MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 plasmid pMU3262

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017998	TGTTAT	2	12	6085	6096	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	390935784
2	NC_017998	TTTGTC	2	12	7096	7107	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	390935786
3	NC_017998	TAATTC	2	12	8875	8886	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390935787
4	NC_017998	CATTAA	2	12	11690	11701	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390935789
5	NC_017998	TTGCTC	2	12	11979	11990	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	390935790
6	NC_017998	TATAAA	2	12	12046	12057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390935790
7	NC_017998	TGTTAA	2	12	12627	12638	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	390935791
8	NC_017998	TTTATA	2	12	15793	15804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935794
9	NC_017998	ATCAGC	2	12	15919	15930	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390935794
10	NC_017998	ATTGCT	2	12	17269	17280	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390935794
11	NC_017998	GCAATG	2	12	18651	18662	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390935795
12	NC_017998	TTTTAT	2	12	21265	21276	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	390935799
13	NC_017998	ATTATC	2	12	25904	25915	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390935805
14	NC_017998	ACCTTC	2	12	29893	29904	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	390935813
15	NC_017998	ATTAAT	2	12	33958	33969	50 %	50 %	0 %	0 %	390935816
16	NC_017998	CTTTTA	2	12	34867	34878	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390935817
17	NC_017998	CTTTAT	2	12	36642	36653	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390935819
18	NC_017998	CAGCAT	2	12	42754	42765	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390935827
19	NC_017998	GTAATA	2	12	43244	43255	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390935828
20	NC_017998	ATTCAT	2	12	44209	44220	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390935829
21	NC_017998	TTAAAT	2	12	44670	44681	50 %	50 %	0 %	0 %	390935829
22	NC_017998	TTCTGT	2	12	44789	44800	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	390935829
23	NC_017998	TCTTGC	2	12	47294	47305	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	390935832
24	NC_017998	CTAAAT	2	12	47428	47439	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390935832
25	NC_017998	CTTTTA	2	12	47680	47691	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390935832
26	NC_017998	CTTTAA	2	12	51928	51939	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390935837
27	NC_017998	AAGTTA	2	12	54285	54296	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390935840
28	NC_017998	AGCATA	2	12	59244	59255	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390935846
29	NC_017998	TCTTTG	2	12	60186	60197	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	390935847
30	NC_017998	CTATTG	2	12	65366	65377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390935857
31	NC_017998	ATTTCT	2	12	66918	66929	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390935858
32	NC_017998	TAAATA	2	12	67663	67674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390935859
33	NC_017998	CTTTTT	2	12	67848	67859	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	390935859
34	NC_017998	TTGTAT	2	12	71809	71820	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	390935862
35	NC_017998	TCTTTT	2	12	76070	76081	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	390935869
36	NC_017998	CTTCAA	2	12	76390	76401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935870
37	NC_017998	GTAATT	2	12	77815	77826	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	390935873
38	NC_017998	TTAATA	2	12	79456	79467	50 %	50 %	0 %	0 %	390935874
39	NC_017998	TGTTGA	2	12	81351	81362	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	390935877
40	NC_017998	AGCAAA	2	12	81528	81539	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	390935877
41	NC_017998	TTAATA	2	12	83606	83617	50 %	50 %	0 %	0 %	390935879
42	NC_017998	ATTCAA	2	12	85179	85190	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390935882
43	NC_017998	TTTATC	2	12	85952	85963	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390935884
44	NC_017998	TAATCA	2	12	90628	90639	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390935895
45	NC_017998	TTGAGA	2	12	92090	92101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935896
46	NC_017998	CTATTT	3	18	96581	96598	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390935904
47	NC_017998	TATTTT	2	12	97873	97884	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	390935905
48	NC_017998	CATTTT	2	12	98615	98626	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390935906
49	NC_017998	TTCATG	2	12	104123	104134	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390935912
50	NC_017998	ATGAAA	2	12	106743	106754	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	390935914
51	NC_017998	AAGAAA	2	12	106786	106797	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	390935914
52	NC_017998	AGAAAA	2	12	108346	108357	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	390935914

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.