MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/SW5

Total Repeats: 386

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017953	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017953	GA	3	6	7596	7601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017953	AG	3	6	9951	9956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017953	TA	3	6	11849	11854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017953	TA	3	6	13940	13945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017953	TA	4	8	14164	14171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017953	AG	3	6	18116	18121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017953	GA	3	6	18129	18134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017953	CT	3	6	19051	19056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017953	AG	3	6	21117	21122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017953	GA	3	6	21275	21280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017953	AG	3	6	21792	21797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017953	CT	3	6	21861	21866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017953	GA	3	6	27113	27118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017953	CT	3	6	27120	27125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017953	TC	3	6	28488	28493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017953	AG	3	6	28571	28576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017953	GA	3	6	36985	36990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017953	AT	3	6	37087	37092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017953	CT	3	6	39354	39359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017953	CT	3	6	40725	40730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017953	AG	3	6	42851	42856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017953	CT	3	6	42917	42922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017953	GA	5	10	43192	43201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017953	AG	3	6	43316	43321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017953	TC	3	6	44408	44413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017953	AG	3	6	48644	48649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017953	TG	4	8	51992	51999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017953	GA	3	6	56208	56213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017953	GA	3	6	61356	61361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017953	AG	4	8	65375	65382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017953	TA	3	6	85804	85809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017953	GA	3	6	91157	91162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017953	CT	3	6	93507	93512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017953	GA	3	6	94035	94040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017953	TA	3	6	94651	94656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017953	CT	3	6	95639	95644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017953	CT	3	6	95821	95826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017953	GA	3	6	96048	96053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017953	GA	3	6	96230	96235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017953	GA	3	6	96598	96603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017953	TC	3	6	100540	100545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017953	AT	3	6	100591	100596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017953	TA	3	6	107267	107272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017953	TG	3	6	116509	116514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017953	CA	3	6	118427	118432	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017953	AG	4	8	119095	119102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017953	GA	3	6	120917	120922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017953	TA	3	6	123152	123157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017953	GT	3	6	124141	124146	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017953	CT	3	6	128677	128682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017953	TC	3	6	130999	131004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017953	AG	3	6	131076	131081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017953	AG	3	6	131101	131106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017953	TG	3	6	133908	133913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017953	AG	3	6	138763	138768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017953	GA	3	6	138826	138831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017953	AT	3	6	143058	143063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017953	AG	3	6	157863	157868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017953	TC	3	6	172326	172331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017953	AG	3	6	172458	172463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017953	CT	3	6	172476	172481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017953	TG	3	6	178967	178972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017953	CT	3	6	183101	183106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017953	GA	4	8	183143	183150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017953	GA	3	6	183347	183352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017953	GA	3	6	183661	183666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017953	GA	3	6	183764	183769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017953	TC	3	6	184171	184176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017953	GA	3	6	184403	184408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017953	TC	3	6	192518	192523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017953	AT	3	6	192860	192865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017953	TC	3	6	196705	196710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017953	AG	3	6	197330	197335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017953	TC	3	6	200321	200326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017953	AG	3	6	202153	202158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017953	CT	3	6	202165	202170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017953	CT	3	6	204079	204084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017953	GA	4	8	207138	207145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017953	CT	4	8	207186	207193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017953	AG	4	8	218422	218429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017953	CA	3	6	218481	218486	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017953	TA	3	6	219976	219981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017953	CT	3	6	221618	221623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017953	TC	3	6	224619	224624	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017953	AG	3	6	224650	224655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017953	TC	3	6	238846	238851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017953	AG	3	6	238872	238877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017953	CA	3	6	243796	243801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017953	GT	3	6	244013	244018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017953	GA	3	6	250880	250885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017953	TG	3	6	250990	250995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017953	AG	3	6	251792	251797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017953	AG	3	6	251817	251822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017953	AG	3	6	252800	252805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017953	TA	3	6	254606	254611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017953	TC	3	6	256922	256927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017953	AG	3	6	258400	258405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017953	TA	3	6	264760	264765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017953	CA	3	6	266567	266572	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017953	TC	3	6	268467	268472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017953	TA	3	6	274020	274025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017953	AT	4	8	284580	284587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017953	CT	3	6	285432	285437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017953	TC	4	8	285523	285530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017953	TC	3	6	287214	287219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017953	TC	3	6	287271	287276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017953	CT	3	6	287744	287749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017953	CA	3	6	302089	302094	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017953	AC	3	6	302130	302135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017953	GA	3	6	306820	306825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017953	AG	3	6	316040	316045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017953	CT	3	6	348018	348023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017953	CT	3	6	351089	351094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017953	TC	3	6	355315	355320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017953	CT	3	6	359231	359236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017953	AC	3	6	362564	362569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017953	GA	3	6	364474	364479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017953	TC	3	6	364552	364557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017953	TA	3	6	364754	364759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017953	GC	3	6	366283	366288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017953	TC	3	6	366587	366592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017953	TA	3	6	366657	366662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017953	AC	3	6	367369	367374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017953	CT	4	8	367541	367548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017953	CT	3	6	367774	367779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017953	CA	3	6	367783	367788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017953	GT	3	6	368101	368106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017953	CT	4	8	381871	381878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017953	GA	3	6	386579	386584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017953	CG	3	6	391710	391715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017953	CA	3	6	392760	392765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017953	TC	3	6	395307	395312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017953	CT	3	6	395797	395802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017953	GA	3	6	395927	395932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017953	GA	3	6	396058	396063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017953	CT	3	6	410163	410168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017953	CT	3	6	411150	411155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017953	CT	3	6	411947	411952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017953	CT	3	6	429878	429883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017953	CT	3	6	430901	430906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017953	AG	3	6	431248	431253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017953	GA	3	6	432943	432948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017953	AC	3	6	436941	436946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017953	CT	3	6	441212	441217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017953	AC	3	6	441250	441255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017953	CA	3	6	443719	443724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017953	CT	3	6	445119	445124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017953	CT	3	6	454401	454406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017953	CT	3	6	456854	456859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017953	AG	3	6	460542	460547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017953	TC	3	6	467080	467085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017953	AT	3	6	467149	467154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017953	GA	4	8	468523	468530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.