MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 12524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018000	GGC	2	6	11	16	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018000	GGC	2	6	79	84	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018000	CGT	2	6	3412	3417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018000	GTC	2	6	3446	3451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018000	CAC	2	6	3465	3470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018000	GGA	2	6	3471	3476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018000	GAG	2	6	3967	3972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018000	CGG	2	6	4848	4853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018000	GCC	2	6	5629	5634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018000	CTG	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018000	TGA	2	6	10057	10062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018000	CGG	2	6	10725	10730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018000	GCG	2	6	10777	10782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018000	TGC	2	6	10821	10826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018000	GAG	2	6	10884	10889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018000	CCG	2	6	10936	10941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018000	TCC	3	9	13005	13013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018000	TGG	2	6	13042	13047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018000	ATT	2	6	13048	13053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018000	CGG	2	6	13059	13064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018000	GCA	2	6	13096	13101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018000	GAG	2	6	13119	13124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018000	CGC	2	6	13203	13208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_018000	TCG	2	6	13209	13214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018000	GGC	2	6	13252	13257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018000	CGG	2	6	13842	13847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018000	CCG	2	6	13849	13854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_018000	GCG	2	6	13861	13866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018000	GCC	2	6	14563	14568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_018000	GCC	2	6	14573	14578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_018000	CGG	2	6	14607	14612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018000	GCC	2	6	14645	14650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_018000	TCG	2	6	18536	18541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018000	GCC	2	6	18603	18608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_018000	GGC	2	6	20103	20108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018000	TCC	2	6	21029	21034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_018000	CGC	2	6	21045	21050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_018000	GCG	2	6	21144	21149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018000	GGT	2	6	21185	21190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018000	TGT	2	6	26054	26059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018000	GAC	2	6	26093	26098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018000	TGC	2	6	27063	27068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018000	GCA	2	6	27109	27114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018000	CAG	2	6	27122	27127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018000	ATT	2	6	27185	27190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018000	TCG	2	6	27232	27237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018000	TCA	2	6	27254	27259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018000	GAT	2	6	27284	27289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018000	AAG	2	6	27393	27398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018000	CCT	2	6	29799	29804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018000	TGT	3	9	29832	29840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018000	TGC	2	6	32752	32757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018000	GCC	2	6	37549	37554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_018000	ATC	2	6	37577	37582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018000	CGG	2	6	37630	37635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018000	CTT	2	6	37645	37650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018000	CCG	2	6	38959	38964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_018000	GCG	2	6	38988	38993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018000	CGC	2	6	39004	39009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_018000	AGC	2	6	40360	40365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018000	GGC	2	6	40379	40384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018000	GAG	2	6	41100	41105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018000	GTG	2	6	41649	41654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018000	GCC	2	6	42509	42514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_018000	GAG	2	6	44072	44077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018000	CTG	2	6	46858	46863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018000	GTG	2	6	47508	47513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018000	AAC	2	6	47549	47554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018000	GTC	2	6	49500	49505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018000	GCG	2	6	50009	50014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018000	CTC	2	6	50063	50068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_018000	GCG	2	6	50102	50107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018000	CTT	2	6	50181	50186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018000	ACA	2	6	51511	51516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018000	GAA	2	6	51696	51701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018000	GAA	2	6	52437	52442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018000	GCA	2	6	52446	52451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018000	CTC	2	6	52517	52522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_018000	CGG	2	6	52581	52586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018000	GGA	2	6	52927	52932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018000	CCG	2	6	52938	52943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_018000	GCA	2	6	53428	53433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018000	GCT	2	6	53543	53548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018000	AGG	2	6	53622	53627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018000	ATC	2	6	57138	57143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018000	AGC	2	6	59588	59593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018000	TCG	2	6	60119	60124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018000	ACT	2	6	60176	60181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018000	GCA	2	6	60224	60229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018000	CGG	2	6	67166	67171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018000	CCG	2	6	67178	67183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_018000	CCG	2	6	70404	70409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018000	GTC	2	6	72389	72394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018000	GTC	2	6	72425	72430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018000	GCG	2	6	73865	73870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018000	AAG	2	6	73886	73891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018000	CGC	2	6	73897	73902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_018000	GCC	2	6	75703	75708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_018000	CGG	2	6	76753	76758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018000	GCT	2	6	79724	79729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018000	CCG	2	6	79745	79750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_018000	CTA	2	6	79854	79859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018000	CCG	2	6	81255	81260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_018000	GCG	2	6	81280	81285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018000	TGG	2	6	82087	82092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018000	CTT	2	6	84543	84548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018000	CGC	2	6	84660	84665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_018000	GCC	2	6	86841	86846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_018000	CCG	2	6	86879	86884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_018000	GCC	2	6	86888	86893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_018000	CGG	2	6	86981	86986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018000	GAA	3	9	87063	87071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018000	GCT	2	6	87152	87157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018000	GCG	2	6	90791	90796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018000	TGC	2	6	90801	90806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018000	CCG	3	9	90828	90836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_018000	GGT	2	6	90912	90917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018000	CCT	2	6	91039	91044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_018000	CCT	2	6	91149	91154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_018000	GGC	2	6	91222	91227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018000	ATC	2	6	91317	91322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018000	CCT	2	6	91478	91483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_018000	TGC	2	6	91523	91528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018000	GAC	2	6	91561	91566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018000	GTC	2	6	91630	91635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018000	GCT	2	6	91644	91649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018000	GCG	2	6	91714	91719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018000	CGA	2	6	91810	91815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018000	AAC	2	6	91880	91885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018000	GGC	2	6	91968	91973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018000	GCT	2	6	91993	91998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018000	GGT	2	6	92166	92171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018000	CTC	2	6	92263	92268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_018000	GCG	2	6	92269	92274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018000	CGC	2	6	92286	92291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_018000	TGA	2	6	92319	92324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018000	CCG	2	6	92340	92345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_018000	CCG	3	9	92390	92398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_018000	CGG	2	6	92501	92506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018000	GCC	3	9	92668	92676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_018000	CGC	2	6	92688	92693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_018000	GCC	2	6	92764	92769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_018000	GGA	2	6	92869	92874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018000	CCG	2	6	92940	92945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_018000	GCC	2	6	92984	92989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_018000	GGA	2	6	93163	93168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_018000	GGC	3	9	93268	93276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_018000	GCG	2	6	93400	93405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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276	NC_018000	CGC	2	6	150615	150620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
277	NC_018000	TGC	2	6	150625	150630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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406	NC_018000	AGC	2	6	226962	226967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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441	NC_018000	GCG	2	6	242398	242403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_018000	GCG	2	6	242473	242478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_018000	CCG	2	6	242504	242509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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