MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM2

Total Repeats: 315

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017966	GCCC	2	8	1171	1178	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_017966	CCGG	2	8	14699	14706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017966	CGGC	2	8	14712	14719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017966	CTGG	2	8	15158	15165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017966	GCCG	2	8	15276	15283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017966	TGCA	2	8	22637	22644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017966	ATCG	2	8	24304	24311	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017966	TCGA	2	8	24527	24534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017966	ATCC	2	8	24594	24601	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017966	GCCT	2	8	31814	31821	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017966	GGGC	2	8	34490	34497	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017966	GCCG	2	8	40573	40580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017966	ACAG	2	8	43255	43262	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017966	CGGG	2	8	45126	45133	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017966	GGCC	2	8	54139	54146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017966	GCCG	2	8	54179	54186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017966	GATG	2	8	54252	54259	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017966	CGGT	2	8	66093	66100	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017966	CCGG	2	8	67373	67380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017966	CCCG	2	8	68227	68234	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_017966	CGGC	3	12	69616	69627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017966	GTCA	2	8	69827	69834	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017966	GGGC	2	8	75259	75266	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017966	TCAG	2	8	76644	76651	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017966	GAAT	2	8	76952	76959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017966	AATC	2	8	77606	77613	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017966	GTAT	2	8	77648	77655	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017966	AATC	2	8	77718	77725	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017966	ACTC	2	8	77832	77839	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017966	CATC	2	8	77925	77932	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017966	GACC	2	8	78033	78040	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017966	TTTC	2	8	78686	78693	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017966	GATG	2	8	78829	78836	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017966	ACGG	2	8	80778	80785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017966	GGAA	2	8	93861	93868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017966	CCCT	2	8	94864	94871	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_017966	CTGA	2	8	100356	100363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017966	CCTC	2	8	105180	105187	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_017966	AAGC	2	8	105229	105236	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017966	TCCC	2	8	111134	111141	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_017966	TCCT	2	8	112798	112805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017966	GTAT	2	8	113054	113061	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017966	CCGG	2	8	116026	116033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017966	GGGC	2	8	132054	132061	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017966	CGGG	2	8	132071	132078	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017966	TGCT	2	8	132125	132132	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017966	GCCT	2	8	135553	135560	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017966	GTAT	2	8	140986	140993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017966	ATTC	2	8	143828	143835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017966	GACG	2	8	148496	148503	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017966	TCCC	2	8	149544	149551	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_017966	GCCC	2	8	151539	151546	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_017966	CAAC	2	8	155083	155090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017966	CCTT	2	8	155157	155164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017966	GCCG	2	8	156240	156247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017966	GTGC	2	8	156924	156931	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017966	CTAC	2	8	156956	156963	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017966	ATAG	2	8	156966	156973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017966	ACCT	2	8	157626	157633	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017966	AGGC	2	8	157640	157647	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017966	ATCT	2	8	157760	157767	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017966	CCGG	2	8	160688	160695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017966	TTTC	2	8	161886	161893	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017966	GCAG	2	8	168281	168288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017966	GCGT	2	8	168479	168486	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017966	ATGC	2	8	168532	168539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017966	TGCA	2	8	168569	168576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017966	GCCG	2	8	168780	168787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017966	TCGG	2	8	171915	171922	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017966	GGCG	2	8	171928	171935	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017966	GAGC	2	8	172986	172993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017966	ACTT	2	8	175013	175020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017966	TGCT	2	8	177907	177914	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017966	CCTT	2	8	179419	179426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017966	GCGA	2	8	180480	180487	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017966	ACCG	2	8	180618	180625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017966	CCCG	2	8	187221	187228	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_017966	CCGC	2	8	187283	187290	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_017966	CGGG	2	8	187519	187526	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017966	GCAT	2	8	189104	189111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017966	CCGC	2	8	190236	190243	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_017966	GCGG	2	8	190258	190265	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017966	GCGT	2	8	190280	190287	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017966	GAAA	2	8	196166	196173	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017966	ATTA	2	8	196698	196705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017966	GCCA	2	8	197505	197512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017966	GCGA	2	8	197550	197557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017966	GCCG	2	8	200370	200377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017966	GGCC	2	8	215711	215718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017966	TGAC	2	8	215783	215790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017966	GTCA	2	8	215792	215799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017966	GATG	2	8	215857	215864	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017966	CGGT	2	8	217763	217770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017966	GAGG	2	8	223213	223220	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017966	CGCC	2	8	232479	232486	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_017966	GCAG	2	8	232534	232541	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017966	GGTC	2	8	235026	235033	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017966	GGTG	2	8	235034	235041	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017966	CTCC	2	8	241940	241947	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_017966	CGGG	2	8	241999	242006	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017966	CGAC	2	8	243777	243784	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017966	CGGC	2	8	247078	247085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017966	TCGC	2	8	251576	251583	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017966	TCGC	2	8	251591	251598	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017966	CGGG	2	8	252501	252508	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017966	TGGT	2	8	262456	262463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017966	TTTG	2	8	266240	266247	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017966	CGGG	2	8	266256	266263	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017966	CGGG	2	8	266309	266316	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017966	GCAG	2	8	266371	266378	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017966	GCAC	2	8	268356	268363	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017966	CTTC	2	8	270452	270459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017966	ATGT	2	8	270470	270477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017966	GTCC	2	8	278322	278329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017966	TCCC	2	8	278542	278549	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_017966	CGGC	2	8	279216	279223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017966	CGAA	2	8	283300	283307	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017966	TCCA	2	8	283317	283324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017966	CGGG	2	8	283446	283453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017966	GGCC	2	8	284683	284690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017966	GTGG	2	8	286173	286180	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017966	GCAT	2	8	293006	293013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017966	TCCT	2	8	295887	295894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017966	GCCG	2	8	295911	295918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017966	ACGG	2	8	295925	295932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017966	GGGC	2	8	296950	296957	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017966	CCGG	2	8	296996	297003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017966	TATT	2	8	299486	299493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017966	CGCC	3	12	299580	299591	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_017966	GCCC	2	8	300924	300931	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_017966	GGGA	2	8	301629	301636	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017966	TGGA	2	8	301637	301644	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017966	GGCA	2	8	304607	304614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017966	ATTC	2	8	304645	304652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017966	CGGG	2	8	307754	307761	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017966	CGGG	2	8	313678	313685	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017966	CGGA	2	8	317079	317086	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017966	GGAA	2	8	320556	320563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017966	TGGG	2	8	321408	321415	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017966	CTGC	2	8	321458	321465	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017966	GCAC	2	8	327199	327206	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017966	CGGA	2	8	330184	330191	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017966	TTGA	2	8	331612	331619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017966	TCCG	2	8	334191	334198	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017966	TGCC	2	8	340445	340452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017966	GCCC	2	8	340659	340666	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_017966	CGGC	2	8	342916	342923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017966	ATCC	2	8	343068	343075	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017966	GCCG	2	8	345304	345311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017966	GCCG	2	8	345394	345401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017966	ACCG	2	8	346212	346219	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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300	NC_017966	TCGA	2	8	680786	680793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
301	NC_017966	GCGA	2	8	681449	681456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
302	NC_017966	CCGC	2	8	682259	682266	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
303	NC_017966	GCCG	2	8	682462	682469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
304	NC_017966	GCCG	2	8	682741	682748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
305	NC_017966	GCGA	2	8	683204	683211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
306	NC_017966	CCGA	2	8	683417	683424	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
307	NC_017966	GCCG	2	8	684190	684197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
308	NC_017966	ACCG	2	8	684199	684206	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
309	NC_017966	GCCC	2	8	684594	684601	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
310	NC_017966	GCCG	2	8	684664	684671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
311	NC_017966	CGCC	2	8	684695	684702	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
312	NC_017966	CTGG	2	8	684724	684731	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
313	NC_017966	GCCG	2	8	685924	685931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
314	NC_017966	CGAC	2	8	686112	686119	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
315	NC_017966	GCCG	2	8	686245	686252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.