MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/SW4

Total Repeats: 12683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017951	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389857698
2	NC_017951	TAA	3	9	93	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389857698
3	NC_017951	GTA	2	6	137	142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857698
4	NC_017951	AGT	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857698
5	NC_017951	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389857698
6	NC_017951	AGT	2	6	364	369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857698
7	NC_017951	GTG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389857698
8	NC_017951	CAG	2	6	416	421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857698
9	NC_017951	GCC	2	6	604	609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389857698
10	NC_017951	TGC	2	6	663	668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857698
11	NC_017951	ATT	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857698
12	NC_017951	CGA	2	6	697	702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857698
13	NC_017951	TAT	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857698
14	NC_017951	GAA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857698
15	NC_017951	AGA	2	6	915	920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857698
16	NC_017951	AGA	2	6	969	974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857698
17	NC_017951	CAA	2	6	1042	1047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389857698
18	NC_017951	TTG	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857698
19	NC_017951	CTC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389857698
20	NC_017951	GAT	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857698
21	NC_017951	GAT	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857698
22	NC_017951	ATG	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857698
23	NC_017951	CCT	2	6	1552	1557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389857698
24	NC_017951	CTT	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857698
25	NC_017951	CAG	2	6	1678	1683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857698
26	NC_017951	TGA	2	6	1739	1744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857698
27	NC_017951	ATG	2	6	1936	1941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857699
28	NC_017951	GTG	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389857699
29	NC_017951	TCC	2	6	1951	1956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389857699
30	NC_017951	AGC	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857699
31	NC_017951	AGC	2	6	1992	1997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857699
32	NC_017951	AAG	2	6	2003	2008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857699
33	NC_017951	TAC	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857699
34	NC_017951	GCT	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857699
35	NC_017951	AAC	2	6	2149	2154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389857699
36	NC_017951	AGA	2	6	2161	2166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857699
37	NC_017951	AGA	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857700
38	NC_017951	ATC	2	6	2424	2429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857700
39	NC_017951	TGC	2	6	2444	2449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857700
40	NC_017951	CAT	2	6	2568	2573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857700
41	NC_017951	AGA	2	6	2597	2602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857700
42	NC_017951	AAG	2	6	2626	2631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857700
43	NC_017951	GGA	2	6	2661	2666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389857700
44	NC_017951	ATC	2	6	2790	2795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857701
45	NC_017951	ATA	2	6	2940	2945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389857701
46	NC_017951	AAC	2	6	2965	2970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389857701
47	NC_017951	GGT	2	6	3019	3024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389857701
48	NC_017951	AAT	2	6	3125	3130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389857701
49	NC_017951	TTC	2	6	3160	3165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857701
50	NC_017951	GCA	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857701
51	NC_017951	GGA	2	6	3227	3232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389857701
52	NC_017951	CAG	2	6	3246	3251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857701
53	NC_017951	GTT	2	6	3263	3268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857701
54	NC_017951	GGT	2	6	3355	3360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389857701
55	NC_017951	AAG	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857701
56	NC_017951	ATT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857701
57	NC_017951	TTG	2	6	3627	3632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857701
58	NC_017951	AAG	2	6	3738	3743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857701
59	NC_017951	AAG	2	6	3753	3758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857701
60	NC_017951	CAG	2	6	3795	3800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857701
61	NC_017951	GCT	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857701
62	NC_017951	AAG	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857701
63	NC_017951	CAG	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857701
64	NC_017951	GGA	2	6	4169	4174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389857701
65	NC_017951	AAT	2	6	4179	4184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389857701
66	NC_017951	ATT	2	6	4259	4264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857702
67	NC_017951	TGA	2	6	4289	4294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857702
68	NC_017951	GTA	2	6	4521	4526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857702
69	NC_017951	AGA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857702
70	NC_017951	GAA	2	6	4752	4757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857702
71	NC_017951	CGT	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857702
72	NC_017951	GTT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857702
73	NC_017951	TGA	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857702
74	NC_017951	TTG	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857702
75	NC_017951	TTC	2	6	5308	5313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857702
76	NC_017951	TCT	2	6	5400	5405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857702
77	NC_017951	AGA	2	6	5420	5425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857702
78	NC_017951	GTT	2	6	5447	5452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857702
79	NC_017951	GGT	2	6	5495	5500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389857702
80	NC_017951	CTC	2	6	5599	5604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389857702
81	NC_017951	AGC	2	6	5630	5635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857702
82	NC_017951	ATT	2	6	5747	5752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857703
83	NC_017951	TCT	2	6	5765	5770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857703
84	NC_017951	GCT	2	6	5811	5816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857703
85	NC_017951	GAT	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857703
86	NC_017951	ACG	2	6	5884	5889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857703
87	NC_017951	GAA	2	6	5908	5913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857703
88	NC_017951	AGA	3	9	5985	5993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857703
89	NC_017951	GCT	2	6	5994	5999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857703
90	NC_017951	AGA	2	6	6003	6008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857703
91	NC_017951	TGG	2	6	6039	6044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389857703
92	NC_017951	AGA	3	9	6057	6065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857703
93	NC_017951	GGA	2	6	6066	6071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389857703
94	NC_017951	TCA	2	6	6251	6256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857703
95	NC_017951	GGA	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389857703
96	NC_017951	CTT	2	6	6348	6353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857703
97	NC_017951	CTG	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857703
98	NC_017951	CAG	2	6	6509	6514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857703
99	NC_017951	GCA	2	6	6547	6552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857703
100	NC_017951	AGG	2	6	7038	7043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389857704
101	NC_017951	GAA	2	6	7082	7087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857704
102	NC_017951	GCA	2	6	7346	7351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857704
103	NC_017951	AAG	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857704
104	NC_017951	TGC	2	6	7420	7425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857704
105	NC_017951	TCG	2	6	7914	7919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857705
106	NC_017951	TCC	2	6	7957	7962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389857705
107	NC_017951	GTT	2	6	8065	8070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857705
108	NC_017951	TTA	2	6	8435	8440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857705
109	NC_017951	TTC	2	6	8758	8763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857705
110	NC_017951	GAA	2	6	8902	8907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857706
111	NC_017951	ACC	2	6	9030	9035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389857706
112	NC_017951	CTT	2	6	9083	9088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857706
113	NC_017951	GAG	2	6	9163	9168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389857706
114	NC_017951	ATA	2	6	9180	9185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389857706
115	NC_017951	AGG	2	6	9204	9209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389857706
116	NC_017951	GAA	2	6	9384	9389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857706
117	NC_017951	CAG	2	6	9400	9405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857706
118	NC_017951	TGT	2	6	9471	9476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857706
119	NC_017951	GAG	2	6	9486	9491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389857706
120	NC_017951	TAC	2	6	9554	9559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857706
121	NC_017951	GTT	2	6	9658	9663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857706
122	NC_017951	AAG	2	6	9682	9687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857706
123	NC_017951	GAG	2	6	9708	9713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389857706
124	NC_017951	TTA	2	6	9998	10003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857707
125	NC_017951	AGA	2	6	10033	10038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857707
126	NC_017951	TGC	2	6	10263	10268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857707
127	NC_017951	GAA	2	6	10290	10295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857707
128	NC_017951	TCG	2	6	10350	10355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857707
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130	NC_017951	GTA	2	6	10424	10429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857708
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