MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium DO plasmid 3

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017963	TCTT	2	8	1517	1524	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017963	TCTT	2	8	4148	4155	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017963	CCTA	2	8	7104	7111	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017963	CAAA	2	8	7653	7660	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017963	ATAG	2	8	25324	25331	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017963	AATG	2	8	29741	29748	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017963	CCTT	2	8	30000	30007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017963	CAAG	2	8	31322	31329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017963	CCAC	2	8	31709	31716	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_017963	ACAA	2	8	31786	31793	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017963	CTTT	2	8	32092	32099	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017963	ATTA	2	8	32344	32351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017963	TTAT	2	8	33599	33606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017963	ATAA	2	8	33641	33648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017963	TAAA	2	8	33748	33755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017963	TAAA	2	8	35219	35226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017963	TAAG	2	8	36741	36748	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017963	ATCA	2	8	36959	36966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017963	ACCG	2	8	36967	36974	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017963	ATTT	2	8	37173	37180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017963	GGTG	2	8	37814	37821	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017963	ATTT	2	8	39294	39301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017963	TTAA	2	8	39327	39334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017963	ATCT	2	8	41384	41391	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017963	TGTA	2	8	43881	43888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017963	AATG	2	8	43913	43920	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017963	GAAA	2	8	45215	45222	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017963	TTAA	2	8	45249	45256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017963	ATAA	2	8	47848	47855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017963	GCTA	2	8	52373	52380	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017963	TCTA	2	8	52558	52565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017963	CAAC	2	8	52611	52618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017963	CAAC	2	8	52905	52912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017963	TTCC	2	8	55499	55506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017963	TTTA	2	8	60784	60791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017963	AAAT	2	8	61137	61144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017963	AAAG	2	8	61164	61171	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017963	AAAG	2	8	63119	63126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017963	AGAA	2	8	65169	65176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017963	GAAA	2	8	66659	66666	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017963	TTTA	2	8	69286	69293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017963	AGGT	2	8	69344	69351	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017963	TTAT	2	8	70294	70301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017963	AAAT	2	8	70366	70373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017963	ATTT	2	8	71908	71915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017963	TAAA	2	8	71967	71974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017963	AAAC	2	8	78650	78657	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017963	ATTT	2	8	78909	78916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017963	TAAA	2	8	79063	79070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017963	GCAG	2	8	80014	80021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017963	ATTT	2	8	80080	80087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017963	TGTT	2	8	84488	84495	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017963	AATT	2	8	85958	85965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017963	TTAG	2	8	86059	86066	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017963	TGAA	2	8	86118	86125	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017963	AGAA	2	8	89472	89479	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017963	CAAC	2	8	92400	92407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017963	TTGG	2	8	93973	93980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017963	GTAG	2	8	94157	94164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017963	TTAT	2	8	98597	98604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017963	ATCA	2	8	99812	99819	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017963	CAAA	2	8	99821	99828	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017963	TTTG	2	8	99891	99898	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017963	TAAT	2	8	102923	102930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017963	AATC	2	8	103032	103039	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017963	AATA	2	8	103111	103118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017963	TGAA	2	8	109237	109244	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017963	TTTC	2	8	114728	114735	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017963	AATT	2	8	118787	118794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017963	ATTT	2	8	120122	120129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017963	AAAT	2	8	120168	120175	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017963	GGGA	2	8	120337	120344	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017963	TATT	2	8	122143	122150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017963	ATTT	2	8	122516	122523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017963	ATTT	2	8	122574	122581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017963	AATA	2	8	122582	122589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017963	TTAC	2	8	122638	122645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017963	CAAA	2	8	122801	122808	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017963	TGTT	2	8	122815	122822	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017963	AAAT	2	8	122848	122855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017963	TGAT	2	8	124529	124536	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017963	AACT	2	8	126337	126344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017963	CTGA	2	8	126512	126519	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017963	CGAA	2	8	130091	130098	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017963	TATC	2	8	130124	130131	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017963	TTAC	2	8	137125	137132	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017963	ATAC	2	8	138927	138934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017963	ATTT	2	8	139035	139042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017963	AGAA	2	8	152268	152275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017963	GATG	2	8	159099	159106	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017963	GATA	2	8	164154	164161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017963	TGAA	2	8	164445	164452	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017963	TGCT	2	8	168148	168155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017963	TCCT	2	8	170450	170457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017963	CTAG	2	8	170488	170495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017963	TTCT	2	8	170592	170599	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017963	TTAC	2	8	173533	173540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017963	AGCA	2	8	179614	179621	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017963	ATTT	2	8	181268	181275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017963	TATT	2	8	183453	183460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017963	CTTA	2	8	185464	185471	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017963	AAAT	2	8	185611	185618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017963	CAAT	2	8	187629	187636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017963	ACAA	2	8	187976	187983	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017963	AGAA	2	8	189658	189665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017963	AATT	2	8	191077	191084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017963	TTCT	2	8	191183	191190	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017963	GAAA	2	8	195118	195125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017963	ATCA	2	8	195525	195532	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017963	TAAA	2	8	198311	198318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017963	TAAA	2	8	198453	198460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017963	ACTC	2	8	199468	199475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017963	CTAC	2	8	200865	200872	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017963	ATCC	2	8	213254	213261	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017963	CTTT	2	8	222078	222085	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017963	TCAT	2	8	223176	223183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017963	TAAA	2	8	225336	225343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017963	CCAA	2	8	226457	226464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017963	CTTT	2	8	227342	227349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017963	TTGC	2	8	230201	230208	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017963	AACC	2	8	230671	230678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017963	TAAA	2	8	231301	231308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017963	ACAA	2	8	231335	231342	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017963	TAAA	2	8	231388	231395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017963	GAAT	2	8	232208	232215	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017963	AGAA	2	8	237372	237379	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017963	AAAT	2	8	237421	237428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017963	ATCT	2	8	239935	239942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017963	TAAA	2	8	240135	240142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017963	TCAA	2	8	240145	240152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017963	ACAT	2	8	242531	242538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017963	TTCT	2	8	244420	244427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017963	GAAT	2	8	244446	244453	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017963	GAAC	2	8	244575	244582	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017963	AAGA	2	8	247849	247856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017963	GGTG	2	8	247940	247947	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.