MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Aequorivita sublithincola DSM 14238 chromosome

Total Repeats: 198

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018013	AAATCC	2	12	2473	2484	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018013	AAAAGA	2	12	3124	3135	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018013	AAACTA	2	12	10839	10850	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018013	AGCGAA	2	12	38214	38225	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018013	ATTAAA	2	12	47683	47694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018013	ACTTCG	2	12	48559	48570	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018013	TTTTAT	2	12	58604	58615	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018013	AAAAGG	2	12	70050	70061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018013	TCGCCA	2	12	112682	112693	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018013	TTATAG	2	12	113465	113476	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018013	ACTTAC	2	12	114088	114099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018013	AGATGA	2	12	115243	115254	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018013	CATATT	2	12	170104	170115	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018013	ATTTTG	2	12	174184	174195	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018013	TAATGC	2	12	174957	174968	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018013	GAAATC	2	12	175678	175689	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018013	TAATTT	2	12	175902	175913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018013	TTTTAA	2	12	197206	197217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018013	ACAAAC	2	12	201324	201335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018013	CAAATT	2	12	203651	203662	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018013	CAAATT	2	12	203725	203736	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018013	CTAATT	2	12	208594	208605	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018013	TCGATT	2	12	233818	233829	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018013	AATACA	2	12	246215	246226	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018013	TCAACG	2	12	274436	274447	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018013	AATATA	2	12	308460	308471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018013	CAAAAA	2	12	325793	325804	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018013	ACAAGC	2	12	346789	346800	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018013	TGAAGT	2	12	349068	349079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018013	GAAAAA	2	12	363739	363750	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018013	AACTGT	2	12	367438	367449	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018013	ATAAAA	2	12	459523	459534	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018013	GTTAAA	2	12	477522	477533	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018013	CTTAAA	2	12	482889	482900	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018013	CTACTG	2	12	499745	499756	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018013	ATAAAA	2	12	499802	499813	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018013	TTATTT	2	12	506002	506013	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018013	ATTATA	2	12	521234	521245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018013	TTTTTA	2	12	528663	528674	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018013	TAAAAT	2	12	537740	537751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018013	TAAAAA	2	12	546145	546156	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018013	ATTTAA	2	12	547222	547233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018013	AAATTT	2	12	582085	582096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018013	TTTAAT	2	12	593532	593543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018013	TTTTAT	2	12	593793	593804	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018013	CTAATT	2	12	611120	611131	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018013	TAACTA	2	12	660355	660366	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018013	GCAGTT	2	12	678577	678588	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018013	TCATCT	2	12	678649	678660	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018013	TTAAAA	2	12	678730	678741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018013	GAAATT	2	12	707543	707554	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018013	ATATTT	2	12	713234	713245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018013	TCAATT	2	12	719783	719794	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018013	AATGAA	2	12	724169	724180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018013	TATTTT	2	12	751895	751906	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018013	ACAAAA	2	12	773733	773744	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018013	AAGTTA	2	12	780515	780526	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018013	AAAATC	2	12	798775	798786	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018013	AACAAA	2	12	820432	820443	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018013	CAGTTT	2	12	838626	838637	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018013	ATATAA	2	12	884963	884974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018013	TTGTTT	2	12	920897	920908	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018013	TTTCAG	2	12	1014942	1014953	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018013	ACTTCG	2	12	1017249	1017260	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018013	AGTTGA	2	12	1017294	1017305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018013	TTGAAG	2	12	1022214	1022225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018013	TAAAAG	2	12	1024482	1024493	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018013	GTTAAG	2	12	1052865	1052876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018013	TAAAAA	2	12	1055573	1055584	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018013	AAAGAT	2	12	1059804	1059815	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018013	ATTTAT	2	12	1078965	1078976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018013	ATGAAT	2	12	1079164	1079175	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018013	TATAAA	2	12	1161532	1161543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018013	ATTTCA	2	12	1202706	1202717	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018013	ACCTTA	2	12	1211500	1211511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018013	CTAAAT	2	12	1291000	1291011	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018013	GCTTCA	2	12	1296840	1296851	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018013	TCATTT	2	12	1336273	1336284	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018013	ATTTAT	2	12	1368868	1368879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018013	AATTTA	2	12	1376969	1376980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018013	ATTAAG	2	12	1414510	1414521	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018013	CATCTT	2	12	1424371	1424382	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018013	CAAAAA	2	12	1431294	1431305	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018013	AAAAAC	2	12	1494139	1494150	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018013	GAAATT	2	12	1498531	1498542	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018013	TAATGA	2	12	1509203	1509214	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018013	TAAAAA	2	12	1538089	1538100	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018013	TTTATC	2	12	1547866	1547877	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018013	ACATGC	2	12	1554900	1554911	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018013	GAAATC	2	12	1595346	1595357	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018013	CATATT	2	12	1633670	1633681	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018013	TTTAAA	2	12	1638286	1638297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018013	CCATCT	2	12	1646135	1646146	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018013	AATTAA	2	12	1686261	1686272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018013	AGAATT	2	12	1693628	1693639	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018013	CAAGTA	2	12	1751705	1751716	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018013	AAAAAC	2	12	1796534	1796545	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018013	GAAATT	2	12	1831892	1831903	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018013	TCTATG	2	12	1877967	1877978	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018013	AATCAA	2	12	1898627	1898638	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018013	GTTTTT	2	12	1935219	1935230	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018013	ATTTTT	2	12	1941071	1941082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018013	TTACCT	2	12	1945892	1945903	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018013	CAGTTT	2	12	1949437	1949448	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018013	ATATGA	2	12	1963944	1963955	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018013	TAAAAG	2	12	1964257	1964268	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018013	TTCATA	2	12	1982714	1982725	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018013	TTTTAT	2	12	1982922	1982933	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018013	TTGAAA	2	12	1997017	1997028	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018013	ATTTCA	2	12	2087255	2087266	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018013	ATTTTT	2	12	2094133	2094144	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018013	AAAGTT	2	12	2098077	2098088	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018013	TTTCAA	2	12	2114073	2114084	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_018013	CCAATC	2	12	2115610	2115621	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018013	TGCATC	2	12	2116037	2116048	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018013	TCAGTC	2	12	2117985	2117996	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018013	GAAATC	2	12	2124152	2124163	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_018013	CGAAAC	2	12	2124184	2124195	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018013	TAAATT	2	12	2125518	2125529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018013	TAATTA	2	12	2135667	2135678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018013	ATTTTT	2	12	2142842	2142853	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018013	GATTTC	2	12	2151108	2151119	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018013	GAAATA	2	12	2152574	2152585	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018013	TTTTAA	2	12	2185564	2185575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018013	ATAGAA	2	12	2185605	2185616	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018013	TCAGTC	2	12	2192207	2192218	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018013	CAGTCG	4	24	2233857	2233880	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018013	ACTGCG	2	12	2234031	2234042	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018013	ACTGCG	2	12	2234050	2234061	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018013	ATTCAG	2	12	2237165	2237176	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_018013	ATTTTT	2	12	2253050	2253061	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018013	TTAAAG	2	12	2262055	2262066	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018013	TTCAAT	2	12	2298101	2298112	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_018013	TTTAAA	2	12	2304146	2304157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018013	AAGACA	2	12	2321983	2321994	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_018013	AAAACA	2	12	2359036	2359047	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_018013	ATTTGC	2	12	2392513	2392524	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_018013	TAAATT	2	12	2506019	2506030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018013	TTTTCT	2	12	2541775	2541786	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_018013	CAACTG	2	12	2542839	2542850	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018013	ACTGAA	2	12	2587383	2587394	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_018013	TCTTAT	2	12	2634620	2634631	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_018013	TTTTAT	2	12	2634811	2634822	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018013	ACTGCG	2	12	2672667	2672678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018013	TGATTT	2	12	2708250	2708261	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018013	TCAACT	2	12	2719246	2719257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018013	TCTTTT	2	12	2794512	2794523	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_018013	GCTATG	2	12	2802066	2802077	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_018013	TAGATT	2	12	2815818	2815829	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018013	GAAACA	2	12	2819267	2819278	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_018013	TAAAGT	2	12	2846747	2846758	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018013	AAATAG	2	12	2861728	2861739	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018013	AGCGCC	2	12	2884052	2884063	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
154	NC_018013	ACCCTC	2	12	2892144	2892155	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_018013	TTTTGA	2	12	2903275	2903286	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018013	GCCTAT	2	12	2932267	2932278	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_018013	ATGTAA	2	12	2942337	2942348	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018013	CAAAAA	2	12	2957134	2957145	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_018013	TTTTGT	2	12	2967173	2967184	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018013	TTTATT	2	12	2981593	2981604	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018013	AATATA	2	12	2983604	2983615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018013	TATCTT	2	12	3006957	3006968	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_018013	TATTTA	2	12	3044556	3044567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018013	AATTTA	2	12	3064566	3064577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018013	TCAACG	2	12	3081974	3081985	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_018013	TGTTTT	2	12	3113874	3113885	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_018013	TTAAAA	2	12	3123644	3123655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_018013	CTAAAA	2	12	3135038	3135049	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.