MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 plasmid pMU3262

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017998	AGAAA	2	10	15	24	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017998	CTTTT	2	10	242	251	0 %	80 %	0 %	20 %	390935778
3	NC_017998	AAAAC	2	10	4695	4704	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017998	AATAA	2	10	6528	6537	80 %	20 %	0 %	0 %	390935785
5	NC_017998	ATAAC	2	10	8305	8314	60 %	20 %	0 %	20 %	390935786
6	NC_017998	CTCTC	2	10	12911	12920	0 %	40 %	0 %	60 %	390935791
7	NC_017998	ATTTT	2	10	15809	15818	20 %	80 %	0 %	0 %	390935794
8	NC_017998	CTTTA	2	10	16306	16315	20 %	60 %	0 %	20 %	390935794
9	NC_017998	GCTTT	2	10	17418	17427	0 %	60 %	20 %	20 %	390935794
10	NC_017998	TTTTG	2	10	19217	19226	0 %	80 %	20 %	0 %	390935795
11	NC_017998	TTGCA	2	10	21443	21452	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017998	TAAAC	2	10	24553	24562	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017998	AAAAT	2	10	25657	25666	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017998	TTTGT	2	10	25730	25739	0 %	80 %	20 %	0 %	390935805
15	NC_017998	ATTTA	2	10	25778	25787	40 %	60 %	0 %	0 %	390935805
16	NC_017998	TATCA	2	10	26309	26318	40 %	40 %	0 %	20 %	390935805
17	NC_017998	AATGT	2	10	27433	27442	40 %	40 %	20 %	0 %	390935807
18	NC_017998	TTTTA	2	10	27733	27742	20 %	80 %	0 %	0 %	390935808
19	NC_017998	CATAT	2	10	28030	28039	40 %	40 %	0 %	20 %	390935808
20	NC_017998	TATTT	2	10	28878	28887	20 %	80 %	0 %	0 %	390935812
21	NC_017998	ACCAA	2	10	30105	30114	60 %	0 %	0 %	40 %	390935814
22	NC_017998	AAATA	2	10	30836	30845	80 %	20 %	0 %	0 %	390935815
23	NC_017998	TTTCT	2	10	32409	32418	0 %	80 %	0 %	20 %	390935816
24	NC_017998	CTCAT	2	10	32837	32846	20 %	40 %	0 %	40 %	390935816
25	NC_017998	GTTGG	2	10	33719	33728	0 %	40 %	60 %	0 %	390935816
26	NC_017998	TTTAT	2	10	33914	33923	20 %	80 %	0 %	0 %	390935816
27	NC_017998	TATTT	2	10	34787	34796	20 %	80 %	0 %	0 %	390935817
28	NC_017998	AAAAT	2	10	35245	35254	80 %	20 %	0 %	0 %	390935818
29	NC_017998	CAAAC	2	10	35963	35972	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017998	TTTGT	2	10	36888	36897	0 %	80 %	20 %	0 %	390935819
31	NC_017998	TTTGA	2	10	37845	37854	20 %	60 %	20 %	0 %	390935820
32	NC_017998	ATTAT	2	10	38716	38725	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017998	GCTTG	2	10	39105	39114	0 %	40 %	40 %	20 %	390935822
34	NC_017998	ATTAA	2	10	39347	39356	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017998	TTATC	2	10	39640	39649	20 %	60 %	0 %	20 %	390935823
36	NC_017998	AATAA	2	10	40354	40363	80 %	20 %	0 %	0 %	390935824
37	NC_017998	ATGTA	2	10	40629	40638	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017998	TGAAG	2	10	41534	41543	40 %	20 %	40 %	0 %	390935825
39	NC_017998	CTTTT	2	10	41636	41645	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017998	TTTTA	2	10	41748	41757	20 %	80 %	0 %	0 %	390935826
41	NC_017998	CAAAA	2	10	43601	43610	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017998	CATTT	2	10	44090	44099	20 %	60 %	0 %	20 %	390935829
43	NC_017998	AATTT	2	10	44433	44442	40 %	60 %	0 %	0 %	390935829
44	NC_017998	TTAAT	2	10	45926	45935	40 %	60 %	0 %	0 %	390935831
45	NC_017998	TCATG	2	10	46981	46990	20 %	40 %	20 %	20 %	390935832
46	NC_017998	CATTT	2	10	47312	47321	20 %	60 %	0 %	20 %	390935832
47	NC_017998	TATCA	2	10	47642	47651	40 %	40 %	0 %	20 %	390935832
48	NC_017998	ATAAA	2	10	47717	47726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017998	TAATT	2	10	47815	47824	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017998	TATAT	2	10	48208	48217	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017998	TAAAA	3	15	48225	48239	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017998	TAAAA	2	10	50668	50677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017998	GGCGT	2	10	51294	51303	0 %	20 %	60 %	20 %	390935837
54	NC_017998	CTTTT	2	10	52830	52839	0 %	80 %	0 %	20 %	390935839
55	NC_017998	GCTGT	2	10	53577	53586	0 %	40 %	40 %	20 %	390935840
56	NC_017998	AATTA	2	10	55351	55360	60 %	40 %	0 %	0 %	390935840
57	NC_017998	ATCCA	2	10	55408	55417	40 %	20 %	0 %	40 %	390935840
58	NC_017998	CTTTT	2	10	55815	55824	0 %	80 %	0 %	20 %	390935841
59	NC_017998	ACATC	2	10	56565	56574	40 %	20 %	0 %	40 %	390935843
60	NC_017998	CTTTT	2	10	56683	56692	0 %	80 %	0 %	20 %	390935843
61	NC_017998	AATTA	2	10	57846	57855	60 %	40 %	0 %	0 %	390935846
62	NC_017998	AATTA	2	10	58233	58242	60 %	40 %	0 %	0 %	390935846
63	NC_017998	TATTG	2	10	60064	60073	20 %	60 %	20 %	0 %	390935847
64	NC_017998	TGATT	2	10	60481	60490	20 %	60 %	20 %	0 %	390935847
65	NC_017998	ATAAA	2	10	60538	60547	80 %	20 %	0 %	0 %	390935847
66	NC_017998	TTTTC	2	10	60577	60586	0 %	80 %	0 %	20 %	390935847
67	NC_017998	TCTTT	2	10	61609	61618	0 %	80 %	0 %	20 %	390935850
68	NC_017998	AAAAT	2	10	61782	61791	80 %	20 %	0 %	0 %	390935850
69	NC_017998	AATTA	2	10	62840	62849	60 %	40 %	0 %	0 %	390935851
70	NC_017998	CTTGC	2	10	63655	63664	0 %	40 %	20 %	40 %	390935853
71	NC_017998	TGAAT	2	10	64141	64150	40 %	40 %	20 %	0 %	390935854
72	NC_017998	AAATA	2	10	64284	64293	80 %	20 %	0 %	0 %	390935854
73	NC_017998	AGTCC	2	10	64712	64721	20 %	20 %	20 %	40 %	390935856
74	NC_017998	CTTTT	2	10	64798	64807	0 %	80 %	0 %	20 %	390935856
75	NC_017998	ATCTC	2	10	65756	65765	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_017998	TTTTA	2	10	66845	66854	20 %	80 %	0 %	0 %	390935858
77	NC_017998	AAAAT	2	10	67097	67106	80 %	20 %	0 %	0 %	390935859
78	NC_017998	AATTA	2	10	67265	67274	60 %	40 %	0 %	0 %	390935859
79	NC_017998	TGTAA	2	10	68343	68352	40 %	40 %	20 %	0 %	390935860
80	NC_017998	TATTT	2	10	69205	69214	20 %	80 %	0 %	0 %	390935861
81	NC_017998	TATAA	2	10	69349	69358	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017998	AGTAA	2	10	73547	73556	60 %	20 %	20 %	0 %	390935863
83	NC_017998	CCATC	2	10	75788	75797	20 %	20 %	0 %	60 %	390935869
84	NC_017998	CTTGT	2	10	76414	76423	0 %	60 %	20 %	20 %	390935870
85	NC_017998	AATAA	2	10	78112	78121	80 %	20 %	0 %	0 %	390935873
86	NC_017998	ATTTT	2	10	80518	80527	20 %	80 %	0 %	0 %	390935876
87	NC_017998	CAGAA	2	10	80532	80541	60 %	0 %	20 %	20 %	390935876
88	NC_017998	CTTTT	2	10	80742	80751	0 %	80 %	0 %	20 %	390935876
89	NC_017998	TTAAA	2	10	81551	81560	60 %	40 %	0 %	0 %	390935877
90	NC_017998	TGAAC	2	10	81758	81767	40 %	20 %	20 %	20 %	390935877
91	NC_017998	TAAAT	2	10	81993	82002	60 %	40 %	0 %	0 %	390935878
92	NC_017998	AATTA	2	10	83400	83409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017998	ACATT	2	10	84432	84441	40 %	40 %	0 %	20 %	390935880
94	NC_017998	CTTTT	2	10	85278	85287	0 %	80 %	0 %	20 %	390935883
95	NC_017998	ATTAA	2	10	86004	86013	60 %	40 %	0 %	0 %	390935885
96	NC_017998	TTAAA	2	10	86226	86235	60 %	40 %	0 %	0 %	390935886
97	NC_017998	TAATA	2	10	87838	87847	60 %	40 %	0 %	0 %	390935889
98	NC_017998	TATGT	2	10	87897	87906	20 %	60 %	20 %	0 %	390935889
99	NC_017998	TTTAA	2	10	88134	88143	40 %	60 %	0 %	0 %	390935889
100	NC_017998	TATTT	2	10	88307	88316	20 %	80 %	0 %	0 %	390935889
101	NC_017998	ATATG	2	10	89260	89269	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017998	AAAAT	2	10	89994	90003	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017998	TATTT	2	10	90445	90454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017998	ATTCC	2	10	90747	90756	20 %	40 %	0 %	40 %	390935895
105	NC_017998	TATAA	2	10	91333	91342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017998	CACTT	2	10	93235	93244	20 %	40 %	0 %	40 %	390935897
107	NC_017998	CATTT	2	10	93484	93493	20 %	60 %	0 %	20 %	390935897
108	NC_017998	TAAAT	2	10	93838	93847	60 %	40 %	0 %	0 %	390935897
109	NC_017998	GAAAA	2	10	94034	94043	80 %	0 %	20 %	0 %	390935898
110	NC_017998	ATTTT	2	10	94850	94859	20 %	80 %	0 %	0 %	390935899
111	NC_017998	TATAT	2	10	97892	97901	40 %	60 %	0 %	0 %	390935905
112	NC_017998	TTTTC	2	10	99176	99185	0 %	80 %	0 %	20 %	390935906
113	NC_017998	CTTAA	2	10	100074	100083	40 %	40 %	0 %	20 %	390935908
114	NC_017998	AGAAT	2	10	101477	101486	60 %	20 %	20 %	0 %	390935910
115	NC_017998	TGATT	2	10	101728	101737	20 %	60 %	20 %	0 %	390935910
116	NC_017998	AAGAA	2	10	103233	103242	80 %	0 %	20 %	0 %	390935911
117	NC_017998	TCTTT	2	10	104406	104415	0 %	80 %	0 %	20 %	390935912
118	NC_017998	TGCTA	2	10	104784	104793	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017998	TTATT	2	10	105273	105282	20 %	80 %	0 %	0 %	390935913
120	NC_017998	GTTAA	2	10	107324	107333	40 %	40 %	20 %	0 %	390935914
121	NC_017998	GTAGA	2	10	108207	108216	40 %	20 %	40 %	0 %	390935914
122	NC_017998	GTCAA	2	10	108671	108680	40 %	20 %	20 %	20 %	390935915

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.