MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium DO plasmid 3

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017963	AAAGA	2	10	7454	7463	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017963	ACAAA	2	10	29682	29691	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017963	CAAAA	2	10	33840	33849	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017963	AGAAT	2	10	34484	34493	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017963	GAAAT	2	10	36624	36633	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017963	AAACA	2	10	39302	39311	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017963	GTTTA	2	10	41241	41250	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017963	CTTAA	2	10	43836	43845	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017963	TAGAA	2	10	53078	53087	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017963	ACAAA	2	10	60765	60774	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017963	TAAAT	2	10	70234	70243	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017963	AAAAG	2	10	70404	70413	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017963	ACAGA	2	10	84595	84604	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017963	TCTGT	2	10	84621	84630	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017963	ATTTT	2	10	86074	86083	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017963	TAGAT	2	10	90600	90609	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017963	AATGG	2	10	90818	90827	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017963	TTTTA	2	10	95485	95494	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017963	ACTAG	2	10	98725	98734	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017963	CCCGA	2	10	99845	99854	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_017963	TTGTG	2	10	103800	103809	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017963	ATTCT	2	10	106099	106108	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017963	AAATC	2	10	106160	106169	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017963	TAAAA	2	10	107578	107587	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017963	ACAGA	2	10	115904	115913	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017963	AAATC	2	10	115957	115966	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017963	TAAAA	2	10	117376	117385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017963	TCTGT	2	10	117452	117461	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017963	AGGAA	2	10	120189	120198	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017963	TTGAT	2	10	120289	120298	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017963	ATGAA	2	10	122415	122424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017963	AAGAA	2	10	129944	129953	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017963	AATTT	2	10	130446	130455	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017963	TTTTA	2	10	133272	133281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017963	GATTT	2	10	134691	134700	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017963	TAGAA	2	10	134751	134760	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017963	CAAAA	2	10	137691	137700	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017963	AATAG	2	10	156415	156424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017963	AGTTA	2	10	158434	158443	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017963	TGAAA	2	10	159065	159074	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017963	TTTTA	2	10	161956	161965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017963	GATTT	2	10	163375	163384	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017963	AAGGA	2	10	164125	164134	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017963	ACTAG	2	10	177097	177106	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017963	ACTAG	2	10	179700	179709	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017963	GTTTA	2	10	185394	185403	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017963	AATTA	2	10	185549	185558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017963	AAAAG	2	10	187298	187307	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017963	TAAAT	2	10	187537	187546	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017963	ACAGA	2	10	189717	189726	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017963	TCTGT	2	10	189743	189752	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017963	TTTTA	2	10	195844	195853	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017963	GATTT	2	10	197263	197272	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017963	CGCTC	2	10	216519	216528	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_017963	GGTGA	2	10	216601	216610	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017963	GTTTT	2	10	217220	217229	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017963	ATTTT	2	10	222152	222161	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017963	TAATT	2	10	223198	223207	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017963	GAGGC	2	10	232238	232247	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017963	CTTTT	2	10	240106	240115	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.