MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium DO plasmid 2

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017962	CTTAG	2	10	2972	2981	20 %	40 %	20 %	20 %	389870178
2	NC_017962	TTTAT	2	10	3068	3077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017962	TAAAA	2	10	3087	3096	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017962	TACAA	2	10	5961	5970	60 %	20 %	0 %	20 %	389870181
5	NC_017962	TGAAA	2	10	7469	7478	60 %	20 %	20 %	0 %	389870185
6	NC_017962	TTCTC	2	10	11486	11495	0 %	60 %	0 %	40 %	389870191
7	NC_017962	CTTTC	2	10	13752	13761	0 %	60 %	0 %	40 %	389870192
8	NC_017962	TATCT	2	10	14254	14263	20 %	60 %	0 %	20 %	389870193
9	NC_017962	TTTAT	2	10	16428	16437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017962	TATTT	2	10	18023	18032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017962	GAAAT	2	10	19182	19191	60 %	20 %	20 %	0 %	389870196
12	NC_017962	CTTTT	2	10	21093	21102	0 %	80 %	0 %	20 %	389870200
13	NC_017962	GATTT	2	10	21287	21296	20 %	60 %	20 %	0 %	389870200
14	NC_017962	AGATA	2	10	21603	21612	60 %	20 %	20 %	0 %	389870200
15	NC_017962	ACTCA	2	10	21720	21729	40 %	20 %	0 %	40 %	389870200
16	NC_017962	TAATT	2	10	22128	22137	40 %	60 %	0 %	0 %	389870200
17	NC_017962	GCTGA	2	10	23952	23961	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017962	TAGAT	2	10	24158	24167	40 %	40 %	20 %	0 %	389870204
19	NC_017962	TAAAG	2	10	24488	24497	60 %	20 %	20 %	0 %	389870204
20	NC_017962	TAAAA	2	10	25249	25258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017962	ATGGA	2	10	25500	25509	40 %	20 %	40 %	0 %	389870205
22	NC_017962	GAATA	2	10	26088	26097	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017962	GAGAA	2	10	27222	27231	60 %	0 %	40 %	0 %	389870208
24	NC_017962	ATTGT	2	10	30305	30314	20 %	60 %	20 %	0 %	389870209
25	NC_017962	ATATA	2	10	30905	30914	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017962	GTATG	2	10	30926	30935	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017962	CATTT	2	10	31769	31778	20 %	60 %	0 %	20 %	389870210
28	NC_017962	TTTTC	2	10	32777	32786	0 %	80 %	0 %	20 %	389870212
29	NC_017962	AGAAT	2	10	33331	33340	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017962	AGTAA	2	10	33695	33704	60 %	20 %	20 %	0 %	389870213
31	NC_017962	CATAA	2	10	34576	34585	60 %	20 %	0 %	20 %	389870213
32	NC_017962	CTAAT	2	10	35381	35390	40 %	40 %	0 %	20 %	389870215
33	NC_017962	TGAAA	2	10	37066	37075	60 %	20 %	20 %	0 %	389870217
34	NC_017962	GTTAA	2	10	38061	38070	40 %	40 %	20 %	0 %	389870218
35	NC_017962	TTCTT	2	10	38196	38205	0 %	80 %	0 %	20 %	389870218
36	NC_017962	ATTGA	2	10	40093	40102	40 %	40 %	20 %	0 %	389870221
37	NC_017962	GATTT	2	10	40245	40254	20 %	60 %	20 %	0 %	389870221
38	NC_017962	AATAT	2	10	44207	44216	60 %	40 %	0 %	0 %	389870226
39	NC_017962	AATTT	2	10	45782	45791	40 %	60 %	0 %	0 %	389870228
40	NC_017962	AAGTA	2	10	49174	49183	60 %	20 %	20 %	0 %	389870233
41	NC_017962	AGCGA	2	10	49601	49610	40 %	0 %	40 %	20 %	389870234
42	NC_017962	GACTT	2	10	50661	50670	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017962	TTACT	2	10	50679	50688	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017962	AAATG	2	10	51163	51172	60 %	20 %	20 %	0 %	389870235
45	NC_017962	ATTTA	2	10	51241	51250	40 %	60 %	0 %	0 %	389870235
46	NC_017962	TTTTG	2	10	51509	51518	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017962	TAAAT	2	10	55252	55261	60 %	40 %	0 %	0 %	389870240
48	NC_017962	TATAA	2	10	55992	56001	60 %	40 %	0 %	0 %	389870241
49	NC_017962	TTATA	2	10	56378	56387	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017962	ATTTC	2	10	58133	58142	20 %	60 %	0 %	20 %	389870245
51	NC_017962	TGCTT	2	10	58454	58463	0 %	60 %	20 %	20 %	389870245
52	NC_017962	ATACC	2	10	58802	58811	40 %	20 %	0 %	40 %	389870245
53	NC_017962	TATTC	2	10	61394	61403	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.