MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Alistipes finegoldii DSM 17242 chromosome

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018011	ATATTT	2	12	10162	10173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018011	TCCAGC	2	12	25617	25628	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018011	AAAGCA	2	12	30333	30344	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018011	TTCCGG	2	12	35873	35884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018011	AATAGT	2	12	42501	42512	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018011	CACCGT	2	12	42538	42549	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018011	GGAACG	2	12	48400	48411	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018011	GATGCT	2	12	53118	53129	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018011	TCGCTT	2	12	118208	118219	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018011	TCGCTT	2	12	119718	119729	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018011	ACCGTC	2	12	182317	182328	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018011	CGGCCC	2	12	196242	196253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_018011	CACACC	2	12	202951	202962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_018011	ATTTTT	2	12	208964	208975	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018011	TCCGGC	2	12	235666	235677	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018011	TTTTAT	2	12	238762	238773	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018011	AAGGAC	2	12	273250	273261	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018011	TTAATT	2	12	319225	319236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018011	TTAATT	2	12	329504	329515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018011	CAAGAT	2	12	341312	341323	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018011	TAAATC	2	12	367623	367634	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018011	AGCCGA	2	12	387659	387670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018011	GAACCG	2	12	398173	398184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018011	TAAAAA	2	12	409382	409393	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018011	ACCGAC	2	12	415794	415805	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018011	CCGCTT	2	12	417494	417505	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018011	CGCGCA	2	12	444521	444532	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018011	TATTGT	2	12	466349	466360	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018011	CTCTTT	2	12	486821	486832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018011	CCGGTC	2	12	506236	506247	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018011	ACACTG	2	12	525031	525042	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018011	CGCTAC	2	12	542018	542029	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018011	GGCGCG	2	12	552790	552801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018011	TTGTGT	2	12	565248	565259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018011	TAACCG	2	12	584069	584080	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018011	CGGTTA	2	12	590111	590122	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018011	TTATTC	2	12	598676	598687	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018011	ATTTTT	2	12	638276	638287	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018011	TCGTTT	2	12	638386	638397	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018011	GAAAAA	2	12	638855	638866	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018011	ATATTC	2	12	641580	641591	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018011	AAACGG	2	12	686967	686978	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018011	AAACGC	2	12	729551	729562	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018011	CAAAAT	2	12	748259	748270	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018011	TCGGGC	2	12	767887	767898	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018011	ACCTCT	2	12	768206	768217	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018011	GAAACC	2	12	820110	820121	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018011	TCGCTA	2	12	820323	820334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018011	TGGTCG	2	12	842996	843007	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018011	AGCGGG	2	12	846344	846355	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018011	AAAAAT	2	12	889106	889117	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018011	CACGGG	2	12	889451	889462	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018011	TTCCGC	2	12	892809	892820	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018011	TTCTGA	2	12	910473	910484	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018011	TTTTCG	2	12	929439	929450	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018011	AGCGAC	2	12	972100	972111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018011	TTTCTG	2	12	1045691	1045702	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018011	TCGGGC	2	12	1081767	1081778	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018011	ACCTCT	2	12	1082086	1082097	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018011	CCAGCG	2	12	1092891	1092902	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018011	CAAAAA	2	12	1222888	1222899	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018011	ATTTGC	2	12	1236155	1236166	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018011	AGAGGA	2	12	1244629	1244640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018011	AGAGCA	4	24	1244641	1244664	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018011	GCAGAC	2	12	1262671	1262682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018011	TTTGCA	2	12	1264215	1264226	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018011	CTGAGA	2	12	1266039	1266050	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018011	ATGCCG	2	12	1280079	1280090	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018011	CAATCA	2	12	1280094	1280105	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018011	GCCAGC	2	12	1295371	1295382	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018011	CCCGCG	2	12	1298086	1298097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_018011	GCTTCA	2	12	1332465	1332476	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018011	AATATA	2	12	1352064	1352075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018011	CCGACG	2	12	1381859	1381870	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018011	ACACCG	2	12	1413100	1413111	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018011	GCACCG	2	12	1416334	1416345	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018011	GATTTT	2	12	1458459	1458470	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018011	GATCAC	2	12	1460435	1460446	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018011	CGTGAT	2	12	1461332	1461343	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018011	ACCAAC	2	12	1462267	1462278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018011	CTACAT	2	12	1463064	1463075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018011	CAAGGT	2	12	1559582	1559593	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018011	CTGAAA	2	12	1560214	1560225	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018011	TCGGAT	2	12	1598123	1598134	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018011	GCGGCC	2	12	1694572	1694583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018011	TTTCGC	2	12	1700731	1700742	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018011	CGGTTC	2	12	1703288	1703299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018011	TGCGCC	2	12	1731642	1731653	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018011	CGGCTG	2	12	1757847	1757858	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018011	CGCGGT	2	12	1760113	1760124	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018011	GAATCC	2	12	1782955	1782966	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018011	GGAAAG	2	12	1795585	1795596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018011	GGTTGC	2	12	1800139	1800150	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018011	TTGTAT	2	12	1809606	1809617	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018011	CCGTTC	2	12	1816143	1816154	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018011	CTTTGC	2	12	1834689	1834700	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018011	ATGCGG	2	12	1869633	1869644	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018011	TGCCGA	2	12	1883060	1883071	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018011	CGACCA	2	12	1883377	1883388	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018011	CATGTT	2	12	1886507	1886518	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018011	TCGTTT	2	12	1899083	1899094	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018011	ATTTAT	2	12	1949717	1949728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018011	CGGGCG	2	12	2004873	2004884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018011	GTCGCT	2	12	2007006	2007017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018011	GGCAAG	2	12	2007656	2007667	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018011	CCGTTC	2	12	2008443	2008454	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018011	TTTTCG	2	12	2011526	2011537	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018011	GGACAA	2	12	2022448	2022459	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018011	AGGGAG	2	12	2091341	2091352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018011	CAGTTT	2	12	2095056	2095067	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018011	AGAATA	2	12	2111551	2111562	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018011	TTTATC	2	12	2125633	2125644	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018011	CGGTCA	2	12	2126541	2126552	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018011	TTGGCG	2	12	2153375	2153386	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018011	GAAAAA	2	12	2179779	2179790	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018011	AAGCGA	2	12	2182048	2182059	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018011	AAGCGA	2	12	2183720	2183731	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_018011	ATTTTC	2	12	2223124	2223135	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018011	TTAAAA	2	12	2232356	2232367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018011	CAATCG	2	12	2260003	2260014	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018011	TTAATA	2	12	2268959	2268970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018011	AAAATT	2	12	2280773	2280784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018011	AAAACA	2	12	2287813	2287824	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_018011	ATTTTT	2	12	2289496	2289507	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018011	ACGGCG	2	12	2321819	2321830	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018011	GAAGGT	2	12	2322243	2322254	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018011	GAAACC	2	12	2324080	2324091	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018011	CGGGGT	2	12	2360531	2360542	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_018011	CCTGCG	2	12	2362836	2362847	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018011	TTCGGC	2	12	2363307	2363318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018011	GGGACC	2	12	2363370	2363381	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018011	GGTTTC	2	12	2365494	2365505	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_018011	CCGTCG	2	12	2365673	2365684	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018011	CGATTG	2	12	2369544	2369555	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_018011	CTTTTT	2	12	2389230	2389241	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_018011	AACACC	2	12	2396159	2396170	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018011	ATTAAT	2	12	2397435	2397446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018011	GCCCAC	2	12	2399397	2399408	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_018011	CATCGA	2	12	2427613	2427624	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018011	ACGGGC	2	12	2450218	2450229	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018011	CATTCT	2	12	2454361	2454372	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018011	ATGTAT	2	12	2518273	2518284	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018011	TGTAGG	2	12	2534196	2534207	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018011	TCAAAT	2	12	2552774	2552785	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_018011	TAACCT	2	12	2593127	2593138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018011	TTTCAG	2	12	2635917	2635928	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_018011	AATGCG	2	12	2710385	2710396	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_018011	GTTTTT	2	12	2711189	2711200	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018011	GTGTAG	2	12	2715262	2715273	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018011	TTTTTA	2	12	2786505	2786516	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018011	TAATTT	2	12	2806474	2806485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018011	GGTTGT	2	12	2829240	2829251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018011	TTCCGG	2	12	2832645	2832656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_018011	TTTTTG	2	12	2837147	2837158	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018011	GAAACC	2	12	2841491	2841502	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_018011	TAAAAA	2	12	2847946	2847957	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018011	TTTCAT	2	12	2916514	2916525	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_018011	ATATGG	2	12	2928727	2928738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018011	TAGACG	2	12	2939931	2939942	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_018011	TCGGCG	2	12	2976317	2976328	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_018011	TATAAT	2	12	3030756	3030767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018011	TGACTG	2	12	3036449	3036460	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_018011	ATTTGC	2	12	3083559	3083570	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_018011	GAGCGT	2	12	3128687	3128698	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
165	NC_018011	CGCGGC	2	12	3143547	3143558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
166	NC_018011	TAAGTG	2	12	3171866	3171877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_018011	CCTGCG	2	12	3197487	3197498	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
168	NC_018011	GTTCCG	2	12	3242494	3242505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_018011	CGGCCG	2	12	3261291	3261302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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180	NC_018011	TTCCCG	2	12	3611463	3611474	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
181	NC_018011	GAAATA	2	12	3619226	3619237	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
182	NC_018011	AATTTT	2	12	3622117	3622128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_018011	TCGGGT	2	12	3660036	3660047	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
184	NC_018011	AGAGGA	2	12	3671615	3671626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.