	AGCCA	2	10	70231	70240	40 %	0 %	20 %	40 %	392399654
35	NC_018019	GGTCT	2	10	70311	70320	0 %	40 %	40 %	20 %	392399654
36	NC_018019	CATGT	2	10	70887	70896	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018019	CAGCG	2	10	71765	71774	20 %	0 %	40 %	40 %	392399655
38	NC_018019	ACTGA	2	10	71942	71951	40 %	20 %	20 %	20 %	392399655
39	NC_018019	CAGGC	2	10	72171	72180	20 %	0 %	40 %	40 %	392399655
40	NC_018019	TGGCA	2	10	73017	73026	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018019	AGGCA	2	10	74337	74346	40 %	0 %	40 %	20 %	392399656
42	NC_018019	TAATT	2	10	75583	75592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018019	GCTTT	2	10	79826	79835	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018019	TGACC	2	10	80081	80090	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_018019	CGTTA	2	10	80823	80832	20 %	40 %	20 %	20 %	392399661
46	NC_018019	TGCTG	2	10	81457	81466	0 %	40 %	40 %	20 %	392399661
47	NC_018019	TGGCC	2	10	83448	83457	0 %	20 %	40 %	40 %	392399662
48	NC_018019	GCGAC	2	10	84252	84261	20 %	0 %	40 %	40 %	392399662
49	NC_018019	TGGGA	2	10	87668	87677	20 %	20 %	60 %	0 %	392399668
50	NC_018019	GATCG	2	10	88768	88777	20 %	20 %	40 %	20 %	392399670
51	NC_018019	CAAAA	2	10	89501	89510	80 %	0 %	0 %	20 %	392399670
52	NC_018019	AACAA	2	10	92342	92351	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018019	TGCAA	2	10	95349	95358	40 %	20 %	20 %	20 %	392399675
54	NC_018019	TGCAG	2	10	95569	95578	20 %	20 %	40 %	20 %	392399675
55	NC_018019	AGGTC	2	10	98005	98014	20 %	20 %	40 %	20 %	392399678
56	NC_018019	ACCAA	2	10	99864	99873	60 %	0 %	0 %	40 %	392399678
57	NC_018019	TCATC	2	10	101127	101136	20 %	40 %	0 %	40 %	392399679
58	NC_018019	TGCAC	2	10	102942	102951	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_018019	ACCTG	2	10	103157	103166	20 %	20 %	20 %	40 %	392399680
60	NC_018019	CGGTG	2	10	103366	103375	0 %	20 %	60 %	20 %	392399680
61	NC_018019	CGGCG	2	10	105985	105994	0 %	0 %	60 %	40 %	392399683
62	NC_018019	CGCGG	2	10	106045	106054	0 %	0 %	60 %	40 %	392399684
63	NC_018019	CAGCG	2	10	106581	106590	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_018019	GGATC	2	10	117399	117408	20 %	20 %	40 %	20 %	392399696
65	NC_018019	TGTTT	2	10	119859	119868	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018019	GACTG	2	10	126759	126768	20 %	20 %	40 %	20 %	392399701
67	NC_018019	TTGGT	2	10	128068	128077	0 %	60 %	40 %	0 %	392399701
68	NC_018019	GTGCG	2	10	130335	130344	0 %	20 %	60 %	20 %	392399702
69	NC_018019	GTGGC	2	10	132073	132082	0 %	20 %	60 %	20 %	392399703
70	NC_018019	GGGGC	2	10	132518	132527	0 %	0 %	80 %	20 %	392399704
71	NC_018019	AGACG	2	10	134323	134332	40 %	0 %	40 %	20 %	392399706
72	NC_018019	ACGGT	2	10	135651	135660	20 %	20 %	40 %	20 %	392399709
73	NC_018019	CGATC	2	10	135924	135933	20 %	20 %	20 %	40 %	392399709
74	NC_018019	TGGCC	2	10	136131	136140	0 %	20 %	40 %	40 %	392399709
75	NC_018019	TGGTG	2	10	136509	136518	0 %	40 %	60 %	0 %	392399709
76	NC_018019	GGAGT	2	10	136981	136990	20 %	20 %	60 %	0 %	392399709
77	NC_018019	ATTGC	2	10	140915	140924	20 %	40 %	20 %	20 %	392399712
78	NC_018019	TCACT	2	10	144780	144789	20 %	40 %	0 %	40 %	392399717
79	NC_018019	ATTTC	2	10	145397	145406	20 %	60 %	0 %	20 %	392399717
80	NC_018019	AGCAC	2	10	149020	149029	40 %	0 %	20 %	40 %	392399720
81	NC_018019	AATGG	2	10	149096	149105	40 %	20 %	40 %	0 %	392399720
82	NC_018019	GTGAG	2	10	150079	150088	20 %	20 %	60 %	0 %	392399722
83	NC_018019	CTGAA	2	10	150877	150886	40 %	20 %	20 %	20 %	392399722
84	NC_018019	CCAGC	2	10	152169	152178	20 %	0 %	20 %	60 %	392399723
85	NC_018019	TTGCC	2	10	152679	152688	0 %	40 %	20 %	40 %	392399724
86	NC_018019	GTACC	2	10	154639	154648	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_018019	TACGC	2	10	155196	155205	20 %	20 %	20 %	40 %	392399726
88	NC_018019	GGTTG	2	10	159962	159971	0 %	40 %	60 %	0 %	392399732
89	NC_018019	CCTTG	2	10	160338	160347	0 %	40 %	20 %	40 %	392399733
90	NC_018019	GCATA	2	10	162061	162070	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018019	TGTGC	2	10	163284	163293	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018019	CGGTG	2	10	164304	164313	0 %	20 %	60 %	20 %	392399736
93	NC_018019	CATGG	2	10	166437	166446	20 %	20 %	40 %	20 %	392399738
94	NC_018019	CAGAT	2	10	166793	166802	40 %	20 %	20 %	20 %	392399738
95	NC_018019	GGATG	2	10	167691	167700	20 %	20 %	60 %	0 %	392399738
96	NC_018019	GGGCC	2	10	168882	168891	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
97	NC_018019	CACTT	2	10	170379	170388	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_018019	AAACT	2	10	171248	171257	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018019	ACCGG	2	10	171643	171652	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_018019	AGACA	2	10	175492	175501	60 %	0 %	20 %	20 %	392399739
101	NC_018019	TGACC	2	10	181180	181189	20 %	20 %	20 %	40 %	392399744
102	NC_018019	TTGCA	2	10	182461	182470	20 %	40 %	20 %	20 %	392399745
103	NC_018019	GTTTG	2	10	184371	184380	0 %	60 %	40 %	0 %	392399747
104	NC_018019	CGGAT	2	10	185311	185320	20 %	20 %	40 %	20 %	392399748
105	NC_018019	AGCGC	2	10	186469	186478	20 %	0 %	40 %	40 %	392399749
106	NC_018019	GCAGT	2	10	187956	187965	20 %	20 %	40 %	20 %	392399750
107	NC_018019	CAATG	2	10	188227	188236	40 %	20 %	20 %	20 %	392399750
108	NC_018019	TAACG	2	10	189179	189188	40 %	20 %	20 %	20 %	392399751
109	NC_018019	AAGCC	2	10	190506	190515	40 %	0 %	20 %	40 %	392399752
110	NC_018019	GGCCC	2	10	192578	192587	0 %	0 %	40 %	60 %	392399755
111	NC_018019	GAATT	2	10	196143	196152	40 %	40 %	20 %	0 %	392399760
112	NC_018019	CAAGG	2	10	197032	197041	40 %	0 %	40 %	20 %	392399760
113	NC_018019	GATGG	2	10	199472	199481	20 %	20 %	60 %	0 %	392399761
114	NC_018019	TGGCG	2	10	200206	200215	0 %	20 %	60 %	20 %	392399762
115	NC_018019	TGCCG	2	10	201793	201802	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_018019	CAGGC	2	10	203329	203338	20 %	0 %	40 %	40 %	392399764
117	NC_018019	GCGAC	2	10	208270	208279	20 %	0 %	40 %	40 %	392399769
118	NC_018019	AGATC	2	10	208295	208304	40 %	20 %	20 %	20 %	392399769
119	NC_018019	CAAGG	2	10	209209	209218	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018019	AGAAA	2	10	209938	209947	80 %	0 %	20 %	0 %	392399771
121	NC_018019	AGTGC	2	10	214971	214980	20 %	20 %	40 %	20 %	392399777
122	NC_018019	CGGGG	2	10	215973	215982	0 %	0 %	80 %	20 %	392399778
123	NC_018019	GAAAA	2	10	216112	216121	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018019	CGAGA	2	10	216747	216756	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018019	TGCGC	2	10	218407	218416	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_018019	CATTG	2	10	220257	220266	20 %	40 %	20 %	20 %	392399781
127	NC_018019	CAAAA	2	10	220372	220381	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018019	CGCAA	2	10	221071	221080	40 %	0 %	20 %	40 %	392399784
129	NC_018019	CAAGA	2	10	223301	223310	60 %	0 %	20 %	20 %	392399785
130	NC_018019	TGGCT	2	10	223497	223506	0 %	40 %	40 %	20 %	392399785
131	NC_018019	CTGTG	2	10	224817	224826	0 %	40 %	40 %	20 %	392399787
132	NC_018019	GCCGT	2	10	226218	226227	0 %	20 %	40 %	40 %	392399787
133	NC_018019	AGAAA	2	10	227125	227134	80 %	0 %	20 %	0 %	392399787
134	NC_018019	AGAGT	2	10	230548	230557	40 %	20 %	40 %	0 %	392399789
135	NC_018019	TTTTG	2	10	232847	232856	0 %	80 %	20 %	0 %	392399791
136	NC_018019	GCCAT	2	10	236204	236213	20 %	20 %	20 %	40 %	392399794
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433	NC_018019	GCTGA	2	10	724818	724827	20 %	20 %	40 %	20 %	392400252
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