MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 2094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018000	CT	3	6	14484	14489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018000	GT	3	6	19712	19717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018000	GA	3	6	19721	19726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018000	GC	3	6	20149	20154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018000	GC	3	6	21134	21139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018000	GC	4	8	32643	32650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018000	GA	3	6	39600	39605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018000	TG	3	6	40196	40201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018000	CG	3	6	44048	44053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018000	AT	3	6	50122	50127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018000	AC	4	8	51544	51551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018000	CG	3	6	52633	52638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018000	GC	3	6	60254	60259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018000	GC	3	6	60268	60273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018000	AG	3	6	60282	60287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018000	CG	3	6	67182	67187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018000	AG	3	6	67231	67236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018000	TC	3	6	68456	68461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018000	GC	3	6	72475	72480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018000	AG	3	6	73857	73862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018000	GC	3	6	75719	75724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018000	GC	3	6	78737	78742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018000	TC	3	6	79874	79879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018000	GA	4	8	79886	79893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018000	GC	3	6	87080	87085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018000	GA	3	6	87115	87120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018000	CG	4	8	91841	91848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018000	CG	3	6	92112	92117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018000	GC	3	6	92224	92229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018000	CG	3	6	92273	92278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018000	GA	3	6	92364	92369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018000	GC	3	6	92488	92493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018000	CG	3	6	92617	92622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018000	CG	3	6	92824	92829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018000	CG	4	8	93328	93335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018000	GC	3	6	105068	105073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018000	CG	3	6	105694	105699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018000	CG	3	6	109047	109052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018000	CG	4	8	112844	112851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018000	CG	3	6	115525	115530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018000	TC	4	8	122060	122067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018000	TA	3	6	122179	122184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018000	GC	3	6	122375	122380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018000	GA	3	6	123720	123725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018000	CG	3	6	129955	129960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018000	GA	3	6	130380	130385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018000	TC	3	6	130931	130936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018000	AG	3	6	131001	131006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018000	CG	3	6	132386	132391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018000	AG	3	6	134996	135001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018000	AG	3	6	141368	141373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018000	TC	4	8	142212	142219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018000	GC	3	6	144655	144660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018000	CA	3	6	144893	144898	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018000	CG	3	6	149960	149965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018000	GC	3	6	150064	150069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018000	CT	3	6	152170	152175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018000	CG	3	6	156102	156107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018000	TC	4	8	158410	158417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018000	GC	4	8	161608	161615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018000	CG	3	6	161686	161691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018000	CG	3	6	165653	165658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018000	GC	3	6	177611	177616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018000	GA	3	6	182211	182216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018000	TC	3	6	185710	185715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018000	GC	3	6	196574	196579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018000	CG	3	6	200624	200629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018000	GC	3	6	200716	200721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018000	CG	3	6	216470	216475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018000	AG	3	6	222412	222417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018000	CG	3	6	222572	222577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018000	TC	3	6	223022	223027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018000	CG	3	6	224579	224584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018000	CA	3	6	227029	227034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018000	GT	3	6	227084	227089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018000	AG	3	6	235165	235170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018000	GC	3	6	235339	235344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018000	GC	3	6	235520	235525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018000	CG	3	6	241346	241351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018000	GA	3	6	241811	241816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018000	GC	3	6	241848	241853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018000	CG	3	6	243217	243222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018000	CT	3	6	245504	245509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018000	GT	3	6	246842	246847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018000	TC	3	6	247815	247820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018000	TC	3	6	255766	255771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018000	GC	3	6	256128	256133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018000	AT	3	6	263782	263787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018000	AC	3	6	264685	264690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018000	TG	3	6	271041	271046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018000	GC	3	6	285261	285266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018000	AC	3	6	285425	285430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018000	GC	3	6	291481	291486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018000	CG	3	6	291496	291501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018000	CT	3	6	291783	291788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018000	TA	4	8	291826	291833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018000	TG	3	6	291921	291926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018000	GA	3	6	292031	292036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018000	GT	3	6	292682	292687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018000	TC	3	6	312900	312905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018000	CT	3	6	312908	312913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018000	CG	3	6	324701	324706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018000	TC	3	6	324941	324946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018000	GC	3	6	325037	325042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018000	CG	4	8	333136	333143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018000	GA	3	6	335657	335662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018000	AT	3	6	335977	335982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018000	TC	3	6	338026	338031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018000	GC	3	6	338061	338066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018000	CG	3	6	339785	339790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018000	GC	3	6	343517	343522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018000	CA	3	6	345164	345169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018000	TC	3	6	347276	347281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018000	GC	3	6	357241	357246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018000	GA	3	6	363873	363878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018000	CA	3	6	363976	363981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018000	CA	3	6	369881	369886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018000	CG	3	6	369936	369941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018000	CG	3	6	374339	374344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018000	TC	3	6	376552	376557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018000	CG	3	6	396004	396009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018000	TC	3	6	399877	399882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018000	CG	3	6	400325	400330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018000	CG	3	6	403429	403434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018000	CA	3	6	418028	418033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018000	CG	4	8	418101	418108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018000	GC	3	6	418561	418566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018000	TC	3	6	424623	424628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018000	CG	3	6	425362	425367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018000	GT	3	6	431527	431532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018000	CG	3	6	431573	431578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018000	GC	4	8	434123	434130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018000	CG	3	6	434884	434889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018000	CT	3	6	435574	435579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_018000	CG	4	8	440919	440926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018000	CG	3	6	441165	441170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018000	AC	3	6	441205	441210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018000	GA	3	6	442568	442573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018000	TG	3	6	451479	451484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018000	CG	3	6	451571	451576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018000	GC	3	6	451984	451989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018000	AC	3	6	452132	452137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018000	AC	3	6	454189	454194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_018000	GC	3	6	454235	454240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_018000	GT	3	6	457618	457623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018000	CG	3	6	458919	458924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018000	TG	3	6	458968	458973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018000	GC	4	8	459003	459010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_018000	AG	4	8	459065	459072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018000	GC	3	6	459108	459113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_018000	GC	3	6	460214	460219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_018000	TC	3	6	460469	460474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_018000	CG	3	6	460660	460665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_018000	CG	3	6	460802	460807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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156	NC_018000	TG	3	6	468591	468596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_018000	TC	3	6	1498463	1498468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
456	NC_018000	CG	3	6	1498896	1498901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
457	NC_018000	CG	3	6	1499285	1499290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
458	NC_018000	TC	3	6	1499457	1499462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
459	NC_018000	CG	3	6	1502191	1502196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
460	NC_018000	GT	3	6	1502384	1502389	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
461	NC_018000	GC	4	8	1502425	1502432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
462	NC_018000	GC	3	6	1502450	1502455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
463	NC_018000	CG	3	6	1502607	1502612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
464	NC_018000	CG	3	6	1502698	1502703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
465	NC_018000	CG	3	6	1503702	1503707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
466	NC_018000	AG	3	6	1503711	1503716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_018000	AT	3	6	1505267	1505272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_018000	CT	3	6	1507409	1507414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
471	NC_018000	GC	3	6	1510258	1510263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
472	NC_018000	GC	3	6	1514917	1514922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
473	NC_018000	TC	3	6	1517762	1517767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
474	NC_018000	CT	3	6	1525656	1525661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
475	NC_018000	AC	3	6	1529921	1529926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
476	NC_018000	AC	3	6	1529988	1529993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
477	NC_018000	GC	3	6	1533591	1533596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
478	NC_018000	GC	3	6	1550384	1550389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
479	NC_018000	GT	3	6	1550509	1550514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
480	NC_018000	TA	3	6	1555504	1555509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_018000	CG	3	6	1556389	1556394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
482	NC_018000	CG	3	6	1563297	1563302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
483	NC_018000	CG	3	6	1563436	1563441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
484	NC_018000	AT	5	10	1569008	1569017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_018000	CG	3	6	1583648	1583653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
486	NC_018000	CA	3	6	1596984	1596989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
487	NC_018000	CG	3	6	1600654	1600659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
488	NC_018000	GA	3	6	1600678	1600683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
489	NC_018000	AT	3	6	1602468	1602473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_018000	GC	4	8	1609440	1609447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
491	NC_018000	GC	4	8	1612983	1612990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
492	NC_018000	AG	3	6	1613146	1613151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
493	NC_018000	AG	3	6	1613168	1613173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
494	NC_018000	GC	3	6	1615828	1615833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
495	NC_018000	TC	3	6	1629808	1629813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
496	NC_018000	GC	3	6	1630135	1630140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
497	NC_018000	GA	3	6	1632457	1632462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
498	NC_018000	AG	3	6	1636937	1636942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
499	NC_018000	CG	3	6	1640605	1640610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
500	NC_018000	CG	3	6	1671054	1671059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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