MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Desulfurococcus fermentans DSM 16532 chromosome

Total Repeats: 18815

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018001	ATC	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937753
2	NC_018001	TCC	2	6	350	355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937753
3	NC_018001	AGG	2	6	403	408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937753
4	NC_018001	TCT	2	6	420	425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937753
5	NC_018001	CAT	3	9	533	541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937753
6	NC_018001	GAT	2	6	760	765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937753
7	NC_018001	ATG	2	6	836	841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937753
8	NC_018001	ATT	2	6	927	932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937753
9	NC_018001	AGG	2	6	1039	1044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937753
10	NC_018001	GAA	2	6	1119	1124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390937753
11	NC_018001	GAG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937753
12	NC_018001	TGT	2	6	1164	1169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390937753
13	NC_018001	GAA	2	6	1200	1205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390937753
14	NC_018001	ATT	2	6	1324	1329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937753
15	NC_018001	ATG	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937753
16	NC_018001	GGT	2	6	1365	1370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937753
17	NC_018001	AAT	2	6	1398	1403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937753
18	NC_018001	CAT	2	6	1499	1504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937754
19	NC_018001	TAG	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937754
20	NC_018001	GGA	2	6	1841	1846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937754
21	NC_018001	GTG	2	6	1857	1862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937754
22	NC_018001	ATT	2	6	1867	1872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937754
23	NC_018001	AAT	2	6	1907	1912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937754
24	NC_018001	GTA	2	6	1947	1952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937754
25	NC_018001	TTA	2	6	2078	2083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018001	CTC	2	6	2240	2245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937755
27	NC_018001	AGG	2	6	2280	2285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937755
28	NC_018001	GAT	2	6	2440	2445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937755
29	NC_018001	TTG	2	6	2646	2651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390937755
30	NC_018001	TCC	2	6	2682	2687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937755
31	NC_018001	AAG	2	6	2816	2821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390937755
32	NC_018001	GAT	2	6	2993	2998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937755
33	NC_018001	AAT	2	6	3004	3009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937755
34	NC_018001	AAT	2	6	3064	3069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937755
35	NC_018001	AGA	2	6	3160	3165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390937755
36	NC_018001	TGG	2	6	3176	3181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937755
37	NC_018001	TGG	2	6	3230	3235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937755
38	NC_018001	ACC	2	6	3268	3273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390937755
39	NC_018001	GGA	2	6	3409	3414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937755
40	NC_018001	GAT	2	6	3635	3640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937755
41	NC_018001	ATG	2	6	3711	3716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937755
42	NC_018001	ATG	2	6	3756	3761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937755
43	NC_018001	ATT	2	6	3772	3777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937755
44	NC_018001	AGG	2	6	3779	3784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937755
45	NC_018001	TTC	2	6	3911	3916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937755
46	NC_018001	TTA	2	6	3923	3928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937755
47	NC_018001	CCG	2	6	3980	3985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390937755
48	NC_018001	CCG	2	6	4050	4055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_018001	CGC	2	6	4089	4094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_018001	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018001	CAT	2	6	4394	4399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937756
52	NC_018001	TCA	2	6	4526	4531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937756
53	NC_018001	TTA	2	6	4532	4537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937756
54	NC_018001	ATT	2	6	4561	4566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937756
55	NC_018001	TCT	2	6	4592	4597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937756
56	NC_018001	ATT	2	6	4657	4662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937756
57	NC_018001	CTA	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937756
58	NC_018001	TGG	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937756
59	NC_018001	GGC	2	6	4819	4824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390937756
60	NC_018001	ACT	2	6	4897	4902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937756
61	NC_018001	TCA	2	6	4972	4977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937756
62	NC_018001	ATT	2	6	4984	4989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937756
63	NC_018001	ATT	2	6	5077	5082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937756
64	NC_018001	GGT	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937756
65	NC_018001	CGC	2	6	5147	5152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390937756
66	NC_018001	TCT	2	6	5164	5169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937756
67	NC_018001	TCC	2	6	5242	5247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937756
68	NC_018001	CCT	2	6	5519	5524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937756
69	NC_018001	ACT	2	6	5556	5561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937756
70	NC_018001	CTA	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937756
71	NC_018001	ACC	2	6	5623	5628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390937756
72	NC_018001	ACT	2	6	5652	5657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937756
73	NC_018001	ACT	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937757
74	NC_018001	ATA	2	6	5993	5998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018001	ATA	2	6	6017	6022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018001	ATT	2	6	6034	6039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018001	AAT	2	6	6054	6059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018001	ATA	3	9	6178	6186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937758
79	NC_018001	GGT	2	6	6283	6288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937758
80	NC_018001	GGT	2	6	6385	6390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937758
81	NC_018001	AAT	2	6	6619	6624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937758
82	NC_018001	TAG	2	6	6722	6727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937758
83	NC_018001	GCA	2	6	6802	6807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390937758
84	NC_018001	CAG	2	6	6828	6833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390937758
85	NC_018001	CAG	3	9	6887	6895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390937758
86	NC_018001	GTT	2	6	6951	6956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390937758
87	NC_018001	ACC	2	6	7013	7018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390937758
88	NC_018001	ATA	2	6	7348	7353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937758
89	NC_018001	GCA	2	6	7357	7362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390937758
90	NC_018001	AAC	2	6	7553	7558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018001	CCT	3	9	7626	7634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937759
92	NC_018001	TTC	2	6	7692	7697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937759
93	NC_018001	CGT	2	6	7739	7744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390937759
94	NC_018001	AAT	2	6	7867	7872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937759
95	NC_018001	TAT	2	6	7914	7919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937759
96	NC_018001	TCC	2	6	8041	8046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937759
97	NC_018001	CGC	2	6	8153	8158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390937759
98	NC_018001	GGT	2	6	8165	8170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937759
99	NC_018001	CGC	2	6	8192	8197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390937759
100	NC_018001	AAT	2	6	8221	8226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937759
101	NC_018001	CTC	2	6	8280	8285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937759
102	NC_018001	TAC	2	6	8295	8300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937759
103	NC_018001	CTT	2	6	8337	8342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937759
104	NC_018001	AGC	2	6	8403	8408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390937759
105	NC_018001	TAA	2	6	8450	8455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937759
106	NC_018001	TTC	2	6	8530	8535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937759
107	NC_018001	CGA	2	6	8720	8725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390937759
108	NC_018001	TCC	2	6	8728	8733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937759
109	NC_018001	TAA	2	6	8736	8741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937759
110	NC_018001	CTT	2	6	8784	8789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937759
111	NC_018001	AGA	2	6	8858	8863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390937759
112	NC_018001	CAG	2	6	8872	8877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390937759
113	NC_018001	GTA	2	6	9051	9056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937759
114	NC_018001	TTC	2	6	9089	9094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937759
115	NC_018001	TTG	2	6	9164	9169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390937759
116	NC_018001	ATA	2	6	9176	9181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937759
117	NC_018001	CGC	2	6	9188	9193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390937759
118	NC_018001	CTT	2	6	9231	9236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937759
119	NC_018001	TGA	2	6	9237	9242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937759
120	NC_018001	GGT	2	6	9269	9274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937759
121	NC_018001	TAA	2	6	9336	9341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018001	TAA	2	6	9354	9359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018001	ATA	2	6	9384	9389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937760
124	NC_018001	CCT	2	6	9442	9447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937760
125	NC_018001	CGA	2	6	9512	9517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390937760
126	NC_018001	AGG	2	6	9714	9719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937760
127	NC_018001	GAG	2	6	9924	9929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937760
128	NC_018001	GGA	2	6	9958	9963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937761
129	NC_018001	CGT	2	6	9974	9979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390937761
130	NC_018001	CGT	2	6	10014	10019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390937761
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132	NC_018001	GCC	2	6	10204	10209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390937761
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188	NC_018001	ATA	2	6	14041	14046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_018001	TCA	2	6	19243	19248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937771
259	NC_018001	AAG	2	6	19314	19319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390937771
260	NC_018001	GGC	2	6	19574	19579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390937771
261	NC_018001	GAT	2	6	19610	19615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937771
262	NC_018001	AGT	2	6	19811	19816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937771
263	NC_018001	AAG	2	6	19818	19823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390937771
264	NC_018001	TGT	2	6	19976	19981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390937771
265	NC_018001	CTG	2	6	20037	20042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390937771
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267	NC_018001	AAT	2	6	20181	20186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_018001	AGG	2	6	20193	20198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_018001	TGG	2	6	20362	20367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937772
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272	NC_018001	GCA	2	6	20454	20459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390937772
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278	NC_018001	ATA	3	9	20694	20702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_018001	CAT	2	6	20777	20782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_018001	CAA	2	6	20838	20843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_018001	GAG	2	6	21041	21046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_018001	CTG	2	6	21471	21476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390937773
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