MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 1013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018019	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	392399584
2	NC_018019	CACGC	2	10	5736	5745	20 %	0 %	20 %	60 %	392399588
3	NC_018019	CAGTG	2	10	15500	15509	20 %	20 %	40 %	20 %	392399597
4	NC_018019	AAAAT	2	10	16760	16769	80 %	20 %	0 %	0 %	392399598
5	NC_018019	CTTTT	2	10	19235	19244	0 %	80 %	0 %	20 %	392399602
6	NC_018019	CACAC	2	10	21467	21476	40 %	0 %	0 %	60 %	392399607
7	NC_018019	TGCGT	2	10	25054	25063	0 %	40 %	40 %	20 %	392399610
8	NC_018019	CTGAT	2	10	29085	29094	20 %	40 %	20 %	20 %	392399614
9	NC_018019	GGAGC	2	10	30037	30046	20 %	0 %	60 %	20 %	392399615
10	NC_018019	TTGCT	2	10	31125	31134	0 %	60 %	20 %	20 %	392399616
11	NC_018019	TGAGG	2	10	37958	37967	20 %	20 %	60 %	0 %	392399620
12	NC_018019	TGCGG	2	10	41070	41079	0 %	20 %	60 %	20 %	392399624
13	NC_018019	GAAGG	2	10	45725	45734	40 %	0 %	60 %	0 %	392399629
14	NC_018019	TGCAC	2	10	51206	51215	20 %	20 %	20 %	40 %	392399636
15	NC_018019	CTGGC	2	10	51465	51474	0 %	20 %	40 %	40 %	392399637
16	NC_018019	GCAGC	2	10	51964	51973	20 %	0 %	40 %	40 %	392399637
17	NC_018019	GACTG	2	10	51980	51989	20 %	20 %	40 %	20 %	392399637
18	NC_018019	AAGGC	2	10	54223	54232	40 %	0 %	40 %	20 %	392399639
19	NC_018019	ATGTG	2	10	61913	61922	20 %	40 %	40 %	0 %	392399647
20	NC_018019	AGGGA	2	10	66683	66692	40 %	0 %	60 %	0 %	392399651
21	NC_018019	AAGAT	2	10	68490	68499	60 %	20 %	20 %	0 %	392399652
22	NC_018019	GGAGC	2	10	68597	68606	20 %	0 %	60 %	20 %	392399652
23	NC_018019	AGCCA	2	10	70231	70240	40 %	0 %	20 %	40 %	392399654
24	NC_018019	GGTCT	2	10	70311	70320	0 %	40 %	40 %	20 %	392399654
25	NC_018019	CAGCG	2	10	71765	71774	20 %	0 %	40 %	40 %	392399655
26	NC_018019	ACTGA	2	10	71942	71951	40 %	20 %	20 %	20 %	392399655
27	NC_018019	CAGGC	2	10	72171	72180	20 %	0 %	40 %	40 %	392399655
28	NC_018019	AGGCA	2	10	74337	74346	40 %	0 %	40 %	20 %	392399656
29	NC_018019	CGTTA	2	10	80823	80832	20 %	40 %	20 %	20 %	392399661
30	NC_018019	TGCTG	2	10	81457	81466	0 %	40 %	40 %	20 %	392399661
31	NC_018019	TGGCC	2	10	83448	83457	0 %	20 %	40 %	40 %	392399662
32	NC_018019	GCGAC	2	10	84252	84261	20 %	0 %	40 %	40 %	392399662
33	NC_018019	TGGGA	2	10	87668	87677	20 %	20 %	60 %	0 %	392399668
34	NC_018019	GATCG	2	10	88768	88777	20 %	20 %	40 %	20 %	392399670
35	NC_018019	CAAAA	2	10	89501	89510	80 %	0 %	0 %	20 %	392399670
36	NC_018019	TGCAA	2	10	95349	95358	40 %	20 %	20 %	20 %	392399675
37	NC_018019	TGCAG	2	10	95569	95578	20 %	20 %	40 %	20 %	392399675
38	NC_018019	AGGTC	2	10	98005	98014	20 %	20 %	40 %	20 %	392399678
39	NC_018019	ACCAA	2	10	99864	99873	60 %	0 %	0 %	40 %	392399678
40	NC_018019	TCATC	2	10	101127	101136	20 %	40 %	0 %	40 %	392399679
41	NC_018019	ACCTG	2	10	103157	103166	20 %	20 %	20 %	40 %	392399680
42	NC_018019	CGGTG	2	10	103366	103375	0 %	20 %	60 %	20 %	392399680
43	NC_018019	CGGCG	2	10	105985	105994	0 %	0 %	60 %	40 %	392399683
44	NC_018019	CGCGG	2	10	106045	106054	0 %	0 %	60 %	40 %	392399684
45	NC_018019	GGATC	2	10	117399	117408	20 %	20 %	40 %	20 %	392399696
46	NC_018019	GACTG	2	10	126759	126768	20 %	20 %	40 %	20 %	392399701
47	NC_018019	TTGGT	2	10	128068	128077	0 %	60 %	40 %	0 %	392399701
48	NC_018019	GTGCG	2	10	130335	130344	0 %	20 %	60 %	20 %	392399702
49	NC_018019	GTGGC	2	10	132073	132082	0 %	20 %	60 %	20 %	392399703
50	NC_018019	GGGGC	2	10	132518	132527	0 %	0 %	80 %	20 %	392399704
51	NC_018019	AGACG	2	10	134323	134332	40 %	0 %	40 %	20 %	392399706
52	NC_018019	ACGGT	2	10	135651	135660	20 %	20 %	40 %	20 %	392399709
53	NC_018019	CGATC	2	10	135924	135933	20 %	20 %	20 %	40 %	392399709
54	NC_018019	TGGCC	2	10	136131	136140	0 %	20 %	40 %	40 %	392399709
55	NC_018019	TGGTG	2	10	136509	136518	0 %	40 %	60 %	0 %	392399709
56	NC_018019	GGAGT	2	10	136981	136990	20 %	20 %	60 %	0 %	392399709
57	NC_018019	ATTGC	2	10	140915	140924	20 %	40 %	20 %	20 %	392399712
58	NC_018019	TCACT	2	10	144780	144789	20 %	40 %	0 %	40 %	392399717
59	NC_018019	ATTTC	2	10	145397	145406	20 %	60 %	0 %	20 %	392399717
60	NC_018019	AGCAC	2	10	149020	149029	40 %	0 %	20 %	40 %	392399720
61	NC_018019	AATGG	2	10	149096	149105	40 %	20 %	40 %	0 %	392399720
62	NC_018019	GTGAG	2	10	150079	150088	20 %	20 %	60 %	0 %	392399722
63	NC_018019	CTGAA	2	10	150877	150886	40 %	20 %	20 %	20 %	392399722
64	NC_018019	CCAGC	2	10	152169	152178	20 %	0 %	20 %	60 %	392399723
65	NC_018019	TTGCC	2	10	152679	152688	0 %	40 %	20 %	40 %	392399724
66	NC_018019	TACGC	2	10	155196	155205	20 %	20 %	20 %	40 %	392399726
67	NC_018019	GGTTG	2	10	159962	159971	0 %	40 %	60 %	0 %	392399732
68	NC_018019	CCTTG	2	10	160338	160347	0 %	40 %	20 %	40 %	392399733
69	NC_018019	CGGTG	2	10	164304	164313	0 %	20 %	60 %	20 %	392399736
70	NC_018019	CATGG	2	10	166437	166446	20 %	20 %	40 %	20 %	392399738
71	NC_018019	CAGAT	2	10	166793	166802	40 %	20 %	20 %	20 %	392399738
72	NC_018019	GGATG	2	10	167691	167700	20 %	20 %	60 %	0 %	392399738
73	NC_018019	AGACA	2	10	175492	175501	60 %	0 %	20 %	20 %	392399739
74	NC_018019	TGACC	2	10	181180	181189	20 %	20 %	20 %	40 %	392399744
75	NC_018019	TTGCA	2	10	182461	182470	20 %	40 %	20 %	20 %	392399745
76	NC_018019	GTTTG	2	10	184371	184380	0 %	60 %	40 %	0 %	392399747
77	NC_018019	CGGAT	2	10	185311	185320	20 %	20 %	40 %	20 %	392399748
78	NC_018019	AGCGC	2	10	186469	186478	20 %	0 %	40 %	40 %	392399749
79	NC_018019	GCAGT	2	10	187956	187965	20 %	20 %	40 %	20 %	392399750
80	NC_018019	CAATG	2	10	188227	188236	40 %	20 %	20 %	20 %	392399750
81	NC_018019	TAACG	2	10	189179	189188	40 %	20 %	20 %	20 %	392399751
82	NC_018019	AAGCC	2	10	190506	190515	40 %	0 %	20 %	40 %	392399752
83	NC_018019	GGCCC	2	10	192578	192587	0 %	0 %	40 %	60 %	392399755
84	NC_018019	GAATT	2	10	196143	196152	40 %	40 %	20 %	0 %	392399760
85	NC_018019	CAAGG	2	10	197032	197041	40 %	0 %	40 %	20 %	392399760
86	NC_018019	GATGG	2	10	199472	199481	20 %	20 %	60 %	0 %	392399761
87	NC_018019	TGGCG	2	10	200206	200215	0 %	20 %	60 %	20 %	392399762
88	NC_018019	CAGGC	2	10	203329	203338	20 %	0 %	40 %	40 %	392399764
89	NC_018019	GCGAC	2	10	208270	208279	20 %	0 %	40 %	40 %	392399769
90	NC_018019	AGATC	2	10	208295	208304	40 %	20 %	20 %	20 %	392399769
91	NC_018019	AGAAA	2	10	209938	209947	80 %	0 %	20 %	0 %	392399771
92	NC_018019	AGTGC	2	10	214971	214980	20 %	20 %	40 %	20 %	392399777
93	NC_018019	CGGGG	2	10	215973	215982	0 %	0 %	80 %	20 %	392399778
94	NC_018019	CATTG	2	10	220257	220266	20 %	40 %	20 %	20 %	392399781
95	NC_018019	CGCAA	2	10	221071	221080	40 %	0 %	20 %	40 %	392399784
96	NC_018019	CAAGA	2	10	223301	223310	60 %	0 %	20 %	20 %	392399785
97	NC_018019	TGGCT	2	10	223497	223506	0 %	40 %	40 %	20 %	392399785
98	NC_018019	CTGTG	2	10	224817	224826	0 %	40 %	40 %	20 %	392399787
99	NC_018019	GCCGT	2	10	226218	226227	0 %	20 %	40 %	40 %	392399787
100	NC_018019	AGAAA	2	10	227125	227134	80 %	0 %	20 %	0 %	392399787
101	NC_018019	AGAGT	2	10	230548	230557	40 %	20 %	40 %	0 %	392399789
102	NC_018019	TTTTG	2	10	232847	232856	0 %	80 %	20 %	0 %	392399791
103	NC_018019	GCCAT	2	10	236204	236213	20 %	20 %	20 %	40 %	392399794
104	NC_018019	CGTAG	2	10	236430	236439	20 %	20 %	40 %	20 %	392399794
105	NC_018019	CCAGC	2	10	238191	238200	20 %	0 %	20 %	60 %	392399796
106	NC_018019	CGCAG	2	10	239266	239275	20 %	0 %	40 %	40 %	392399797
107	NC_018019	CATGC	2	10	241037	241046	20 %	20 %	20 %	40 %	392399798
108	NC_018019	CCATG	2	10	241268	241277	20 %	20 %	20 %	40 %	392399798
109	NC_018019	AATTG	2	10	241441	241450	40 %	40 %	20 %	0 %	392399798
110	NC_018019	CCCCG	2	10	246093	246102	0 %	0 %	20 %	80 %	392399802
111	NC_018019	GAAGT	2	10	246634	246643	40 %	20 %	40 %	0 %	392399802
112	NC_018019	CCGTG	2	10	246820	246829	0 %	20 %	40 %	40 %	392399802
113	NC_018019	GCGCA	2	10	251200	251209	20 %	0 %	40 %	40 %	392399805
114	NC_018019	TGCTC	2	10	251760	251769	0 %	40 %	20 %	40 %	392399806
115	NC_018019	GGCTC	2	10	254000	254009	0 %	20 %	40 %	40 %	392399809
116	NC_018019	TCCTT	2	10	254730	254739	0 %	60 %	0 %	40 %	392399810
117	NC_018019	GGAAG	2	10	255416	255425	40 %	0 %	60 %	0 %	392399811
118	NC_018019	CCATG	2	10	256814	256823	20 %	20 %	20 %	40 %	392399813
119	NC_018019	TTGCC	2	10	256901	256910	0 %	40 %	20 %	40 %	392399813
120	NC_018019	GAATG	2	10	260243	260252	40 %	20 %	40 %	0 %	392399815
121	NC_018019	GGTGT	2	10	260998	261007	0 %	40 %	60 %	0 %	392399816
122	NC_018019	CGGGG	2	10	261239	261248	0 %	0 %	80 %	20 %	392399816
123	NC_018019	TCGTC	2	10	262393	262402	0 %	40 %	20 %	40 %	392399817
124	NC_018019	GCATC	2	10	263137	263146	20 %	20 %	20 %	40 %	392399817
125	NC_018019	GGTGG	2	10	264278	264287	0 %	20 %	80 %	0 %	392399818
126	NC_018019	ACGCA	2	10	264549	264558	40 %	0 %	20 %	40 %	392399818
127	NC_018019	CTTCT	2	10	265489	265498	0 %	60 %	0 %	40 %	392399819
128	NC_018019	AATGC	2	10	266942	266951	40 %	20 %	20 %	20 %	392399820
129	NC_018019	TGCGT	2	10	270616	270625	0 %	40 %	40 %	20 %	392399825
130	NC_018019	CGGGT	2	10	273771	273780	0 %	20 %	60 %	20 %	392399831
131	NC_018019	GGCCC	2	10	276231	276240	0 %	0 %	40 %	60 %	392399834
132	NC_018019	TAGGC	2	10	276440	276449	20 %	20 %	40 %	20 %	392399834
133	NC_018019	GCAGG	2	10	282187	282196	20 %	0 %	60 %	20 %	392399839
134	NC_018019	AGGCC	2	10	287155	287164	20 %	0 %	40 %	40 %	392399842
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244	NC_018019	ATCAA	2	10	514053	514062	60 %	20 %	0 %	20 %	392400057
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249	NC_018019	CTGGG	2	10	526647	526656	0 %	20 %	60 %	20 %	392400071
250	NC_018019	TGCTG	2	10	526843	526852	0 %	40 %	40 %	20 %	392400071
251	NC_018019	TCCGG	2	10	530926	530935	0 %	20 %	40 %	40 %	392400075
252	NC_018019	GGCGT	2	10	531049	531058	0 %	20 %	60 %	20 %	392400075
253	NC_018019	CGGAG	2	10	533607	533616	20 %	0 %	60 %	20 %	392400077
254	NC_018019	GAACT	2	10	537344	537353	40 %	20 %	20 %	20 %	392400081
255	NC_018019	TATTC	2	10	541257	541266	20 %	60 %	0 %	20 %	392400086
256	NC_018019	TGTGA	2	10	541673	541682	20 %	40 %	40 %	0 %	392400087
257	NC_018019	GCTCT	2	10	542793	542802	0 %	40 %	20 %	40 %	392400088
258	NC_018019	GGAAG	2	10	542960	542969	40 %	0 %	60 %	0 %	392400089
259	NC_018019	TCAAC	2	10	543873	543882	40 %	20 %	0 %	40 %	392400090
260	NC_018019	ATGTG	2	10	544153	544162	20 %	40 %	40 %	0 %	392400090
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382	NC_018019	CATTG	2	10	799112	799121	20 %	40 %	20 %	20 %	392400317
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386	NC_018019	CGATG	2	10	808440	808449	20 %	20 %	40 %	20 %	392400326
387	NC_018019	ACTGA	2	10	810792	810801	40 %	20 %	20 %	20 %	392400329
388	NC_018019	ATGCA	2	10	815970	815979	40 %	20 %	20 %	20 %	392400335
389	NC_018019	TCAGC	2	10	816013	816022	20 %	20 %	20 %	40 %	392400335
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