MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 1685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017999	TCGAT	2	10	431	440	20 %	40 %	20 %	20 %	390935918
2	NC_017999	AACGC	2	10	3017	3026	40 %	0 %	20 %	40 %	390935919
3	NC_017999	CGAAT	2	10	3340	3349	40 %	20 %	20 %	20 %	390935920
4	NC_017999	ATGAC	2	10	3382	3391	40 %	20 %	20 %	20 %	390935920
5	NC_017999	GGGCA	2	10	8147	8156	20 %	0 %	60 %	20 %	390935924
6	NC_017999	TCGGC	2	10	8160	8169	0 %	20 %	40 %	40 %	390935924
7	NC_017999	TGCCG	2	10	8773	8782	0 %	20 %	40 %	40 %	390935924
8	NC_017999	TCGTC	2	10	10886	10895	0 %	40 %	20 %	40 %	390935925
9	NC_017999	ACGCC	2	10	12725	12734	20 %	0 %	20 %	60 %	390935928
10	NC_017999	TTCGA	2	10	14649	14658	20 %	40 %	20 %	20 %	390935929
11	NC_017999	CGCGA	2	10	15333	15342	20 %	0 %	40 %	40 %	390935930
12	NC_017999	TGGCG	2	10	16389	16398	0 %	20 %	60 %	20 %	390935931
13	NC_017999	ACGGC	2	10	16970	16979	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017999	GCAGT	2	10	17663	17672	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017999	CACGG	2	10	19851	19860	20 %	0 %	40 %	40 %	390935936
16	NC_017999	AGCTG	2	10	20900	20909	20 %	20 %	40 %	20 %	390935937
17	NC_017999	GCGGT	2	10	21822	21831	0 %	20 %	60 %	20 %	390935938
18	NC_017999	TTGTC	2	10	22695	22704	0 %	60 %	20 %	20 %	390935939
19	NC_017999	CGAGC	2	10	23392	23401	20 %	0 %	40 %	40 %	390935939
20	NC_017999	GTGAT	2	10	26040	26049	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017999	CGGGC	2	10	31467	31476	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017999	AAGAA	2	10	31896	31905	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017999	AGCGC	2	10	32016	32025	20 %	0 %	40 %	40 %	390935945
24	NC_017999	TCGCG	2	10	35579	35588	0 %	20 %	40 %	40 %	390935948
25	NC_017999	ACGCC	2	10	36507	36516	20 %	0 %	20 %	60 %	390935948
26	NC_017999	CGTTG	2	10	37180	37189	0 %	40 %	40 %	20 %	390935949
27	NC_017999	GTCGG	2	10	39615	39624	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017999	CGAGC	2	10	40398	40407	20 %	0 %	40 %	40 %	390935952
29	NC_017999	AGCGC	2	10	41850	41859	20 %	0 %	40 %	40 %	390935953
30	NC_017999	AGGGC	2	10	46326	46335	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017999	AACGC	2	10	46620	46629	40 %	0 %	20 %	40 %	390935956
32	NC_017999	CAGAT	2	10	47972	47981	40 %	20 %	20 %	20 %	390935956
33	NC_017999	CATCG	2	10	48964	48973	20 %	20 %	20 %	40 %	390935956
34	NC_017999	ATGGC	2	10	52288	52297	20 %	20 %	40 %	20 %	390935959
35	NC_017999	ATCAG	2	10	53020	53029	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017999	GCAGC	2	10	53479	53488	20 %	0 %	40 %	40 %	390935960
37	NC_017999	GGTCG	2	10	55657	55666	0 %	20 %	60 %	20 %	390935961
38	NC_017999	GGCGT	2	10	56779	56788	0 %	20 %	60 %	20 %	390935963
39	NC_017999	GCTTT	2	10	64504	64513	0 %	60 %	20 %	20 %	390935969
40	NC_017999	GTTGT	2	10	65464	65473	0 %	60 %	40 %	0 %	390935969
41	NC_017999	TAAAA	2	10	66504	66513	80 %	20 %	0 %	0 %	390935970
42	NC_017999	ACAGG	2	10	68231	68240	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017999	CACCG	2	10	68271	68280	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_017999	GCTCA	2	10	70387	70396	20 %	20 %	20 %	40 %	390935976
45	NC_017999	TGCTG	2	10	71153	71162	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017999	TGCGT	2	10	71724	71733	0 %	40 %	40 %	20 %	390935977
47	NC_017999	ATGCC	2	10	74524	74533	20 %	20 %	20 %	40 %	390935979
48	NC_017999	GCATG	2	10	77676	77685	20 %	20 %	40 %	20 %	390935981
49	NC_017999	TCTGC	2	10	80121	80130	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017999	ATAAG	2	10	80594	80603	60 %	20 %	20 %	0 %	390935983
51	NC_017999	GGCTT	2	10	84845	84854	0 %	40 %	40 %	20 %	390935985
52	NC_017999	AAAGG	2	10	84973	84982	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017999	TGCGA	2	10	85794	85803	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017999	GATGG	2	10	87428	87437	20 %	20 %	60 %	0 %	390935988
55	NC_017999	TCAAT	2	10	89528	89537	40 %	40 %	0 %	20 %	390935990
56	NC_017999	CGCTG	2	10	91142	91151	0 %	20 %	40 %	40 %	390935992
57	NC_017999	CTTGC	2	10	94486	94495	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017999	ACATG	2	10	96350	96359	40 %	20 %	20 %	20 %	390935997
59	NC_017999	CATGA	2	10	97732	97741	40 %	20 %	20 %	20 %	390935998
60	NC_017999	GTCAT	2	10	98168	98177	20 %	40 %	20 %	20 %	390935998
61	NC_017999	GAGCT	2	10	100437	100446	20 %	20 %	40 %	20 %	390936001
62	NC_017999	ACGAG	2	10	100935	100944	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017999	GTCGC	2	10	101981	101990	0 %	20 %	40 %	40 %	390936003
64	NC_017999	TCACG	2	10	103560	103569	20 %	20 %	20 %	40 %	390936003
65	NC_017999	GACGG	2	10	104763	104772	20 %	0 %	60 %	20 %	390936004
66	NC_017999	TCGTG	2	10	105778	105787	0 %	40 %	40 %	20 %	390936005
67	NC_017999	TTGCG	2	10	106219	106228	0 %	40 %	40 %	20 %	390936005
68	NC_017999	TCGCG	2	10	108590	108599	0 %	20 %	40 %	40 %	390936007
69	NC_017999	GCCGG	2	10	109834	109843	0 %	0 %	60 %	40 %	390936008
70	NC_017999	GGTCA	2	10	110202	110211	20 %	20 %	40 %	20 %	390936009
71	NC_017999	GGCGA	2	10	112419	112428	20 %	0 %	60 %	20 %	390936010
72	NC_017999	CCCCG	2	10	113089	113098	0 %	0 %	20 %	80 %	390936010
73	NC_017999	CGGCT	2	10	114007	114016	0 %	20 %	40 %	40 %	390936011
74	NC_017999	GCCAC	2	10	116605	116614	20 %	0 %	20 %	60 %	390936012
75	NC_017999	GCTCG	2	10	117272	117281	0 %	20 %	40 %	40 %	390936012
76	NC_017999	GCGCT	2	10	117546	117555	0 %	20 %	40 %	40 %	390936012
77	NC_017999	ACTCG	2	10	117980	117989	20 %	20 %	20 %	40 %	390936012
78	NC_017999	CGATG	2	10	118721	118730	20 %	20 %	40 %	20 %	390936012
79	NC_017999	CGTGC	2	10	119847	119856	0 %	20 %	40 %	40 %	390936013
80	NC_017999	GGTGC	2	10	120434	120443	0 %	20 %	60 %	20 %	390936014
81	NC_017999	GGCGT	2	10	120638	120647	0 %	20 %	60 %	20 %	390936014
82	NC_017999	CGGTG	2	10	121045	121054	0 %	20 %	60 %	20 %	390936014
83	NC_017999	CGGCG	2	10	121578	121587	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017999	AACGC	2	10	122780	122789	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017999	GACGC	2	10	123189	123198	20 %	0 %	40 %	40 %	390936017
86	NC_017999	ACCGT	2	10	124749	124758	20 %	20 %	20 %	40 %	390936019
87	NC_017999	ACTCT	2	10	128960	128969	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017999	GGACG	2	10	129286	129295	20 %	0 %	60 %	20 %	390936022
89	NC_017999	GCATG	2	10	129871	129880	20 %	20 %	40 %	20 %	390936024
90	NC_017999	GGCCG	2	10	131814	131823	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017999	GTGGC	2	10	132898	132907	0 %	20 %	60 %	20 %	390936027
92	NC_017999	TGAAG	2	10	134964	134973	40 %	20 %	40 %	0 %	390936030
93	NC_017999	GTAAA	2	10	135464	135473	60 %	20 %	20 %	0 %	390936030
94	NC_017999	CGCGG	2	10	137950	137959	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017999	CCAAT	2	10	138322	138331	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017999	CTCAC	2	10	139691	139700	20 %	20 %	0 %	60 %	390936034
97	NC_017999	GCCGC	2	10	140964	140973	0 %	0 %	40 %	60 %	390936034
98	NC_017999	CGGGC	2	10	145153	145162	0 %	0 %	60 %	40 %	390936036
99	NC_017999	TCATC	2	10	145283	145292	20 %	40 %	0 %	40 %	390936036
100	NC_017999	TCATT	2	10	147585	147594	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017999	GGTCT	2	10	147791	147800	0 %	40 %	40 %	20 %	390936038
102	NC_017999	GAACT	2	10	149879	149888	40 %	20 %	20 %	20 %	390936039
103	NC_017999	CAGCA	2	10	150820	150829	40 %	0 %	20 %	40 %	390936040
104	NC_017999	TCGCA	2	10	152397	152406	20 %	20 %	20 %	40 %	390936043
105	NC_017999	GCCGC	2	10	152579	152588	0 %	0 %	40 %	60 %	390936043
106	NC_017999	GCCGC	2	10	156147	156156	0 %	0 %	40 %	60 %	390936048
107	NC_017999	CGCTG	2	10	156512	156521	0 %	20 %	40 %	40 %	390936049
108	NC_017999	GCGGT	2	10	157236	157245	0 %	20 %	60 %	20 %	390936049
109	NC_017999	CGGCC	2	10	158160	158169	0 %	0 %	40 %	60 %	390936050
110	NC_017999	GACCA	2	10	158311	158320	40 %	0 %	20 %	40 %	390936050
111	NC_017999	GACTC	2	10	159249	159258	20 %	20 %	20 %	40 %	390936051
112	NC_017999	TTCCA	2	10	159380	159389	20 %	40 %	0 %	40 %	390936051
113	NC_017999	CGATA	2	10	159484	159493	40 %	20 %	20 %	20 %	390936051
114	NC_017999	ACGCG	2	10	162098	162107	20 %	0 %	40 %	40 %	390936054
115	NC_017999	AAGAG	2	10	162186	162195	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017999	TTCGC	2	10	163327	163336	0 %	40 %	20 %	40 %	390936055
117	NC_017999	CATCG	2	10	163386	163395	20 %	20 %	20 %	40 %	390936055
118	NC_017999	CCGGT	2	10	163520	163529	0 %	20 %	40 %	40 %	390936055
119	NC_017999	CGATG	2	10	165077	165086	20 %	20 %	40 %	20 %	390936056
120	NC_017999	CTCCG	2	10	167160	167169	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_017999	AAGTC	2	10	167764	167773	40 %	20 %	20 %	20 %	390936059
122	NC_017999	ATGCA	2	10	169946	169955	40 %	20 %	20 %	20 %	390936060
123	NC_017999	CGCTG	2	10	172587	172596	0 %	20 %	40 %	40 %	390936061
124	NC_017999	CCACA	2	10	174657	174666	40 %	0 %	0 %	60 %	390936063
125	NC_017999	GGGCC	2	10	176202	176211	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017999	CCGCG	2	10	178541	178550	0 %	0 %	40 %	60 %	390936066
127	NC_017999	CGATG	2	10	180734	180743	20 %	20 %	40 %	20 %	390936066
128	NC_017999	GCTCG	2	10	180747	180756	0 %	20 %	40 %	40 %	390936066
129	NC_017999	CGGCG	2	10	181803	181812	0 %	0 %	60 %	40 %	390936067
130	NC_017999	GGGGC	2	10	182828	182837	0 %	0 %	80 %	20 %	390936068
131	NC_017999	AGGCG	2	10	184199	184208	20 %	0 %	60 %	20 %	390936071
132	NC_017999	CGCGG	2	10	184273	184282	0 %	0 %	60 %	40 %	390936071
133	NC_017999	TGGCA	2	10	185697	185706	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017999	CACGC	2	10	186861	186870	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_017999	GGCAT	2	10	190724	190733	20 %	20 %	40 %	20 %	390936076
136	NC_017999	GACGG	2	10	195253	195262	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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251	NC_017999	ACGGC	2	10	348592	348601	20 %	0 %	40 %	40 %	390936200
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254	NC_017999	TTGTA	2	10	349736	349745	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
255	NC_017999	CGATG	2	10	351343	351352	20 %	20 %	40 %	20 %	390936206
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258	NC_017999	GAGTC	2	10	355316	355325	20 %	20 %	40 %	20 %	390936212
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260	NC_017999	GCGAT	2	10	355949	355958	20 %	20 %	40 %	20 %	390936212
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264	NC_017999	TCCGG	2	10	359255	359264	0 %	20 %	40 %	40 %	390936215
265	NC_017999	CGAAT	2	10	359620	359629	40 %	20 %	20 %	20 %	390936215
266	NC_017999	CGGCG	2	10	360238	360247	0 %	0 %	60 %	40 %	390936215
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