MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM2

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017966	CAGGCG	2	12	24337	24348	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017966	CCCGCC	2	12	38876	38887	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
3	NC_017966	CTTCCC	2	12	40506	40517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017966	GCGGGG	2	12	40616	40627	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017966	TGGACG	2	12	66139	66150	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017966	GCCTGC	2	12	66282	66293	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017966	AGATGA	2	12	130798	130809	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017966	CCGACG	2	12	133020	133031	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017966	CATAAT	2	12	144100	144111	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017966	GCCGGT	2	12	168138	168149	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017966	TCCGGC	2	12	168167	168178	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017966	GCGGGC	2	12	188972	188983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017966	GCTGCC	2	12	197947	197958	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017966	GCAGGG	2	12	301548	301559	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017966	TGCCGG	2	12	304937	304948	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017966	GGTGCC	2	12	313752	313763	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017966	GGGCGT	2	12	332171	332182	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017966	GAAACG	2	12	406728	406739	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017966	TCGGAA	2	12	439440	439451	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017966	GGCCAC	2	12	450812	450823	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017966	TCATAA	2	12	510732	510743	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017966	CCCCTC	2	12	552152	552163	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
23	NC_017966	TCGCCA	2	12	586724	586735	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017966	CGGTCG	2	12	587693	587704	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017966	CGGGGC	2	12	602246	602257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017966	CCGAAG	2	12	602311	602322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017966	GCGATC	2	12	604277	604288	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017966	GGGCAA	2	12	607529	607540	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017966	GGCCGA	2	12	643362	643373	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017966	GGTCCG	2	12	644232	644243	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017966	TCGGAC	2	12	658710	658721	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017966	AGCCGG	2	12	665438	665449	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017966	GGTGAT	2	12	673286	673297	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017966	CCGAGG	2	12	673534	673545	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017966	GGCGAG	2	12	675418	675429	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017966	GTTGCC	2	12	675520	675531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017966	TGGCGC	2	12	676662	676673	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017966	CCATGC	2	12	677052	677063	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017966	TTGCCG	2	12	677447	677458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017966	TGCCGC	2	12	678258	678269	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017966	TGCCGC	3	18	679449	679466	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017966	GACCGT	2	12	680302	680313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017966	ACCGCC	2	12	680554	680565	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017966	GCCGTG	2	12	680681	680692	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017966	GGCCGA	2	12	681082	681093	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017966	GCCCGA	2	12	681226	681237	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017966	TGGAGG	2	12	681834	681845	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017966	CGGCAT	2	12	682317	682328	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017966	GCCGGT	2	12	683320	683331	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017966	CCGAGG	2	12	684021	684032	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017966	ACCGTA	2	12	684344	684355	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017966	GACCGC	2	12	684388	684399	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017966	CGGTGA	2	12	684870	684881	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017966	TGGCGC	2	12	685410	685421	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017966	ACCGCC	2	12	685771	685782	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.