MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM2

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017966	TCCGG	2	10	5905	5914	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017966	CGCCC	2	10	24640	24649	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3	NC_017966	GTCCG	2	10	40598	40607	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017966	ACCAA	2	10	54474	54483	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017966	ACCAA	2	10	75082	75091	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017966	ATATT	2	10	77705	77714	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017966	TTCTA	2	10	77778	77787	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017966	GGGTC	2	10	85320	85329	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017966	CCGTA	2	10	92965	92974	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017966	CCCGG	2	10	95906	95915	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_017966	CGGTG	2	10	140752	140761	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017966	AAATA	2	10	142610	142619	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017966	ATTTT	2	10	143857	143866	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017966	GGAAG	2	10	156914	156923	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017966	CACAC	2	10	157659	157668	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_017966	GCAAA	2	10	160762	160771	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017966	CCGCC	2	10	161855	161864	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18	NC_017966	GTCAT	2	10	167427	167436	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017966	GGTCA	2	10	170626	170635	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017966	TTCTG	2	10	196679	196688	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017966	CGTCG	2	10	207330	207339	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017966	GTGCA	2	10	207534	207543	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017966	CACAT	2	10	218620	218629	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017966	CCTGT	2	10	232488	232497	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017966	ATGAA	2	10	233259	233268	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017966	GCCGC	2	10	251429	251438	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_017966	GGCGG	2	10	252479	252488	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017966	GTCAT	2	10	252950	252959	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017966	GGCGG	2	10	265056	265065	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017966	CGGGG	2	10	267663	267672	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017966	TGCGG	2	10	267724	267733	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017966	GGCGG	2	10	267744	267753	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017966	CGCCC	2	10	271586	271595	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
34	NC_017966	TCCGC	2	10	272546	272555	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_017966	CCGCG	2	10	278220	278229	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_017966	TTGCA	2	10	304738	304747	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017966	ATGGA	2	10	305190	305199	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017966	GTGTG	2	10	338732	338741	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017966	GGGCG	3	15	340412	340426	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017966	GGTCA	2	10	345850	345859	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017966	GCCGG	2	10	345955	345964	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017966	TGCGC	2	10	345981	345990	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_017966	GCAGG	2	10	395304	395313	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017966	CCCTG	2	10	395328	395337	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_017966	CGCCT	2	10	396441	396450	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_017966	CGCCT	2	10	396482	396491	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_017966	CGCCT	2	10	396523	396532	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_017966	CAGCG	2	10	402399	402408	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_017966	GAAAA	2	10	407759	407768	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017966	TGCCC	2	10	412879	412888	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_017966	GACCG	2	10	413920	413929	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_017966	GGCCG	2	10	421230	421239	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_017966	CCTGC	2	10	421298	421307	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_017966	TTTTA	2	10	426817	426826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017966	CGACC	2	10	431673	431682	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_017966	ACGGT	2	10	433955	433964	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017966	CCCGC	2	10	460387	460396	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
58	NC_017966	TCCCC	2	10	501868	501877	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
59	NC_017966	TCGGA	2	10	533392	533401	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017966	CGCAG	2	10	537900	537909	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017966	CGGAT	2	10	575065	575074	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017966	GCCCG	2	10	587017	587026	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
63	NC_017966	TCTGC	2	10	587544	587553	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017966	GGCCG	2	10	604354	604363	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017966	CCTCC	2	10	614968	614977	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
66	NC_017966	TCGGG	2	10	619621	619630	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017966	GGATG	2	10	649082	649091	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017966	AGGAC	2	10	650808	650817	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017966	TCCCC	3	15	658562	658576	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
70	NC_017966	GCGAT	2	10	661606	661615	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017966	GCGTT	2	10	661896	661905	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017966	ACCGC	2	10	673179	673188	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_017966	GCCGA	2	10	673863	673872	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_017966	ACCGC	2	10	673905	673914	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_017966	TGCCG	2	10	676915	676924	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_017966	CCCGT	2	10	677471	677480	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_017966	CGTCA	2	10	677950	677959	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017966	CCCGT	2	10	678668	678677	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_017966	ACCGC	2	10	680063	680072	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_017966	ACCCG	2	10	683965	683974	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
81	NC_017966	TGAAG	2	10	688620	688629	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017966	CTCCA	2	10	690032	690041	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.