MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/SW5

Total Repeats: 12690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017953	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389859449
2	NC_017953	TAA	3	9	93	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389859449
3	NC_017953	GTA	2	6	137	142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859449
4	NC_017953	AGT	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859449
5	NC_017953	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389859449
6	NC_017953	AGT	2	6	364	369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859449
7	NC_017953	GTG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389859449
8	NC_017953	CAG	2	6	416	421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859449
9	NC_017953	GCC	2	6	604	609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389859449
10	NC_017953	TGC	2	6	663	668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859449
11	NC_017953	ATT	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389859449
12	NC_017953	CGA	2	6	697	702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859449
13	NC_017953	TAT	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389859449
14	NC_017953	GAA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859449
15	NC_017953	AGA	2	6	915	920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859449
16	NC_017953	AGA	2	6	969	974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859449
17	NC_017953	CAA	2	6	1042	1047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389859449
18	NC_017953	TTG	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389859449
19	NC_017953	CTC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389859449
20	NC_017953	GAT	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859449
21	NC_017953	GAT	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859449
22	NC_017953	ATG	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859449
23	NC_017953	CCT	2	6	1552	1557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389859449
24	NC_017953	CTT	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389859449
25	NC_017953	CAG	2	6	1678	1683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859449
26	NC_017953	TGA	2	6	1739	1744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859449
27	NC_017953	ATG	2	6	1936	1941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859450
28	NC_017953	GTG	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389859450
29	NC_017953	TCC	2	6	1951	1956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389859450
30	NC_017953	AGC	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859450
31	NC_017953	AGC	2	6	1992	1997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859450
32	NC_017953	AAG	2	6	2003	2008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859450
33	NC_017953	TAC	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389859450
34	NC_017953	GCT	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859450
35	NC_017953	AAC	2	6	2149	2154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389859450
36	NC_017953	AGA	2	6	2161	2166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859450
37	NC_017953	AGA	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859451
38	NC_017953	ATC	2	6	2424	2429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389859451
39	NC_017953	TGC	2	6	2444	2449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859451
40	NC_017953	CAT	2	6	2568	2573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389859451
41	NC_017953	AGA	2	6	2597	2602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859451
42	NC_017953	AAG	2	6	2626	2631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859451
43	NC_017953	GGA	2	6	2661	2666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389859451
44	NC_017953	ATC	2	6	2790	2795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389859452
45	NC_017953	ATA	2	6	2940	2945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389859452
46	NC_017953	AAC	2	6	2965	2970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389859452
47	NC_017953	GGT	2	6	3019	3024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389859452
48	NC_017953	AAT	2	6	3125	3130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389859452
49	NC_017953	TTC	2	6	3160	3165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389859452
50	NC_017953	GCA	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859452
51	NC_017953	GGA	2	6	3227	3232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389859452
52	NC_017953	CAG	2	6	3246	3251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859452
53	NC_017953	GTT	2	6	3263	3268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389859452
54	NC_017953	GGT	2	6	3355	3360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389859452
55	NC_017953	AAG	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859452
56	NC_017953	ATT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389859452
57	NC_017953	TTG	2	6	3627	3632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389859452
58	NC_017953	AAG	2	6	3738	3743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859452
59	NC_017953	AAG	2	6	3753	3758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859452
60	NC_017953	CAG	2	6	3795	3800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859452
61	NC_017953	GCT	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859452
62	NC_017953	AAG	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859452
63	NC_017953	CAG	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859452
64	NC_017953	GGA	2	6	4169	4174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389859452
65	NC_017953	AAT	2	6	4179	4184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389859452
66	NC_017953	ATT	2	6	4259	4264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389859453
67	NC_017953	TGA	2	6	4289	4294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859453
68	NC_017953	GTA	2	6	4521	4526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859453
69	NC_017953	AGA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859453
70	NC_017953	GAA	2	6	4752	4757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859453
71	NC_017953	CGT	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859453
72	NC_017953	GTT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389859453
73	NC_017953	TGA	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859453
74	NC_017953	TTG	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389859453
75	NC_017953	TTC	2	6	5308	5313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389859453
76	NC_017953	TCT	2	6	5400	5405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389859453
77	NC_017953	AGA	2	6	5420	5425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859453
78	NC_017953	GTT	2	6	5447	5452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389859453
79	NC_017953	GGT	2	6	5495	5500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389859453
80	NC_017953	CTC	2	6	5599	5604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389859453
81	NC_017953	AGC	2	6	5630	5635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859453
82	NC_017953	ATT	2	6	5747	5752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389859454
83	NC_017953	TCT	2	6	5765	5770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389859454
84	NC_017953	GCT	2	6	5811	5816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859454
85	NC_017953	GAT	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859454
86	NC_017953	ACG	2	6	5884	5889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859454
87	NC_017953	GAA	2	6	5908	5913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859454
88	NC_017953	AGA	3	9	5985	5993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859454
89	NC_017953	GCT	2	6	5994	5999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859454
90	NC_017953	AGA	2	6	6003	6008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859454
91	NC_017953	TGG	2	6	6039	6044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389859454
92	NC_017953	AGA	3	9	6057	6065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859454
93	NC_017953	GGA	2	6	6066	6071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389859454
94	NC_017953	TCA	2	6	6251	6256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389859454
95	NC_017953	GGA	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389859454
96	NC_017953	CTT	2	6	6348	6353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389859454
97	NC_017953	CTG	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859454
98	NC_017953	CAG	2	6	6509	6514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859454
99	NC_017953	GCA	2	6	6547	6552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859454
100	NC_017953	AGG	2	6	7038	7043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389859455
101	NC_017953	GAA	2	6	7082	7087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859455
102	NC_017953	GCA	2	6	7346	7351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859455
103	NC_017953	AAG	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859455
104	NC_017953	TGC	2	6	7420	7425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859455
105	NC_017953	TCG	2	6	7914	7919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859456
106	NC_017953	TCC	2	6	7957	7962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389859456
107	NC_017953	GTT	2	6	8065	8070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389859456
108	NC_017953	TTA	2	6	8435	8440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389859456
109	NC_017953	TTC	2	6	8758	8763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389859456
110	NC_017953	GAA	2	6	8902	8907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859457
111	NC_017953	ACC	2	6	9030	9035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389859457
112	NC_017953	CTT	2	6	9083	9088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389859457
113	NC_017953	GAG	2	6	9163	9168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389859457
114	NC_017953	ATA	2	6	9180	9185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389859457
115	NC_017953	AGG	2	6	9204	9209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389859457
116	NC_017953	GAA	2	6	9384	9389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859457
117	NC_017953	CAG	2	6	9400	9405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859457
118	NC_017953	TGT	2	6	9471	9476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389859457
119	NC_017953	GAG	2	6	9486	9491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389859457
120	NC_017953	TAC	2	6	9554	9559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389859457
121	NC_017953	GTT	2	6	9658	9663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389859457
122	NC_017953	AAG	2	6	9682	9687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859457
123	NC_017953	GAG	2	6	9708	9713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389859457
124	NC_017953	TTA	2	6	9998	10003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389859458
125	NC_017953	AGA	2	6	10033	10038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859458
126	NC_017953	TGC	2	6	10263	10268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859458
127	NC_017953	GAA	2	6	10290	10295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859458
128	NC_017953	TCG	2	6	10350	10355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859458
129	NC_017953	TGG	2	6	10373	10378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389859458
130	NC_017953	GTA	2	6	10424	10429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859459
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