MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Aequorivita sublithincola DSM 14238 chromosome

Total Repeats: 1438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018013	TGGTTT	2	12	4174	4185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390952793
2	NC_018013	TTCCTT	2	12	5084	5095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390952793
3	NC_018013	CAGAAC	2	12	6350	6361	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	390952794
4	NC_018013	TAAATC	2	12	7344	7355	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390952794
5	NC_018013	GGTTTC	2	12	9717	9728	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	390952794
6	NC_018013	TTTTTC	2	12	11011	11022	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	390952795
7	NC_018013	TTTGAA	2	12	11252	11263	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	390952795
8	NC_018013	GCTTCA	2	12	13046	13057	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390952797
9	NC_018013	AATAAA	2	12	15052	15063	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	390952800
10	NC_018013	CCTATG	2	12	16142	16153	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390952800
11	NC_018013	AGCTGC	2	12	19906	19917	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390952802
12	NC_018013	TTCATT	2	12	20091	20102	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390952802
13	NC_018013	AAAATA	2	12	20537	20548	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	390952804
14	NC_018013	CAGAAA	2	12	21800	21811	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	390952804
15	NC_018013	ATGGCA	2	12	24471	24482	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390952807
16	NC_018013	CCTGCT	2	12	29850	29861	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390952812
17	NC_018013	TTACAA	2	12	30926	30937	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390952814
18	NC_018013	TTTTTC	2	12	31833	31844	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	390952815
19	NC_018013	ATTTTC	2	12	32392	32403	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390952816
20	NC_018013	GATTAC	2	12	38675	38686	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390952823
21	NC_018013	ATATGA	2	12	51865	51876	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390952836
22	NC_018013	AATATG	2	12	52115	52126	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390952836
23	NC_018013	TTGAAA	2	12	55519	55530	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390952839
24	NC_018013	ATAACT	2	12	58460	58471	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390952841
25	NC_018013	TTCACA	2	12	59971	59982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390952842
26	NC_018013	CCGTTG	2	12	60256	60267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390952842
27	NC_018013	GGCATT	2	12	61116	61127	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390952842
28	NC_018013	TTCAAA	2	12	62943	62954	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390952844
29	NC_018013	ACATTT	2	12	64966	64977	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390952845
30	NC_018013	CATAAA	2	12	65735	65746	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	390952845
31	NC_018013	CAAAAA	2	12	71556	71567	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	390952850
32	NC_018013	TAAACT	2	12	72138	72149	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390952851
33	NC_018013	CGGGTC	2	12	75495	75506	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	390952853
34	NC_018013	TTGATC	2	12	78053	78064	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390952856
35	NC_018013	TAAGAA	2	12	78312	78323	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	390952856
36	NC_018013	CTTTAT	2	12	83437	83448	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390952860
37	NC_018013	AAATTC	2	12	86360	86371	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390952862
38	NC_018013	TTGAAA	2	12	92843	92854	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390952872
39	NC_018013	AATGGC	2	12	95857	95868	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390952875
40	NC_018013	ATTGAA	2	12	96122	96133	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390952875
41	NC_018013	CCATCT	2	12	106293	106304	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	390952887
42	NC_018013	ACTTCT	2	12	107907	107918	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	390952888
43	NC_018013	TGAAGC	2	12	108395	108406	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390952888
44	NC_018013	TTCAAT	2	12	108965	108976	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390952888
45	NC_018013	TTTTCT	2	12	110082	110093	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	390952889
46	NC_018013	TTTTGT	2	12	116430	116441	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	390952891
47	NC_018013	AAACTG	2	12	117387	117398	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390952892
48	NC_018013	CCGCCA	2	12	126895	126906	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	390952902
49	NC_018013	TTGCTA	2	12	127046	127057	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390952902
50	NC_018013	AACGTG	2	12	128905	128916	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390952904
51	NC_018013	GCTCTG	2	12	135637	135648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390952910
52	NC_018013	TGAATT	2	12	143851	143862	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	390952920
53	NC_018013	CTTTTT	2	12	145869	145880	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	390952923
54	NC_018013	AATTAA	2	12	147643	147654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390952925
55	NC_018013	TCATAT	2	12	149393	149404	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390952928
56	NC_018013	TTTTGG	2	12	151661	151672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390952929
57	NC_018013	TTCCTT	2	12	153332	153343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390952932
58	NC_018013	TTCAAT	2	12	155986	155997	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390952935
59	NC_018013	ATTGGC	2	12	164768	164779	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390952945
60	NC_018013	AATTGC	2	12	168118	168129	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390952947
61	NC_018013	TTTGCT	2	12	168202	168213	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	390952947
62	NC_018013	ATTGCC	2	12	169751	169762	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390952948
63	NC_018013	TAGATG	2	12	170505	170516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390952949
64	NC_018013	GGCAAC	2	12	174291	174302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390952954
65	NC_018013	ATTTAC	2	12	176774	176785	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390952956
66	NC_018013	ATTTAT	2	12	179046	179057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390952958
67	NC_018013	AAAATG	2	12	179063	179074	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	390952958
68	NC_018013	TCTTTT	2	12	181028	181039	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	390952959
69	NC_018013	TATTTT	2	12	186146	186157	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	390952963
70	NC_018013	GCTTAC	2	12	187709	187720	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390952964
71	NC_018013	CCCTTT	2	12	187779	187790	0 %	50 %	0 %	50 %	390952964
72	NC_018013	GAAAAA	3	18	187940	187957	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	390952964
73	NC_018013	AAAACA	2	12	188859	188870	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	390952965
74	NC_018013	TAATGG	2	12	190504	190515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390952969
75	NC_018013	CTATTA	2	12	195357	195368	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390952974
76	NC_018013	GCACAA	2	12	197141	197152	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	390952977
77	NC_018013	TGCTAT	2	12	204852	204863	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390952986
78	NC_018013	AGAAAA	2	12	205005	205016	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	390952986
79	NC_018013	TCAACC	2	12	215074	215085	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	390952997
80	NC_018013	TTTGGT	3	18	215425	215442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390952998
81	NC_018013	TGGTTT	2	12	215451	215462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390952998
82	NC_018013	TTTACT	2	12	223168	223179	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390953000
83	NC_018013	TGCAAT	2	12	227208	227219	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390953004
84	NC_018013	ATTGGA	2	12	232108	232119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390953009
85	NC_018013	GGTTTA	2	12	234459	234470	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	390953011
86	NC_018013	TTGGCT	2	12	236467	236478	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	390953013
87	NC_018013	TTCAGT	2	12	241425	241436	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390953019
88	NC_018013	CCAGCG	2	12	245369	245380	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	390953025
89	NC_018013	CGTAAC	2	12	247712	247723	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390953026
90	NC_018013	CTTCGT	2	12	248317	248328	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	390953026
91	NC_018013	TTGACT	2	12	264361	264372	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390953042
92	NC_018013	TTTGAT	2	12	267172	267183	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	390953043
93	NC_018013	TTTTCA	2	12	270424	270435	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390953047
94	NC_018013	CTATTT	2	12	270911	270922	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390953047
95	NC_018013	CTTTTT	2	12	282572	282583	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	390953053
96	NC_018013	TCCTTT	2	12	282719	282730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390953053
97	NC_018013	CTTTTA	2	12	284534	284545	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390953054
98	NC_018013	CCTTTT	2	12	287784	287795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390953057
99	NC_018013	TTTTTG	2	12	288808	288819	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	390953058
100	NC_018013	TGGCGA	2	12	290380	290391	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390953059
101	NC_018013	CCGTTT	2	12	291872	291883	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	390953061
102	NC_018013	CTATAA	2	12	299190	299201	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390953069
103	NC_018013	ATTGCG	2	12	301535	301546	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390953072
104	NC_018013	AAGTTG	2	12	302166	302177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390953072
105	NC_018013	ATATCA	2	12	302939	302950	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390953072
106	NC_018013	ACGGTC	2	12	304359	304370	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390953074
107	NC_018013	ATTTCA	2	12	304960	304971	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390953074
108	NC_018013	GCGGCA	2	12	310687	310698	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	390953080
109	NC_018013	AGAAAT	2	12	316734	316745	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	390953086
110	NC_018013	GAAATT	2	12	316946	316957	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390953087
111	NC_018013	TCCTGT	2	12	317360	317371	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	390953088
112	NC_018013	CTTTTA	2	12	321950	321961	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390953094
113	NC_018013	ACTTCA	2	12	326155	326166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390953097
114	NC_018013	ACTTCG	2	12	326179	326190	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390953097
115	NC_018013	GGCTTG	2	12	326371	326382	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	390953097
116	NC_018013	TTGGTT	2	12	327094	327105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390953097
117	NC_018013	TTTCAG	2	12	328902	328913	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390953098
118	NC_018013	TTGGTT	2	12	333102	333113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390953103
119	NC_018013	ACGGCA	2	12	341945	341956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390953112
120	NC_018013	CTTCAA	2	12	349050	349061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390953120
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122	NC_018013	TGATAA	2	12	352160	352171	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390953123
123	NC_018013	AAAATC	2	12	352996	353007	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	390953123
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230	NC_018013	CATAAA	2	12	601158	601169	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	390953365
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452	NC_018013	AATGCA	2	12	1106779	1106790	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390953797
453	NC_018013	ATATTG	2	12	1107352	1107363	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	390953798
454	NC_018013	TTTAGC	2	12	1108716	1108727	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390953800
455	NC_018013	TTTTGA	2	12	1109253	1109264	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	390953800
456	NC_018013	ATAACC	2	12	1110715	1110726	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	390953801
457	NC_018013	TTCGCC	2	12	1118668	1118679	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390953807
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459	NC_018013	AAAACC	2	12	1125960	1125971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390953815
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461	NC_018013	ACTTTC	2	12	1129896	1129907	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	390953819
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