MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM3

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017958	ATTCA	2	10	7886	7895	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017958	ACGCC	2	10	12122	12131	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_017958	GGCGT	2	10	18599	18608	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017958	CGTCC	2	10	18709	18718	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_017958	GGCCG	2	10	18735	18744	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017958	AAGCG	2	10	18828	18837	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017958	AAGCG	2	10	24139	24148	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017958	GCCGG	2	10	25737	25746	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017958	TCTCG	2	10	27810	27819	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017958	GGCCA	2	10	36490	36499	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017958	CATGT	2	10	36541	36550	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017958	ACGGC	2	10	48167	48176	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017958	GGATG	2	10	62354	62363	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017958	GCCAG	2	10	70631	70640	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017958	GCACC	2	10	74936	74945	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_017958	CGATG	2	10	77064	77073	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017958	GCGAG	2	10	77175	77184	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017958	AGGCG	2	10	77578	77587	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017958	CACGC	2	10	82125	82134	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_017958	TCTGT	2	10	82766	82775	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017958	GGCCG	2	10	83772	83781	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017958	CCGTT	2	10	88684	88693	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017958	CAGCG	2	10	90017	90026	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017958	CCGGG	2	10	103242	103251	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017958	TCGTG	2	10	103591	103600	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017958	ATCGG	2	10	116854	116863	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017958	GTTCC	2	10	117712	117721	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017958	CGCAT	2	10	122871	122880	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017958	CCTCC	2	10	126249	126258	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
30	NC_017958	GGGCC	2	10	126329	126338	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017958	CGTGT	2	10	126369	126378	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017958	TCGCT	2	10	126417	126426	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017958	CGACG	2	10	137032	137041	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017958	GATCC	2	10	141880	141889	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017958	ATTGA	2	10	144939	144948	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017958	GGATG	2	10	146428	146437	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017958	ATGGC	2	10	151455	151464	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017958	CGGGT	2	10	155587	155596	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017958	GGGGC	2	10	156704	156713	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017958	TCGTC	2	10	157676	157685	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017958	TTCCG	2	10	182849	182858	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017958	ATGAC	2	10	187154	187163	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017958	GCCAG	2	10	203207	203216	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017958	CGCCA	2	10	206281	206290	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_017958	ATTCT	2	10	212317	212326	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017958	GCATG	2	10	214409	214418	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017958	GGCCC	2	10	225890	225899	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48	NC_017958	GGCGC	2	10	226950	226959	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_017958	ATTAA	2	10	231629	231638	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017958	TCGGG	2	10	242913	242922	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017958	CGCGG	2	10	249499	249508	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_017958	CGGGG	2	10	251664	251673	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017958	CAGGC	2	10	270910	270919	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_017958	CCATC	2	10	271322	271331	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
55	NC_017958	CACGT	2	10	276794	276803	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_017958	CCGCC	2	10	279010	279019	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
57	NC_017958	CCCGA	2	10	279058	279067	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_017958	CGCAG	2	10	291369	291378	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017958	GGGTC	2	10	297457	297466	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017958	TTTTC	2	10	301812	301821	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017958	TCTCC	2	10	306626	306635	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_017958	GCCGG	2	10	306749	306758	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017958	GGCGG	2	10	311175	311184	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017958	TCCGG	2	10	311826	311835	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017958	GCCGG	2	10	329591	329600	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017958	CCGGG	2	10	362409	362418	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017958	CGATC	2	10	385039	385048	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017958	TCATA	2	10	396369	396378	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017958	CTTGC	2	10	397407	397416	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017958	CCCGC	2	10	407006	407015	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
71	NC_017958	CGATG	2	10	414598	414607	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017958	CGTCG	2	10	416292	416301	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017958	CGGCC	2	10	416380	416389	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
74	NC_017958	GCTCG	2	10	416530	416539	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017958	ATGGC	2	10	462269	462278	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017958	GACGG	2	10	464742	464751	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017958	TGTCC	2	10	472374	472383	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017958	AGGCC	2	10	476997	477006	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017958	GGTGC	2	10	477054	477063	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017958	CGCTT	2	10	488781	488790	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017958	CCACC	2	10	504409	504418	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
82	NC_017958	TCCCC	2	10	505440	505449	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
83	NC_017958	TAAGA	2	10	514792	514801	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017958	CCCTC	2	10	523725	523734	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
85	NC_017958	GCAGA	2	10	528097	528106	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017958	TTCAG	2	10	536195	536204	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017958	ACGAA	2	10	541212	541221	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017958	GCGCC	2	10	552401	552410	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
89	NC_017958	GAGCG	2	10	556090	556099	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017958	GCGAC	2	10	571643	571652	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017958	GACAC	2	10	585399	585408	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017958	GGGCC	2	10	587493	587502	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017958	CCCGA	2	10	589156	589165	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_017958	CCGGG	2	10	597222	597231	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017958	CATCG	2	10	606091	606100	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017958	GCACC	2	10	610965	610974	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_017958	TGAGA	2	10	617660	617669	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017958	GGGAT	2	10	617793	617802	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017958	TCAGC	2	10	617993	618002	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017958	ATCTC	2	10	620820	620829	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017958	AGCCC	2	10	621455	621464	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
102	NC_017958	CACGA	2	10	621600	621609	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017958	CCGAA	2	10	621647	621656	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_017958	CCCGC	2	10	622831	622840	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
105	NC_017958	CGGAC	2	10	623229	623238	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017958	CCGGA	2	10	635383	635392	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017958	CCCTC	2	10	639603	639612	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
108	NC_017958	TGAAA	2	10	641717	641726	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017958	GGCCC	2	10	644075	644084	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
110	NC_017958	TCAAC	2	10	654489	654498	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_017958	CCCGG	2	10	659685	659694	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
112	NC_017958	CCCGC	2	10	660124	660133	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
113	NC_017958	CGCCC	2	10	669495	669504	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
114	NC_017958	GCACC	2	10	674775	674784	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_017958	CAGAC	2	10	729404	729413	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017958	TCCGT	2	10	730635	730644	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_017958	GCGTC	2	10	732664	732673	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017958	CGCAT	2	10	734337	734346	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017958	GCCGC	2	10	739120	739129	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
120	NC_017958	GCTGC	2	10	757947	757956	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017958	CGTTT	2	10	772331	772340	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017958	ATGGC	2	10	781660	781669	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017958	TTTCG	2	10	790020	790029	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017958	TGACC	2	10	798364	798373	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017958	GGACG	2	10	804727	804736	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017958	CATCA	2	10	821038	821047	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017958	GCCGC	2	10	838886	838895	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
128	NC_017958	CGGGC	2	10	839400	839409	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017958	CTCCG	2	10	847398	847407	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_017958	GCGAC	2	10	870035	870044	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017958	GACCC	2	10	882165	882174	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_017958	TCCGG	2	10	904859	904868	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_017958	CGGTG	2	10	917145	917154	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017958	CGGGC	2	10	922606	922615	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_017958	ACGGC	2	10	925247	925256	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_017958	CCTGC	2	10	930611	930620	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_017958	TCTCC	2	10	934479	934488	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
138	NC_017958	GCCCG	2	10	940474	940483	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
139	NC_017958	GATGC	2	10	943522	943531	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017958	CCGCG	2	10	952998	953007	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
141	NC_017958	CGGCA	2	10	954366	954375	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017958	CGCCC	2	10	956950	956959	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
143	NC_017958	CCAGT	2	10	967797	967806	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017958	CGATC	2	10	980277	980286	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017958	CTCCC	2	10	982920	982929	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
146	NC_017958	GCCCT	2	10	988114	988123	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
147	NC_017958	CGCAG	2	10	1004956	1004965	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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164	NC_017958	TCCCG	2	10	1117678	1117687	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
165	NC_017958	AAACC	2	10	1118674	1118683	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
166	NC_017958	GACGG	2	10	1118998	1119007	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
167	NC_017958	CGTGT	2	10	1119023	1119032	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.