MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Advenella kashmirensis WT001 plasmid pWTk445

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017965	TCGAT	2	10	1396	1405	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017965	CAATG	2	10	3611	3620	40 %	20 %	20 %	20 %	389874178
3	NC_017965	AGAAT	2	10	6163	6172	60 %	20 %	20 %	0 %	389874181
4	NC_017965	TTGTC	2	10	7082	7091	0 %	60 %	20 %	20 %	389874181
5	NC_017965	ACGAT	2	10	10983	10992	40 %	20 %	20 %	20 %	389874185
6	NC_017965	ACACC	2	10	11107	11116	40 %	0 %	0 %	60 %	389874185
7	NC_017965	TGAAA	2	10	11469	11478	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017965	GCTTT	2	10	11497	11506	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017965	CTGCC	2	10	17835	17844	0 %	20 %	20 %	60 %	389874192
10	NC_017965	GCCCC	2	10	18211	18220	0 %	0 %	20 %	80 %	389874192
11	NC_017965	TGGCG	2	10	19418	19427	0 %	20 %	60 %	20 %	389874192
12	NC_017965	AACTG	2	10	19764	19773	40 %	20 %	20 %	20 %	389874193
13	NC_017965	CTGGG	2	10	22262	22271	0 %	20 %	60 %	20 %	389874195
14	NC_017965	CCGAA	2	10	23932	23941	40 %	0 %	20 %	40 %	389874197
15	NC_017965	CACCT	2	10	24209	24218	20 %	20 %	0 %	60 %	389874198
16	NC_017965	GAACA	2	10	24609	24618	60 %	0 %	20 %	20 %	389874199
17	NC_017965	TCGCT	2	10	26136	26145	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017965	TTGAA	2	10	26452	26461	40 %	40 %	20 %	0 %	389874202
19	NC_017965	CAAGG	2	10	29513	29522	40 %	0 %	40 %	20 %	389874203
20	NC_017965	TTTTG	2	10	31438	31447	0 %	80 %	20 %	0 %	389874206
21	NC_017965	TTCTG	2	10	32264	32273	0 %	60 %	20 %	20 %	389874208
22	NC_017965	CTTGC	2	10	32842	32851	0 %	40 %	20 %	40 %	389874208
23	NC_017965	TAGTT	2	10	33807	33816	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017965	TTTGG	2	10	37426	37435	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017965	GATTG	2	10	41854	41863	20 %	40 %	40 %	0 %	389874220
26	NC_017965	GAACA	2	10	44308	44317	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017965	GAAAA	2	10	44609	44618	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017965	GTGGC	2	10	46837	46846	0 %	20 %	60 %	20 %	389874225
29	NC_017965	CGATT	2	10	47192	47201	20 %	40 %	20 %	20 %	389874225
30	NC_017965	ATCGA	2	10	48167	48176	40 %	20 %	20 %	20 %	389874226
31	NC_017965	GCTTA	2	10	48349	48358	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017965	GTTGA	2	10	49432	49441	20 %	40 %	40 %	0 %	389874227
33	NC_017965	TTTCC	2	10	50588	50597	0 %	60 %	0 %	40 %	389874228
34	NC_017965	ATTGT	2	10	50628	50637	20 %	60 %	20 %	0 %	389874228
35	NC_017965	TATGA	2	10	50754	50763	40 %	40 %	20 %	0 %	389874228
36	NC_017965	TTGAA	2	10	50871	50880	40 %	40 %	20 %	0 %	389874228
37	NC_017965	GTTGA	2	10	51284	51293	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017965	TGGCA	2	10	52254	52263	20 %	20 %	40 %	20 %	389874229
39	NC_017965	GTCTT	2	10	52764	52773	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017965	GGTTT	2	10	53452	53461	0 %	60 %	40 %	0 %	389874231
41	NC_017965	ATTGA	2	10	55140	55149	40 %	40 %	20 %	0 %	389874233
42	NC_017965	GAGCA	2	10	56262	56271	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017965	TCGGT	2	10	56397	56406	0 %	40 %	40 %	20 %	389874235
44	NC_017965	CTGAC	2	10	57094	57103	20 %	20 %	20 %	40 %	389874235

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.