MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium DO plasmid 3

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017963	TTCATG	2	12	134	145	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	389869888
2	NC_017963	TTCTCT	2	12	1892	1903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389869889
3	NC_017963	TTGTGT	2	12	2438	2449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389869889
4	NC_017963	CTTTTG	2	12	10269	10280	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	389869898
5	NC_017963	TGAATC	2	12	11575	11586	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	389869899
6	NC_017963	TTTTCC	2	12	13808	13819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389869901
7	NC_017963	AAAAAG	2	12	14779	14790	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	389869903
8	NC_017963	TTTTCA	2	12	15394	15405	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	389869904
9	NC_017963	CTTTTT	2	12	15635	15646	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	389869904
10	NC_017963	AAAATC	2	12	16867	16878	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	389869904
11	NC_017963	CATCCC	2	12	17210	17221	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	389869904
12	NC_017963	CTTTTT	2	12	20460	20471	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	389869906
13	NC_017963	TTTTCT	2	12	20714	20725	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	389869906
14	NC_017963	TCTTTT	2	12	21446	21457	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	389869906
15	NC_017963	TCACGT	2	12	22369	22380	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	389869908
16	NC_017963	TATCCA	2	12	30258	30269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389869917
17	NC_017963	TTTTAA	2	12	32480	32491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017963	TTTTTG	2	12	33327	33338	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	389869921
19	NC_017963	TATATT	2	12	34164	34175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017963	AGATGA	2	12	39850	39861	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	389869929
21	NC_017963	TTTGAT	2	12	41596	41607	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	389869933
22	NC_017963	TACCGG	2	12	42002	42013	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389869933
23	NC_017963	AGATGA	2	12	45431	45442	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	389869936
24	NC_017963	GTTCAA	2	12	46926	46937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	389869938
25	NC_017963	GAAAGA	2	12	47007	47018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389869939
26	NC_017963	AAGAAA	3	18	51016	51033	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	389869941
27	NC_017963	TTTTTC	2	12	56930	56941	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	389869947
28	NC_017963	AAGAAA	2	12	57845	57856	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	389869948
29	NC_017963	GTAGTC	2	12	60024	60035	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	389869951
30	NC_017963	GAAAAA	2	12	68762	68773	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017963	AGATGA	2	12	69395	69406	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017963	GAAGCA	2	12	71345	71356	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	389869965
33	NC_017963	TGATAA	2	12	74345	74356	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	389869970
34	NC_017963	AAATAA	2	12	74905	74916	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017963	TTTTTC	2	12	79583	79594	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	389869976
36	NC_017963	TAAAGA	2	12	81497	81508	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	389869977
37	NC_017963	GAAGAT	2	12	82984	82995	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	389869978
38	NC_017963	TGATAT	2	12	89214	89225	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	389869984
39	NC_017963	ATTTTT	2	12	95564	95575	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017963	AAATGA	2	12	98468	98479	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	389869996
41	NC_017963	GAATAT	2	12	101085	101096	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	389869999
42	NC_017963	TAGAAA	2	12	102132	102143	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	389870000
43	NC_017963	AAAGAT	2	12	107109	107120	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	389870005
44	NC_017963	GAAAAC	2	12	115217	115228	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	389870012
45	NC_017963	TGATAT	2	12	115554	115565	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	389870012
46	NC_017963	AAAGAT	2	12	116906	116917	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	389870013
47	NC_017963	TAAAAC	2	12	124828	124839	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	389870019
48	NC_017963	TCTTTT	2	12	128568	128579	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	389870025
49	NC_017963	TCAGAA	2	12	129819	129830	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017963	TGCTGA	2	12	132116	132127	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	389870028
51	NC_017963	TATCTT	2	12	133739	133750	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	389870031
52	NC_017963	AGAAAA	2	12	137080	137091	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017963	AAGAAA	2	12	137297	137308	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017963	CTTTTT	2	12	141167	141178	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017963	AATATC	2	12	146571	146582	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	389870044
56	NC_017963	GAATTT	2	12	149695	149706	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	389870045
57	NC_017963	AATCAA	2	12	155426	155437	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	389870050
58	NC_017963	GAAAAA	2	12	156653	156664	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	389870051
59	NC_017963	TTATAC	2	12	158850	158861	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017963	TATCTT	2	12	162423	162434	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	389870056
61	NC_017963	CTATTT	2	12	164512	164523	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	389870059
62	NC_017963	TCTACT	2	12	174359	174370	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	389870070
63	NC_017963	TTCCTG	2	12	175493	175504	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	389870071
64	NC_017963	TATTGA	2	12	176739	176750	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	389870072
65	NC_017963	CTTATC	2	12	177072	177083	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017963	TTTTAA	2	12	181565	181576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870081
67	NC_017963	GAAAAC	2	12	182259	182270	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	389870082
68	NC_017963	TGATAT	2	12	182596	182607	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	389870082
69	NC_017963	AAATTT	2	12	185563	185574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017963	TCTATT	2	12	189452	189463	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017963	AAATTG	2	12	194310	194321	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	389870095
72	NC_017963	TATCTT	2	12	196311	196322	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	389870097
73	NC_017963	CCAATC	2	12	198101	198112	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	389870098
74	NC_017963	CAAATA	2	12	210059	210070	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	389870107
75	NC_017963	GTTTTC	2	12	210922	210933	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	389870108
76	NC_017963	TAAAAC	2	12	211464	211475	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	389870109
77	NC_017963	AAAACT	2	12	211526	211537	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	389870109
78	NC_017963	AGAAAA	2	12	211779	211790	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	389870109
79	NC_017963	TTGTCA	2	12	213898	213909	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	389870112
80	NC_017963	TGATTT	2	12	214715	214726	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	389870113
81	NC_017963	TAAAAA	2	12	215232	215243	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	389870113
82	NC_017963	GATCAA	2	12	216428	216439	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	389870114
83	NC_017963	CCTTGT	2	12	221968	221979	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	389870120
84	NC_017963	TCATGA	2	12	222955	222966	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	389870121
85	NC_017963	ATTTCA	2	12	230816	230827	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	389870137
86	NC_017963	TTTTTC	2	12	231911	231922	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017963	TGGGCA	2	12	233639	233650	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389870143
88	NC_017963	ATCAAA	2	12	234126	234137	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017963	CCTTTT	2	12	234776	234787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870144
90	NC_017963	TTTATT	2	12	237298	237309	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017963	GACAAG	2	12	244465	244476	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017963	CTTGTC	2	12	244499	244510	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017963	TATCAA	2	12	246970	246981	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	389870164
94	NC_017963	TTTCTG	2	12	247405	247416	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	389870165
95	NC_017963	CAAAAA	2	12	249213	249224	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	389870167
96	NC_017963	GAGTAG	2	12	250849	250860	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	389870170

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.