MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Aequorivita sublithincola DSM 14238 chromosome

Total Repeats: 1636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018013	CCCGAA	2	12	3177705	3177716	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	390955636
1502	NC_018013	TGGGAA	2	12	3181859	3181870	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	390955640
1503	NC_018013	TTCATA	2	12	3184318	3184329	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390955641
1504	NC_018013	CCGAAA	2	12	3184571	3184582	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	390955641
1505	NC_018013	ACTTTC	2	12	3184943	3184954	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	390955641
1506	NC_018013	CCAACC	2	12	3192074	3192085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390955644
1507	NC_018013	TATGAA	2	12	3200990	3201001	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390955652
1508	NC_018013	TCGAAA	2	12	3210486	3210497	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390955658
1509	NC_018013	GTATAT	2	12	3213209	3213220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_018013	ATTGAA	2	12	3213239	3213250	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_018013	TTTCTT	2	12	3214112	3214123	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	390955661
1512	NC_018013	GCTCCT	2	12	3214407	3214418	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390955661
1513	NC_018013	TTCAAA	2	12	3215040	3215051	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390955661
1514	NC_018013	TTCATA	2	12	3216325	3216336	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390955662
1515	NC_018013	TTAAAA	2	12	3216584	3216595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390955662
1516	NC_018013	TTCATA	2	12	3217639	3217650	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390955663
1517	NC_018013	TCAATA	2	12	3220119	3220130	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390955664
1518	NC_018013	TTGAAA	2	12	3220375	3220386	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390955664
1519	NC_018013	CAGTTA	2	12	3222780	3222791	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390955667
1520	NC_018013	TGAAGA	2	12	3223090	3223101	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	390955668
1521	NC_018013	AAGTGA	2	12	3227321	3227332	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	390955671
1522	NC_018013	CAGCGT	2	12	3227394	3227405	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390955671
1523	NC_018013	TGAATG	2	12	3228199	3228210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390955673
1524	NC_018013	AGTTAC	2	12	3235769	3235780	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390955680
1525	NC_018013	TGAGGT	2	12	3237417	3237428	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	390955682
1526	NC_018013	TTTTAT	2	12	3238885	3238896	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_018013	TGGTGA	2	12	3240940	3240951	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	390955688
1528	NC_018013	AAGAAA	2	12	3241754	3241765	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	390955688
1529	NC_018013	AATTTG	2	12	3247950	3247961	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	390955695
1530	NC_018013	CACTAA	2	12	3248544	3248555	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_018013	TAATCA	2	12	3250851	3250862	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390955697
1532	NC_018013	AATTTT	2	12	3253296	3253307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390955699
1533	NC_018013	ACGAAA	2	12	3253986	3253997	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	390955699
1534	NC_018013	AGACCA	2	12	3258909	3258920	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	390955703
1535	NC_018013	AAAGTC	2	12	3259951	3259962	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390955705
1536	NC_018013	TTTTGA	2	12	3267330	3267341	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	390955712
1537	NC_018013	ATTTCA	2	12	3269465	3269476	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1538	NC_018013	TACTTT	2	12	3271178	3271189	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390955715
1539	NC_018013	ATGTAT	2	12	3271504	3271515	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	390955715
1540	NC_018013	ATCCAA	2	12	3271793	3271804	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	390955715
1541	NC_018013	GCTCTC	2	12	3272453	3272464	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390955716
1542	NC_018013	TTGCTT	2	12	3279088	3279099	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1543	NC_018013	AATATG	2	12	3279581	3279592	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390955718
1544	NC_018013	ATGAAA	2	12	3280996	3281007	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	390955718
1545	NC_018013	GGAAAC	2	12	3284699	3284710	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	390955724
1546	NC_018013	TGAAGA	2	12	3286373	3286384	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	390955726
1547	NC_018013	AATTTT	2	12	3291279	3291290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390955729
1548	NC_018013	ATAGAA	2	12	3293513	3293524	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	390955729
1549	NC_018013	TTCTAT	2	12	3293708	3293719	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1550	NC_018013	TTACAA	2	12	3294743	3294754	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1551	NC_018013	TGACGA	2	12	3297467	3297478	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390955732
1552	NC_018013	AGAAAA	2	12	3298120	3298131	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	390955733
1553	NC_018013	CTGAAG	2	12	3303938	3303949	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390955740
1554	NC_018013	AAGATA	2	12	3304048	3304059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	390955740
1555	NC_018013	CGGTAG	2	12	3310647	3310658	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390955746
1556	NC_018013	TATTTT	2	12	3311020	3311031	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	390955747
1557	NC_018013	TTTTGT	2	12	3315650	3315661	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	390955748
1558	NC_018013	ACAATA	2	12	3322871	3322882	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1559	NC_018013	TTTTTG	2	12	3326004	3326015	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	390955759
1560	NC_018013	AACAAA	2	12	3326856	3326867	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	390955759
1561	NC_018013	GCGATC	2	12	3329402	3329413	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390955761
1562	NC_018013	TTTTGA	2	12	3330279	3330290	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	390955761
1563	NC_018013	AGAAAA	2	12	3330475	3330486	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	390955762
1564	NC_018013	TTCCAG	2	12	3342523	3342534	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390955772
1565	NC_018013	AAACAA	2	12	3344446	3344457	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	390955775
1566	NC_018013	TACCAT	2	12	3347423	3347434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390955777
1567	NC_018013	TGTGTA	2	12	3347792	3347803	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	390955777
1568	NC_018013	TAATAT	2	12	3349226	3349237	50 %	50 %	0 %	0 %	390955779
1569	NC_018013	GGCATC	2	12	3354950	3354961	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390955781
1570	NC_018013	GTAATG	2	12	3355593	3355604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390955781
1571	NC_018013	AAATTT	2	12	3358266	3358277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_018013	AAAAGA	2	12	3363175	3363186	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_018013	AAAAAT	2	12	3363390	3363401	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_018013	GCAAAA	2	12	3364828	3364839	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	390955788
1575	NC_018013	GGAAAT	2	12	3366341	3366352	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	390955789
1576	NC_018013	AATGAT	2	12	3367844	3367855	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390955790
1577	NC_018013	ACTTAA	2	12	3368232	3368243	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390955790
1578	NC_018013	AAGATA	2	12	3373302	3373313	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	390955795
1579	NC_018013	GGTAAT	2	12	3375588	3375599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390955797
1580	NC_018013	ATTTTT	2	12	3378413	3378424	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_018013	AATCTT	2	12	3382856	3382867	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1582	NC_018013	AAATTT	2	12	3387051	3387062	50 %	50 %	0 %	0 %	390955807
1583	NC_018013	TATTTT	2	12	3388702	3388713	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_018013	TAATTT	2	12	3389111	3389122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390955809
1585	NC_018013	TTCATA	2	12	3389836	3389847	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390955809
1586	NC_018013	AATCAA	2	12	3390797	3390808	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	390955810
1587	NC_018013	ACAAAA	2	12	3392577	3392588	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	390955810
1588	NC_018013	TGCAGA	2	12	3406950	3406961	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390955820
1589	NC_018013	TAAAAA	2	12	3407779	3407790	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	390955821
1590	NC_018013	ATTTTT	2	12	3408319	3408330	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_018013	TTTAAA	2	12	3408379	3408390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_018013	ATGGAT	2	12	3408565	3408576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_018013	TTACTT	2	12	3413604	3413615	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1594	NC_018013	TTTTAA	2	12	3413679	3413690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_018013	TCAATT	2	12	3415971	3415982	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1596	NC_018013	TTGTAA	2	12	3418999	3419010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	390955836
1597	NC_018013	CAATGG	2	12	3419482	3419493	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390955836
1598	NC_018013	TCTGCA	2	12	3419496	3419507	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390955836
1599	NC_018013	ACAAAC	2	12	3425278	3425289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390955842
1600	NC_018013	CAAAGG	2	12	3425644	3425655	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	390955842
1601	NC_018013	ATTTTA	2	12	3426738	3426749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390955843
1602	NC_018013	CCTAAC	2	12	3427169	3427180	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	390955843
1603	NC_018013	AGTGGG	2	12	3434829	3434840	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	390955855
1604	NC_018013	TAAAGC	2	12	3435149	3435160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1605	NC_018013	CTATTC	2	12	3435626	3435637	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	390955856
1606	NC_018013	TAAAGA	2	12	3436122	3436133	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	390955856
1607	NC_018013	CAAAAC	2	12	3438844	3438855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390955859
1608	NC_018013	ACCATC	2	12	3441980	3441991	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	390955862
1609	NC_018013	GCCATT	2	12	3442834	3442845	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_018013	CAATTT	2	12	3444479	3444490	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390955864
1611	NC_018013	TGTAGG	2	12	3448143	3448154	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	390955869
1612	NC_018013	ATTTTG	3	18	3449241	3449258	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	390955870
1613	NC_018013	CATTTT	2	12	3450428	3450439	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390955871
1614	NC_018013	GATTGA	2	12	3452153	3452164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390955872
1615	NC_018013	CAATGG	2	12	3455541	3455552	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390955873
1616	NC_018013	TTCGGC	2	12	3456456	3456467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390955873
1617	NC_018013	AAATCA	2	12	3464638	3464649	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	390955882
1618	NC_018013	AAGCGA	2	12	3466079	3466090	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	390955882
1619	NC_018013	TAAAAA	2	12	3475788	3475799	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	390955891
1620	NC_018013	TTTCGG	2	12	3477330	3477341	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	390955892
1621	NC_018013	TCAAGG	2	12	3480541	3480552	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390955895
1622	NC_018013	CGTTTT	2	12	3483938	3483949	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	390955899
1623	NC_018013	GCAAAA	2	12	3486470	3486481	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	390955901
1624	NC_018013	TTTGAT	2	12	3488973	3488984	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	390955903
1625	NC_018013	CAAATT	2	12	3490732	3490743	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390955905
1626	NC_018013	GCATCA	2	12	3490992	3491003	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390955905
1627	NC_018013	CACCGC	2	12	3497379	3497390	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	390955910
1628	NC_018013	AAAAGA	2	12	3502171	3502182	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	390955911
1629	NC_018013	ACCGCC	2	12	3504046	3504057	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	390955912
1630	NC_018013	TTTGCA	2	12	3505839	3505850	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390955914
1631	NC_018013	CTTGGG	2	12	3508404	3508415	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	390955915
1632	NC_018013	TAATTT	2	12	3512211	3512222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_018013	CATTTT	2	12	3515792	3515803	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390955923
1634	NC_018013	AAGCAG	2	12	3516362	3516373	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	390955924
1635	NC_018013	AATAAA	2	12	3519106	3519117	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	390955927
1636	NC_018013	AAAACC	2	12	3520330	3520341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390955929

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