MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecium DO plasmid 1

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017961	AGAA	2	8	730	737	75 %	0 %	25 %	0 %	389870258
2	NC_017961	CTTT	2	8	1162	1169	0 %	75 %	0 %	25 %	389870258
3	NC_017961	ATCA	2	8	1409	1416	50 %	25 %	0 %	25 %	389870258
4	NC_017961	TGCT	2	8	1553	1560	0 %	50 %	25 %	25 %	389870258
5	NC_017961	CTTT	2	8	1781	1788	0 %	75 %	0 %	25 %	389870258
6	NC_017961	GTTT	2	8	1804	1811	0 %	75 %	25 %	0 %	389870258
7	NC_017961	GATA	2	8	1881	1888	50 %	25 %	25 %	0 %	389870258
8	NC_017961	TTCT	2	8	2413	2420	0 %	75 %	0 %	25 %	389870259
9	NC_017961	CTTA	2	8	2425	2432	25 %	50 %	0 %	25 %	389870259
10	NC_017961	AAAG	2	8	2680	2687	75 %	0 %	25 %	0 %	389870259
11	NC_017961	TTTC	2	8	3107	3114	0 %	75 %	0 %	25 %	389870259
12	NC_017961	CTTT	2	8	3136	3143	0 %	75 %	0 %	25 %	389870259
13	NC_017961	TTGA	2	8	4242	4249	25 %	50 %	25 %	0 %	389870261
14	NC_017961	AAAT	2	8	4731	4738	75 %	25 %	0 %	0 %	389870262
15	NC_017961	CTGA	2	8	5135	5142	25 %	25 %	25 %	25 %	389870262
16	NC_017961	AAGA	2	8	5647	5654	75 %	0 %	25 %	0 %	389870263
17	NC_017961	ATAA	2	8	6105	6112	75 %	25 %	0 %	0 %	389870264
18	NC_017961	AACC	2	8	7041	7048	50 %	0 %	0 %	50 %	389870266
19	NC_017961	TCTT	2	8	7738	7745	0 %	75 %	0 %	25 %	389870268
20	NC_017961	TGAT	2	8	7752	7759	25 %	50 %	25 %	0 %	389870268
21	NC_017961	TGAA	2	8	7963	7970	50 %	25 %	25 %	0 %	389870269
22	NC_017961	CAGT	2	8	8629	8636	25 %	25 %	25 %	25 %	389870271
23	NC_017961	CATA	2	8	9064	9071	50 %	25 %	0 %	25 %	389870272
24	NC_017961	TCTT	2	8	9140	9147	0 %	75 %	0 %	25 %	389870272
25	NC_017961	TTCT	2	8	9362	9369	0 %	75 %	0 %	25 %	389870273
26	NC_017961	TTCC	2	8	9653	9660	0 %	50 %	0 %	50 %	389870273
27	NC_017961	AGCC	2	8	9875	9882	25 %	0 %	25 %	50 %	389870273
28	NC_017961	ACTT	2	8	9900	9907	25 %	50 %	0 %	25 %	389870273
29	NC_017961	GATC	2	8	9955	9962	25 %	25 %	25 %	25 %	389870273
30	NC_017961	TACA	2	8	10834	10841	50 %	25 %	0 %	25 %	389870274
31	NC_017961	AGCA	2	8	10916	10923	50 %	0 %	25 %	25 %	389870274
32	NC_017961	AATG	2	8	10927	10934	50 %	25 %	25 %	0 %	389870274
33	NC_017961	CTTT	2	8	11615	11622	0 %	75 %	0 %	25 %	389870274
34	NC_017961	AACG	2	8	11681	11688	50 %	0 %	25 %	25 %	389870274
35	NC_017961	TTCA	2	8	11831	11838	25 %	50 %	0 %	25 %	389870274
36	NC_017961	TTGT	2	8	12633	12640	0 %	75 %	25 %	0 %	389870275
37	NC_017961	AAAT	2	8	12967	12974	75 %	25 %	0 %	0 %	389870276
38	NC_017961	TCTT	2	8	13290	13297	0 %	75 %	0 %	25 %	389870276
39	NC_017961	CTTT	2	8	13449	13456	0 %	75 %	0 %	25 %	389870276
40	NC_017961	CTTG	2	8	13556	13563	0 %	50 %	25 %	25 %	389870276
41	NC_017961	GATT	2	8	13630	13637	25 %	50 %	25 %	0 %	389870276
42	NC_017961	GAAA	2	8	13938	13945	75 %	0 %	25 %	0 %	389870278
43	NC_017961	TTTG	2	8	14332	14339	0 %	75 %	25 %	0 %	389870278
44	NC_017961	GTAT	2	8	14368	14375	25 %	50 %	25 %	0 %	389870278
45	NC_017961	AAGC	2	8	14613	14620	50 %	0 %	25 %	25 %	389870278
46	NC_017961	AAAC	2	8	14671	14678	75 %	0 %	0 %	25 %	389870278
47	NC_017961	ATAA	2	8	14724	14731	75 %	25 %	0 %	0 %	389870278
48	NC_017961	ATTG	2	8	14979	14986	25 %	50 %	25 %	0 %	389870279
49	NC_017961	TTGA	2	8	15887	15894	25 %	50 %	25 %	0 %	389870280
50	NC_017961	AACG	2	8	16677	16684	50 %	0 %	25 %	25 %	389870281
51	NC_017961	GCAA	2	8	16858	16865	50 %	0 %	25 %	25 %	389870281
52	NC_017961	GATT	2	8	17111	17118	25 %	50 %	25 %	0 %	389870281
53	NC_017961	CCAA	2	8	17289	17296	50 %	0 %	0 %	50 %	389870281
54	NC_017961	AACT	2	8	17716	17723	50 %	25 %	0 %	25 %	389870281
55	NC_017961	GAAA	2	8	18229	18236	75 %	0 %	25 %	0 %	389870282
56	NC_017961	GTTG	2	8	18362	18369	0 %	50 %	50 %	0 %	389870282
57	NC_017961	AATA	2	8	18516	18523	75 %	25 %	0 %	0 %	389870282
58	NC_017961	CATG	2	8	18549	18556	25 %	25 %	25 %	25 %	389870282
59	NC_017961	TAAA	2	8	18908	18915	75 %	25 %	0 %	0 %	389870282
60	NC_017961	TCAA	2	8	19125	19132	50 %	25 %	0 %	25 %	389870283
61	NC_017961	CGTT	2	8	20010	20017	0 %	50 %	25 %	25 %	389870284
62	NC_017961	AAGT	2	8	20147	20154	50 %	25 %	25 %	0 %	389870284
63	NC_017961	GAAA	2	8	20225	20232	75 %	0 %	25 %	0 %	389870284
64	NC_017961	TGAC	2	8	20323	20330	25 %	25 %	25 %	25 %	389870284
65	NC_017961	AGAT	2	8	20875	20882	50 %	25 %	25 %	0 %	389870285
66	NC_017961	AAAT	2	8	21158	21165	75 %	25 %	0 %	0 %	389870285
67	NC_017961	CATT	2	8	21678	21685	25 %	50 %	0 %	25 %	389870287
68	NC_017961	ACGG	2	8	21809	21816	25 %	0 %	50 %	25 %	389870288
69	NC_017961	AAAG	2	8	22031	22038	75 %	0 %	25 %	0 %	389870288
70	NC_017961	AAGT	2	8	22220	22227	50 %	25 %	25 %	0 %	389870289
71	NC_017961	TTCA	2	8	22383	22390	25 %	50 %	0 %	25 %	389870289
72	NC_017961	AAAG	2	8	22407	22414	75 %	0 %	25 %	0 %	389870289
73	NC_017961	CCTG	2	8	22534	22541	0 %	25 %	25 %	50 %	389870290
74	NC_017961	TGCT	2	8	22676	22683	0 %	50 %	25 %	25 %	389870290
75	NC_017961	ACTT	2	8	23165	23172	25 %	50 %	0 %	25 %	389870290
76	NC_017961	CTTA	2	8	23391	23398	25 %	50 %	0 %	25 %	389870290
77	NC_017961	GCTG	2	8	23853	23860	0 %	25 %	50 %	25 %	389870291
78	NC_017961	TGAA	2	8	24042	24049	50 %	25 %	25 %	0 %	389870292
79	NC_017961	TGAA	2	8	24963	24970	50 %	25 %	25 %	0 %	389870292
80	NC_017961	CAGT	2	8	25190	25197	25 %	25 %	25 %	25 %	389870292
81	NC_017961	GCAG	2	8	26201	26208	25 %	0 %	50 %	25 %	389870293
82	NC_017961	CAGC	2	8	26533	26540	25 %	0 %	25 %	50 %	389870293
83	NC_017961	AGTT	2	8	27111	27118	25 %	50 %	25 %	0 %	389870293
84	NC_017961	ACAA	2	8	27350	27357	75 %	0 %	0 %	25 %	389870293
85	NC_017961	TAAA	2	8	27852	27859	75 %	25 %	0 %	0 %	389870293
86	NC_017961	TAAA	2	8	27876	27883	75 %	25 %	0 %	0 %	389870293
87	NC_017961	TAAA	2	8	28251	28258	75 %	25 %	0 %	0 %	389870294
88	NC_017961	TCAT	2	8	28683	28690	25 %	50 %	0 %	25 %	389870295
89	NC_017961	TATG	2	8	28705	28712	25 %	50 %	25 %	0 %	389870295
90	NC_017961	GATT	2	8	28946	28953	25 %	50 %	25 %	0 %	389870296
91	NC_017961	ACAG	2	8	29613	29620	50 %	0 %	25 %	25 %	389870297
92	NC_017961	GACA	2	8	29924	29931	50 %	0 %	25 %	25 %	389870297
93	NC_017961	AATG	2	8	30192	30199	50 %	25 %	25 %	0 %	389870297
94	NC_017961	AGAA	2	8	30248	30255	75 %	0 %	25 %	0 %	389870297
95	NC_017961	ATGA	2	8	30544	30551	50 %	25 %	25 %	0 %	389870297
96	NC_017961	GAAA	2	8	30852	30859	75 %	0 %	25 %	0 %	389870297
97	NC_017961	CTAT	2	8	31441	31448	25 %	50 %	0 %	25 %	389870297
98	NC_017961	GGCT	2	8	32013	32020	0 %	25 %	50 %	25 %	389870298
99	NC_017961	ACAA	2	8	33335	33342	75 %	0 %	0 %	25 %	389870298
100	NC_017961	CAGA	2	8	33508	33515	50 %	0 %	25 %	25 %	389870298
101	NC_017961	CAGC	2	8	33603	33610	25 %	0 %	25 %	50 %	389870298
102	NC_017961	AAGA	2	8	33787	33794	75 %	0 %	25 %	0 %	389870298
103	NC_017961	CGTC	2	8	33864	33871	0 %	25 %	25 %	50 %	389870298
104	NC_017961	TGTT	2	8	34020	34027	0 %	75 %	25 %	0 %	389870299
105	NC_017961	AAAT	2	8	34405	34412	75 %	25 %	0 %	0 %	389870299
106	NC_017961	TTTC	2	8	34795	34802	0 %	75 %	0 %	25 %	389870299

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.