MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfurospirillum barnesii SES-3 chromosome

Total Repeats: 433

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018002	TTAA	2	8	1508	1515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018002	TTTA	2	8	9895	9902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018002	ATAA	2	8	13741	13748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018002	GGAA	2	8	13885	13892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018002	AAAT	2	8	13974	13981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018002	TAAA	2	8	14500	14507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018002	TTTA	2	8	16835	16842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018002	TAAA	2	8	32779	32786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018002	CTTT	2	8	45177	45184	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018002	AATA	2	8	47944	47951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018002	GATT	2	8	65098	65105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018002	TTTA	2	8	65187	65194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018002	AATA	2	8	73966	73973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018002	AAAT	2	8	87196	87203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018002	AAAT	3	12	87386	87397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018002	CTTA	2	8	87548	87555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018002	GATT	2	8	87997	88004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018002	GGGT	2	8	88109	88116	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018002	TTAT	2	8	88170	88177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018002	ATTG	2	8	91248	91255	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018002	GTAA	2	8	93200	93207	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018002	ATTT	2	8	96211	96218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018002	TTTA	2	8	116033	116040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018002	GGCA	2	8	117876	117883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018002	ACAG	2	8	124620	124627	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018002	TCTT	2	8	124659	124666	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018002	AAGA	2	8	124931	124938	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018002	GATT	2	8	126745	126752	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018002	TCAA	2	8	126757	126764	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018002	ATGG	2	8	128450	128457	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018002	AATA	2	8	163628	163635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018002	CAAG	2	8	177016	177023	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018002	TTAA	2	8	180947	180954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018002	ATAA	2	8	181027	181034	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018002	TATT	2	8	194006	194013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018002	AATA	2	8	197285	197292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018002	AAAT	2	8	199874	199881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018002	GTTT	2	8	212613	212620	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018002	TAAT	2	8	224472	224479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018002	TAGT	2	8	225963	225970	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018002	TTAG	2	8	251562	251569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018002	ACCT	2	8	253806	253813	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018002	GTTT	2	8	253814	253821	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018002	GAGC	2	8	253864	253871	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018002	GTTT	2	8	253888	253895	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018002	TTCA	2	8	253978	253985	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018002	GCTT	2	8	254621	254628	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018002	TAAA	2	8	273416	273423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018002	ACTC	2	8	273843	273850	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018002	CTTT	2	8	277850	277857	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018002	TTGT	2	8	283271	283278	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018002	ATTT	2	8	284875	284882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018002	ACAT	2	8	286899	286906	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018002	AAGT	2	8	289971	289978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018002	TTAC	2	8	307196	307203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018002	AAAG	2	8	310509	310516	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018002	AGTA	2	8	320858	320865	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018002	GACT	2	8	321896	321903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018002	TTTC	2	8	322120	322127	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018002	GAAA	2	8	322350	322357	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018002	TTTC	2	8	322414	322421	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018002	GGTT	2	8	330766	330773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018002	GAAA	2	8	333501	333508	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018002	ATTT	2	8	338417	338424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018002	CTTT	2	8	354095	354102	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018002	TCTA	2	8	354127	354134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018002	TAAA	2	8	362883	362890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018002	TAAA	2	8	367893	367900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018002	CCAA	2	8	368862	368869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018002	AAAC	2	8	372020	372027	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018002	GAAT	2	8	375311	375318	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018002	TAAA	2	8	394272	394279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018002	AATT	2	8	432472	432479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018002	ATTA	2	8	432489	432496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018002	AAAT	2	8	448494	448501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018002	TTTA	2	8	456600	456607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018002	ATTA	2	8	456630	456637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018002	CAAA	2	8	459031	459038	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018002	ACTC	2	8	460179	460186	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018002	TTGA	2	8	460400	460407	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018002	ATCA	2	8	460409	460416	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018002	TTGA	2	8	468265	468272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018002	TGAA	2	8	468521	468528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018002	AAGA	2	8	471585	471592	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018002	AAAG	2	8	476243	476250	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018002	TAGA	2	8	476451	476458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018002	TTCT	2	8	479068	479075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018002	ATTT	2	8	484577	484584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018002	TTTA	2	8	486135	486142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018002	CAAG	2	8	487431	487438	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018002	AATT	2	8	487874	487881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018002	TTAT	2	8	488077	488084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018002	CTAT	2	8	488284	488291	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018002	GAAA	2	8	518182	518189	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018002	TAAA	2	8	519820	519827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018002	GCTT	2	8	520234	520241	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018002	ATAA	2	8	527332	527339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018002	ATAA	2	8	540764	540771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018002	TTAA	2	8	540781	540788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018002	TTAT	2	8	548840	548847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018002	TTGA	2	8	553694	553701	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018002	AATT	2	8	557306	557313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018002	CTTA	2	8	561005	561012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018002	TAAA	2	8	566681	566688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018002	ATCC	2	8	566745	566752	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018002	AAAG	2	8	573619	573626	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018002	AGGT	2	8	585037	585044	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018002	ATTT	2	8	611680	611687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018002	TTTA	2	8	618604	618611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018002	ATCA	2	8	631582	631589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018002	TAAT	2	8	636568	636575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018002	AATA	2	8	636581	636588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018002	TAAT	2	8	642579	642586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018002	TCTT	2	8	643305	643312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018002	GATT	2	8	657350	657357	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018002	ATTG	2	8	657532	657539	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018002	CAAC	2	8	657640	657647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018002	TTAT	2	8	661023	661030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018002	TTAG	2	8	662925	662932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018002	TAAG	2	8	679159	679166	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018002	TTTA	2	8	679234	679241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018002	ATTT	2	8	682455	682462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018002	TCTT	2	8	684319	684326	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018002	ATTA	2	8	714572	714579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018002	AAGA	2	8	734810	734817	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018002	AAAT	2	8	734879	734886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018002	ATTT	2	8	735768	735775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018002	GCTT	2	8	750978	750985	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018002	GAAA	2	8	762951	762958	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018002	TATT	2	8	763085	763092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018002	GCGT	2	8	763098	763105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018002	CTCA	2	8	764819	764826	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018002	AATA	2	8	765631	765638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018002	TAAA	2	8	772364	772371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018002	TATT	2	8	776154	776161	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018002	AATG	2	8	797397	797404	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018002	TAAA	2	8	809151	809158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018002	TTAT	2	8	809268	809275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018002	TGAT	2	8	810476	810483	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018002	GTTT	2	8	813947	813954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018002	CATT	2	8	814261	814268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018002	ATTT	2	8	814306	814313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018002	GTAG	2	8	814411	814418	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018002	AAGA	2	8	824560	824567	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018002	TTTC	2	8	824570	824577	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018002	TTAA	2	8	830541	830548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018002	GTTT	2	8	833590	833597	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018002	ACTT	2	8	845706	845713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018002	GAAG	2	8	850299	850306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018002	GAAA	2	8	916206	916213	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018002	TTAT	2	8	917622	917629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018002	TAAA	2	8	919895	919902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.