MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 26219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018019	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399584
2	NC_018019	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399584
3	NC_018019	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399584
4	NC_018019	CTT	2	6	458	463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399584
5	NC_018019	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399584
6	NC_018019	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399584
7	NC_018019	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399584
8	NC_018019	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399584
9	NC_018019	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399584
10	NC_018019	TGA	2	6	1080	1085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399584
11	NC_018019	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392399584
12	NC_018019	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399584
13	NC_018019	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399584
14	NC_018019	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399584
15	NC_018019	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399584
16	NC_018019	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399584
17	NC_018019	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399584
18	NC_018019	TGG	2	6	1683	1688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399584
19	NC_018019	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399584
20	NC_018019	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399584
21	NC_018019	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399584
22	NC_018019	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399584
23	NC_018019	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399584
24	NC_018019	TAC	2	6	2498	2503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399585
25	NC_018019	TCA	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399585
26	NC_018019	GAT	2	6	2524	2529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399585
27	NC_018019	GCT	2	6	2628	2633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399585
28	NC_018019	CAT	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399585
29	NC_018019	GCA	3	9	2830	2838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399585
30	NC_018019	GCT	2	6	3171	3176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399585
31	NC_018019	CGG	2	6	3308	3313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399585
32	NC_018019	AGA	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399585
33	NC_018019	GAG	2	6	3493	3498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399585
34	NC_018019	TTG	2	6	3767	3772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399586
35	NC_018019	TTG	2	6	4067	4072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399586
36	NC_018019	GAT	2	6	4186	4191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399586
37	NC_018019	GAG	2	6	4390	4395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399586
38	NC_018019	TCA	2	6	4399	4404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399586
39	NC_018019	GAC	2	6	4510	4515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399586
40	NC_018019	CGA	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399586
41	NC_018019	GCC	2	6	4735	4740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399586
42	NC_018019	CTG	2	6	4869	4874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399587
43	NC_018019	AGA	2	6	4885	4890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399587
44	NC_018019	TGC	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399587
45	NC_018019	GCG	2	6	4933	4938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399587
46	NC_018019	CGG	2	6	5146	5151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399587
47	NC_018019	TGG	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399587
48	NC_018019	AGC	2	6	5194	5199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399587
49	NC_018019	ATG	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399587
50	NC_018019	CGG	2	6	5771	5776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399588
51	NC_018019	TGG	2	6	5870	5875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399588
52	NC_018019	GGT	2	6	5907	5912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399588
53	NC_018019	ACC	2	6	6060	6065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399588
54	NC_018019	ACC	3	9	6099	6107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399588
55	NC_018019	CAT	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399588
56	NC_018019	CGT	2	6	6129	6134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399588
57	NC_018019	GAA	2	6	6201	6206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399588
58	NC_018019	TGA	2	6	6227	6232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399588
59	NC_018019	CTG	2	6	6301	6306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399588
60	NC_018019	GAA	2	6	6311	6316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399588
61	NC_018019	GAA	2	6	6323	6328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399588
62	NC_018019	TTA	2	6	6338	6343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392399588
63	NC_018019	TGA	2	6	6431	6436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399588
64	NC_018019	TGA	2	6	6565	6570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399588
65	NC_018019	TCT	2	6	6819	6824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399588
66	NC_018019	GGC	2	6	6839	6844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399588
67	NC_018019	TGG	2	6	6890	6895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399588
68	NC_018019	ATT	2	6	7098	7103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392399588
69	NC_018019	ATG	2	6	7126	7131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399588
70	NC_018019	CAA	2	6	7142	7147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399588
71	NC_018019	GCT	3	9	7211	7219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399588
72	NC_018019	TTG	2	6	7224	7229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399588
73	NC_018019	CCG	2	6	7281	7286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399588
74	NC_018019	GAA	2	6	7359	7364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399588
75	NC_018019	CAA	2	6	7388	7393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399588
76	NC_018019	GAT	2	6	7395	7400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399588
77	NC_018019	ATG	2	6	7501	7506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399588
78	NC_018019	TGA	2	6	7517	7522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399588
79	NC_018019	TCG	2	6	7559	7564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399588
80	NC_018019	TTC	2	6	7899	7904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399589
81	NC_018019	GAG	2	6	7947	7952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399589
82	NC_018019	AGC	2	6	7959	7964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399589
83	NC_018019	TGC	2	6	7995	8000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399589
84	NC_018019	GAG	2	6	8106	8111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399589
85	NC_018019	CTG	2	6	8548	8553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399590
86	NC_018019	TGT	2	6	8593	8598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399590
87	NC_018019	CTG	2	6	8601	8606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399590
88	NC_018019	GTC	2	6	8662	8667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399590
89	NC_018019	GCG	2	6	8724	8729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399591
90	NC_018019	TGA	2	6	8810	8815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399591
91	NC_018019	CGA	2	6	9088	9093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399592
92	NC_018019	GCG	2	6	9102	9107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399592
93	NC_018019	GAG	2	6	9143	9148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399592
94	NC_018019	CCG	2	6	9235	9240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399592
95	NC_018019	ACG	2	6	9441	9446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399592
96	NC_018019	CGC	2	6	9451	9456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399592
97	NC_018019	TTC	2	6	9573	9578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399592
98	NC_018019	TGA	2	6	9600	9605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399592
99	NC_018019	TCT	2	6	9681	9686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399592
100	NC_018019	GAA	3	9	9857	9865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399592
101	NC_018019	ACA	2	6	9918	9923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399592
102	NC_018019	TGC	2	6	10158	10163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399592
103	NC_018019	TTA	2	6	10165	10170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392399592
104	NC_018019	TCG	2	6	10198	10203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399592
105	NC_018019	GAA	2	6	10220	10225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399592
106	NC_018019	CGA	2	6	10279	10284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399592
107	NC_018019	AGA	2	6	10422	10427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399592
108	NC_018019	CGT	2	6	10556	10561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399592
109	NC_018019	ATT	2	6	10568	10573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392399592
110	NC_018019	GAA	2	6	10595	10600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399592
111	NC_018019	GTG	2	6	10622	10627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399592
112	NC_018019	CGT	2	6	10688	10693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399592
113	NC_018019	CTT	2	6	10747	10752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399592
114	NC_018019	AAG	2	6	10973	10978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399592
115	NC_018019	GGT	2	6	11012	11017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399592
116	NC_018019	GAA	2	6	11039	11044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399592
117	NC_018019	ATG	2	6	11076	11081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399592
118	NC_018019	GCT	2	6	11086	11091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399592
119	NC_018019	GAA	2	6	11102	11107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399592
120	NC_018019	TGA	3	9	11131	11139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399592
121	NC_018019	CGA	2	6	11197	11202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399592
122	NC_018019	GCT	2	6	11206	11211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399592
123	NC_018019	TCT	2	6	11242	11247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399592
124	NC_018019	GGC	2	6	11261	11266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399592
125	NC_018019	CAG	2	6	11300	11305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399592
126	NC_018019	GTG	2	6	11310	11315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399592
127	NC_018019	GGT	2	6	11371	11376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399592
128	NC_018019	TGA	2	6	11380	11385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399592
129	NC_018019	CCA	2	6	11466	11471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399592
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