MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SW3

Total Repeats: 12709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017952	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389858572
2	NC_017952	TAA	3	9	93	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389858572
3	NC_017952	GTA	2	6	137	142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858572
4	NC_017952	AGT	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858572
5	NC_017952	AAG	2	6	324	329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858572
6	NC_017952	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389858572
7	NC_017952	AGT	2	6	364	369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858572
8	NC_017952	GTG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389858572
9	NC_017952	CAG	2	6	416	421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858572
10	NC_017952	GCC	2	6	604	609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389858572
11	NC_017952	TGC	2	6	663	668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858572
12	NC_017952	ATT	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389858572
13	NC_017952	CGA	2	6	697	702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858572
14	NC_017952	TAT	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389858572
15	NC_017952	GAA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858572
16	NC_017952	AGA	2	6	915	920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858572
17	NC_017952	AGA	2	6	969	974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858572
18	NC_017952	CAA	2	6	1042	1047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389858572
19	NC_017952	TTG	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858572
20	NC_017952	CTC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389858572
21	NC_017952	GAT	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858572
22	NC_017952	GAT	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858572
23	NC_017952	ATG	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858572
24	NC_017952	CCT	2	6	1552	1557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389858572
25	NC_017952	CTT	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858572
26	NC_017952	CAG	2	6	1678	1683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858572
27	NC_017952	TGA	2	6	1739	1744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858572
28	NC_017952	ATG	2	6	1936	1941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858573
29	NC_017952	GTG	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389858573
30	NC_017952	TCC	2	6	1951	1956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389858573
31	NC_017952	AGC	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858573
32	NC_017952	AGC	2	6	1992	1997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858573
33	NC_017952	AAG	2	6	2003	2008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858573
34	NC_017952	TAC	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389858573
35	NC_017952	GCT	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858573
36	NC_017952	AAC	2	6	2149	2154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389858573
37	NC_017952	AGA	2	6	2161	2166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858573
38	NC_017952	AGA	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858574
39	NC_017952	ATC	2	6	2424	2429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389858574
40	NC_017952	TGC	2	6	2444	2449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858574
41	NC_017952	CAT	2	6	2568	2573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389858574
42	NC_017952	AGA	2	6	2597	2602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858574
43	NC_017952	AAG	2	6	2626	2631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858574
44	NC_017952	GGA	2	6	2661	2666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389858574
45	NC_017952	ATC	2	6	2790	2795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389858575
46	NC_017952	ATA	2	6	2940	2945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389858575
47	NC_017952	AAC	2	6	2965	2970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389858575
48	NC_017952	GGT	2	6	3019	3024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389858575
49	NC_017952	AAT	2	6	3125	3130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389858575
50	NC_017952	TTC	2	6	3160	3165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858575
51	NC_017952	GCA	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858575
52	NC_017952	GGA	2	6	3227	3232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389858575
53	NC_017952	CAG	2	6	3246	3251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858575
54	NC_017952	GTT	2	6	3263	3268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858575
55	NC_017952	GGT	2	6	3355	3360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389858575
56	NC_017952	AAG	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858575
57	NC_017952	ATT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389858575
58	NC_017952	TTG	2	6	3627	3632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858575
59	NC_017952	AAG	2	6	3738	3743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858575
60	NC_017952	AAG	2	6	3753	3758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858575
61	NC_017952	CAG	2	6	3795	3800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858575
62	NC_017952	GCT	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858575
63	NC_017952	AAG	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858575
64	NC_017952	CAG	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858575
65	NC_017952	GGA	2	6	4169	4174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389858575
66	NC_017952	AAT	2	6	4179	4184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389858575
67	NC_017952	ATT	2	6	4259	4264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389858576
68	NC_017952	TGA	2	6	4289	4294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858576
69	NC_017952	GTA	2	6	4521	4526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858576
70	NC_017952	AGA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858576
71	NC_017952	GAA	2	6	4752	4757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858576
72	NC_017952	CGT	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858576
73	NC_017952	GTT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858576
74	NC_017952	TGA	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858576
75	NC_017952	TTG	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858576
76	NC_017952	TTC	2	6	5308	5313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858576
77	NC_017952	TCT	2	6	5400	5405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858576
78	NC_017952	AGA	2	6	5420	5425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858576
79	NC_017952	GTT	2	6	5447	5452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858576
80	NC_017952	GGT	2	6	5495	5500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389858576
81	NC_017952	CTC	2	6	5599	5604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389858576
82	NC_017952	AGC	2	6	5630	5635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858576
83	NC_017952	ATT	2	6	5749	5754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389858577
84	NC_017952	TCT	2	6	5767	5772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858577
85	NC_017952	GCT	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858577
86	NC_017952	GAT	2	6	5848	5853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858577
87	NC_017952	ACG	2	6	5886	5891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858577
88	NC_017952	GAA	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858577
89	NC_017952	AGA	3	9	5987	5995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858577
90	NC_017952	GCT	2	6	5996	6001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858577
91	NC_017952	AGA	2	6	6005	6010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858577
92	NC_017952	TGG	2	6	6041	6046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389858577
93	NC_017952	AGA	3	9	6059	6067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858577
94	NC_017952	GGA	2	6	6068	6073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389858577
95	NC_017952	TCA	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389858577
96	NC_017952	GGA	2	6	6290	6295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389858577
97	NC_017952	CTT	2	6	6350	6355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858577
98	NC_017952	CTG	2	6	6356	6361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858577
99	NC_017952	CAG	2	6	6511	6516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858577
100	NC_017952	AGG	2	6	7040	7045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389858578
101	NC_017952	GAA	2	6	7084	7089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858578
102	NC_017952	GCA	2	6	7348	7353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858578
103	NC_017952	AAG	2	6	7389	7394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858578
104	NC_017952	TGC	2	6	7422	7427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858578
105	NC_017952	TCG	2	6	7915	7920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858579
106	NC_017952	TCC	2	6	7958	7963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389858579
107	NC_017952	GTT	2	6	8066	8071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858579
108	NC_017952	TTA	2	6	8436	8441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389858579
109	NC_017952	TTC	2	6	8759	8764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858579
110	NC_017952	GAA	2	6	8903	8908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858580
111	NC_017952	ACC	2	6	9031	9036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389858580
112	NC_017952	CTT	2	6	9084	9089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858580
113	NC_017952	GAG	2	6	9164	9169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389858580
114	NC_017952	ATA	2	6	9181	9186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389858580
115	NC_017952	AGG	2	6	9205	9210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389858580
116	NC_017952	GAA	2	6	9385	9390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858580
117	NC_017952	CAG	2	6	9401	9406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858580
118	NC_017952	TGT	2	6	9472	9477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858580
119	NC_017952	GAG	2	6	9487	9492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389858580
120	NC_017952	TAC	2	6	9555	9560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389858580
121	NC_017952	GTT	2	6	9659	9664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858580
122	NC_017952	AAG	2	6	9683	9688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858580
123	NC_017952	GAG	2	6	9709	9714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389858580
124	NC_017952	TTA	2	6	9997	10002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389858581
125	NC_017952	AGA	2	6	10032	10037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858581
126	NC_017952	TGC	2	6	10262	10267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858581
127	NC_017952	GAA	2	6	10289	10294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858581
128	NC_017952	TCG	2	6	10349	10354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858581
129	NC_017952	TGG	2	6	10372	10377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389858581
130	NC_017952	GTA	2	6	10423	10428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858582
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