MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 458

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017999	A	6	6	1652	1657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017999	T	6	6	1662	1667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017999	T	6	6	1878	1883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017999	A	6	6	2128	2133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017999	G	10	10	7623	7632	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017999	T	9	9	13808	13816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017999	T	6	6	14858	14863	0 %	100 %	0 %	0 %	390935929
8	NC_017999	T	6	6	18033	18038	0 %	100 %	0 %	0 %	390935933
9	NC_017999	A	7	7	26424	26430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017999	T	6	6	26607	26612	0 %	100 %	0 %	0 %	390935940
11	NC_017999	G	10	10	35381	35390	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017999	G	6	6	38015	38020	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017999	G	7	7	40657	40663	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017999	C	6	6	44595	44600	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_017999	G	10	10	46295	46304	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017999	T	6	6	53318	53323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017999	A	6	6	61254	61259	100 %	0 %	0 %	0 %	390935967
18	NC_017999	T	6	6	63519	63524	0 %	100 %	0 %	0 %	390935969
19	NC_017999	A	7	7	63714	63720	100 %	0 %	0 %	0 %	390935969
20	NC_017999	T	6	6	64721	64726	0 %	100 %	0 %	0 %	390935969
21	NC_017999	A	6	6	66021	66026	100 %	0 %	0 %	0 %	390935970
22	NC_017999	A	6	6	66318	66323	100 %	0 %	0 %	0 %	390935970
23	NC_017999	A	7	7	66510	66516	100 %	0 %	0 %	0 %	390935970
24	NC_017999	A	6	6	69294	69299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017999	G	6	6	70034	70039	0 %	0 %	100 %	0 %	390935976
26	NC_017999	A	7	7	70237	70243	100 %	0 %	0 %	0 %	390935976
27	NC_017999	T	7	7	71292	71298	0 %	100 %	0 %	0 %	390935977
28	NC_017999	T	6	6	71716	71721	0 %	100 %	0 %	0 %	390935977
29	NC_017999	A	6	6	72514	72519	100 %	0 %	0 %	0 %	390935977
30	NC_017999	A	7	7	72870	72876	100 %	0 %	0 %	0 %	390935977
31	NC_017999	A	6	6	77111	77116	100 %	0 %	0 %	0 %	390935981
32	NC_017999	A	6	6	81392	81397	100 %	0 %	0 %	0 %	390935983
33	NC_017999	T	6	6	86166	86171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017999	C	6	6	92960	92965	0 %	0 %	0 %	100 %	390935993
35	NC_017999	C	6	6	93785	93790	0 %	0 %	0 %	100 %	390935993
36	NC_017999	A	6	6	98790	98795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017999	A	7	7	99539	99545	100 %	0 %	0 %	0 %	390936000
38	NC_017999	G	7	7	110928	110934	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017999	G	6	6	113739	113744	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017999	T	6	6	131413	131418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017999	T	6	6	133177	133182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017999	T	6	6	134125	134130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017999	A	6	6	136013	136018	100 %	0 %	0 %	0 %	390936031
44	NC_017999	A	7	7	136320	136326	100 %	0 %	0 %	0 %	390936031
45	NC_017999	T	6	6	137383	137388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017999	G	6	6	139476	139481	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017999	T	8	8	153647	153654	0 %	100 %	0 %	0 %	390936046
48	NC_017999	T	7	7	164381	164387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017999	A	6	6	164444	164449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017999	A	6	6	165898	165903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017999	G	7	7	185044	185050	0 %	0 %	100 %	0 %	390936071
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54	NC_017999	C	11	11	195505	195515	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55	NC_017999	T	7	7	203432	203438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58	NC_017999	T	6	6	232738	232743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60	NC_017999	A	6	6	235383	235388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017999	C	7	7	237040	237046	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_017999	C	6	6	242504	242509	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_017999	T	6	6	257869	257874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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69	NC_017999	G	8	8	288415	288422	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017999	G	7	7	290233	290239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017999	T	6	6	291561	291566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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113	NC_017999	A	6	6	565738	565743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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115	NC_017999	C	6	6	571416	571421	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_017999	G	6	6	571428	571433	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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121	NC_017999	T	7	7	622071	622077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.