MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SW3

Total Repeats: 2494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017952	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	389858572
2	NC_017952	AGTG	2	8	547	554	25 %	25 %	50 %	0 %	389858572
3	NC_017952	TGGC	2	8	581	588	0 %	25 %	50 %	25 %	389858572
4	NC_017952	AATG	2	8	1066	1073	50 %	25 %	25 %	0 %	389858572
5	NC_017952	CTAT	2	8	1400	1407	25 %	50 %	0 %	25 %	389858572
6	NC_017952	AGTA	2	8	2089	2096	50 %	25 %	25 %	0 %	389858573
7	NC_017952	ATGA	2	8	2493	2500	50 %	25 %	25 %	0 %	389858574
8	NC_017952	GATA	2	8	2531	2538	50 %	25 %	25 %	0 %	389858574
9	NC_017952	TTTC	2	8	2828	2835	0 %	75 %	0 %	25 %	389858575
10	NC_017952	CATG	2	8	3709	3716	25 %	25 %	25 %	25 %	389858575
11	NC_017952	TTCC	2	8	4014	4021	0 %	50 %	0 %	50 %	389858575
12	NC_017952	TTTA	2	8	4412	4419	25 %	75 %	0 %	0 %	389858576
13	NC_017952	ATCC	2	8	4712	4719	25 %	25 %	0 %	50 %	389858576
14	NC_017952	GACG	2	8	5459	5466	25 %	0 %	50 %	25 %	389858576
15	NC_017952	TTGG	2	8	5562	5569	0 %	50 %	50 %	0 %	389858576
16	NC_017952	TGGA	2	8	5923	5930	25 %	25 %	50 %	0 %	389858577
17	NC_017952	CTTT	2	8	6300	6307	0 %	75 %	0 %	25 %	389858577
18	NC_017952	GGGA	2	8	6815	6822	25 %	0 %	75 %	0 %	389858577
19	NC_017952	GGTG	2	8	7118	7125	0 %	25 %	75 %	0 %	389858578
20	NC_017952	AAAT	2	8	7184	7191	75 %	25 %	0 %	0 %	389858578
21	NC_017952	AAGC	2	8	8421	8428	50 %	0 %	25 %	25 %	389858579
22	NC_017952	ATTG	2	8	8819	8826	25 %	50 %	25 %	0 %	389858580
23	NC_017952	AGCG	2	8	9286	9293	25 %	0 %	50 %	25 %	389858580
24	NC_017952	AAAG	2	8	9307	9314	75 %	0 %	25 %	0 %	389858580
25	NC_017952	CTTT	2	8	9647	9654	0 %	75 %	0 %	25 %	389858580
26	NC_017952	TTCG	2	8	10019	10026	0 %	50 %	25 %	25 %	389858581
27	NC_017952	AATT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	389858581
28	NC_017952	ATGG	2	8	10183	10190	25 %	25 %	50 %	0 %	389858581
29	NC_017952	CTTT	2	8	10808	10815	0 %	75 %	0 %	25 %	389858582
30	NC_017952	GCAA	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	389858582
31	NC_017952	AGCC	2	8	11255	11262	25 %	0 %	25 %	50 %	389858582
32	NC_017952	GAAA	2	8	11398	11405	75 %	0 %	25 %	0 %	389858582
33	NC_017952	GTTT	2	8	13163	13170	0 %	75 %	25 %	0 %	389858583
34	NC_017952	ATGC	2	8	13593	13600	25 %	25 %	25 %	25 %	389858583
35	NC_017952	TTGT	2	8	14629	14636	0 %	75 %	25 %	0 %	389858584
36	NC_017952	TTCT	2	8	14800	14807	0 %	75 %	0 %	25 %	389858584
37	NC_017952	ATTT	2	8	15006	15013	25 %	75 %	0 %	0 %	389858584
38	NC_017952	TTTC	2	8	15668	15675	0 %	75 %	0 %	25 %	389858585
39	NC_017952	AAAT	2	8	16150	16157	75 %	25 %	0 %	0 %	389858585
40	NC_017952	GTAA	2	8	16992	16999	50 %	25 %	25 %	0 %	389858586
41	NC_017952	CTAA	2	8	17185	17192	50 %	25 %	0 %	25 %	389858586
42	NC_017952	AGAA	2	8	17448	17455	75 %	0 %	25 %	0 %	389858586
43	NC_017952	ATTT	2	8	17594	17601	25 %	75 %	0 %	0 %	389858586
44	NC_017952	CTTT	2	8	19155	19162	0 %	75 %	0 %	25 %	389858588
45	NC_017952	GAAG	2	8	20100	20107	50 %	0 %	50 %	0 %	389858588
46	NC_017952	TTTG	2	8	20126	20133	0 %	75 %	25 %	0 %	389858588
47	NC_017952	TGTA	2	8	20818	20825	25 %	50 %	25 %	0 %	389858589
48	NC_017952	TGGG	2	8	22236	22243	0 %	25 %	75 %	0 %	389858590
49	NC_017952	CATT	2	8	23293	23300	25 %	50 %	0 %	25 %	389858590
50	NC_017952	GCTT	2	8	23636	23643	0 %	50 %	25 %	25 %	389858590
51	NC_017952	GGTT	2	8	23684	23691	0 %	50 %	50 %	0 %	389858590
52	NC_017952	TTCT	2	8	24054	24061	0 %	75 %	0 %	25 %	389858590
53	NC_017952	TAAC	2	8	24156	24163	50 %	25 %	0 %	25 %	389858590
54	NC_017952	CATT	2	8	24279	24286	25 %	50 %	0 %	25 %	389858590
55	NC_017952	GGTA	2	8	24649	24656	25 %	25 %	50 %	0 %	389858590
56	NC_017952	TTGA	2	8	25644	25651	25 %	50 %	25 %	0 %	389858591
57	NC_017952	TTCG	2	8	25789	25796	0 %	50 %	25 %	25 %	389858591
58	NC_017952	TAGG	2	8	25868	25875	25 %	25 %	50 %	0 %	389858591
59	NC_017952	TTCC	2	8	25992	25999	0 %	50 %	0 %	50 %	389858591
60	NC_017952	TAGG	2	8	26106	26113	25 %	25 %	50 %	0 %	389858591
61	NC_017952	TTTC	2	8	26541	26548	0 %	75 %	0 %	25 %	389858591
62	NC_017952	GCTT	2	8	26878	26885	0 %	50 %	25 %	25 %	389858591
63	NC_017952	GGAA	2	8	27461	27468	50 %	0 %	50 %	0 %	389858592
64	NC_017952	TTAA	2	8	27534	27541	50 %	50 %	0 %	0 %	389858592
65	NC_017952	AAAG	2	8	27584	27591	75 %	0 %	25 %	0 %	389858592
66	NC_017952	GGGC	2	8	27864	27871	0 %	0 %	75 %	25 %	389858592
67	NC_017952	GTTT	2	8	28147	28154	0 %	75 %	25 %	0 %	389858593
68	NC_017952	CAGA	2	8	28169	28176	50 %	0 %	25 %	25 %	389858593
69	NC_017952	CTTT	2	8	30141	30148	0 %	75 %	0 %	25 %	389858595
70	NC_017952	TTTG	2	8	30156	30163	0 %	75 %	25 %	0 %	389858595
71	NC_017952	TTGT	2	8	30191	30198	0 %	75 %	25 %	0 %	389858595
72	NC_017952	TGGC	2	8	30354	30361	0 %	25 %	50 %	25 %	389858595
73	NC_017952	AAAG	2	8	30914	30921	75 %	0 %	25 %	0 %	389858596
74	NC_017952	AAAC	2	8	30984	30991	75 %	0 %	0 %	25 %	389858596
75	NC_017952	GATG	2	8	31127	31134	25 %	25 %	50 %	0 %	389858596
76	NC_017952	GATA	2	8	32236	32243	50 %	25 %	25 %	0 %	389858598
77	NC_017952	TGAT	2	8	34731	34738	25 %	50 %	25 %	0 %	389858601
78	NC_017952	AAGA	3	12	34859	34870	75 %	0 %	25 %	0 %	389858601
79	NC_017952	AAGC	2	8	35079	35086	50 %	0 %	25 %	25 %	389858602
80	NC_017952	GTTC	2	8	35112	35119	0 %	50 %	25 %	25 %	389858602
81	NC_017952	GGCA	2	8	35491	35498	25 %	0 %	50 %	25 %	389858603
82	NC_017952	TCGA	2	8	35748	35755	25 %	25 %	25 %	25 %	389858603
83	NC_017952	TGCT	2	8	35901	35908	0 %	50 %	25 %	25 %	389858603
84	NC_017952	TTGG	2	8	36133	36140	0 %	50 %	50 %	0 %	389858603
85	NC_017952	AGAT	2	8	36853	36860	50 %	25 %	25 %	0 %	389858603
86	NC_017952	CTTT	2	8	37226	37233	0 %	75 %	0 %	25 %	389858604
87	NC_017952	ATGA	2	8	37716	37723	50 %	25 %	25 %	0 %	389858604
88	NC_017952	TAGG	2	8	37875	37882	25 %	25 %	50 %	0 %	389858604
89	NC_017952	CAAT	2	8	38059	38066	50 %	25 %	0 %	25 %	389858604
90	NC_017952	AATG	2	8	38846	38853	50 %	25 %	25 %	0 %	389858604
91	NC_017952	AGAA	2	8	39683	39690	75 %	0 %	25 %	0 %	389858605
92	NC_017952	AAGA	2	8	39735	39742	75 %	0 %	25 %	0 %	389858605
93	NC_017952	ATCC	2	8	39743	39750	25 %	25 %	0 %	50 %	389858605
94	NC_017952	TAAT	2	8	39954	39961	50 %	50 %	0 %	0 %	389858605
95	NC_017952	GTGC	2	8	42042	42049	0 %	25 %	50 %	25 %	389858607
96	NC_017952	AGAA	2	8	42461	42468	75 %	0 %	25 %	0 %	389858607
97	NC_017952	GGAT	2	8	42613	42620	25 %	25 %	50 %	0 %	389858607
98	NC_017952	AAAC	2	8	43821	43828	75 %	0 %	0 %	25 %	389858609
99	NC_017952	CAAT	2	8	44025	44032	50 %	25 %	0 %	25 %	389858609
100	NC_017952	ATTT	2	8	44782	44789	25 %	75 %	0 %	0 %	389858611
101	NC_017952	GCTC	2	8	45090	45097	0 %	25 %	25 %	50 %	389858611
102	NC_017952	TTCT	2	8	45232	45239	0 %	75 %	0 %	25 %	389858611
103	NC_017952	TTGA	2	8	45832	45839	25 %	50 %	25 %	0 %	389858612
104	NC_017952	TGTT	2	8	46004	46011	0 %	75 %	25 %	0 %	389858612
105	NC_017952	CTAT	2	8	46034	46041	25 %	50 %	0 %	25 %	389858612
106	NC_017952	TGTT	2	8	46063	46070	0 %	75 %	25 %	0 %	389858612
107	NC_017952	CTAT	2	8	46359	46366	25 %	50 %	0 %	25 %	389858612
108	NC_017952	AAGA	2	8	46855	46862	75 %	0 %	25 %	0 %	389858613
109	NC_017952	AAGA	2	8	46912	46919	75 %	0 %	25 %	0 %	389858613
110	NC_017952	AAAG	2	8	46952	46959	75 %	0 %	25 %	0 %	389858613
111	NC_017952	AAGA	2	8	47067	47074	75 %	0 %	25 %	0 %	389858613
112	NC_017952	ACTT	2	8	47328	47335	25 %	50 %	0 %	25 %	389858613
113	NC_017952	ATGG	2	8	47954	47961	25 %	25 %	50 %	0 %	389858613
114	NC_017952	AGGA	2	8	47985	47992	50 %	0 %	50 %	0 %	389858613
115	NC_017952	GAAC	2	8	48532	48539	50 %	0 %	25 %	25 %	389858613
116	NC_017952	AACA	2	8	48776	48783	75 %	0 %	0 %	25 %	389858614
117	NC_017952	CTTT	2	8	48972	48979	0 %	75 %	0 %	25 %	389858614
118	NC_017952	CTTT	2	8	49857	49864	0 %	75 %	0 %	25 %	389858615
119	NC_017952	GTAG	2	8	49875	49882	25 %	25 %	50 %	0 %	389858615
120	NC_017952	GAAG	2	8	51303	51310	50 %	0 %	50 %	0 %	389858616
121	NC_017952	TTCA	2	8	51725	51732	25 %	50 %	0 %	25 %	389858616
122	NC_017952	TCTA	2	8	51942	51949	25 %	50 %	0 %	25 %	389858616
123	NC_017952	GGAA	2	8	53107	53114	50 %	0 %	50 %	0 %	389858618
124	NC_017952	TTAA	2	8	53848	53855	50 %	50 %	0 %	0 %	389858618
125	NC_017952	CCTT	2	8	54055	54062	0 %	50 %	0 %	50 %	389858619
126	NC_017952	TTTA	2	8	54222	54229	25 %	75 %	0 %	0 %	389858619
127	NC_017952	AAAG	2	8	54446	54453	75 %	0 %	25 %	0 %	389858619
128	NC_017952	GATT	2	8	54583	54590	25 %	50 %	25 %	0 %	389858619
129	NC_017952	AATC	2	8	54638	54645	50 %	25 %	0 %	25 %	389858619
130	NC_017952	GGAT	2	8	54931	54938	25 %	25 %	50 %	0 %	389858620
131	NC_017952	TCGA	2	8	55093	55100	25 %	25 %	25 %	25 %	389858620
132	NC_017952	CTTC	2	8	55187	55194	0 %	50 %	0 %	50 %	389858620
133	NC_017952	GAAT	2	8	55222	55229	50 %	25 %	25 %	0 %	389858620
134	NC_017952	TTGA	2	8	55292	55299	25 %	50 %	25 %	0 %	389858620
135	NC_017952	GGAA	2	8	55648	55655	50 %	0 %	50 %	0 %	389858620
136	NC_017952	CTGG	3	12	56559	56570	0 %	25 %	50 %	25 %	389858621
137	NC_017952	TTGC	2	8	56696	56703	0 %	50 %	25 %	25 %	389858621
138	NC_017952	AGCT	2	8	57195	57202	25 %	25 %	25 %	25 %	389858621
139	NC_017952	GGTT	2	8	57898	57905	0 %	50 %	50 %	0 %	389858621
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