MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Desulfurococcus fermentans DSM 16532 chromosome

Total Repeats: 630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018001	AGGAG	2	10	2320	2329	40 %	0 %	60 %	0 %	390937755
2	NC_018001	AACAT	2	10	2765	2774	60 %	20 %	0 %	20 %	390937755
3	NC_018001	GAGGG	2	10	4482	4491	20 %	0 %	80 %	0 %	390937756
4	NC_018001	TATAT	2	10	5538	5547	40 %	60 %	0 %	0 %	390937756
5	NC_018001	CAGTA	2	10	8466	8475	40 %	20 %	20 %	20 %	390937759
6	NC_018001	TGCTT	2	10	16027	16036	0 %	60 %	20 %	20 %	390937768
7	NC_018001	TTCAT	2	10	16657	16666	20 %	60 %	0 %	20 %	390937769
8	NC_018001	TCTCC	2	10	18860	18869	0 %	40 %	0 %	60 %	390937770
9	NC_018001	GGCCC	2	10	21708	21717	0 %	0 %	40 %	60 %	390937773
10	NC_018001	ACAGG	2	10	24714	24723	40 %	0 %	40 %	20 %	390937775
11	NC_018001	TGGCT	2	10	28637	28646	0 %	40 %	40 %	20 %	390937779
12	NC_018001	ATGGT	2	10	28739	28748	20 %	40 %	40 %	0 %	390937779
13	NC_018001	AATGG	2	10	28899	28908	40 %	20 %	40 %	0 %	390937779
14	NC_018001	ACAAT	2	10	29741	29750	60 %	20 %	0 %	20 %	390937780
15	NC_018001	GATAT	2	10	42833	42842	40 %	40 %	20 %	0 %	390937799
16	NC_018001	CACTA	2	10	46338	46347	40 %	20 %	0 %	40 %	390937801
17	NC_018001	ATATA	2	10	54219	54228	60 %	40 %	0 %	0 %	390937810
18	NC_018001	CACAA	2	10	57263	57272	60 %	0 %	0 %	40 %	390937815
19	NC_018001	CGTGG	2	10	59137	59146	0 %	20 %	60 %	20 %	390937817
20	NC_018001	GCATC	2	10	59610	59619	20 %	20 %	20 %	40 %	390937817
21	NC_018001	AATAG	2	10	61731	61740	60 %	20 %	20 %	0 %	390937819
22	NC_018001	AGATA	2	10	63607	63616	60 %	20 %	20 %	0 %	390937821
23	NC_018001	TGCAT	2	10	66166	66175	20 %	40 %	20 %	20 %	390937824
24	NC_018001	CTCTC	2	10	68115	68124	0 %	40 %	0 %	60 %	390937826
25	NC_018001	AGCAG	2	10	75884	75893	40 %	0 %	40 %	20 %	390937835
26	NC_018001	CTAGC	2	10	83059	83068	20 %	20 %	20 %	40 %	390937845
27	NC_018001	ATATT	2	10	83973	83982	40 %	60 %	0 %	0 %	390937846
28	NC_018001	TAAAG	2	10	84175	84184	60 %	20 %	20 %	0 %	390937846
29	NC_018001	GTATT	2	10	87822	87831	20 %	60 %	20 %	0 %	390937850
30	NC_018001	TGAGG	2	10	88542	88551	20 %	20 %	60 %	0 %	390937852
31	NC_018001	CCCCT	2	10	90586	90595	0 %	20 %	0 %	80 %	390937855
32	NC_018001	ACCAT	2	10	90772	90781	40 %	20 %	0 %	40 %	390937855
33	NC_018001	GGGTA	2	10	90919	90928	20 %	20 %	60 %	0 %	390937855
34	NC_018001	TGGCT	2	10	92687	92696	0 %	40 %	40 %	20 %	390937857
35	NC_018001	ATTAT	2	10	93707	93716	40 %	60 %	0 %	0 %	390937858
36	NC_018001	TGGTG	2	10	96685	96694	0 %	40 %	60 %	0 %	390937861
37	NC_018001	CTTTT	2	10	99474	99483	0 %	80 %	0 %	20 %	390937864
38	NC_018001	CTTCA	2	10	100044	100053	20 %	40 %	0 %	40 %	390937865
39	NC_018001	TTGAA	2	10	102205	102214	40 %	40 %	20 %	0 %	390937868
40	NC_018001	TACAT	2	10	103110	103119	40 %	40 %	0 %	20 %	390937869
41	NC_018001	CTTCT	2	10	105843	105852	0 %	60 %	0 %	40 %	390937871
42	NC_018001	GGAAT	2	10	106364	106373	40 %	20 %	40 %	0 %	390937872
43	NC_018001	AAATA	2	10	106573	106582	80 %	20 %	0 %	0 %	390937872
44	NC_018001	TATAA	2	10	106976	106985	60 %	40 %	0 %	0 %	390937872
45	NC_018001	AATAG	2	10	107147	107156	60 %	20 %	20 %	0 %	390937872
46	NC_018001	ATCTA	2	10	113751	113760	40 %	40 %	0 %	20 %	390937877
47	NC_018001	AGTAT	2	10	118447	118456	40 %	40 %	20 %	0 %	390937884
48	NC_018001	GGGCC	2	10	121416	121425	0 %	0 %	60 %	40 %	390937888
49	NC_018001	CCAAT	3	15	123224	123238	40 %	20 %	0 %	40 %	390937890
50	NC_018001	ACTCA	2	10	123691	123700	40 %	20 %	0 %	40 %	390937890
51	NC_018001	ACGTG	2	10	124508	124517	20 %	20 %	40 %	20 %	390937890
52	NC_018001	TGCCT	2	10	127278	127287	0 %	40 %	20 %	40 %	390937891
53	NC_018001	CTTAA	2	10	127296	127305	40 %	40 %	0 %	20 %	390937891
54	NC_018001	CTTCT	2	10	127317	127326	0 %	60 %	0 %	40 %	390937891
55	NC_018001	GGATG	2	10	127646	127655	20 %	20 %	60 %	0 %	390937892
56	NC_018001	CTGCT	2	10	130082	130091	0 %	40 %	20 %	40 %	390937895
57	NC_018001	TACGC	2	10	131588	131597	20 %	20 %	20 %	40 %	390937896
58	NC_018001	TCCCC	2	10	131709	131718	0 %	20 %	0 %	80 %	390937896
59	NC_018001	ATAGT	2	10	132810	132819	40 %	40 %	20 %	0 %	390937897
60	NC_018001	CGTGG	2	10	133382	133391	0 %	20 %	60 %	20 %	390937897
61	NC_018001	TTTTA	2	10	135081	135090	20 %	80 %	0 %	0 %	390937900
62	NC_018001	TGGCG	2	10	135595	135604	0 %	20 %	60 %	20 %	390937900
63	NC_018001	TACCT	2	10	139988	139997	20 %	40 %	0 %	40 %	390937906
64	NC_018001	AAAAT	2	10	140988	140997	80 %	20 %	0 %	0 %	390937908
65	NC_018001	AGAGG	2	10	141202	141211	40 %	0 %	60 %	0 %	390937909
66	NC_018001	CCAGG	2	10	142499	142508	20 %	0 %	40 %	40 %	390937910
67	NC_018001	ACCGA	2	10	145938	145947	40 %	0 %	20 %	40 %	390937913
68	NC_018001	TCTAG	2	10	149063	149072	20 %	40 %	20 %	20 %	390937917
69	NC_018001	TATCT	2	10	152399	152408	20 %	60 %	0 %	20 %	390937919
70	NC_018001	CTACC	2	10	152710	152719	20 %	20 %	0 %	60 %	390937919
71	NC_018001	CTTCA	2	10	153038	153047	20 %	40 %	0 %	40 %	390937919
72	NC_018001	TGGCT	2	10	154678	154687	0 %	40 %	40 %	20 %	390937922
73	NC_018001	GAAAT	2	10	157104	157113	60 %	20 %	20 %	0 %	390937925
74	NC_018001	CAGTG	2	10	158079	158088	20 %	20 %	40 %	20 %	390937927
75	NC_018001	AGGTT	2	10	160198	160207	20 %	40 %	40 %	0 %	390937930
76	NC_018001	CCCTC	2	10	160565	160574	0 %	20 %	0 %	80 %	390937930
77	NC_018001	AAGGT	2	10	161177	161186	40 %	20 %	40 %	0 %	390937931
78	NC_018001	GGGGT	2	10	165651	165660	0 %	20 %	80 %	0 %	390937935
79	NC_018001	ACTAC	2	10	166489	166498	40 %	20 %	0 %	40 %	390937936
80	NC_018001	GTAGC	2	10	169837	169846	20 %	20 %	40 %	20 %	390937939
81	NC_018001	CCATC	2	10	171038	171047	20 %	20 %	0 %	60 %	390937940
82	NC_018001	CATGG	2	10	171145	171154	20 %	20 %	40 %	20 %	390937940
83	NC_018001	ATAGG	2	10	173268	173277	40 %	20 %	40 %	0 %	390937943
84	NC_018001	GAGAA	2	10	173552	173561	60 %	0 %	40 %	0 %	390937943
85	NC_018001	TAAGA	2	10	174472	174481	60 %	20 %	20 %	0 %	390937943
86	NC_018001	TGATC	2	10	177826	177835	20 %	40 %	20 %	20 %	390937946
87	NC_018001	ATTCT	2	10	183097	183106	20 %	60 %	0 %	20 %	390937950
88	NC_018001	ATCCA	2	10	185369	185378	40 %	20 %	0 %	40 %	390937952
89	NC_018001	CCCTT	2	10	185562	185571	0 %	40 %	0 %	60 %	390937952
90	NC_018001	TCTAC	2	10	188632	188641	20 %	40 %	0 %	40 %	390937955
91	NC_018001	AGAGA	2	10	190257	190266	60 %	0 %	40 %	0 %	390937957
92	NC_018001	TCTCT	2	10	190739	190748	0 %	60 %	0 %	40 %	390937958
93	NC_018001	ATAGT	2	10	192627	192636	40 %	40 %	20 %	0 %	390937959
94	NC_018001	TACTG	2	10	194024	194033	20 %	40 %	20 %	20 %	390937960
95	NC_018001	CTTGG	2	10	195405	195414	0 %	40 %	40 %	20 %	390937961
96	NC_018001	TGTAG	2	10	199347	199356	20 %	40 %	40 %	0 %	390937967
97	NC_018001	ATGTC	2	10	199643	199652	20 %	40 %	20 %	20 %	390937967
98	NC_018001	TCTAT	2	10	199901	199910	20 %	60 %	0 %	20 %	390937968
99	NC_018001	TTGGC	2	10	200681	200690	0 %	40 %	40 %	20 %	390937968
100	NC_018001	CTTAA	2	10	204566	204575	40 %	40 %	0 %	20 %	390937973
101	NC_018001	CTATC	2	10	204807	204816	20 %	40 %	0 %	40 %	390937973
102	NC_018001	CTATG	2	10	205016	205025	20 %	40 %	20 %	20 %	390937974
103	NC_018001	CATGG	2	10	209068	209077	20 %	20 %	40 %	20 %	390937976
104	NC_018001	TATAG	2	10	209625	209634	40 %	40 %	20 %	0 %	390937976
105	NC_018001	GGCCC	2	10	213031	213040	0 %	0 %	40 %	60 %	390937981
106	NC_018001	GTTGG	2	10	214320	214329	0 %	40 %	60 %	0 %	390937982
107	NC_018001	ATGGA	2	10	214337	214346	40 %	20 %	40 %	0 %	390937982
108	NC_018001	TATGC	2	10	218424	218433	20 %	40 %	20 %	20 %	390937986
109	NC_018001	TATCT	2	10	218813	218822	20 %	60 %	0 %	20 %	390937986
110	NC_018001	AGTAT	2	10	222090	222099	40 %	40 %	20 %	0 %	390937989
111	NC_018001	TATAT	2	10	223988	223997	40 %	60 %	0 %	0 %	390937990
112	NC_018001	GCTGG	2	10	224846	224855	0 %	20 %	60 %	20 %	390937990
113	NC_018001	TAGCC	2	10	226557	226566	20 %	20 %	20 %	40 %	390937992
114	NC_018001	TAACG	2	10	227457	227466	40 %	20 %	20 %	20 %	390937994
115	NC_018001	ACTAG	2	10	228065	228074	40 %	20 %	20 %	20 %	390937994
116	NC_018001	GTGAT	2	10	228567	228576	20 %	40 %	40 %	0 %	390937995
117	NC_018001	GAATG	2	10	228790	228799	40 %	20 %	40 %	0 %	390937996
118	NC_018001	ATAGT	2	10	234440	234449	40 %	40 %	20 %	0 %	390938002
119	NC_018001	CTTCT	2	10	234902	234911	0 %	60 %	0 %	40 %	390938004
120	NC_018001	CTCTT	2	10	234942	234951	0 %	60 %	0 %	40 %	390938004
121	NC_018001	ACACC	2	10	236709	236718	40 %	0 %	0 %	60 %	390938006
122	NC_018001	AGCAG	2	10	237361	237370	40 %	0 %	40 %	20 %	390938006
123	NC_018001	CCTGT	2	10	238562	238571	0 %	40 %	20 %	40 %	390938008
124	NC_018001	GAATA	2	10	240999	241008	60 %	20 %	20 %	0 %	390938009
125	NC_018001	TAGAG	2	10	246620	246629	40 %	20 %	40 %	0 %	390938014
126	NC_018001	CCCTA	2	10	246904	246913	20 %	20 %	0 %	60 %	390938014
127	NC_018001	CCTCT	2	10	252651	252660	0 %	40 %	0 %	60 %	390938021
128	NC_018001	CTATA	2	10	255130	255139	40 %	40 %	0 %	20 %	390938023
129	NC_018001	TCCAT	2	10	256711	256720	20 %	40 %	0 %	40 %	390938025
130	NC_018001	GGGAT	2	10	261293	261302	20 %	20 %	60 %	0 %	390938029
131	NC_018001	GGGGA	2	10	262866	262875	20 %	0 %	80 %	0 %	390938030
132	NC_018001	TATGA	2	10	264157	264166	40 %	40 %	20 %	0 %	390938032
133	NC_018001	GAAGA	2	10	270442	270451	60 %	0 %	40 %	0 %	390938041
134	NC_018001	TCATT	2	10	271688	271697	20 %	60 %	0 %	20 %	390938043
135	NC_018001	CTAGT	2	10	272853	272862	20 %	40 %	20 %	20 %	390938045
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138	NC_018001	TATCT	2	10	275406	275415	20 %	60 %	0 %	20 %	390938048
139	NC_018001	TATTT	2	10	275627	275636	20 %	80 %	0 %	0 %	390938048
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172	NC_018001	TACAG	2	10	346021	346030	40 %	20 %	20 %	20 %	390938117
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249	NC_018001	ATCAC	2	10	515726	515735	40 %	20 %	0 %	40 %	390938289
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261	NC_018001	GTAAT	2	10	544815	544824	40 %	40 %	20 %	0 %	390938315
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