MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis F/SW4

Total Repeats: 752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017951	TGTGA	2	10	3881	3890	20 %	40 %	40 %	0 %	389857701
2	NC_017951	TTGAA	2	10	4237	4246	40 %	40 %	20 %	0 %	389857702
3	NC_017951	GAGAA	2	10	4531	4540	60 %	0 %	40 %	0 %	389857702
4	NC_017951	GAAAA	2	10	4968	4977	80 %	0 %	20 %	0 %	389857702
5	NC_017951	TTACA	2	10	5123	5132	40 %	40 %	0 %	20 %	389857702
6	NC_017951	GTCTT	2	10	5817	5826	0 %	60 %	20 %	20 %	389857703
7	NC_017951	TATTT	2	10	7632	7641	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017951	TGGTA	2	10	8290	8299	20 %	40 %	40 %	0 %	389857705
9	NC_017951	CGAAA	2	10	9698	9707	60 %	0 %	20 %	20 %	389857706
10	NC_017951	GGCTG	2	10	10334	10343	0 %	20 %	60 %	20 %	389857707
11	NC_017951	CCTCT	2	10	11126	11135	0 %	40 %	0 %	60 %	389857708
12	NC_017951	AAAGG	2	10	11285	11294	60 %	0 %	40 %	0 %	389857708
13	NC_017951	AAGAA	2	10	12405	12414	80 %	0 %	20 %	0 %	389857709
14	NC_017951	AAAGA	2	10	13803	13812	80 %	0 %	20 %	0 %	389857710
15	NC_017951	GGTGT	2	10	13907	13916	0 %	40 %	60 %	0 %	389857710
16	NC_017951	GATTT	2	10	15650	15659	20 %	60 %	20 %	0 %	389857712
17	NC_017951	CGTTC	2	10	16761	16770	0 %	40 %	20 %	40 %	389857713
18	NC_017951	GCTTC	2	10	17134	17143	0 %	40 %	20 %	40 %	389857713
19	NC_017951	GAAGG	2	10	17505	17514	40 %	0 %	60 %	0 %	389857713
20	NC_017951	GTTGT	2	10	20931	20940	0 %	60 %	40 %	0 %	389857716
21	NC_017951	AAGAT	2	10	22043	22052	60 %	20 %	20 %	0 %	389857717
22	NC_017951	TTTGC	2	10	22654	22663	0 %	60 %	20 %	20 %	389857717
23	NC_017951	GGAAA	2	10	24408	24417	60 %	0 %	40 %	0 %	389857717
24	NC_017951	AGAGG	2	10	26133	26142	40 %	0 %	60 %	0 %	389857718
25	NC_017951	GGAGA	2	10	27912	27921	40 %	0 %	60 %	0 %	389857719
26	NC_017951	ATCCG	2	10	28663	28672	20 %	20 %	20 %	40 %	389857721
27	NC_017951	AGGGT	2	10	29181	29190	20 %	20 %	60 %	0 %	389857721
28	NC_017951	CCTAT	2	10	30221	30230	20 %	40 %	0 %	40 %	389857722
29	NC_017951	AAGGA	2	10	31021	31030	60 %	0 %	40 %	0 %	389857723
30	NC_017951	GAGCT	2	10	32060	32069	20 %	20 %	40 %	20 %	389857724
31	NC_017951	AAAGA	2	10	33693	33702	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017951	TCAGT	2	10	36300	36309	20 %	40 %	20 %	20 %	389857730
33	NC_017951	CTATT	2	10	36734	36743	20 %	60 %	0 %	20 %	389857730
34	NC_017951	TCCTA	2	10	36781	36790	20 %	40 %	0 %	40 %	389857730
35	NC_017951	ACGAT	2	10	38697	38706	40 %	20 %	20 %	20 %	389857731
36	NC_017951	TTTGA	2	10	39062	39071	20 %	60 %	20 %	0 %	389857731
37	NC_017951	AGCAA	2	10	42713	42722	60 %	0 %	20 %	20 %	389857734
38	NC_017951	CGATG	2	10	42770	42779	20 %	20 %	40 %	20 %	389857734
39	NC_017951	TGCAA	2	10	42928	42937	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017951	CAAAA	2	10	43246	43255	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017951	TTTAT	2	10	44843	44852	20 %	80 %	0 %	0 %	389857738
42	NC_017951	CTTTC	2	10	46940	46949	0 %	60 %	0 %	40 %	389857740
43	NC_017951	AGTTT	2	10	47479	47488	20 %	60 %	20 %	0 %	389857740
44	NC_017951	GAAGA	2	10	48612	48621	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017951	CTATT	2	10	50192	50201	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017951	CTTTT	2	10	50643	50652	0 %	80 %	0 %	20 %	389857743
47	NC_017951	ATTAA	2	10	51983	51992	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017951	CCGTA	2	10	54418	54427	20 %	20 %	20 %	40 %	389857746
49	NC_017951	AATTT	2	10	54658	54667	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017951	TTATC	2	10	55827	55836	20 %	60 %	0 %	20 %	389857747
51	NC_017951	TGAGT	2	10	55848	55857	20 %	40 %	40 %	0 %	389857747
52	NC_017951	GTTGT	2	10	56895	56904	0 %	60 %	40 %	0 %	389857748
53	NC_017951	GAGCA	2	10	60343	60352	40 %	0 %	40 %	20 %	389857750
54	NC_017951	TGTGA	2	10	62792	62801	20 %	40 %	40 %	0 %	389857752
55	NC_017951	AGTGA	2	10	64313	64322	40 %	20 %	40 %	0 %	389857753
56	NC_017951	CCTTC	2	10	64587	64596	0 %	40 %	0 %	60 %	389857753
57	NC_017951	AGGAG	2	10	66815	66824	40 %	0 %	60 %	0 %	389857755
58	NC_017951	GTTAA	2	10	66945	66954	40 %	40 %	20 %	0 %	389857755
59	NC_017951	AAAAG	2	10	69571	69580	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017951	GGAGC	2	10	70193	70202	20 %	0 %	60 %	20 %	389857758
61	NC_017951	GCGAT	2	10	70383	70392	20 %	20 %	40 %	20 %	389857758
62	NC_017951	CTCTT	2	10	70737	70746	0 %	60 %	0 %	40 %	389857758
63	NC_017951	AGGGG	2	10	71383	71392	20 %	0 %	80 %	0 %	389857758
64	NC_017951	AAGAA	2	10	71425	71434	80 %	0 %	20 %	0 %	389857758
65	NC_017951	CTTGC	2	10	72514	72523	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017951	ATTGG	2	10	72715	72724	20 %	40 %	40 %	0 %	389857760
67	NC_017951	GAAAA	2	10	73787	73796	80 %	0 %	20 %	0 %	389857760
68	NC_017951	TGGGA	2	10	74204	74213	20 %	20 %	60 %	0 %	389857761
69	NC_017951	TATTT	2	10	76731	76740	20 %	80 %	0 %	0 %	389857762
70	NC_017951	AAAAG	2	10	77264	77273	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017951	ATCAA	2	10	78962	78971	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017951	TGTCT	2	10	80524	80533	0 %	60 %	20 %	20 %	389857765
73	NC_017951	TTACT	2	10	81031	81040	20 %	60 %	0 %	20 %	389857765
74	NC_017951	AGAAA	2	10	82421	82430	80 %	0 %	20 %	0 %	389857767
75	NC_017951	GGAAG	2	10	82934	82943	40 %	0 %	60 %	0 %	389857767
76	NC_017951	AGCGA	2	10	85400	85409	40 %	0 %	40 %	20 %	389857769
77	NC_017951	TTTGT	2	10	85699	85708	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017951	GATCC	2	10	86485	86494	20 %	20 %	20 %	40 %	389857770
79	NC_017951	AGAGC	2	10	87820	87829	40 %	0 %	40 %	20 %	389857771
80	NC_017951	AATAA	2	10	88698	88707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017951	TTTTC	2	10	91552	91561	0 %	80 %	0 %	20 %	389857774
82	NC_017951	GGATG	2	10	91812	91821	20 %	20 %	60 %	0 %	389857775
83	NC_017951	CAACA	2	10	93351	93360	60 %	0 %	0 %	40 %	389857776
84	NC_017951	TTTAA	2	10	94234	94243	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017951	ACAGC	2	10	94395	94404	40 %	0 %	20 %	40 %	389857778
86	NC_017951	CTTTT	2	10	94769	94778	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017951	GGAAC	2	10	95108	95117	40 %	0 %	40 %	20 %	389857779
88	NC_017951	GGATT	2	10	96008	96017	20 %	40 %	40 %	0 %	389857779
89	NC_017951	CAATC	2	10	97110	97119	40 %	20 %	0 %	40 %	389857781
90	NC_017951	TTTGC	2	10	97244	97253	0 %	60 %	20 %	20 %	389857781
91	NC_017951	ATTCA	2	10	97508	97517	40 %	40 %	0 %	20 %	389857781
92	NC_017951	GATCC	2	10	97767	97776	20 %	20 %	20 %	40 %	389857781
93	NC_017951	GTTTT	2	10	98188	98197	0 %	80 %	20 %	0 %	389857781
94	NC_017951	ACAAA	2	10	98315	98324	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017951	AAGCT	2	10	99391	99400	40 %	20 %	20 %	20 %	389857782
96	NC_017951	AGGGG	2	10	99750	99759	20 %	0 %	80 %	0 %	389857782
97	NC_017951	ATAGC	2	10	100449	100458	40 %	20 %	20 %	20 %	389857783
98	NC_017951	AGCGA	2	10	103377	103386	40 %	0 %	40 %	20 %	389857786
99	NC_017951	TTTCT	2	10	103735	103744	0 %	80 %	0 %	20 %	389857786
100	NC_017951	ATCAT	2	10	104941	104950	40 %	40 %	0 %	20 %	389857787
101	NC_017951	GGCAT	2	10	105649	105658	20 %	20 %	40 %	20 %	389857787
102	NC_017951	AAAGC	2	10	109375	109384	60 %	0 %	20 %	20 %	389857790
103	NC_017951	GCATT	2	10	110535	110544	20 %	40 %	20 %	20 %	389857792
104	NC_017951	GCTCT	2	10	114588	114597	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017951	TGTTT	2	10	115212	115221	0 %	80 %	20 %	0 %	389857795
106	NC_017951	CATGT	2	10	115590	115599	20 %	40 %	20 %	20 %	389857795
107	NC_017951	TATCG	2	10	116294	116303	20 %	40 %	20 %	20 %	389857795
108	NC_017951	TTTCT	2	10	116810	116819	0 %	80 %	0 %	20 %	389857796
109	NC_017951	AAAGA	2	10	119055	119064	80 %	0 %	20 %	0 %	389857798
110	NC_017951	GCTTC	2	10	123045	123054	0 %	40 %	20 %	40 %	389857801
111	NC_017951	TACAA	2	10	126833	126842	60 %	20 %	0 %	20 %	389857805
112	NC_017951	ATCCA	2	10	129241	129250	40 %	20 %	0 %	40 %	389857808
113	NC_017951	GAAGA	2	10	130791	130800	60 %	0 %	40 %	0 %	389857808
114	NC_017951	AAAAG	2	10	132704	132713	80 %	0 %	20 %	0 %	389857809
115	NC_017951	GATTC	2	10	133035	133044	20 %	40 %	20 %	20 %	389857809
116	NC_017951	ATTGG	2	10	136320	136329	20 %	40 %	40 %	0 %	389857812
117	NC_017951	TGTTT	2	10	136779	136788	0 %	80 %	20 %	0 %	389857813
118	NC_017951	TTGCA	2	10	137569	137578	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017951	TCCAG	2	10	140525	140534	20 %	20 %	20 %	40 %	389857819
120	NC_017951	GTACA	2	10	141256	141265	40 %	20 %	20 %	20 %	389857820
121	NC_017951	TAGAT	2	10	141629	141638	40 %	40 %	20 %	0 %	389857820
122	NC_017951	AAAAG	2	10	142041	142050	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017951	AAAAC	2	10	142521	142530	80 %	0 %	0 %	20 %	389857821
124	NC_017951	TGCTA	2	10	143607	143616	20 %	40 %	20 %	20 %	389857823
125	NC_017951	GGAGC	2	10	143654	143663	20 %	0 %	60 %	20 %	389857823
126	NC_017951	CTGGG	2	10	145068	145077	0 %	20 %	60 %	20 %	389857825
127	NC_017951	GTTTT	2	10	145815	145824	0 %	80 %	20 %	0 %	389857826
128	NC_017951	GAACC	2	10	149549	149558	40 %	0 %	20 %	40 %	389857827
129	NC_017951	ATTCT	2	10	153046	153055	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017951	CTGTG	2	10	153250	153259	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017951	TTCTT	2	10	155723	155732	0 %	80 %	0 %	20 %	389857833
132	NC_017951	TTCTA	2	10	157828	157837	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017951	AGGAA	2	10	160281	160290	60 %	0 %	40 %	0 %	389857837
134	NC_017951	CAAAA	2	10	162284	162293	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017951	AGAGA	2	10	163512	163521	60 %	0 %	40 %	0 %	389857840
136	NC_017951	AGCAA	2	10	163947	163956	60 %	0 %	20 %	20 %	389857840
137	NC_017951	CAAAA	2	10	167450	167459	80 %	0 %	0 %	20 %	389857842
138	NC_017951	AAGAG	2	10	168283	168292	60 %	0 %	40 %	0 %	389857842
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