MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecium DO plasmid 1

Total Repeats: 384

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017961	ATT	2	6	7	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870258
2	NC_017961	TTA	2	6	67	72	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870258
3	NC_017961	ATA	2	6	131	136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870258
4	NC_017961	CAT	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389870258
5	NC_017961	TAT	2	6	332	337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870258
6	NC_017961	ATG	2	6	545	550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389870258
7	NC_017961	AGA	2	6	616	621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389870258
8	NC_017961	AGC	2	6	683	688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870258
9	NC_017961	TCA	2	6	718	723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389870258
10	NC_017961	GAA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389870258
11	NC_017961	CTG	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870258
12	NC_017961	AAC	2	6	1041	1046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389870258
13	NC_017961	CAA	2	6	1066	1071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389870258
14	NC_017961	GCC	2	6	1308	1313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389870258
15	NC_017961	CAG	2	6	1538	1543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870258
16	NC_017961	AAT	2	6	1714	1719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870258
17	NC_017961	TAC	2	6	1836	1841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389870258
18	NC_017961	CGT	2	6	1864	1869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870258
19	NC_017961	TAA	2	6	2245	2250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870259
20	NC_017961	ACC	2	6	2251	2256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389870259
21	NC_017961	TAA	2	6	2373	2378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870259
22	NC_017961	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389870259
23	NC_017961	TAG	2	6	2553	2558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389870259
24	NC_017961	TGG	2	6	2587	2592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389870259
25	NC_017961	TCT	2	6	2623	2628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870259
26	NC_017961	ATT	2	6	2674	2679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870259
27	NC_017961	TGT	2	6	2757	2762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389870259
28	NC_017961	ACA	2	6	2765	2770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389870259
29	NC_017961	TTG	2	6	2853	2858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389870259
30	NC_017961	ATG	2	6	2957	2962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389870259
31	NC_017961	ATT	2	6	3005	3010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870259
32	NC_017961	ATT	2	6	3032	3037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870259
33	NC_017961	TGG	2	6	3049	3054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389870259
34	NC_017961	TTG	2	6	3060	3065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389870259
35	NC_017961	AGA	2	6	3068	3073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389870259
36	NC_017961	ACA	2	6	3149	3154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389870259
37	NC_017961	CAA	2	6	3222	3227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389870259
38	NC_017961	CAG	2	6	3248	3253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870259
39	NC_017961	GGT	2	6	3326	3331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389870259
40	NC_017961	TTA	2	6	3332	3337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870259
41	NC_017961	GTT	2	6	3361	3366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389870259
42	NC_017961	TTA	2	6	3410	3415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870259
43	NC_017961	CTA	2	6	3699	3704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389870260
44	NC_017961	CAG	2	6	3777	3782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870261
45	NC_017961	ATT	2	6	3789	3794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870261
46	NC_017961	CTA	2	6	3806	3811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389870261
47	NC_017961	ACG	2	6	3882	3887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870261
48	NC_017961	ACT	2	6	3917	3922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389870261
49	NC_017961	ATT	2	6	4009	4014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870261
50	NC_017961	AGC	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870261
51	NC_017961	TGA	2	6	4121	4126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389870261
52	NC_017961	AAT	2	6	4236	4241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870261
53	NC_017961	AAG	2	6	4363	4368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389870261
54	NC_017961	TAT	2	6	4408	4413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870261
55	NC_017961	GAA	2	6	4682	4687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389870262
56	NC_017961	CTT	2	6	4914	4919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870262
57	NC_017961	GAA	2	6	5021	5026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389870262
58	NC_017961	GAT	2	6	5222	5227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389870262
59	NC_017961	AGA	3	9	5334	5342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389870263
60	NC_017961	GTT	2	6	5432	5437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389870263
61	NC_017961	GAT	2	6	5501	5506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389870263
62	NC_017961	GTT	2	6	5578	5583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389870263
63	NC_017961	AAG	2	6	5628	5633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389870263
64	NC_017961	CAA	2	6	5688	5693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389870263
65	NC_017961	GAA	2	6	5701	5706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389870263
66	NC_017961	AGA	2	6	5799	5804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389870263
67	NC_017961	GAA	2	6	5810	5815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389870263
68	NC_017961	TTA	2	6	6096	6101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870264
69	NC_017961	CTG	2	6	6210	6215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870264
70	NC_017961	TTC	2	6	6318	6323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870265
71	NC_017961	CTT	2	6	6413	6418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870265
72	NC_017961	CTT	3	9	6446	6454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870265
73	NC_017961	CTA	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389870265
74	NC_017961	TTG	2	6	6532	6537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389870265
75	NC_017961	TAA	2	6	6689	6694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870265
76	NC_017961	GGT	2	6	7083	7088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389870266
77	NC_017961	CCA	2	6	7090	7095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389870266
78	NC_017961	TTG	2	6	7126	7131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389870266
79	NC_017961	GTT	2	6	7329	7334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389870267
80	NC_017961	ATG	2	6	7554	7559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389870267
81	NC_017961	TTC	2	6	7704	7709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870268
82	NC_017961	ACT	2	6	7714	7719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389870268
83	NC_017961	AAT	2	6	7760	7765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870268
84	NC_017961	GCT	2	6	7863	7868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870269
85	NC_017961	TTG	2	6	8078	8083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389870269
86	NC_017961	TTC	2	6	8104	8109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870269
87	NC_017961	TCC	2	6	8132	8137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389870269
88	NC_017961	TCT	2	6	8148	8153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870269
89	NC_017961	TTA	2	6	8209	8214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870270
90	NC_017961	CTT	2	6	8306	8311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870270
91	NC_017961	TAA	2	6	8313	8318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870270
92	NC_017961	GTT	2	6	8348	8353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389870270
93	NC_017961	TTG	2	6	8369	8374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389870270
94	NC_017961	TCT	2	6	8378	8383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870270
95	NC_017961	TTA	2	6	8392	8397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870270
96	NC_017961	ATA	2	6	8439	8444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870270
97	NC_017961	TAA	2	6	8463	8468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870270
98	NC_017961	ACA	2	6	8474	8479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389870270
99	NC_017961	CTT	2	6	8620	8625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870271
100	NC_017961	TTC	2	6	8664	8669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870271
101	NC_017961	CAA	2	6	8746	8751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389870271
102	NC_017961	TTC	2	6	8768	8773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870271
103	NC_017961	TAT	2	6	8995	9000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870272
104	NC_017961	TCG	2	6	9015	9020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870272
105	NC_017961	GGA	2	6	9117	9122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389870272
106	NC_017961	ATC	2	6	9185	9190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389870272
107	NC_017961	TCT	2	6	9220	9225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870272
108	NC_017961	TAA	2	6	9242	9247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870272
109	NC_017961	TGT	2	6	9343	9348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389870273
110	NC_017961	CCA	2	6	9402	9407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389870273
111	NC_017961	TAA	2	6	9638	9643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870273
112	NC_017961	TCT	2	6	9646	9651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870273
113	NC_017961	ATA	2	6	9691	9696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870273
114	NC_017961	GCA	2	6	9703	9708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870273
115	NC_017961	TGG	2	6	9741	9746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389870273
116	NC_017961	TTC	2	6	9783	9788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870273
117	NC_017961	ACG	2	6	9819	9824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870273
118	NC_017961	TTC	2	6	9858	9863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870273
119	NC_017961	ATA	2	6	9883	9888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870273
120	NC_017961	TGC	2	6	9942	9947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870273
121	NC_017961	AGT	2	6	9999	10004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389870273
122	NC_017961	TTG	2	6	10011	10016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389870273
123	NC_017961	TAA	2	6	10071	10076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870273
124	NC_017961	GCC	2	6	10101	10106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389870273
125	NC_017961	GTG	2	6	10893	10898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389870274
126	NC_017961	GAA	2	6	10961	10966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389870274
127	NC_017961	GAT	2	6	11036	11041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389870274
128	NC_017961	ATT	2	6	11138	11143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870274
129	NC_017961	ATA	2	6	11379	11384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870274
130	NC_017961	AGA	2	6	11470	11475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389870274
131	NC_017961	TCG	2	6	11568	11573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870274
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380	NC_017961	TCT	2	6	35350	35355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870300
381	NC_017961	ACG	2	6	35632	35637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870300
382	NC_017961	TTC	2	6	35638	35643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870300
383	NC_017961	CTA	2	6	35679	35684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389870300
384	NC_017961	CAG	2	6	35806	35811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870300

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.