MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris NZ9000 chromosome

Total Repeats: 887

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017949	TTGCTG	2	12	419	430	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	389853199
2	NC_017949	TTGAAG	2	12	1628	1639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853200
3	NC_017949	TGAAAG	2	12	1931	1942	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	389853200
4	NC_017949	ATGTTG	2	12	4415	4426	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	389853201
5	NC_017949	TCAAAA	2	12	7004	7015	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	389853202
6	NC_017949	AAAATG	2	12	7155	7166	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	389853202
7	NC_017949	AAGCCA	2	12	10232	10243	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	389853204
8	NC_017949	AAAGAT	2	12	11231	11242	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	389853205
9	NC_017949	TAAAAA	2	12	12749	12760	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	389853207
10	NC_017949	AATTGG	2	12	14831	14842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853210
11	NC_017949	TTGACA	2	12	17334	17345	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	389853211
12	NC_017949	AAATCA	2	12	20707	20718	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	389853215
13	NC_017949	GTCGGA	2	12	24138	24149	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389853218
14	NC_017949	GCGTGA	2	12	24680	24691	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389853218
15	NC_017949	ATGCAA	2	12	25312	25323	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	389853218
16	NC_017949	TTTCTT	2	12	36702	36713	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	389853227
17	NC_017949	AAAAGG	2	12	50879	50890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853253
18	NC_017949	GGAAAG	2	12	51351	51362	50 %	0 %	50 %	0 %	389853253
19	NC_017949	TTTTAA	2	12	54937	54948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853257
20	NC_017949	TGTTTG	2	12	57100	57111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853261
21	NC_017949	GATAAT	2	12	60019	60030	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	389853263
22	NC_017949	TCAGAG	2	12	60238	60249	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	389853263
23	NC_017949	AAGGAA	2	12	60297	60308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853263
24	NC_017949	TTCACC	2	12	67045	67056	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	389853269
25	NC_017949	GCAGGA	2	12	68231	68242	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	389853269
26	NC_017949	CTTCAA	2	12	71311	71322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853272
27	NC_017949	TATAAA	2	12	72211	72222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853273
28	NC_017949	GGTCAG	2	12	74266	74277	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389853276
29	NC_017949	TTGCTT	2	12	76220	76231	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	389853278
30	NC_017949	TTGTTT	2	12	76529	76540	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	389853278
31	NC_017949	TTATTT	2	12	77668	77679	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	389853279
32	NC_017949	TCCAAG	2	12	80337	80348	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	389853282
33	NC_017949	ACAAGA	2	12	82505	82516	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	389853283
34	NC_017949	TAGGCT	2	12	82635	82646	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	389853284
35	NC_017949	CTTTAT	2	12	85553	85564	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	389853287
36	NC_017949	AAGTTC	2	12	92443	92454	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	389853295
37	NC_017949	CATTTG	2	12	94649	94660	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	389853298
38	NC_017949	AAGCAA	2	12	94754	94765	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	389853298
39	NC_017949	GGGAAT	2	12	95790	95801	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	389853299
40	NC_017949	ATCAAA	2	12	97891	97902	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	389853301
41	NC_017949	TTTTCG	2	12	98880	98891	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	389853302
42	NC_017949	AAAACC	2	12	100528	100539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853304
43	NC_017949	TGGACG	2	12	101019	101030	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389853304
44	NC_017949	TGGGAC	2	12	103234	103245	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389853308
45	NC_017949	CAGTTG	2	12	104096	104107	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	389853309
46	NC_017949	AGCTGA	2	12	107491	107502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	389853311
47	NC_017949	TTTATC	2	12	110282	110293	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	389853314
48	NC_017949	TATAAA	2	12	114991	115002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853321
49	NC_017949	TATGGG	2	12	122260	122271	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	389853327
50	NC_017949	TTCATA	2	12	140112	140123	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	389853348
51	NC_017949	ATTGCT	2	12	142138	142149	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	389853350
52	NC_017949	TGCAGC	2	12	142221	142232	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389853350
53	NC_017949	TCATAA	2	12	145607	145618	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	389853357
54	NC_017949	CAAAAG	2	12	146143	146154	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	389853358
55	NC_017949	GTTTAA	2	12	146834	146845	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	389853359
56	NC_017949	CAAACC	2	12	149710	149721	50 %	0 %	0 %	50 %	389853362
57	NC_017949	ATTAAT	2	12	153863	153874	50 %	50 %	0 %	0 %	389853366
58	NC_017949	ATAATT	2	12	159082	159093	50 %	50 %	0 %	0 %	389853371
59	NC_017949	TTGCTT	2	12	165432	165443	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	389853378
60	NC_017949	GTAAAG	2	12	170716	170727	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	389853381
61	NC_017949	GAATAC	2	12	173531	173542	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	389853387
62	NC_017949	TTTGAA	2	12	173982	173993	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	389853387
63	NC_017949	TTCAGC	2	12	178304	178315	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	389853392
64	NC_017949	ATTGGG	2	12	179305	179316	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	389853392
65	NC_017949	AAATAG	2	12	181639	181650	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	389853394
66	NC_017949	AATCGA	2	12	182094	182105	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	389853395
67	NC_017949	TACCAT	2	12	185992	186003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853399
68	NC_017949	ATGTTT	2	12	186043	186054	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	389853399
69	NC_017949	AAAAGA	2	12	187009	187020	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	389853400
70	NC_017949	AAGTAA	2	12	187794	187805	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	389853400
71	NC_017949	CGAAGT	2	12	190689	190700	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	389853403
72	NC_017949	AGAAGT	2	12	192630	192641	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	389853405
73	NC_017949	GACTTT	2	12	192705	192716	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	389853405
74	NC_017949	TCCAGA	2	12	195871	195882	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	389853409
75	NC_017949	GAAGGT	2	12	197646	197657	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	389853412
76	NC_017949	GAAAAC	2	12	198189	198200	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	389853412
77	NC_017949	CTGAAT	2	12	198824	198835	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	389853413
78	NC_017949	AAAAGC	2	12	199236	199247	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	389853413
79	NC_017949	AAAAAC	2	12	201581	201592	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	389853415
80	NC_017949	TTGCTT	2	12	204245	204256	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	389853418
81	NC_017949	TAAAAA	2	12	209375	209386	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	389853423
82	NC_017949	TGCAAC	2	12	211326	211337	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	389853425
83	NC_017949	AAAAAT	2	12	211745	211756	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	389853425
84	NC_017949	AAATAA	2	12	216620	216631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	389853429
85	NC_017949	ATTATG	2	12	216832	216843	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	389853429
86	NC_017949	TGAAAA	2	12	222159	222170	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	389853433
87	NC_017949	ACGTAA	2	12	238507	238518	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	389853452
88	NC_017949	CGTAAA	2	12	238532	238543	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	389853452
89	NC_017949	CCAGCC	2	12	241378	241389	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	389853455
90	NC_017949	AAGCTC	2	12	249699	249710	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	389853462
91	NC_017949	TGATTG	2	12	252551	252562	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	389853463
92	NC_017949	GTCATT	2	12	254657	254668	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	389853465
93	NC_017949	AAGGCC	2	12	259858	259869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853469
94	NC_017949	TAACGA	2	12	261215	261226	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	389853470
95	NC_017949	TGGCAT	2	12	262125	262136	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	389853472
96	NC_017949	TTTGAT	2	12	263766	263777	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	389853473
97	NC_017949	TTTAAC	2	12	266893	266904	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	389853477
98	NC_017949	TTGGTT	2	12	268182	268193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853478
99	NC_017949	CAAAAT	2	12	269478	269489	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	389853478
100	NC_017949	ATTTCC	2	12	273965	273976	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	389853482
101	NC_017949	ATCTGC	2	12	274739	274750	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	389853482
102	NC_017949	GGCTCA	2	12	280215	280226	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389853488
103	NC_017949	AAAAAC	2	12	285576	285587	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	389853493
104	NC_017949	GTCTTG	2	12	285720	285731	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	389853493
105	NC_017949	CTTGGT	2	12	287940	287951	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	389853494
106	NC_017949	CTTTTT	2	12	290703	290714	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	389853498
107	NC_017949	ATTTTT	2	12	300420	300431	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	389853510
108	NC_017949	ATAAGT	2	12	306247	306258	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	389853516
109	NC_017949	CCAACA	2	12	308329	308340	50 %	0 %	0 %	50 %	389853519
110	NC_017949	AACATC	2	12	310143	310154	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	389853521
111	NC_017949	AGGGAT	2	12	312120	312131	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	389853523
112	NC_017949	TTTAAA	2	12	318028	318039	50 %	50 %	0 %	0 %	389853527
113	NC_017949	TTGCTG	2	12	326156	326167	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	389853536
114	NC_017949	TAATTA	2	12	326757	326768	50 %	50 %	0 %	0 %	389853536
115	NC_017949	GATTTT	3	18	330556	330573	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	389853540
116	NC_017949	TTGCTT	2	12	331657	331668	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	389853542
117	NC_017949	ATGATT	2	12	332790	332801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	389853542
118	NC_017949	GAAAAT	2	12	332898	332909	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	389853542
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459	NC_017949	TTTTTC	2	12	1349820	1349831	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	389854547
460	NC_017949	TTTGTT	2	12	1354542	1354553	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	389854550
461	NC_017949	AAGTCA	2	12	1355677	1355688	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	389854552
462	NC_017949	TTTCAT	2	12	1356477	1356488	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	389854553
463	NC_017949	TCCTTT	2	12	1359544	1359555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389854555
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