MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 109204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018000	GGC	2	6	11	16	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018000	GGC	2	6	79	84	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018000	CAA	2	6	259	264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398349898
4	NC_018000	CAG	2	6	296	301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349898
5	NC_018000	CGG	2	6	363	368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349898
6	NC_018000	CGC	2	6	448	453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349898
7	NC_018000	GCC	2	6	473	478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349898
8	NC_018000	CGC	2	6	510	515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349898
9	NC_018000	TCG	2	6	543	548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349898
10	NC_018000	TGC	2	6	574	579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349898
11	NC_018000	TGC	2	6	688	693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349898
12	NC_018000	GTC	2	6	719	724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349898
13	NC_018000	CGG	2	6	732	737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349898
14	NC_018000	ACG	2	6	777	782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349898
15	NC_018000	TCT	2	6	817	822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349898
16	NC_018000	CGA	2	6	829	834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349898
17	NC_018000	TGC	2	6	891	896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349898
18	NC_018000	GGT	2	6	913	918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349898
19	NC_018000	GGC	2	6	922	927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349898
20	NC_018000	GCG	2	6	987	992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349898
21	NC_018000	CTC	2	6	1166	1171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349898
22	NC_018000	CCG	2	6	1174	1179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349898
23	NC_018000	GCT	2	6	1219	1224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349898
24	NC_018000	GTC	2	6	1283	1288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349898
25	NC_018000	CCG	2	6	1330	1335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349898
26	NC_018000	CGC	2	6	1392	1397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349898
27	NC_018000	GCC	2	6	1416	1421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349898
28	NC_018000	CGG	2	6	1426	1431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349898
29	NC_018000	CGC	2	6	1652	1657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349899
30	NC_018000	ACA	2	6	1783	1788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398349900
31	NC_018000	AGG	4	12	1816	1827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349900
32	NC_018000	CCG	2	6	1849	1854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349900
33	NC_018000	CGA	2	6	1909	1914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349900
34	NC_018000	CCA	2	6	1921	1926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349900
35	NC_018000	GCC	2	6	2061	2066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349900
36	NC_018000	TGC	2	6	2196	2201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349901
37	NC_018000	AGG	2	6	2241	2246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349901
38	NC_018000	GAA	2	6	2275	2280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349901
39	NC_018000	CCG	2	6	2285	2290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349901
40	NC_018000	GCC	2	6	2300	2305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349901
41	NC_018000	TCG	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349901
42	NC_018000	GCG	2	6	2347	2352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349901
43	NC_018000	GCC	2	6	2374	2379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349901
44	NC_018000	GCT	2	6	2386	2391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349901
45	NC_018000	CGA	2	6	2452	2457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349901
46	NC_018000	GCT	2	6	2467	2472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349901
47	NC_018000	GCA	2	6	2481	2486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349901
48	NC_018000	CAG	2	6	2507	2512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349901
49	NC_018000	GGC	2	6	2584	2589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349901
50	NC_018000	GCC	2	6	2630	2635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349901
51	NC_018000	CGC	2	6	2659	2664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349901
52	NC_018000	CGG	2	6	2685	2690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349901
53	NC_018000	GAT	2	6	2698	2703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349901
54	NC_018000	CCG	2	6	2757	2762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349901
55	NC_018000	CGA	2	6	2770	2775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349901
56	NC_018000	CTC	2	6	2852	2857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349901
57	NC_018000	CAT	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349901
58	NC_018000	GGC	2	6	2925	2930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349901
59	NC_018000	GAT	2	6	2944	2949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349901
60	NC_018000	GAT	2	6	2965	2970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349901
61	NC_018000	TCG	2	6	2989	2994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349901
62	NC_018000	GCT	2	6	3082	3087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349901
63	NC_018000	GTC	2	6	3122	3127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349901
64	NC_018000	GCG	2	6	3173	3178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349901
65	NC_018000	TAT	2	6	3224	3229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	398349901
66	NC_018000	GCG	2	6	3240	3245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349901
67	NC_018000	AGC	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349901
68	NC_018000	CCA	2	6	3312	3317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349901
69	NC_018000	GCC	2	6	3320	3325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349901
70	NC_018000	GCC	2	6	3329	3334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349901
71	NC_018000	AGC	2	6	3345	3350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349901
72	NC_018000	ACC	2	6	3354	3359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349901
73	NC_018000	AGA	2	6	3394	3399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349901
74	NC_018000	CGT	2	6	3412	3417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018000	GTC	2	6	3446	3451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018000	CAC	2	6	3465	3470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_018000	GGA	2	6	3471	3476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018000	TCG	2	6	3950	3955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349902
79	NC_018000	GAG	2	6	3967	3972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018000	AGC	2	6	3996	4001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349903
81	NC_018000	CGC	2	6	4004	4009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349903
82	NC_018000	GCC	2	6	4115	4120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349903
83	NC_018000	TCA	2	6	4349	4354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349903
84	NC_018000	GGC	2	6	4394	4399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349903
85	NC_018000	CCG	2	6	4449	4454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349903
86	NC_018000	CGT	2	6	4463	4468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349903
87	NC_018000	AGG	3	9	4534	4542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349903
88	NC_018000	GGC	2	6	4599	4604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349903
89	NC_018000	GCC	2	6	4652	4657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349903
90	NC_018000	TGC	2	6	4669	4674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349903
91	NC_018000	CGA	2	6	4685	4690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349903
92	NC_018000	TGG	2	6	4701	4706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349903
93	NC_018000	TCG	2	6	4813	4818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349903
94	NC_018000	GAA	2	6	4826	4831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349903
95	NC_018000	CGG	2	6	4848	4853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018000	TCA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349904
97	NC_018000	TGC	3	9	5137	5145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349904
98	NC_018000	GCG	2	6	5321	5326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349904
99	NC_018000	GGT	2	6	5518	5523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349904
100	NC_018000	GCG	2	6	5537	5542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349904
101	NC_018000	CGC	2	6	5560	5565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349904
102	NC_018000	GCC	2	6	5629	5634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_018000	CAG	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349905
104	NC_018000	CAG	2	6	5840	5845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349905
105	NC_018000	TCG	2	6	5850	5855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349905
106	NC_018000	CGC	2	6	5899	5904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349905
107	NC_018000	CTC	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349905
108	NC_018000	GCC	2	6	5980	5985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349905
109	NC_018000	GGC	2	6	6043	6048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349905
110	NC_018000	CGC	2	6	6101	6106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349905
111	NC_018000	CCG	2	6	6136	6141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349905
112	NC_018000	CTC	2	6	6203	6208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349905
113	NC_018000	GCC	3	9	6599	6607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349905
114	NC_018000	GGA	2	6	6667	6672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349905
115	NC_018000	TGG	2	6	6705	6710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349905
116	NC_018000	TTC	2	6	6930	6935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349906
117	NC_018000	GAC	2	6	7023	7028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349906
118	NC_018000	CGC	2	6	7043	7048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349906
119	NC_018000	TCC	2	6	7114	7119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349906
120	NC_018000	GCC	2	6	7233	7238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349906
121	NC_018000	ATC	2	6	7263	7268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349906
122	NC_018000	CGC	2	6	7317	7322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349906
123	NC_018000	TCC	2	6	7348	7353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349906
124	NC_018000	CGG	2	6	7373	7378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349906
125	NC_018000	GCG	2	6	7718	7723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349907
126	NC_018000	GGC	2	6	7747	7752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349907
127	NC_018000	CCG	2	6	7763	7768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349907
128	NC_018000	CGC	2	6	7793	7798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349907
129	NC_018000	GAA	2	6	7803	7808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349907
130	NC_018000	CGG	2	6	7871	7876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349907
131	NC_018000	ATC	2	6	7884	7889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349907
132	NC_018000	CGA	2	6	8015	8020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349908
133	NC_018000	TTC	2	6	8064	8069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349908
134	NC_018000	CCG	2	6	8090	8095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349908
135	NC_018000	GGC	2	6	8220	8225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349908
136	NC_018000	GCC	2	6	8334	8339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349908
137	NC_018000	CGA	2	6	8399	8404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349908
138	NC_018000	GCA	2	6	8507	8512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349908
139	NC_018000	GCC	2	6	8541	8546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349908
140	NC_018000	TCG	2	6	8705	8710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349908
141	NC_018000	CTG	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018000	CCG	2	6	8931	8936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349909
143	NC_018000	GCG	2	6	8960	8965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349909
144	NC_018000	CTT	2	6	9117	9122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349909
145	NC_018000	GCG	2	6	9189	9194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349909
146	NC_018000	CTT	2	6	9223	9228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349909
147	NC_018000	TCA	2	6	9278	9283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349909
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153	NC_018000	GCG	2	6	9518	9523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349909
154	NC_018000	CGA	2	6	9588	9593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349909
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157	NC_018000	CTC	2	6	9718	9723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349909
158	NC_018000	TCG	2	6	9796	9801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349909
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163	NC_018000	TGA	2	6	10057	10062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018000	CGA	2	6	10106	10111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349910
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169	NC_018000	AAC	2	6	10593	10598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398349910
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173	NC_018000	CGG	2	6	10725	10730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_018000	GCG	2	6	10777	10782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_018000	TGC	2	6	10821	10826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_018000	CCG	2	6	10936	10941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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244	NC_018000	GCC	2	6	14645	14650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
245	NC_018000	GCC	2	6	14676	14681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349915
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257	NC_018000	TCC	2	6	15405	15410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349915
258	NC_018000	TCG	2	6	15411	15416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349915
259	NC_018000	TCT	2	6	15427	15432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349915
260	NC_018000	CTG	2	6	15575	15580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349915
261	NC_018000	GCC	2	6	15630	15635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349915
262	NC_018000	TGC	2	6	15690	15695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349915
263	NC_018000	CGA	2	6	15775	15780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349915
264	NC_018000	TCG	2	6	15783	15788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349915
265	NC_018000	CGT	2	6	15805	15810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349915
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382	NC_018000	GGA	2	6	22723	22728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349924
383	NC_018000	ATC	2	6	22781	22786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349924
384	NC_018000	CGC	2	6	22798	22803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349924
385	NC_018000	CAT	2	6	22816	22821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349924
386	NC_018000	ACC	2	6	22835	22840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349924
387	NC_018000	CGA	2	6	22869	22874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349924
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402	NC_018000	GCT	2	6	23535	23540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349925
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411	NC_018000	CTG	2	6	23955	23960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
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498	NC_018000	TTG	2	6	28803	28808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398349928
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