MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM1

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017957	ATCCG	2	10	15421	15430	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017957	CAGAG	2	10	23277	23286	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017957	GGGCC	2	10	29575	29584	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017957	GACCG	2	10	31264	31273	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017957	TTATT	2	10	31363	31372	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017957	GGGCC	2	10	49340	49349	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017957	TCCCG	2	10	51424	51433	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_017957	GGGTC	2	10	54366	54375	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017957	CCCGG	2	10	58185	58194	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_017957	GCGCG	2	10	98451	98460	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017957	GCCTG	2	10	110418	110427	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017957	GCCCG	2	10	113884	113893	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_017957	GCCGG	2	10	122289	122298	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017957	CCGCC	2	10	133711	133720	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15	NC_017957	GCTGT	2	10	146202	146211	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017957	CAGGC	2	10	149731	149740	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017957	CAGGC	2	10	149748	149757	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017957	CCGGG	2	10	153783	153792	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017957	CCCTT	2	10	153893	153902	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_017957	CCCGC	2	10	153903	153912	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
21	NC_017957	CCCGG	2	10	154196	154205	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_017957	GGGGC	2	10	155177	155186	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017957	GTCGG	2	10	155279	155288	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017957	AGGGG	2	10	155304	155313	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017957	CAGGG	2	10	155597	155606	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017957	GACAC	2	10	157590	157599	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017957	GCGCG	2	10	158224	158233	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017957	GAGAC	2	10	172958	172967	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017957	TGCAA	2	10	187718	187727	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017957	AGGAC	2	10	188772	188781	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017957	CCCGT	2	10	194827	194836	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_017957	TCCCG	2	10	195415	195424	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_017957	ACCGG	2	10	201096	201105	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017957	GGGCA	2	10	204719	204728	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017957	CCGTG	2	10	209428	209437	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017957	GGGAG	2	10	220690	220699	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017957	GGGGT	2	10	220725	220734	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017957	GATCC	2	10	230681	230690	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017957	CTCGC	2	10	248007	248016	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_017957	GGAGT	2	10	300886	300895	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017957	GGCCG	2	10	309570	309579	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017957	ACCTG	2	10	320835	320844	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_017957	ACCTG	2	10	320850	320859	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017957	CGTCA	2	10	322523	322532	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017957	CCCCG	2	10	340712	340721	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
46	NC_017957	GGGTC	2	10	348092	348101	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017957	GGCGG	2	10	370868	370877	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017957	ATTTT	2	10	372421	372430	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017957	CGGGC	2	10	382449	382458	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017957	ATGAG	2	10	386614	386623	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017957	GGAGC	2	10	412251	412260	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017957	GGGCA	2	10	420489	420498	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017957	CGGGG	2	10	422241	422250	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017957	CGCGC	2	10	423389	423398	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_017957	GCGCC	2	10	435012	435021	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_017957	CGGGA	2	10	445925	445934	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017957	ATCAT	2	10	478347	478356	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017957	GGCCG	2	10	491597	491606	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017957	GCCGG	2	10	493587	493596	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017957	CGCCC	2	10	502525	502534	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
61	NC_017957	GTGAC	2	10	504247	504256	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017957	GGTGG	2	10	510610	510619	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017957	GCCGG	2	10	510985	510994	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017957	GATCC	2	10	539721	539730	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017957	TCCGG	2	10	553858	553867	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017957	GGCCG	2	10	573886	573895	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017957	GACCG	2	10	573899	573908	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017957	CGGCC	2	10	585911	585920	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_017957	CTGCT	2	10	587779	587788	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017957	CGGGA	2	10	590442	590451	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017957	AAACA	2	10	603071	603080	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017957	GAGGG	2	10	605843	605852	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017957	TGCAG	2	10	612949	612958	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017957	GCGCC	2	10	615840	615849	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_017957	CGGCA	2	10	625517	625526	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_017957	CCGGA	2	10	625582	625591	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017957	GACCG	2	10	625691	625700	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017957	CTCGT	2	10	644503	644512	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017957	GCGGG	2	10	658714	658723	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017957	GGCCA	2	10	662439	662448	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017957	GGCGG	2	10	675121	675130	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017957	GGCCG	2	10	675134	675143	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_017957	ACTCT	2	10	676685	676694	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.