MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecium DO plasmid 2

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017962	ATCC	2	8	338	345	25 %	25 %	0 %	50 %	389870173
2	NC_017962	TCAA	2	8	696	703	50 %	25 %	0 %	25 %	389870174
3	NC_017962	ATTT	2	8	1413	1420	25 %	75 %	0 %	0 %	389870175
4	NC_017962	GCAA	2	8	1556	1563	50 %	0 %	25 %	25 %	389870176
5	NC_017962	TTCT	2	8	1960	1967	0 %	75 %	0 %	25 %	389870176
6	NC_017962	TTGT	2	8	2196	2203	0 %	75 %	25 %	0 %	389870177
7	NC_017962	ATAA	2	8	2215	2222	75 %	25 %	0 %	0 %	389870177
8	NC_017962	TAGT	2	8	3188	3195	25 %	50 %	25 %	0 %	389870179
9	NC_017962	TGGT	2	8	3483	3490	0 %	50 %	50 %	0 %	389870179
10	NC_017962	AACT	2	8	3793	3800	50 %	25 %	0 %	25 %	389870180
11	NC_017962	AACA	2	8	3825	3832	75 %	0 %	0 %	25 %	389870180
12	NC_017962	CAAA	2	8	4012	4019	75 %	0 %	0 %	25 %	389870180
13	NC_017962	ATCA	3	12	4065	4076	50 %	25 %	0 %	25 %	389870180
14	NC_017962	TATT	2	8	4129	4136	25 %	75 %	0 %	0 %	389870180
15	NC_017962	GAAA	2	8	4172	4179	75 %	0 %	25 %	0 %	389870180
16	NC_017962	TATC	2	8	4394	4401	25 %	50 %	0 %	25 %	389870180
17	NC_017962	ACTA	2	8	4898	4905	50 %	25 %	0 %	25 %	389870180
18	NC_017962	TAAA	2	8	5353	5360	75 %	25 %	0 %	0 %	389870180
19	NC_017962	ACTT	2	8	5577	5584	25 %	50 %	0 %	25 %	389870180
20	NC_017962	AAAG	2	8	5869	5876	75 %	0 %	25 %	0 %	389870181
21	NC_017962	TATT	2	8	5921	5928	25 %	75 %	0 %	0 %	389870181
22	NC_017962	ATTA	2	8	6109	6116	50 %	50 %	0 %	0 %	389870181
23	NC_017962	TTAT	2	8	6458	6465	25 %	75 %	0 %	0 %	389870182
24	NC_017962	TAGT	2	8	6671	6678	25 %	50 %	25 %	0 %	389870183
25	NC_017962	ATCA	2	8	7246	7253	50 %	25 %	0 %	25 %	389870184
26	NC_017962	CGAT	2	8	7879	7886	25 %	25 %	25 %	25 %	389870185
27	NC_017962	GAAC	2	8	8079	8086	50 %	0 %	25 %	25 %	389870185
28	NC_017962	GATT	2	8	8352	8359	25 %	50 %	25 %	0 %	389870186
29	NC_017962	TTTA	2	8	8517	8524	25 %	75 %	0 %	0 %	389870187
30	NC_017962	TCTT	2	8	8634	8641	0 %	75 %	0 %	25 %	389870187
31	NC_017962	AGCA	2	8	8778	8785	50 %	0 %	25 %	25 %	389870187
32	NC_017962	ACTC	2	8	8884	8891	25 %	25 %	0 %	50 %	389870187
33	NC_017962	ACAT	2	8	9874	9881	50 %	25 %	0 %	25 %	389870188
34	NC_017962	TTGA	2	8	10135	10142	25 %	50 %	25 %	0 %	389870188
35	NC_017962	TGAA	2	8	10513	10520	50 %	25 %	25 %	0 %	389870189
36	NC_017962	TTCT	2	8	10840	10847	0 %	75 %	0 %	25 %	389870190
37	NC_017962	CTTT	2	8	11387	11394	0 %	75 %	0 %	25 %	389870191
38	NC_017962	CTTT	2	8	11663	11670	0 %	75 %	0 %	25 %	389870191
39	NC_017962	CTGA	2	8	12642	12649	25 %	25 %	25 %	25 %	389870191
40	NC_017962	TGTT	2	8	14221	14228	0 %	75 %	25 %	0 %	389870193
41	NC_017962	TTCA	2	8	14296	14303	25 %	50 %	0 %	25 %	389870193
42	NC_017962	GCAT	2	8	15807	15814	25 %	25 %	25 %	25 %	389870194
43	NC_017962	TGTA	2	8	16658	16665	25 %	50 %	25 %	0 %	389870195
44	NC_017962	AGCT	2	8	16919	16926	25 %	25 %	25 %	25 %	389870195
45	NC_017962	TCAA	2	8	17395	17402	50 %	25 %	0 %	25 %	389870195
46	NC_017962	CGTC	2	8	17472	17479	0 %	25 %	25 %	50 %	389870195
47	NC_017962	AGTT	2	8	18444	18451	25 %	50 %	25 %	0 %	389870196
48	NC_017962	TCGA	2	8	19095	19102	25 %	25 %	25 %	25 %	389870196
49	NC_017962	GATC	2	8	19301	19308	25 %	25 %	25 %	25 %	389870196
50	NC_017962	TGAA	2	8	19984	19991	50 %	25 %	25 %	0 %	389870197
51	NC_017962	AGCA	2	8	20349	20356	50 %	0 %	25 %	25 %	389870199
52	NC_017962	TAAA	2	8	20958	20965	75 %	25 %	0 %	0 %	389870200
53	NC_017962	GTTT	2	8	21127	21134	0 %	75 %	25 %	0 %	389870200
54	NC_017962	TTTA	2	8	21777	21784	25 %	75 %	0 %	0 %	389870200
55	NC_017962	GAAT	2	8	22029	22036	50 %	25 %	25 %	0 %	389870200
56	NC_017962	GTCT	2	8	22084	22091	0 %	50 %	25 %	25 %	389870200
57	NC_017962	AAAT	2	8	22107	22114	75 %	25 %	0 %	0 %	389870200
58	NC_017962	CTTT	2	8	24529	24536	0 %	75 %	0 %	25 %	389870204
59	NC_017962	GAAA	2	8	24657	24664	75 %	0 %	25 %	0 %	389870204
60	NC_017962	GTTT	2	8	25487	25494	0 %	75 %	25 %	0 %	389870205
61	NC_017962	AAAT	2	8	25705	25712	75 %	25 %	0 %	0 %	389870205
62	NC_017962	CATA	2	8	25768	25775	50 %	25 %	0 %	25 %	389870206
63	NC_017962	CATC	2	8	25816	25823	25 %	25 %	0 %	50 %	389870206
64	NC_017962	ATGA	2	8	27537	27544	50 %	25 %	25 %	0 %	389870208
65	NC_017962	CGAT	2	8	27771	27778	25 %	25 %	25 %	25 %	389870208
66	NC_017962	ACCA	2	8	27993	28000	50 %	0 %	0 %	50 %	389870208
67	NC_017962	GTAG	2	8	28437	28444	25 %	25 %	50 %	0 %	389870208
68	NC_017962	TCAA	2	8	28459	28466	50 %	25 %	0 %	25 %	389870208
69	NC_017962	ATCG	2	8	28620	28627	25 %	25 %	25 %	25 %	389870208
70	NC_017962	ACCA	2	8	28888	28895	50 %	0 %	0 %	50 %	389870208
71	NC_017962	ATCA	2	8	28926	28933	50 %	25 %	0 %	25 %	389870208
72	NC_017962	TTGG	2	8	29000	29007	0 %	50 %	50 %	0 %	389870208
73	NC_017962	GTTT	2	8	29137	29144	0 %	75 %	25 %	0 %	389870208
74	NC_017962	ATTG	2	8	30157	30164	25 %	50 %	25 %	0 %	389870209
75	NC_017962	TCAT	2	8	30408	30415	25 %	50 %	0 %	25 %	389870209
76	NC_017962	GCCC	2	8	31673	31680	0 %	0 %	25 %	75 %	389870210
77	NC_017962	TTCG	2	8	32312	32319	0 %	50 %	25 %	25 %	389870211
78	NC_017962	AACT	2	8	32763	32770	50 %	25 %	0 %	25 %	389870212
79	NC_017962	CTTT	2	8	33303	33310	0 %	75 %	0 %	25 %	389870212
80	NC_017962	CGAT	2	8	35439	35446	25 %	25 %	25 %	25 %	389870215
81	NC_017962	TGAA	2	8	35694	35701	50 %	25 %	25 %	0 %	389870215
82	NC_017962	ATCA	2	8	36364	36371	50 %	25 %	0 %	25 %	389870217
83	NC_017962	ATTT	2	8	36525	36532	25 %	75 %	0 %	0 %	389870217
84	NC_017962	CTTG	2	8	36687	36694	0 %	50 %	25 %	25 %	389870217
85	NC_017962	AATT	2	8	37611	37618	50 %	50 %	0 %	0 %	389870217
86	NC_017962	TTGT	2	8	38223	38230	0 %	75 %	25 %	0 %	389870218
87	NC_017962	TCAA	2	8	38239	38246	50 %	25 %	0 %	25 %	389870218
88	NC_017962	TGAT	2	8	38270	38277	25 %	50 %	25 %	0 %	389870218
89	NC_017962	TATC	2	8	38354	38361	25 %	50 %	0 %	25 %	389870218
90	NC_017962	TTTC	2	8	38609	38616	0 %	75 %	0 %	25 %	389870218
91	NC_017962	TCAA	2	8	39032	39039	50 %	25 %	0 %	25 %	389870219
92	NC_017962	TCTG	2	8	39745	39752	0 %	50 %	25 %	25 %	389870220
93	NC_017962	ACTT	2	8	41023	41030	25 %	50 %	0 %	25 %	389870222
94	NC_017962	AGTA	2	8	41195	41202	50 %	25 %	25 %	0 %	389870222
95	NC_017962	CTCA	2	8	41359	41366	25 %	25 %	0 %	50 %	389870222
96	NC_017962	TTCC	2	8	41427	41434	0 %	50 %	0 %	50 %	389870222
97	NC_017962	TTCC	2	8	41559	41566	0 %	50 %	0 %	50 %	389870222
98	NC_017962	ATCC	2	8	42479	42486	25 %	25 %	0 %	50 %	389870224
99	NC_017962	AAAG	2	8	43134	43141	75 %	0 %	25 %	0 %	389870224
100	NC_017962	CCAT	2	8	43777	43784	25 %	25 %	0 %	50 %	389870225
101	NC_017962	CCAG	2	8	43862	43869	25 %	0 %	25 %	50 %	389870225
102	NC_017962	GCGA	2	8	43878	43885	25 %	0 %	50 %	25 %	389870225
103	NC_017962	TTTC	2	8	43932	43939	0 %	75 %	0 %	25 %	389870225
104	NC_017962	TTAT	2	8	43965	43972	25 %	75 %	0 %	0 %	389870226
105	NC_017962	TTCA	2	8	43985	43992	25 %	50 %	0 %	25 %	389870226
106	NC_017962	CTTT	2	8	44122	44129	0 %	75 %	0 %	25 %	389870226
107	NC_017962	CATT	2	8	44965	44972	25 %	50 %	0 %	25 %	389870227
108	NC_017962	ATCA	2	8	45131	45138	50 %	25 %	0 %	25 %	389870227
109	NC_017962	AATT	2	8	45205	45212	50 %	50 %	0 %	0 %	389870228
110	NC_017962	TATT	2	8	45395	45402	25 %	75 %	0 %	0 %	389870228
111	NC_017962	ATGA	2	8	45492	45499	50 %	25 %	25 %	0 %	389870228
112	NC_017962	CTAT	2	8	45593	45600	25 %	50 %	0 %	25 %	389870228
113	NC_017962	CAAA	2	8	45805	45812	75 %	0 %	0 %	25 %	389870228
114	NC_017962	AGAT	2	8	46800	46807	50 %	25 %	25 %	0 %	389870229
115	NC_017962	TGTT	2	8	46893	46900	0 %	75 %	25 %	0 %	389870229
116	NC_017962	TCAC	2	8	47665	47672	25 %	25 %	0 %	50 %	389870230
117	NC_017962	TTGA	2	8	48557	48564	25 %	50 %	25 %	0 %	389870232
118	NC_017962	TTTA	2	8	48986	48993	25 %	75 %	0 %	0 %	389870233
119	NC_017962	TCGT	2	8	49509	49516	0 %	50 %	25 %	25 %	389870234
120	NC_017962	TCGT	2	8	49966	49973	0 %	50 %	25 %	25 %	389870234
121	NC_017962	GTTA	2	8	50025	50032	25 %	50 %	25 %	0 %	389870234
122	NC_017962	AAAG	2	8	50115	50122	75 %	0 %	25 %	0 %	389870234
123	NC_017962	GAAA	2	8	50188	50195	75 %	0 %	25 %	0 %	389870234
124	NC_017962	TGGC	2	8	50449	50456	0 %	25 %	50 %	25 %	389870234
125	NC_017962	ATTT	2	8	51141	51148	25 %	75 %	0 %	0 %	389870235
126	NC_017962	GATT	2	8	51226	51233	25 %	50 %	25 %	0 %	389870235
127	NC_017962	ATGA	2	8	51389	51396	50 %	25 %	25 %	0 %	389870235
128	NC_017962	AATG	2	8	51422	51429	50 %	25 %	25 %	0 %	389870235
129	NC_017962	TTAA	2	8	52087	52094	50 %	50 %	0 %	0 %	389870236
130	NC_017962	ATTA	2	8	52176	52183	50 %	50 %	0 %	0 %	389870237
131	NC_017962	TTGA	2	8	53063	53070	25 %	50 %	25 %	0 %	389870238
132	NC_017962	TTTA	2	8	54593	54600	25 %	75 %	0 %	0 %	389870239
133	NC_017962	TCAT	2	8	54900	54907	25 %	50 %	0 %	25 %	389870239
134	NC_017962	TCAA	2	8	55293	55300	50 %	25 %	0 %	25 %	389870240
135	NC_017962	TACT	2	8	55546	55553	25 %	50 %	0 %	25 %	389870240
136	NC_017962	TCGT	2	8	55840	55847	0 %	50 %	25 %	25 %	389870241
137	NC_017962	CAAT	2	8	55984	55991	50 %	25 %	0 %	25 %	389870241
138	NC_017962	GGTT	2	8	56179	56186	0 %	50 %	50 %	0 %	389870241
139	NC_017962	ATAA	2	8	57626	57633	75 %	25 %	0 %	0 %	389870244
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141	NC_017962	CCGC	2	8	57695	57702	0 %	0 %	25 %	75 %	389870245
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.