MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Advenella kashmirensis WT001 plasmid pWTk445

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017965	TTGA	2	8	313	320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017965	ACTT	2	8	397	404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017965	CAGA	2	8	456	463	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017965	ATTT	2	8	1690	1697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017965	TCTA	2	8	1777	1784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017965	GTTA	2	8	1854	1861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017965	TAGA	2	8	1951	1958	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017965	AAGT	2	8	2053	2060	50 %	25 %	25 %	0 %	389874177
9	NC_017965	TCCG	2	8	2465	2472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017965	AGTT	2	8	2941	2948	25 %	50 %	25 %	0 %	389874178
11	NC_017965	TGTC	2	8	4399	4406	0 %	50 %	25 %	25 %	389874179
12	NC_017965	ACGC	2	8	5298	5305	25 %	0 %	25 %	50 %	389874180
13	NC_017965	CCCA	3	12	5979	5990	25 %	0 %	0 %	75 %	389874181
14	NC_017965	CCGG	2	8	7021	7028	0 %	0 %	50 %	50 %	389874181
15	NC_017965	ATGG	2	8	7036	7043	25 %	25 %	50 %	0 %	389874181
16	NC_017965	ATCG	2	8	7116	7123	25 %	25 %	25 %	25 %	389874181
17	NC_017965	TCTT	2	8	7454	7461	0 %	75 %	0 %	25 %	389874181
18	NC_017965	CCTG	2	8	7805	7812	0 %	25 %	25 %	50 %	389874182
19	NC_017965	CCGG	2	8	8334	8341	0 %	0 %	50 %	50 %	389874182
20	NC_017965	CAGT	2	8	8527	8534	25 %	25 %	25 %	25 %	389874183
21	NC_017965	TCAA	2	8	8603	8610	50 %	25 %	0 %	25 %	389874183
22	NC_017965	GCCA	2	8	8797	8804	25 %	0 %	25 %	50 %	389874183
23	NC_017965	TTGT	2	8	9131	9138	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017965	ATCT	2	8	9232	9239	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017965	TCGC	2	8	9375	9382	0 %	25 %	25 %	50 %	389874184
26	NC_017965	GAAG	2	8	9461	9468	50 %	0 %	50 %	0 %	389874184
27	NC_017965	CGTC	2	8	10044	10051	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017965	CATC	2	8	11280	11287	25 %	25 %	0 %	50 %	389874185
29	NC_017965	CATC	2	8	11558	11565	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017965	TTAC	2	8	11698	11705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017965	TCAA	2	8	11741	11748	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017965	CATC	2	8	14701	14708	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017965	CGAC	2	8	14961	14968	25 %	0 %	25 %	50 %	389874190
34	NC_017965	GATC	2	8	15110	15117	25 %	25 %	25 %	25 %	389874190
35	NC_017965	AAAT	2	8	15239	15246	75 %	25 %	0 %	0 %	389874190
36	NC_017965	CTGG	2	8	15499	15506	0 %	25 %	50 %	25 %	389874191
37	NC_017965	TCGG	2	8	15683	15690	0 %	25 %	50 %	25 %	389874191
38	NC_017965	GCAG	2	8	15962	15969	25 %	0 %	50 %	25 %	389874191
39	NC_017965	CAAA	2	8	16455	16462	75 %	0 %	0 %	25 %	389874191
40	NC_017965	TAAT	2	8	16967	16974	50 %	50 %	0 %	0 %	389874191
41	NC_017965	GATT	2	8	17245	17252	25 %	50 %	25 %	0 %	389874191
42	NC_017965	ATTG	2	8	17295	17302	25 %	50 %	25 %	0 %	389874191
43	NC_017965	AGCC	2	8	19186	19193	25 %	0 %	25 %	50 %	389874192
44	NC_017965	GATC	2	8	19606	19613	25 %	25 %	25 %	25 %	389874192
45	NC_017965	CAAC	2	8	19687	19694	50 %	0 %	0 %	50 %	389874192
46	NC_017965	AATG	2	8	19742	19749	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017965	TTTG	2	8	19952	19959	0 %	75 %	25 %	0 %	389874193
48	NC_017965	AATA	2	8	20285	20292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017965	GAAA	2	8	20827	20834	75 %	0 %	25 %	0 %	389874194
50	NC_017965	AGAC	2	8	21472	21479	50 %	0 %	25 %	25 %	389874195
51	NC_017965	CTGG	2	8	21946	21953	0 %	25 %	50 %	25 %	389874195
52	NC_017965	GCAA	2	8	21980	21987	50 %	0 %	25 %	25 %	389874195
53	NC_017965	AAGT	2	8	22008	22015	50 %	25 %	25 %	0 %	389874195
54	NC_017965	CCGC	2	8	22021	22028	0 %	0 %	25 %	75 %	389874195
55	NC_017965	ACGT	2	8	23077	23084	25 %	25 %	25 %	25 %	389874196
56	NC_017965	GTTT	2	8	23157	23164	0 %	75 %	25 %	0 %	389874196
57	NC_017965	CCGC	2	8	23297	23304	0 %	0 %	25 %	75 %	389874196
58	NC_017965	AGCT	2	8	23510	23517	25 %	25 %	25 %	25 %	389874197
59	NC_017965	CCCA	2	8	23690	23697	25 %	0 %	0 %	75 %	389874197
60	NC_017965	GCCT	2	8	23830	23837	0 %	25 %	25 %	50 %	389874197
61	NC_017965	TTGA	2	8	24233	24240	25 %	50 %	25 %	0 %	389874198
62	NC_017965	TGGC	2	8	24279	24286	0 %	25 %	50 %	25 %	389874198
63	NC_017965	TTAC	2	8	24337	24344	25 %	50 %	0 %	25 %	389874198
64	NC_017965	GATT	2	8	25080	25087	25 %	50 %	25 %	0 %	389874200
65	NC_017965	TAAA	2	8	25283	25290	75 %	25 %	0 %	0 %	389874200
66	NC_017965	TTTC	2	8	26253	26260	0 %	75 %	0 %	25 %	389874202
67	NC_017965	AATC	2	8	26376	26383	50 %	25 %	0 %	25 %	389874202
68	NC_017965	ACCC	2	8	27321	27328	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_017965	CGGT	2	8	27339	27346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017965	ACAA	2	8	27917	27924	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017965	CCCG	2	8	28285	28292	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_017965	AAAG	3	12	28756	28767	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017965	TGGG	2	8	29638	29645	0 %	25 %	75 %	0 %	389874203
74	NC_017965	TATT	2	8	30743	30750	25 %	75 %	0 %	0 %	389874205
75	NC_017965	GCCA	2	8	31518	31525	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017965	CGGG	2	8	31914	31921	0 %	0 %	75 %	25 %	389874207
77	NC_017965	TGCT	2	8	32113	32120	0 %	50 %	25 %	25 %	389874207
78	NC_017965	CTGA	2	8	32235	32242	25 %	25 %	25 %	25 %	389874208
79	NC_017965	ATTG	2	8	32698	32705	25 %	50 %	25 %	0 %	389874208
80	NC_017965	TACC	2	8	32829	32836	25 %	25 %	0 %	50 %	389874208
81	NC_017965	CAAT	2	8	33344	33351	50 %	25 %	0 %	25 %	389874209
82	NC_017965	ACTT	2	8	33480	33487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017965	TTAT	2	8	33924	33931	25 %	75 %	0 %	0 %	389874210
84	NC_017965	CATT	2	8	34255	34262	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017965	AAAT	2	8	34331	34338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017965	ACTG	2	8	34545	34552	25 %	25 %	25 %	25 %	389874211
87	NC_017965	AATA	2	8	34615	34622	75 %	25 %	0 %	0 %	389874211
88	NC_017965	AAAT	2	8	34774	34781	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017965	TCCC	2	8	34870	34877	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_017965	ATCT	2	8	35338	35345	25 %	50 %	0 %	25 %	389874212
91	NC_017965	AATT	2	8	35356	35363	50 %	50 %	0 %	0 %	389874212
92	NC_017965	CATT	2	8	36146	36153	25 %	50 %	0 %	25 %	389874213
93	NC_017965	GCCA	2	8	36375	36382	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017965	GTTG	2	8	36953	36960	0 %	50 %	50 %	0 %	389874215
95	NC_017965	ACCT	2	8	37479	37486	25 %	25 %	0 %	50 %	389874216
96	NC_017965	AGGC	2	8	37666	37673	25 %	0 %	50 %	25 %	389874216
97	NC_017965	TCGA	2	8	37699	37706	25 %	25 %	25 %	25 %	389874216
98	NC_017965	GGAC	2	8	38019	38026	25 %	0 %	50 %	25 %	389874217
99	NC_017965	TGAC	2	8	38664	38671	25 %	25 %	25 %	25 %	389874217
100	NC_017965	ATTC	2	8	38764	38771	25 %	50 %	0 %	25 %	389874217
101	NC_017965	GGCG	2	8	38917	38924	0 %	0 %	75 %	25 %	389874217
102	NC_017965	TATT	2	8	39621	39628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017965	TGAT	2	8	39734	39741	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017965	TTAT	2	8	41042	41049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017965	ATTA	2	8	41777	41784	50 %	50 %	0 %	0 %	389874219
106	NC_017965	CCAT	2	8	41830	41837	25 %	25 %	0 %	50 %	389874220
107	NC_017965	CAAA	2	8	42373	42380	75 %	0 %	0 %	25 %	389874221
108	NC_017965	GTCG	2	8	43120	43127	0 %	25 %	50 %	25 %	389874222
109	NC_017965	ACTT	2	8	43404	43411	25 %	50 %	0 %	25 %	389874223
110	NC_017965	GTTC	2	8	43827	43834	0 %	50 %	25 %	25 %	389874223
111	NC_017965	GATC	2	8	44044	44051	25 %	25 %	25 %	25 %	389874223
112	NC_017965	TTTC	2	8	44256	44263	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017965	TTTG	2	8	44395	44402	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017965	AAAC	2	8	44514	44521	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017965	TTTC	2	8	45034	45041	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017965	AAGT	2	8	45262	45269	50 %	25 %	25 %	0 %	389874224
117	NC_017965	TTTG	2	8	45362	45369	0 %	75 %	25 %	0 %	389874224
118	NC_017965	TTCT	2	8	45554	45561	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017965	CGAA	2	8	46304	46311	50 %	0 %	25 %	25 %	389874225
120	NC_017965	TGGC	2	8	46669	46676	0 %	25 %	50 %	25 %	389874225
121	NC_017965	GTTT	2	8	46739	46746	0 %	75 %	25 %	0 %	389874225
122	NC_017965	TCAA	2	8	47302	47309	50 %	25 %	0 %	25 %	389874225
123	NC_017965	AGTA	2	8	47785	47792	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017965	ATAA	2	8	48894	48901	75 %	25 %	0 %	0 %	389874227
125	NC_017965	GACA	2	8	49583	49590	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017965	GAAT	2	8	50776	50783	50 %	25 %	25 %	0 %	389874228
127	NC_017965	TCAA	2	8	51010	51017	50 %	25 %	0 %	25 %	389874228
128	NC_017965	CTTA	2	8	51142	51149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017965	GTTG	2	8	51893	51900	0 %	50 %	50 %	0 %	389874229
130	NC_017965	AAGG	2	8	52370	52377	50 %	0 %	50 %	0 %	389874229
131	NC_017965	TGAT	2	8	52877	52884	25 %	50 %	25 %	0 %	389874230
132	NC_017965	TATT	2	8	52929	52936	25 %	75 %	0 %	0 %	389874230
133	NC_017965	TCTA	3	12	53197	53208	25 %	50 %	0 %	25 %	389874230
134	NC_017965	GAGT	2	8	53291	53298	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017965	GAGT	2	8	54383	54390	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017965	CTGA	2	8	55273	55280	25 %	25 %	25 %	25 %	389874233
137	NC_017965	CTTC	2	8	55370	55377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017965	CAGC	2	8	56030	56037	25 %	0 %	25 %	50 %	389874234
139	NC_017965	CATT	2	8	56159	56166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017965	ATGC	2	8	56284	56291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017965	CAAT	2	8	57158	57165	50 %	25 %	0 %	25 %	389874235
142	NC_017965	CCAC	2	8	57401	57408	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.