MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Flexibacter litoralis DSM 6794 chromosome

Total Repeats: 524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018018	TTACAA	2	12	19056	19067	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018018	TCAAAA	2	12	21051	21062	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018018	GTTAAA	2	12	23594	23605	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018018	TATTTA	2	12	27272	27283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018018	TGAATA	2	12	27447	27458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018018	AGAAAA	2	12	30591	30602	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018018	CTATAC	2	12	35425	35436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018018	TTTATT	2	12	49147	49158	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018018	TCTATT	2	12	100448	100459	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018018	AATTTC	2	12	100648	100659	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018018	ATTTTT	2	12	112067	112078	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018018	AAATAA	2	12	112292	112303	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018018	AGTTCT	2	12	118802	118813	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018018	ATTTTT	2	12	130218	130229	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018018	CACAAG	2	12	139364	139375	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018018	TTATAC	2	12	153984	153995	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018018	TTTAGT	2	12	156963	156974	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018018	AATACA	2	12	162149	162160	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018018	AGTTCA	2	12	166011	166022	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018018	AATACA	2	12	172969	172980	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018018	GGTTTT	2	12	195157	195168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018018	CTTTTA	2	12	205694	205705	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018018	TGCGCA	2	12	205918	205929	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018018	AAATAC	2	12	211964	211975	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018018	AAATAC	2	12	213818	213829	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018018	TAGATG	2	12	217054	217065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018018	TTGTAT	2	12	219712	219723	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018018	TCAAAA	2	12	224098	224109	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018018	ATTTTT	2	12	280491	280502	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018018	TGTATT	2	12	287454	287465	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018018	TTAGTT	2	12	298862	298873	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018018	ATATTT	2	12	307103	307114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018018	TACTTT	2	12	307366	307377	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018018	TACTTT	2	12	307722	307733	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018018	ATATTT	2	12	313234	313245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018018	TACTTT	2	12	313678	313689	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018018	ATATTT	2	12	315647	315658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018018	TACTTT	2	12	318821	318832	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018018	AAAATA	2	12	319926	319937	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018018	TACTTT	2	12	323384	323395	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018018	TACTTT	2	12	329239	329250	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018018	TTTATA	2	12	341036	341047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018018	ATATTT	2	12	348176	348187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018018	TAGATT	2	12	354346	354357	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018018	TTTGAT	2	12	360312	360323	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018018	TGTTTA	2	12	371354	371365	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018018	AATGAA	2	12	376392	376403	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018018	TTTGAG	2	12	379259	379270	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018018	GTATTT	2	12	379854	379865	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018018	GTATTT	2	12	381240	381251	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018018	AAATAC	2	12	384942	384953	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018018	GAAATT	2	12	389315	389326	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018018	CTACGA	2	12	397471	397482	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018018	AAATAC	2	12	397954	397965	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018018	AAATAC	2	12	400144	400155	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018018	AGAATA	2	12	403483	403494	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018018	ATTAAA	2	12	407547	407558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018018	CTTTTA	2	12	425093	425104	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018018	TAAAGT	2	12	435301	435312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018018	AATTTT	2	12	438240	438251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018018	AATACA	2	12	439153	439164	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018018	ATTTTA	2	12	440787	440798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018018	GTATTT	2	12	442065	442076	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018018	TGTATT	2	12	444766	444777	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018018	GTATTT	2	12	446261	446272	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018018	AATAAG	2	12	447244	447255	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018018	GTATTT	2	12	447338	447349	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018018	GTATTT	2	12	448906	448917	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018018	AATATT	2	12	502529	502540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018018	TACAAG	2	12	507172	507183	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018018	TTTATT	2	12	525512	525523	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018018	TTTAAA	2	12	533739	533750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018018	TAAAAG	2	12	536142	536153	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018018	ATGGTT	2	12	536187	536198	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018018	AAATAC	2	12	546980	546991	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018018	ATTTAC	2	12	560234	560245	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018018	TTAAAA	2	12	564382	564393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018018	CAAATA	2	12	582466	582477	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018018	TTAACG	2	12	594804	594815	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018018	TCAACG	2	12	595653	595664	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018018	TCGCTT	2	12	595765	595776	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018018	GTAAGC	2	12	603247	603258	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018018	ATTTAT	2	12	623050	623061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018018	GTATTT	2	12	657650	657661	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018018	TATTTT	2	12	665396	665407	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018018	AGCAAC	2	12	665856	665867	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018018	GATTTT	2	12	675057	675068	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018018	TTAAAA	2	12	676038	676049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018018	TAGAAA	2	12	676458	676469	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018018	ATAAAA	2	12	704730	704741	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018018	AATCAA	2	12	722477	722488	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018018	ATTTAC	2	12	732504	732515	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018018	AATTCA	2	12	733437	733448	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018018	TAATCC	2	12	813610	813621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018018	AATTTT	2	12	815114	815125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018018	TTTTTA	2	12	858265	858276	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018018	TCTAAA	2	12	912728	912739	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018018	ATAAAA	2	12	918129	918140	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018018	TTTTAT	2	12	922803	922814	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018018	TAAAAT	2	12	930102	930113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018018	ATTTTT	2	12	955836	955847	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018018	AAACCA	2	12	961673	961684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018018	AATTTT	2	12	988968	988979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018018	TATTTT	2	12	989035	989046	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018018	ATTCCT	2	12	989199	989210	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018018	TATTTT	2	12	997421	997432	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018018	TTTGAA	2	12	1000475	1000486	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018018	GTTAAA	2	12	1011239	1011250	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018018	ACAGAA	2	12	1017759	1017770	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_018018	ATTTTC	2	12	1041812	1041823	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018018	GTATTC	2	12	1087693	1087704	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_018018	AAATAT	2	12	1107797	1107808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018018	TATTTT	2	12	1111409	1111420	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018018	GACATG	2	12	1112930	1112941	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018018	AAAATA	2	12	1114822	1114833	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018018	AAATAA	2	12	1119090	1119101	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018018	AGGTGC	2	12	1125330	1125341	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_018018	GTACAG	2	12	1125449	1125460	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018018	TTACAA	2	12	1140515	1140526	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_018018	TTACTT	2	12	1158368	1158379	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018018	TATCAT	2	12	1158502	1158513	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018018	TAAAAA	2	12	1178962	1178973	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018018	TCAAAA	2	12	1186167	1186178	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_018018	ATTTAT	2	12	1195085	1195096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018018	AGAAAA	2	12	1221939	1221950	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018018	TTAACG	2	12	1224899	1224910	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_018018	TCAACG	2	12	1225748	1225759	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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497	NC_018018	TTATTT	2	12	4696504	4696515	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_018018	TATTTT	2	12	4702437	4702448	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_018018	TGATTA	2	12	4715201	4715212	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
500	NC_018018	GTTTTT	2	12	4716790	4716801	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

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