MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM4

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017959	CCGTG	2	10	933	942	0 %	20 %	40 %	40 %	389875180
2	NC_017959	GGCGG	2	10	1257	1266	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017959	GCGAT	2	10	5558	5567	20 %	20 %	40 %	20 %	389875185
4	NC_017959	TCCGG	2	10	7370	7379	0 %	20 %	40 %	40 %	389875186
5	NC_017959	CGCTG	2	10	10025	10034	0 %	20 %	40 %	40 %	389875189
6	NC_017959	ATGGC	2	10	12455	12464	20 %	20 %	40 %	20 %	389875192
7	NC_017959	CGAGG	2	10	13548	13557	20 %	0 %	60 %	20 %	389875195
8	NC_017959	ATCGC	2	10	13750	13759	20 %	20 %	20 %	40 %	389875195
9	NC_017959	CGCAG	2	10	16265	16274	20 %	0 %	40 %	40 %	389875195
10	NC_017959	TGCGA	2	10	17148	17157	20 %	20 %	40 %	20 %	389875195
11	NC_017959	CGGAT	2	10	18781	18790	20 %	20 %	40 %	20 %	389875195
12	NC_017959	GGCCG	2	10	19359	19368	0 %	0 %	60 %	40 %	389875195
13	NC_017959	GAAGA	2	10	19380	19389	60 %	0 %	40 %	0 %	389875195
14	NC_017959	GGCAA	2	10	19584	19593	40 %	0 %	40 %	20 %	389875195
15	NC_017959	GCCCG	2	10	20781	20790	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_017959	GAAAG	2	10	22761	22770	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017959	ATCGC	2	10	22876	22885	20 %	20 %	20 %	40 %	389875198
18	NC_017959	CAGGG	2	10	23030	23039	20 %	0 %	60 %	20 %	389875198
19	NC_017959	AGGCG	2	10	27361	27370	20 %	0 %	60 %	20 %	389875203
20	NC_017959	GGCTG	2	10	27438	27447	0 %	20 %	60 %	20 %	389875203
21	NC_017959	GGGCC	2	10	27969	27978	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017959	TTCAT	2	10	28446	28455	20 %	60 %	0 %	20 %	389875204
23	NC_017959	TGGGG	2	10	28728	28737	0 %	20 %	80 %	0 %	389875204
24	NC_017959	GTTCC	2	10	29760	29769	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017959	GACGC	2	10	30414	30423	20 %	0 %	40 %	40 %	389875206
26	NC_017959	GGACC	2	10	31225	31234	20 %	0 %	40 %	40 %	389875207
27	NC_017959	CCGAT	2	10	32481	32490	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017959	GTGCC	2	10	33653	33662	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017959	GCCCA	2	10	34987	34996	20 %	0 %	20 %	60 %	389875211
30	NC_017959	GCGCC	2	10	35621	35630	0 %	0 %	40 %	60 %	389875211
31	NC_017959	CGCGC	2	10	36188	36197	0 %	0 %	40 %	60 %	389875212
32	NC_017959	CCCGG	2	10	38034	38043	0 %	0 %	40 %	60 %	389875214
33	NC_017959	CGCCC	2	10	38837	38846	0 %	0 %	20 %	80 %	389875215
34	NC_017959	CGGGC	2	10	39252	39261	0 %	0 %	60 %	40 %	389875215
35	NC_017959	CCGCC	2	10	39608	39617	0 %	0 %	20 %	80 %	389875215
36	NC_017959	GGCGG	2	10	41182	41191	0 %	0 %	80 %	20 %	389875216
37	NC_017959	CCGGG	2	10	42395	42404	0 %	0 %	60 %	40 %	389875217
38	NC_017959	ACCGC	2	10	43004	43013	20 %	0 %	20 %	60 %	389875218
39	NC_017959	CCGGC	2	10	43652	43661	0 %	0 %	40 %	60 %	389875219
40	NC_017959	CGTGA	2	10	44845	44854	20 %	20 %	40 %	20 %	389875220
41	NC_017959	GGCGA	2	10	46206	46215	20 %	0 %	60 %	20 %	389875222
42	NC_017959	CTGCG	2	10	47526	47535	0 %	20 %	40 %	40 %	389875224
43	NC_017959	CACCG	2	10	47667	47676	20 %	0 %	20 %	60 %	389875224
44	NC_017959	CGGGG	2	10	48534	48543	0 %	0 %	80 %	20 %	389875225
45	NC_017959	GGCGA	2	10	48657	48666	20 %	0 %	60 %	20 %	389875225
46	NC_017959	GCCGG	2	10	49199	49208	0 %	0 %	60 %	40 %	389875225
47	NC_017959	CAGAT	2	10	52046	52055	40 %	20 %	20 %	20 %	389875228
48	NC_017959	GCGCC	2	10	54389	54398	0 %	0 %	40 %	60 %	389875230
49	NC_017959	AGCGC	2	10	55260	55269	20 %	0 %	40 %	40 %	389875231
50	NC_017959	CGGGC	2	10	55416	55425	0 %	0 %	60 %	40 %	389875231
51	NC_017959	ATGCC	2	10	58622	58631	20 %	20 %	20 %	40 %	389875232
52	NC_017959	GCCAG	2	10	58961	58970	20 %	0 %	40 %	40 %	389875233
53	NC_017959	CGTCG	2	10	59066	59075	0 %	20 %	40 %	40 %	389875233
54	NC_017959	GGCGG	2	10	60630	60639	0 %	0 %	80 %	20 %	389875235
55	NC_017959	CCGGC	2	10	61700	61709	0 %	0 %	40 %	60 %	389875236
56	NC_017959	GCCCG	2	10	62348	62357	0 %	0 %	40 %	60 %	389875236
57	NC_017959	GGGGC	2	10	64229	64238	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017959	GCCGC	2	10	64570	64579	0 %	0 %	40 %	60 %	389875238
59	NC_017959	TCGGA	2	10	65698	65707	20 %	20 %	40 %	20 %	389875239
60	NC_017959	GCCAG	2	10	66257	66266	20 %	0 %	40 %	40 %	389875239
61	NC_017959	CGGCC	2	10	67533	67542	0 %	0 %	40 %	60 %	389875241
62	NC_017959	CTTCC	2	10	68274	68283	0 %	40 %	0 %	60 %	389875243
63	NC_017959	GCCGT	2	10	69020	69029	0 %	20 %	40 %	40 %	389875243
64	NC_017959	GCTTT	2	10	69799	69808	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017959	CGATG	2	10	70942	70951	20 %	20 %	40 %	20 %	389875245
66	NC_017959	CTGCG	2	10	71971	71980	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017959	GCACG	2	10	72797	72806	20 %	0 %	40 %	40 %	389875246
68	NC_017959	CTGAT	2	10	75604	75613	20 %	40 %	20 %	20 %	389875248
69	NC_017959	CCGGA	2	10	75618	75627	20 %	0 %	40 %	40 %	389875249
70	NC_017959	TTCGG	2	10	79419	79428	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017959	TCGTG	2	10	79466	79475	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017959	TGGGC	2	10	79610	79619	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017959	GCTGA	2	10	83073	83082	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017959	ATCCC	2	10	83273	83282	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_017959	ATCTC	2	10	83405	83414	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_017959	ATCTC	2	10	83544	83553	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.