MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 13401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018000	GC	3	6	581	586	0 %	0 %	50 %	50 %	398349898
2	NC_018000	GC	3	6	1115	1120	0 %	0 %	50 %	50 %	398349898
3	NC_018000	CG	3	6	1338	1343	0 %	0 %	50 %	50 %	398349898
4	NC_018000	CG	3	6	1895	1900	0 %	0 %	50 %	50 %	398349900
5	NC_018000	GA	3	6	1945	1950	50 %	0 %	50 %	0 %	398349900
6	NC_018000	CG	3	6	2170	2175	0 %	0 %	50 %	50 %	398349901
7	NC_018000	GC	3	6	2190	2195	0 %	0 %	50 %	50 %	398349901
8	NC_018000	CG	3	6	2289	2294	0 %	0 %	50 %	50 %	398349901
9	NC_018000	CG	6	12	2865	2876	0 %	0 %	50 %	50 %	398349901
10	NC_018000	GC	3	6	3278	3283	0 %	0 %	50 %	50 %	398349901
11	NC_018000	CG	3	6	3554	3559	0 %	0 %	50 %	50 %	398349902
12	NC_018000	TC	3	6	4256	4261	0 %	50 %	0 %	50 %	398349903
13	NC_018000	GC	3	6	4603	4608	0 %	0 %	50 %	50 %	398349903
14	NC_018000	GC	3	6	4709	4714	0 %	0 %	50 %	50 %	398349903
15	NC_018000	AG	3	6	5228	5233	50 %	0 %	50 %	0 %	398349904
16	NC_018000	CG	3	6	5478	5483	0 %	0 %	50 %	50 %	398349904
17	NC_018000	GA	3	6	6228	6233	50 %	0 %	50 %	0 %	398349905
18	NC_018000	CG	3	6	6340	6345	0 %	0 %	50 %	50 %	398349905
19	NC_018000	CG	3	6	7010	7015	0 %	0 %	50 %	50 %	398349906
20	NC_018000	GC	3	6	7733	7738	0 %	0 %	50 %	50 %	398349907
21	NC_018000	GC	3	6	8265	8270	0 %	0 %	50 %	50 %	398349908
22	NC_018000	TC	3	6	8985	8990	0 %	50 %	0 %	50 %	398349909
23	NC_018000	CG	4	8	10352	10359	0 %	0 %	50 %	50 %	398349910
24	NC_018000	CG	3	6	10389	10394	0 %	0 %	50 %	50 %	398349910
25	NC_018000	GC	3	6	11865	11870	0 %	0 %	50 %	50 %	398349911
26	NC_018000	CG	4	8	12913	12920	0 %	0 %	50 %	50 %	398349912
27	NC_018000	CT	3	6	14484	14489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018000	GC	3	6	14691	14696	0 %	0 %	50 %	50 %	398349915
29	NC_018000	CG	3	6	14763	14768	0 %	0 %	50 %	50 %	398349915
30	NC_018000	GC	3	6	15120	15125	0 %	0 %	50 %	50 %	398349915
31	NC_018000	GC	3	6	15452	15457	0 %	0 %	50 %	50 %	398349915
32	NC_018000	GC	3	6	15548	15553	0 %	0 %	50 %	50 %	398349915
33	NC_018000	CG	3	6	15595	15600	0 %	0 %	50 %	50 %	398349915
34	NC_018000	GC	3	6	15867	15872	0 %	0 %	50 %	50 %	398349915
35	NC_018000	CG	3	6	16536	16541	0 %	0 %	50 %	50 %	398349916
36	NC_018000	CG	3	6	16789	16794	0 %	0 %	50 %	50 %	398349916
37	NC_018000	GC	3	6	17095	17100	0 %	0 %	50 %	50 %	398349916
38	NC_018000	GC	3	6	18267	18272	0 %	0 %	50 %	50 %	398349918
39	NC_018000	CG	3	6	18348	18353	0 %	0 %	50 %	50 %	398349918
40	NC_018000	CG	4	8	18851	18858	0 %	0 %	50 %	50 %	398349919
41	NC_018000	GA	3	6	18900	18905	50 %	0 %	50 %	0 %	398349919
42	NC_018000	GT	3	6	19183	19188	0 %	50 %	50 %	0 %	398349919
43	NC_018000	GT	3	6	19712	19717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018000	GA	3	6	19721	19726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018000	CG	3	6	19812	19817	0 %	0 %	50 %	50 %	398349920
46	NC_018000	GC	3	6	20149	20154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018000	CG	4	8	20435	20442	0 %	0 %	50 %	50 %	398349921
48	NC_018000	GC	3	6	21134	21139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018000	GC	3	6	21391	21396	0 %	0 %	50 %	50 %	398349923
50	NC_018000	GC	4	8	21399	21406	0 %	0 %	50 %	50 %	398349923
51	NC_018000	GC	3	6	21918	21923	0 %	0 %	50 %	50 %	398349923
52	NC_018000	GC	4	8	21939	21946	0 %	0 %	50 %	50 %	398349923
53	NC_018000	CG	3	6	22176	22181	0 %	0 %	50 %	50 %	398349923
54	NC_018000	CG	3	6	22427	22432	0 %	0 %	50 %	50 %	398349924
55	NC_018000	GC	3	6	23159	23164	0 %	0 %	50 %	50 %	398349924
56	NC_018000	GC	3	6	23510	23515	0 %	0 %	50 %	50 %	398349925
57	NC_018000	GC	5	10	23935	23944	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
58	NC_018000	GC	3	6	24402	24407	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
59	NC_018000	GC	3	6	24428	24433	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
60	NC_018000	CG	3	6	24794	24799	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
61	NC_018000	GC	3	6	24945	24950	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
62	NC_018000	CG	3	6	25245	25250	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
63	NC_018000	GC	3	6	25266	25271	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
64	NC_018000	GA	3	6	25674	25679	50 %	0 %	50 %	0 %	398349926
65	NC_018000	AC	3	6	25925	25930	50 %	0 %	0 %	50 %	398349926
66	NC_018000	CG	3	6	26458	26463	0 %	0 %	50 %	50 %	398349927
67	NC_018000	AT	3	6	26937	26942	50 %	50 %	0 %	0 %	398349927
68	NC_018000	CG	3	6	27883	27888	0 %	0 %	50 %	50 %	398349928
69	NC_018000	GC	3	6	28259	28264	0 %	0 %	50 %	50 %	398349928
70	NC_018000	GC	3	6	28541	28546	0 %	0 %	50 %	50 %	398349928
71	NC_018000	GC	3	6	28755	28760	0 %	0 %	50 %	50 %	398349928
72	NC_018000	GA	3	6	28971	28976	50 %	0 %	50 %	0 %	398349928
73	NC_018000	CG	3	6	30092	30097	0 %	0 %	50 %	50 %	398349929
74	NC_018000	CG	3	6	30495	30500	0 %	0 %	50 %	50 %	398349929
75	NC_018000	CG	3	6	30672	30677	0 %	0 %	50 %	50 %	398349929
76	NC_018000	CG	3	6	30892	30897	0 %	0 %	50 %	50 %	398349929
77	NC_018000	CG	3	6	31022	31027	0 %	0 %	50 %	50 %	398349929
78	NC_018000	CG	3	6	31038	31043	0 %	0 %	50 %	50 %	398349929
79	NC_018000	GC	3	6	31471	31476	0 %	0 %	50 %	50 %	398349929
80	NC_018000	CG	3	6	31611	31616	0 %	0 %	50 %	50 %	398349929
81	NC_018000	CG	3	6	32007	32012	0 %	0 %	50 %	50 %	398349929
82	NC_018000	CG	3	6	32401	32406	0 %	0 %	50 %	50 %	398349929
83	NC_018000	GC	4	8	32643	32650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018000	CG	3	6	33461	33466	0 %	0 %	50 %	50 %	398349930
85	NC_018000	TC	3	6	34473	34478	0 %	50 %	0 %	50 %	398349930
86	NC_018000	CG	3	6	35682	35687	0 %	0 %	50 %	50 %	398349930
87	NC_018000	GC	3	6	35722	35727	0 %	0 %	50 %	50 %	398349930
88	NC_018000	GC	3	6	36027	36032	0 %	0 %	50 %	50 %	398349931
89	NC_018000	GC	5	10	36690	36699	0 %	0 %	50 %	50 %	398349931
90	NC_018000	CG	4	8	36941	36948	0 %	0 %	50 %	50 %	398349931
91	NC_018000	GC	3	6	37372	37377	0 %	0 %	50 %	50 %	398349931
92	NC_018000	CG	3	6	38509	38514	0 %	0 %	50 %	50 %	398349932
93	NC_018000	GC	3	6	39114	39119	0 %	0 %	50 %	50 %	398349933
94	NC_018000	GC	3	6	39214	39219	0 %	0 %	50 %	50 %	398349933
95	NC_018000	GA	3	6	39600	39605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018000	GC	4	8	39714	39721	0 %	0 %	50 %	50 %	398349934
97	NC_018000	TG	3	6	40196	40201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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99	NC_018000	CG	3	6	40631	40636	0 %	0 %	50 %	50 %	398349935
100	NC_018000	GC	3	6	40831	40836	0 %	0 %	50 %	50 %	398349935
101	NC_018000	GC	3	6	41597	41602	0 %	0 %	50 %	50 %	398349936
102	NC_018000	TC	3	6	41726	41731	0 %	50 %	0 %	50 %	398349937
103	NC_018000	GC	3	6	42467	42472	0 %	0 %	50 %	50 %	398349937
104	NC_018000	GC	3	6	42633	42638	0 %	0 %	50 %	50 %	398349938
105	NC_018000	CG	3	6	42921	42926	0 %	0 %	50 %	50 %	398349938
106	NC_018000	CG	3	6	43372	43377	0 %	0 %	50 %	50 %	398349938
107	NC_018000	CG	3	6	44048	44053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018000	CG	3	6	44260	44265	0 %	0 %	50 %	50 %	398349939
109	NC_018000	GC	4	8	44315	44322	0 %	0 %	50 %	50 %	398349939
110	NC_018000	GC	3	6	44493	44498	0 %	0 %	50 %	50 %	398349939
111	NC_018000	CG	3	6	44965	44970	0 %	0 %	50 %	50 %	398349939
112	NC_018000	GT	3	6	45022	45027	0 %	50 %	50 %	0 %	398349939
113	NC_018000	CG	3	6	46095	46100	0 %	0 %	50 %	50 %	398349941
114	NC_018000	TC	3	6	46231	46236	0 %	50 %	0 %	50 %	398349941
115	NC_018000	CG	4	8	46504	46511	0 %	0 %	50 %	50 %	398349941
116	NC_018000	GC	3	6	46730	46735	0 %	0 %	50 %	50 %	398349941
117	NC_018000	GC	3	6	47308	47313	0 %	0 %	50 %	50 %	398349942
118	NC_018000	CG	3	6	47805	47810	0 %	0 %	50 %	50 %	398349944
119	NC_018000	GC	3	6	48594	48599	0 %	0 %	50 %	50 %	398349944
120	NC_018000	GC	3	6	48780	48785	0 %	0 %	50 %	50 %	398349944
121	NC_018000	GC	3	6	49167	49172	0 %	0 %	50 %	50 %	398349944
122	NC_018000	AT	3	6	50122	50127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018000	GC	3	6	50209	50214	0 %	0 %	50 %	50 %	398349946
124	NC_018000	GT	3	6	50264	50269	0 %	50 %	50 %	0 %	398349946
125	NC_018000	TC	3	6	51283	51288	0 %	50 %	0 %	50 %	398349946
126	NC_018000	AC	4	8	51544	51551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018000	AG	3	6	52015	52020	50 %	0 %	50 %	0 %	398349947
128	NC_018000	CG	4	8	52179	52186	0 %	0 %	50 %	50 %	398349947
129	NC_018000	CG	3	6	52633	52638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018000	CG	3	6	53786	53791	0 %	0 %	50 %	50 %	398349950
131	NC_018000	CG	3	6	53855	53860	0 %	0 %	50 %	50 %	398349950
132	NC_018000	GC	3	6	54567	54572	0 %	0 %	50 %	50 %	398349950
133	NC_018000	GC	3	6	55050	55055	0 %	0 %	50 %	50 %	398349951
134	NC_018000	GC	3	6	55702	55707	0 %	0 %	50 %	50 %	398349951
135	NC_018000	GC	3	6	55725	55730	0 %	0 %	50 %	50 %	398349951
136	NC_018000	CG	3	6	56830	56835	0 %	0 %	50 %	50 %	398349951
137	NC_018000	CG	3	6	57279	57284	0 %	0 %	50 %	50 %	398349952
138	NC_018000	GC	3	6	57967	57972	0 %	0 %	50 %	50 %	398349952
139	NC_018000	CG	3	6	58929	58934	0 %	0 %	50 %	50 %	398349953
140	NC_018000	GC	5	10	59338	59347	0 %	0 %	50 %	50 %	398349953
141	NC_018000	GC	3	6	60254	60259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018000	GC	3	6	60268	60273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018000	AG	3	6	60282	60287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018000	CG	3	6	60937	60942	0 %	0 %	50 %	50 %	398349955
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