MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Alistipes finegoldii DSM 17242 chromosome

Total Repeats: 1500

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018011	TTTA	2	8	9603	9610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018011	TCGA	2	8	15305	15312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018011	GCGG	2	8	17323	17330	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018011	GCGG	2	8	17349	17356	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018011	GCGG	2	8	17472	17479	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018011	GGAA	2	8	24168	24175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018011	GCAG	2	8	24466	24473	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018011	CGTC	2	8	25171	25178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018011	GACG	2	8	26014	26021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018011	CGCC	2	8	26188	26195	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_018011	GTAT	2	8	33314	33321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018011	GCGG	2	8	33426	33433	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018011	GCGG	2	8	33437	33444	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018011	ATGA	2	8	41794	41801	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018011	CCGT	2	8	41867	41874	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018011	CGTC	2	8	42372	42379	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018011	TCCG	2	8	42739	42746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018011	AGGC	2	8	43072	43079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018011	GCCG	2	8	44369	44376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018011	CGAA	2	8	46458	46465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018011	GCCG	2	8	46843	46850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018011	TAAA	2	8	47452	47459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018011	GCCG	2	8	48234	48241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018011	GTGG	2	8	48299	48306	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018011	AACA	2	8	48483	48490	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018011	CAAA	2	8	49503	49510	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018011	TCCG	2	8	49569	49576	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018011	CGAA	2	8	49869	49876	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018011	CGGA	2	8	52941	52948	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018011	CATC	2	8	53354	53361	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018011	GCCG	2	8	53871	53878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018011	TGCA	2	8	54081	54088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018011	AGGC	2	8	66079	66086	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018011	CGTC	2	8	67898	67905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018011	ATCA	2	8	69866	69873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018011	CGCA	2	8	98050	98057	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018011	GGCA	2	8	98101	98108	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018011	CGGG	2	8	98883	98890	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018011	CGGG	2	8	99018	99025	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018011	CGGG	2	8	99038	99045	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018011	CGGG	2	8	99058	99065	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018011	GCAC	2	8	99252	99259	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018011	CCGG	2	8	101937	101944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018011	GAAA	2	8	107107	107114	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018011	CAAA	2	8	112094	112101	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018011	TACA	2	8	113459	113466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018011	GGCA	2	8	115580	115587	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018011	TGAA	2	8	117755	117762	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018011	TTCG	2	8	118106	118113	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018011	TCGC	2	8	118634	118641	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018011	TTTC	2	8	118662	118669	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018011	TACC	2	8	119341	119348	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018011	AGGT	2	8	120444	120451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018011	AGTT	2	8	121115	121122	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018011	GGAC	2	8	122513	122520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018011	CGGA	2	8	122557	122564	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018011	AAAC	2	8	123500	123507	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018011	CGGA	2	8	132064	132071	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018011	GCCC	2	8	137146	137153	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_018011	AACC	2	8	150210	150217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018011	GCCG	2	8	154503	154510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018011	CCGC	2	8	155059	155066	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_018011	CGAA	2	8	156207	156214	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018011	ACCG	2	8	156303	156310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018011	CAAA	2	8	156317	156324	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018011	CGGC	2	8	156345	156352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018011	CCGG	2	8	156419	156426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018011	ATTA	2	8	158058	158065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018011	AACG	2	8	158079	158086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018011	CGCC	2	8	162673	162680	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_018011	GTAA	2	8	165997	166004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018011	ACAG	2	8	179300	179307	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018011	TCCG	2	8	179677	179684	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018011	CCGA	2	8	179706	179713	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018011	CCGG	2	8	180315	180322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018011	CAGG	2	8	180349	180356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018011	AAAT	2	8	181418	181425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018011	CGGA	2	8	181540	181547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018011	CGAA	2	8	181574	181581	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018011	CCGA	2	8	181597	181604	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018011	CGGA	2	8	181785	181792	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018011	GCGG	2	8	181859	181866	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018011	GCCA	2	8	182071	182078	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018011	ATCC	2	8	182487	182494	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018011	GTGC	2	8	186918	186925	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018011	CAAA	2	8	187077	187084	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018011	CAGA	2	8	189716	189723	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018011	GCCG	2	8	191876	191883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018011	CGCA	2	8	191921	191928	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018011	CGGC	2	8	202971	202978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018011	GCCG	2	8	203088	203095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018011	AAAT	2	8	203124	203131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018011	AATC	2	8	205622	205629	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018011	TCCA	2	8	205633	205640	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018011	GCTC	2	8	205779	205786	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018011	CTCA	2	8	205811	205818	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018011	CATC	2	8	207350	207357	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018011	TCAA	2	8	207775	207782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018011	TCTA	2	8	208707	208714	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018011	GAAA	2	8	209025	209032	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018011	CTCA	2	8	210089	210096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018011	CTTT	2	8	211371	211378	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018011	GCGG	2	8	211812	211819	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018011	CCGG	2	8	216564	216571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018011	CCGG	2	8	216583	216590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018011	CTTT	2	8	218272	218279	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018011	TCAC	2	8	218317	218324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018011	GAAA	2	8	231969	231976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018011	AACC	2	8	235338	235345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018011	CGGA	2	8	235478	235485	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018011	AAGA	2	8	238839	238846	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018011	TGAT	2	8	251292	251299	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018011	CTTT	2	8	251401	251408	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018011	TAAA	2	8	252485	252492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018011	GATA	2	8	252558	252565	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018011	ATTT	2	8	252706	252713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018011	ATTA	2	8	252778	252785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018011	CCGG	2	8	253447	253454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018011	CGAG	2	8	253513	253520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018011	GCAA	2	8	261263	261270	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018011	TGAC	2	8	261499	261506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018011	GGCC	2	8	263199	263206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018011	AGAT	2	8	263322	263329	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018011	CGCA	2	8	267262	267269	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018011	TTCT	2	8	269656	269663	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018011	CCCG	2	8	270502	270509	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_018011	GCGG	2	8	270519	270526	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018011	GGCC	2	8	273277	273284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018011	CCGG	2	8	273480	273487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018011	ACGC	2	8	282586	282593	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018011	TTCT	2	8	286748	286755	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018011	CCGC	2	8	287153	287160	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_018011	GCAA	2	8	288811	288818	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018011	GTTT	2	8	293725	293732	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018011	TTTA	2	8	294589	294596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018011	GCTT	2	8	296706	296713	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018011	CCAT	2	8	296758	296765	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018011	CTGC	2	8	296815	296822	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018011	TAAG	2	8	297058	297065	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018011	TCAA	2	8	303770	303777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018011	AAAG	2	8	303984	303991	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018011	ACAG	2	8	304480	304487	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018011	TAAT	2	8	329616	329623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018011	GTCT	2	8	329636	329643	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_018011	ATTT	2	8	331254	331261	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018011	AGGC	2	8	339138	339145	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_018011	TCGG	2	8	339852	339859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018011	GCGG	2	8	340347	340354	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018011	AGGC	2	8	340946	340953	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018011	GATC	2	8	341077	341084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_018011	CTGC	2	8	341123	341130	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_018011	CTCG	2	8	341159	341166	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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169	NC_018011	CGCC	2	8	414721	414728	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
170	NC_018011	CATT	2	8	414856	414863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
171	NC_018011	GGGA	2	8	415035	415042	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_018011	CGCC	2	8	1065806	1065813	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
448	NC_018011	GACT	2	8	1069264	1069271	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
449	NC_018011	TCCC	2	8	1069384	1069391	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
450	NC_018011	GTCA	2	8	1070109	1070116	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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461	NC_018011	GTAA	2	8	1078989	1078996	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_018011	CATC	2	8	1094191	1094198	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
475	NC_018011	GTTC	2	8	1098180	1098187	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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480	NC_018011	GGAG	2	8	1109519	1109526	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
481	NC_018011	GTCG	2	8	1114132	1114139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
482	NC_018011	CGGC	2	8	1115046	1115053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
483	NC_018011	CAGT	2	8	1115282	1115289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
484	NC_018011	CGGA	2	8	1116463	1116470	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_018011	GGGA	2	8	1116484	1116491	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
486	NC_018011	CTCC	2	8	1116506	1116513	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
487	NC_018011	TGCA	2	8	1116561	1116568	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
488	NC_018011	CGGA	2	8	1120422	1120429	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
489	NC_018011	CATA	2	8	1131812	1131819	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
490	NC_018011	GACA	2	8	1135823	1135830	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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492	NC_018011	ACCG	2	8	1138229	1138236	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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499	NC_018011	TATC	2	8	1181143	1181150	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
500	NC_018011	TAAA	2	8	1181354	1181361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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