MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM4

Total Repeats: 263

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017959	GCCC	2	8	164	171	0 %	0 %	25 %	75 %	389875180
2	NC_017959	GCAC	2	8	422	429	25 %	0 %	25 %	50 %	389875180
3	NC_017959	CGGG	2	8	459	466	0 %	0 %	75 %	25 %	389875180
4	NC_017959	TGCG	2	8	608	615	0 %	25 %	50 %	25 %	389875180
5	NC_017959	ATCT	2	8	685	692	25 %	50 %	0 %	25 %	389875180
6	NC_017959	GCAG	2	8	1136	1143	25 %	0 %	50 %	25 %	389875180
7	NC_017959	CCGG	2	8	1494	1501	0 %	0 %	50 %	50 %	389875181
8	NC_017959	TCGG	2	8	1936	1943	0 %	25 %	50 %	25 %	389875182
9	NC_017959	CGGT	2	8	2310	2317	0 %	25 %	50 %	25 %	389875183
10	NC_017959	GCGA	2	8	2517	2524	25 %	0 %	50 %	25 %	389875183
11	NC_017959	GGCG	2	8	2644	2651	0 %	0 %	75 %	25 %	389875183
12	NC_017959	GGTC	2	8	3617	3624	0 %	25 %	50 %	25 %	389875184
13	NC_017959	GCCA	2	8	3903	3910	25 %	0 %	25 %	50 %	389875184
14	NC_017959	GAGC	2	8	4253	4260	25 %	0 %	50 %	25 %	389875184
15	NC_017959	ATGC	2	8	4467	4474	25 %	25 %	25 %	25 %	389875184
16	NC_017959	GCAG	2	8	4761	4768	25 %	0 %	50 %	25 %	389875185
17	NC_017959	CCGG	2	8	5110	5117	0 %	0 %	50 %	50 %	389875185
18	NC_017959	GGCC	2	8	5143	5150	0 %	0 %	50 %	50 %	389875185
19	NC_017959	CGGA	2	8	5183	5190	25 %	0 %	50 %	25 %	389875185
20	NC_017959	GCCG	2	8	5783	5790	0 %	0 %	50 %	50 %	389875185
21	NC_017959	CGGC	2	8	5827	5834	0 %	0 %	50 %	50 %	389875185
22	NC_017959	GGCC	2	8	5869	5876	0 %	0 %	50 %	50 %	389875185
23	NC_017959	GGGC	2	8	6289	6296	0 %	0 %	75 %	25 %	389875185
24	NC_017959	GCCG	2	8	6569	6576	0 %	0 %	50 %	50 %	389875185
25	NC_017959	CGGC	2	8	6664	6671	0 %	0 %	50 %	50 %	389875185
26	NC_017959	TCGC	2	8	6693	6700	0 %	25 %	25 %	50 %	389875185
27	NC_017959	GGGC	2	8	7350	7357	0 %	0 %	75 %	25 %	389875186
28	NC_017959	TCGA	2	8	7654	7661	25 %	25 %	25 %	25 %	389875187
29	NC_017959	CCGG	2	8	7887	7894	0 %	0 %	50 %	50 %	389875187
30	NC_017959	GCCG	2	8	8497	8504	0 %	0 %	50 %	50 %	389875188
31	NC_017959	GCTC	2	8	8577	8584	0 %	25 %	25 %	50 %	389875188
32	NC_017959	GCCG	2	8	8770	8777	0 %	0 %	50 %	50 %	389875188
33	NC_017959	GCCG	2	8	8893	8900	0 %	0 %	50 %	50 %	389875188
34	NC_017959	CGGC	2	8	9057	9064	0 %	0 %	50 %	50 %	389875188
35	NC_017959	ACCG	2	8	9160	9167	25 %	0 %	25 %	50 %	389875188
36	NC_017959	CGGG	2	8	10061	10068	0 %	0 %	75 %	25 %	389875189
37	NC_017959	GAAG	2	8	10614	10621	50 %	0 %	50 %	0 %	389875189
38	NC_017959	CGGC	2	8	11806	11813	0 %	0 %	50 %	50 %	389875191
39	NC_017959	GCGG	2	8	12362	12369	0 %	0 %	75 %	25 %	389875192
40	NC_017959	GATC	2	8	12767	12774	25 %	25 %	25 %	25 %	389875193
41	NC_017959	GCCG	2	8	12933	12940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017959	GGAT	2	8	13152	13159	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017959	CGAT	2	8	13927	13934	25 %	25 %	25 %	25 %	389875195
44	NC_017959	ACGA	2	8	14232	14239	50 %	0 %	25 %	25 %	389875195
45	NC_017959	CGCC	2	8	14812	14819	0 %	0 %	25 %	75 %	389875195
46	NC_017959	GCGA	2	8	15255	15262	25 %	0 %	50 %	25 %	389875195
47	NC_017959	GGCG	2	8	15434	15441	0 %	0 %	75 %	25 %	389875195
48	NC_017959	TGGC	2	8	15828	15835	0 %	25 %	50 %	25 %	389875195
49	NC_017959	CGGC	2	8	15983	15990	0 %	0 %	50 %	50 %	389875195
50	NC_017959	ACCG	2	8	16413	16420	25 %	0 %	25 %	50 %	389875195
51	NC_017959	CTGG	2	8	17066	17073	0 %	25 %	50 %	25 %	389875195
52	NC_017959	TATC	2	8	17540	17547	25 %	50 %	0 %	25 %	389875195
53	NC_017959	ATTA	2	8	17682	17689	50 %	50 %	0 %	0 %	389875195
54	NC_017959	CTGG	2	8	17936	17943	0 %	25 %	50 %	25 %	389875195
55	NC_017959	TCGT	2	8	18175	18182	0 %	50 %	25 %	25 %	389875195
56	NC_017959	GGCT	2	8	18660	18667	0 %	25 %	50 %	25 %	389875195
57	NC_017959	CTAT	2	8	18913	18920	25 %	50 %	0 %	25 %	389875195
58	NC_017959	CGAG	2	8	19714	19721	25 %	0 %	50 %	25 %	389875195
59	NC_017959	TGGC	2	8	20142	20149	0 %	25 %	50 %	25 %	389875195
60	NC_017959	GCCG	2	8	20661	20668	0 %	0 %	50 %	50 %	389875195
61	NC_017959	CCGC	2	8	20848	20855	0 %	0 %	25 %	75 %	389875196
62	NC_017959	CACC	2	8	20866	20873	25 %	0 %	0 %	75 %	389875196
63	NC_017959	CCGG	2	8	21359	21366	0 %	0 %	50 %	50 %	389875196
64	NC_017959	CGGC	2	8	21889	21896	0 %	0 %	50 %	50 %	389875197
65	NC_017959	GATC	2	8	22466	22473	25 %	25 %	25 %	25 %	389875197
66	NC_017959	CGGG	2	8	23969	23976	0 %	0 %	75 %	25 %	389875200
67	NC_017959	GCCG	2	8	24654	24661	0 %	0 %	50 %	50 %	389875200
68	NC_017959	TCGA	2	8	24890	24897	25 %	25 %	25 %	25 %	389875201
69	NC_017959	GGCC	2	8	25944	25951	0 %	0 %	50 %	50 %	389875202
70	NC_017959	ATCG	2	8	26140	26147	25 %	25 %	25 %	25 %	389875202
71	NC_017959	CGGT	2	8	26399	26406	0 %	25 %	50 %	25 %	389875202
72	NC_017959	GCAG	2	8	26469	26476	25 %	0 %	50 %	25 %	389875202
73	NC_017959	CGGC	2	8	26921	26928	0 %	0 %	50 %	50 %	389875202
74	NC_017959	GCGG	2	8	26935	26942	0 %	0 %	75 %	25 %	389875202
75	NC_017959	GGCC	2	8	27175	27182	0 %	0 %	50 %	50 %	389875203
76	NC_017959	TCGC	2	8	27419	27426	0 %	25 %	25 %	50 %	389875203
77	NC_017959	CGGG	2	8	27851	27858	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017959	CGGC	2	8	28251	28258	0 %	0 %	50 %	50 %	389875204
79	NC_017959	CGGT	2	8	28264	28271	0 %	25 %	50 %	25 %	389875204
80	NC_017959	GCCA	2	8	28563	28570	25 %	0 %	25 %	50 %	389875204
81	NC_017959	TGGG	2	8	28690	28697	0 %	25 %	75 %	0 %	389875204
82	NC_017959	GCGG	2	8	28809	28816	0 %	0 %	75 %	25 %	389875204
83	NC_017959	GCGG	2	8	29013	29020	0 %	0 %	75 %	25 %	389875205
84	NC_017959	CCGG	2	8	29225	29232	0 %	0 %	50 %	50 %	389875205
85	NC_017959	GGGC	2	8	29430	29437	0 %	0 %	75 %	25 %	389875205
86	NC_017959	AGGC	2	8	29810	29817	25 %	0 %	50 %	25 %	389875206
87	NC_017959	GCCG	2	8	29876	29883	0 %	0 %	50 %	50 %	389875206
88	NC_017959	CTCG	2	8	30044	30051	0 %	25 %	25 %	50 %	389875206
89	NC_017959	CAGC	2	8	30094	30101	25 %	0 %	25 %	50 %	389875206
90	NC_017959	CCAT	2	8	30834	30841	25 %	25 %	0 %	50 %	389875207
91	NC_017959	CGGG	2	8	31367	31374	0 %	0 %	75 %	25 %	389875207
92	NC_017959	CGGG	2	8	31789	31796	0 %	0 %	75 %	25 %	389875208
93	NC_017959	CCGG	2	8	32107	32114	0 %	0 %	50 %	50 %	389875208
94	NC_017959	GCCG	2	8	32259	32266	0 %	0 %	50 %	50 %	389875208
95	NC_017959	CGAT	2	8	32359	32366	25 %	25 %	25 %	25 %	389875208
96	NC_017959	GCCG	2	8	32402	32409	0 %	0 %	50 %	50 %	389875208
97	NC_017959	CCGG	2	8	32918	32925	0 %	0 %	50 %	50 %	389875209
98	NC_017959	GCCG	2	8	33640	33647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017959	GATG	2	8	34217	34224	25 %	25 %	50 %	0 %	389875210
100	NC_017959	GCCG	2	8	34242	34249	0 %	0 %	50 %	50 %	389875210
101	NC_017959	GGGC	2	8	34502	34509	0 %	0 %	75 %	25 %	389875210
102	NC_017959	AGCG	2	8	35164	35171	25 %	0 %	50 %	25 %	389875211
103	NC_017959	GCCG	2	8	35211	35218	0 %	0 %	50 %	50 %	389875211
104	NC_017959	TCGT	2	8	35716	35723	0 %	50 %	25 %	25 %	389875211
105	NC_017959	GCCA	2	8	36581	36588	25 %	0 %	25 %	50 %	389875212
106	NC_017959	CGAG	2	8	36660	36667	25 %	0 %	50 %	25 %	389875212
107	NC_017959	CAGG	2	8	36726	36733	25 %	0 %	50 %	25 %	389875212
108	NC_017959	GCCC	2	8	36822	36829	0 %	0 %	25 %	75 %	389875212
109	NC_017959	CAGG	2	8	37317	37324	25 %	0 %	50 %	25 %	389875213
110	NC_017959	GTCC	2	8	37629	37636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017959	GGCC	2	8	37670	37677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017959	CGAC	2	8	38379	38386	25 %	0 %	25 %	50 %	389875214
113	NC_017959	CGGC	2	8	38641	38648	0 %	0 %	50 %	50 %	389875215
114	NC_017959	CGCC	2	8	38726	38733	0 %	0 %	25 %	75 %	389875215
115	NC_017959	TCCG	2	8	40350	40357	0 %	25 %	25 %	50 %	389875216
116	NC_017959	GCCG	2	8	40563	40570	0 %	0 %	50 %	50 %	389875216
117	NC_017959	CCGG	2	8	40633	40640	0 %	0 %	50 %	50 %	389875216
118	NC_017959	GGCC	2	8	40680	40687	0 %	0 %	50 %	50 %	389875216
119	NC_017959	CCGG	2	8	41013	41020	0 %	0 %	50 %	50 %	389875216
120	NC_017959	GGCC	2	8	41038	41045	0 %	0 %	50 %	50 %	389875216
121	NC_017959	GCCG	2	8	41050	41057	0 %	0 %	50 %	50 %	389875216
122	NC_017959	GCCG	2	8	41241	41248	0 %	0 %	50 %	50 %	389875216
123	NC_017959	GGCC	2	8	41685	41692	0 %	0 %	50 %	50 %	389875217
124	NC_017959	GGCG	2	8	42054	42061	0 %	0 %	75 %	25 %	389875217
125	NC_017959	GACC	2	8	42105	42112	25 %	0 %	25 %	50 %	389875217
126	NC_017959	CTGG	2	8	42372	42379	0 %	25 %	50 %	25 %	389875217
127	NC_017959	CGAT	2	8	42500	42507	25 %	25 %	25 %	25 %	389875217
128	NC_017959	CGGC	2	8	42863	42870	0 %	0 %	50 %	50 %	389875218
129	NC_017959	ACCG	2	8	42942	42949	25 %	0 %	25 %	50 %	389875218
130	NC_017959	CGGC	2	8	42986	42993	0 %	0 %	50 %	50 %	389875218
131	NC_017959	CGGC	2	8	43755	43762	0 %	0 %	50 %	50 %	389875219
132	NC_017959	CGCT	2	8	44339	44346	0 %	25 %	25 %	50 %	389875220
133	NC_017959	GCAG	2	8	44550	44557	25 %	0 %	50 %	25 %	389875220
134	NC_017959	CCGG	2	8	44718	44725	0 %	0 %	50 %	50 %	389875220
135	NC_017959	GCGG	2	8	44764	44771	0 %	0 %	75 %	25 %	389875220
136	NC_017959	TCAG	2	8	45448	45455	25 %	25 %	25 %	25 %	389875221
137	NC_017959	CGGC	2	8	46138	46145	0 %	0 %	50 %	50 %	389875222
138	NC_017959	GCCG	2	8	46223	46230	0 %	0 %	50 %	50 %	389875222
139	NC_017959	ATCG	2	8	47112	47119	25 %	25 %	25 %	25 %	389875223
140	NC_017959	GCCG	2	8	47126	47133	0 %	0 %	50 %	50 %	389875223
141	NC_017959	CGGG	2	8	47809	47816	0 %	0 %	75 %	25 %	389875224
142	NC_017959	GGCG	2	8	48027	48034	0 %	0 %	75 %	25 %	389875224
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262	NC_017959	CAGG	2	8	83743	83750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
263	NC_017959	CTTC	3	12	83812	83823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.