MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium DO chromosome

Total Repeats: 441

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017960	TAAAA	2	10	15007	15016	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017960	AATTT	2	10	24836	24845	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017960	TTTCT	2	10	29713	29722	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017960	TATTT	2	10	30934	30943	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017960	TTATA	2	10	39038	39047	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017960	ATAAA	2	10	42654	42663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017960	TTCTT	2	10	42749	42758	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017960	TAAAG	2	10	61623	61632	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017960	CATAT	2	10	83417	83426	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017960	ACTAG	2	10	108830	108839	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017960	ACTAG	2	10	108951	108960	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017960	AGTCA	2	10	111265	111274	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017960	AAATC	2	10	111372	111381	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017960	AGGCT	2	10	112335	112344	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017960	GAAGA	2	10	114436	114445	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017960	TTTAA	2	10	125564	125573	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017960	ATTTT	2	10	129782	129791	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017960	TAAAA	2	10	142947	142956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017960	ATAAA	2	10	146916	146925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017960	TAAAA	2	10	158778	158787	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017960	GTTGG	2	10	168442	168451	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017960	TGAAC	2	10	168615	168624	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017960	TATTT	2	10	173341	173350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017960	TTTTG	2	10	175460	175469	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017960	TTACA	2	10	182082	182091	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017960	TTTTG	2	10	182468	182477	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017960	TAAAG	2	10	183647	183656	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017960	GGAAT	2	10	190429	190438	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017960	TTATT	2	10	211134	211143	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017960	TTTTC	2	10	218242	218251	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017960	TAAAA	2	10	218285	218294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017960	GAAAA	2	10	235752	235761	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017960	TAATT	2	10	241826	241835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017960	GAATT	2	10	247885	247894	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017960	TTTAA	2	10	248714	248723	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017960	CAATT	2	10	250705	250714	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017960	CCAGT	2	10	256587	256596	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017960	ATTAA	2	10	264062	264071	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017960	CCAAA	2	10	271618	271627	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_017960	TTTTG	2	10	274870	274879	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017960	CTAGT	2	10	281168	281177	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017960	AACAA	2	10	281277	281286	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017960	ATTTT	2	10	289555	289564	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017960	ACAGA	2	10	294709	294718	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017960	TTCTG	2	10	294734	294743	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017960	AAAGA	2	10	314649	314658	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017960	TTTTA	2	10	316027	316036	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017960	TAGTT	2	10	343084	343093	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017960	AAAAG	2	10	345748	345757	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017960	ACTGA	2	10	345767	345776	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017960	TGTTT	2	10	354278	354287	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017960	CTTCT	2	10	357740	357749	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_017960	ATTAC	2	10	367504	367513	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017960	TAAAA	2	10	377060	377069	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017960	GAAAT	2	10	383452	383461	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017960	GTGAG	2	10	383495	383504	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017960	AAAAT	2	10	395581	395590	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017960	TCCTA	2	10	395934	395943	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017960	TAAAA	2	10	411450	411459	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017960	CCCAA	2	10	413567	413576	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_017960	TATAT	2	10	430298	430307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017960	AAATA	2	10	430326	430335	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017960	TTTTC	2	10	440395	440404	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017960	TAAAT	2	10	452259	452268	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017960	AGCAA	2	10	462707	462716	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017960	GATAA	2	10	462773	462782	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017960	TGATA	2	10	462953	462962	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017960	ATTCA	2	10	463068	463077	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017960	TTTGA	2	10	463366	463375	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017960	TCGTG	2	10	464245	464254	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017960	GCTAA	2	10	464445	464454	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017960	AGGGA	2	10	467803	467812	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017960	AAAAG	2	10	467981	467990	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017960	AAGAT	2	10	468819	468828	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017960	TAATG	2	10	482132	482141	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017960	TTAAA	2	10	483826	483835	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017960	AAACA	2	10	514646	514655	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017960	TCATT	2	10	517066	517075	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017960	TAATT	2	10	523170	523179	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017960	TAAAT	2	10	523249	523258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017960	TTGTT	2	10	523275	523284	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017960	ATAAA	2	10	540535	540544	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017960	ATGGA	2	10	551938	551947	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017960	AAAAG	2	10	552741	552750	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017960	CTTTT	2	10	554245	554254	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017960	ATAGC	2	10	554257	554266	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017960	TAAAA	2	10	579513	579522	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017960	AAAGA	2	10	584744	584753	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017960	CACGC	2	10	590300	590309	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_017960	AACTT	2	10	590413	590422	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017960	TGAAA	2	10	597771	597780	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017960	ACCCC	2	10	604290	604299	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
93	NC_017960	TGAAA	2	10	604404	604413	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017960	AAAAG	2	10	606339	606348	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017960	AAGAT	2	10	606777	606786	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017960	AAAGG	2	10	611107	611116	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017960	ATAAA	2	10	614739	614748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017960	TGCTT	2	10	622125	622134	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017960	TTTTA	2	10	630506	630515	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017960	TCATG	2	10	652508	652517	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017960	TTGTT	2	10	656350	656359	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017960	GAAAT	2	10	659994	660003	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017960	TGTTA	2	10	670730	670739	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017960	GAAAG	2	10	671539	671548	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017960	ATAAA	2	10	678300	678309	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017960	TCAGG	2	10	681831	681840	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017960	TGCAG	2	10	681958	681967	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017960	TCTTT	2	10	712786	712795	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017960	AAAGA	2	10	717914	717923	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017960	TGGAG	2	10	719112	719121	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017960	TTGTT	2	10	722833	722842	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017960	GGTTC	2	10	726139	726148	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017960	AAGCT	2	10	729488	729497	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017960	TTTTG	2	10	729516	729525	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017960	CTATA	2	10	751697	751706	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017960	AATAA	2	10	751785	751794	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017960	AAATA	2	10	767159	767168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017960	TATTT	2	10	770109	770118	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017960	TATTT	2	10	787837	787846	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017960	AAGAA	2	10	835202	835211	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017960	ACTAG	2	10	857174	857183	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017960	GAAAA	2	10	864339	864348	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017960	ATTTT	2	10	883000	883009	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017960	TAAGA	2	10	901398	901407	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017960	AAATC	2	10	901458	901467	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017960	ACAGA	2	10	901528	901537	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017960	TCTGT	2	10	901554	901563	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017960	ATTCT	2	10	905103	905112	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017960	ACAGA	2	10	909519	909528	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017960	TCTGT	2	10	909545	909554	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017960	GGTAT	2	10	921775	921784	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017960	TGATT	2	10	923888	923897	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017960	GTATA	2	10	929427	929436	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017960	AATAT	2	10	929508	929517	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017960	TCTTT	2	10	932221	932230	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017960	GAGAA	2	10	937715	937724	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017960	AAGAA	2	10	958222	958231	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017960	TGCAG	2	10	958280	958289	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017960	ACAGA	2	10	971923	971932	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017960	TCTGT	2	10	971949	971958	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017960	TAGAA	2	10	987805	987814	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017960	ATTCA	2	10	990616	990625	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017960	TTTGA	2	10	990913	990922	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017960	TCGTG	2	10	991792	991801	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017960	GCTAA	2	10	991992	992001	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017960	AGGGA	2	10	995449	995458	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017960	AAAAG	2	10	995627	995636	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_017960	GAAAG	2	10	2656327	2656336	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
428	NC_017960	CAATT	2	10	2658243	2658252	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
429	NC_017960	TGTTC	2	10	2662805	2662814	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
430	NC_017960	TTGAT	2	10	2666652	2666661	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
431	NC_017960	TTGGT	2	10	2666691	2666700	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
432	NC_017960	TTCTT	2	10	2675054	2675063	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
433	NC_017960	TCCCT	2	10	2675234	2675243	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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435	NC_017960	TTAGC	2	10	2678593	2678602	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
436	NC_017960	CACGA	2	10	2678793	2678802	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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439	NC_017960	TATCA	2	10	2680082	2680091	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
440	NC_017960	TTATC	2	10	2680260	2680269	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
441	NC_017960	GAAGA	2	10	2694877	2694886	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.